Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 A 5 -4 -3 -4 -3 -3 -4 1 -4 -4 -3 -3 5 -5 -4 2 2 -5 -4 -3 49 0 0 0 0 0 0 8 0 0 0 0 15 0 0 16 11 0 0 0 0.90 1.28 2 K -1 4 -3 -3 -6 1 -2 -4 -4 -3 -4 6 -4 -6 -4 -2 -1 -6 -5 -1 5 22 1 1 0 6 0 1 0 1 1 52 0 0 0 2 3 0 0 6 1.08 1.59 3 L -4 -4 -5 -6 -6 -4 -5 -6 3 -4 -2 -