Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 M -1 -2 -3 -4 -2 -1 -3 -3 -2 1 2 -2 8 0 -3 -2 -1 -2 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0.72 0.15 2 L -2 -3 -4 -4 -2 -3 -4 -4 -3 2 3 -4 0 4 -4 -3 -2 -2 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10 28 0 0 22 0 0 0 0 0 40 0.53 0.29 3 K -2 5 -2 -2 -4 0 -1 -3 -2 -2 1 4 -1 -3 -3 -2 -2 -4 -3 -2 0 46 0 0 0 0 0 0 0 0 17 37 0 0 0 0 0 0 0 0 0.66 0.29 4 E -1 -1 3 2 -4 1 5 -2 -1 -4 -4 0 -3 -4 -2 -1 -1 -4 -3 -3 5 0 22 9 0 0 64 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.80 0.30 5 V -1 -3 -3 -4 -2 -3 -3 -4 -4 4 0 -3 0 -2 -3 -2 2 -4 -2 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45 0 0 0 0 0 0 22 0 0 33 0.56 0.30 6 H -3 3 0 -2 -4 0 -1 -3 9 -4 -4 -1 -2 -2 -3 -2 -2 -3 0 -4 0 22 0 0 0 0 0 0 78 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.27 0.30 7 E -2 -1 3 3 -4 0 5 -2 -1 -4 -4 1 -3 -4 -2 0 -1 -4 -3 -4 0 0 22 17 0 0 52 0 0 0 0 5 0 0 0 4 0 0 0 0 0.77 0.34 8 L -3 -3 -4 -4 -3 -3 -4 -4 3 0 2 -4 0 6 -4 -3 -2 -1 1 2 0 0 0 0 0 0 0 0 10 0 25 0 0 48 0 0 0 0 0 17 0.67 0.34 9 L -3 -3 -5 -5 -2 -3 -4 -5 -4 1 5 -4 1 -1 -4 -4 -2 -3 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.97 0.37 10 N -3 -1 7 0 -4 -1 -1 -1 0 -4 -5 -1 -3 -4 -3 0 -1 -5 -3 -4 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.38 0.37 11 R -1 3 -1 2 -4 3 3 -3 -1 -4 -3 3 -2 0 -3 -1 -2 -3 -2 -3 4 23 0 12 0 14 19 0 0 0 0 21 0 7 0 0 0 0 0 0 0.51 0.37 12 I -2 -3 -4 -4 -2 -3 -4 -5 -4 5 2 -3 6 -1 -4 -3 -2 -3 -2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49 20 0 31 0 0 0 0 0 0 0 0.75 0.37 13 W -3 -3 -4 -5 -3 -3 -4 -4 -1 -3 -2 -4 -2 1 -5 -3 -3 11 6 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62 38 0 2.16 0.37 14 G -1 -2 -1 0 -4 3 4 3 -2 0 -3 -1 -2 -4 -3 1 -2 -4 -3 -2 0 0 0 4 0 14 35 23 0 12 0 0 0 0 0 12 0 0 0 0 0.45 0.37 15 D -2 -2 2 3 -4 0 4 1 -2 -2 -4 -1 -3 -4 3 0 -2 -4 -3 -3 0 0 12 15 0 0 35 11 0 4 0 0 0 0 14 8 0 0 0 0 0.54 0.37 16 I -2 -4 -4 -4 -2 -3 -4 -4 -4 5 2 -3 2 -1 -4 -2 2 -4 -2 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 58 14 0 4 0 0 0 15 0 0 8 0.62 0.37 17 F -3 -3 4 -2 -4 -2 1 -3 -2 -2 -1 -2 -2 6 -4 -2 -2 -1 1 -2 0 0 26 0 0 0 12 0 0 0 4 0 0 58 0 0 0 0 0 0 0.76 0.37 18 E -2 3 -1 -1 -4 2 3 -3 -1 -4 -3 2 -2 -4 -2 -1 2 -4 -3 -3 0 23 0 0 0 12 30 0 0 0 0 16 0 0 0 0 19 0 0 0 0.58 0.37 19 L -2 -1 -3 -4 -3 -2 -2 -4 -3 3 4 3 2 -1 -3 -3 -2 -3 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20 49 26 5 0 0 0 0 0 0 0 0.49 0.37 20 R 0 5 5 -1 -4 0 -1 -2 -1 -4 -4 2 -3 -4 -3 -1 -1 -4 -3 -3 12 38 38 0 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 0 0 0 0 0 0.70 0.37 21 E -2 -1 -1 2 -4 0 5 -3 -2 1 -3 2 -2 -4 -2 -1 -2 -4 -3 -2 0 0 0 7 0 0 67 0 0 14 0 12 0 0 0 0 0 0 0 0 0.75 0.37 22 E -2 -1 -2 0 -4 1 6 -3 -1 -2 -3 0 -2 -4 -2 -1 -2 -4 -3 1 0 0 0 0 0 0 84 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16 0.93 0.37 23 L -3 -3 -5 -5 -2 -3 -4 -5 -4 1 5 -4 1 -1 -4 -4 -2 -3 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.97 0.37 24 K -1 4 -2 -2 -4 0 -1 -3 -2 1 -2 4 -2 -3 -3 -1 1 -4 -3 -2 4 30 0 0 0 0 0 0 0 12 0 42 0 0 0 0 12 0 0 0 0.57 0.37 25 E 1 1 -1 0 -4 0 5 -3 4 -4 -2 -1 -2 -4 -2 2 -1 -4 -2 -3 10 7 0 0 0 0 50 0 12 0 4 0 0 0 0 16 0 0 0 0 0.56 0.37 26 E 1 -1 -2 -1 -3 0 4 -2 -2 -3 -3 2 -2 2 -2 1 -1 -3 -2 -3 14 0 0 0 0 0 46 0 0 0 0 16 0 12 0 12 0 0 0 0 0.50 0.37 27 L -3 -3 -4 -5 -3 -4 -4 -5 -3 0 5 -4 1 4 -4 -4 -2 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 74 0 0 26 0 0 0 0 0 0 0.82 0.37 28 K -2 0 2 -1 -4 0 2 -2 -2 -3 -3 5 -3 -4 0 0 0 -4 -3 -2 0 0 14 0 0 0 12 0 0 0 0 57 0 0 4 5 4 0 0 4 0.60 0.37 29 G -1 -3 2 1 -4 -2 1 6 -2 -5 -5 -2 -4 -4 -3 -1 -2 -4 -4 -4 0 0 12 8 0 0 12 68 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.96 0.37 30 F -3 -2 -3 -4 -3 2 -2 -4 -2 -1 1 1 -1 7 -4 -3 -3 -1 1 -2 0 0 0 0 0 12 0 0 0 0 14 12 0 62 0 0 0 0 0 0 0.76 0.37 31 T -1 1 -1 -1 -4 0 2 1 -2 -4 -4 5 -3 -4 -2 1 1 -4 -3 -3 0 4 0 0 0 0 16 12 0 0 0 48 0 0 0 12 8 0 0 0 0.53 0.37 32 V -2 -4 -4 -4 -2 -4 -4 -4 -4 3 1 -4 0 2 -4 -3 -1 -3 -1 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14 12 0 0 12 0 0 0 0 0 62 0.65 0.37 33 E -2 -1 -1 0 -4 3 5 -3 -1 -4 -4 0 -3 -4 2 -1 2 -4 -3 -3 0 0 0 0 0 12 62 0 0 0 0 0 0 0 12 0 14 0 0 0 0.81 0.37 34 E -2 -2 0 4 -4 -1 3 -3 -2 1 -3 -2 -3 -2 3 -2 -2 -3 2 -2 0 0 4 37 0 0 20 0 0 12 0 0 0 0 16 0 0 0 12 0 0.58 0.37 35 V -1 1 -2 2 -2 -2 -2 -3 -3 1 -1 -2 -1 -2 -2 -2 -1 -3 -2 5 1 12 1 13 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 1 0 0 63 0.42 0.32 36 S -1 -1 -1 0 4 0 4 1 -1 -3 -3 -1 -2 -3 -2 2 0 -3 -2 -2 1 1 1 1 12 1 43 9 0 1 1 1 0 1 1 21 5 0 0 1 0.47 0.32 37 E -1 -2 -1 0 -4 0 5 4 -2 -5 -4 -1 -3 -4 -3 -1 -2 -4 -4 -4 0 0 0 0 0 0 62 38 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.91 0.37 38 V -1 -4 -4 -4 -2 -3 -4 -4 -3 1 -1 -3 -1 3 -4 -3 -2 6 3 4 4 0 0 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 14 0 0 0 12 12 53 0.66 0.37 39 F -3 -3 -4 -5 -4 -4 -4 -4 -1 -2 -1 -4 -1 7 -5 -3 -3 1 6 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62 0 0 0 0 38 0 1.28 0.37 40 N -2 -2 7 0 -4 -1 -2 3 -1 -5 -5 -1 -3 -4 -3 -1 -1 -5 -3 -4 0 0 78 0 0 0 0 22 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.10 0.37 41 A 4 -2 -2 2 -2 2 -1 2 -2 -3 -3 -2 -2 -4 -2 0 -1 -4 -3 -2 62 0 0 12 0 12 0 14 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.56 0.37 42 Y -3 -2 -2 -3 -4 -2 -2 -4 7 -3 -3 -2 -2 1 -4 -2 -3 0 7 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 38 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62 0 1.31 0.37 43 L -2 -4 -4 -4 -3 -3 -4 -5 -2 4 2 -3 0 0 -4 -3 -2 -1 5 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39 19 0 0 0 0 0 0 0 27 15 0.62 0.37 44 Y -3 -2 -2 -3 -4 -2 -2 -4 6 -3 -2 1 -2 5 -4 -2 -3 0 6 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 27 0 0 12 0 26 0 0 0 0 35 0 0.89 0.37 45 I -2 2 -4 -4 -2 -3 -3 -5 -4 4 3 -2 0 -1 -4 -3 -2 -3 -2 2 0 14 0 0 0 0 0 0 0 32 38 0 0 0 0 0 0 0 0 16 0.52 0.37 46 D -3 -2 3 6 -5 -1 3 -2 -2 -4 -5 -1 -4 -5 -3 -1 -2 -5 -4 -4 0 0 14 65 0 0 21 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.08 0.37 47 G -1 -3 2 -2 -4 -3 -3 6 -3 -5 -5 -2 -4 -4 -3 -1 -2 -4 -4 -4 0 0 12 0 0 0 0 88 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.34 0.37 48 K -2 0 -1 0 -4 3 5 -3 -1 1 -3 1 -2 -4 -2 -1 -2 -4 -3 -2 0 4 0 0 0 14 61 0 0 12 0 8 0 0 0 0 0 0 0 0 0.72 0.37 49 W -4 -4 -5 -5 -3 -3 -4 -4 -2 -4 -3 -4 -2 0 -5 -4 -3 12 4 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 86 14 0 2.71 0.37 50 E -2 5 -2 -2 -4 3 2 -4 -2 2 -2 1 -1 -3 -3 -2 -2 -4 -3 0 0 39 0 0 0 14 15 0 0 24 0 4 0 0 0 0 0 0 0 4 0.51 0.37 51 E 1 2 -2 -1 -3 1 4 -3 -2 -3 -1 0 -2 -4 0 -1 1 -4 -3 -2 14 16 0 0 0 4 43 0 0 0 8 0 0 0 4 0 12 0 0 0 0.45 0.37 52 M -2 -2 -2 2 -3 -1 3 -3 -2 -1 0 -2 7 -2 -3 -2 -2 -3 -3 -1 0 0 0 14 0 0 24 0 0 0 0 0 62 0 0 0 0 0 0 0 0.73 0.37 53 K 1 -1 0 0 -3 -1 1 -2 -2 -1 0 4 -1 -3 -2 1 -1 -4 -3 -2 12 0 4 4 0 0 12 0 0 5 15 35 0 0 0 14 0 0 0 0 0.28 0.37 54 Y -3 -3 -3 -4 -4 -3 -3 -4 1 -2 -2 -3 -2 2 -4 -3 -3 1 9 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 1.62 0.37 55 P -2 -3 -3 -3 -4 -2 -2 -3 -3 -4 -4 -2 -4 -5 8 -2 -2 -5 -4 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 2.45 0.37 56 H -3 -2 -1 -3 -3 -1 -2 -4 8 4 -1 -2 -1 -2 -4 -2 -2 -4 0 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 62 38 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.01 0.37 57 P -2 -2 -3 -2 -4 -2 -2 -3 -3 -4 -4 1 -3 -5 8 -2 -2 -5 -4 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 88 0 0 0 0 0 2.06 0.37 58 A 4 -3 -3 -3 -2 -2 -2 -2 -3 0 -1 -2 -1 -3 -2 -1 -1 -4 -3 3 62 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38 0.61 0.37 59 F -3 -4 -4 -5 -3 -4 -4 -5 -3 3 1 -4 0 7 -4 -4 -3 -1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26 12 0 0 62 0 0 0 0 0 0 0.92 0.37 60 A 1 -2 -1 -1 -3 0 4 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 -2 3 3 -4 -3 -2 8 0 0 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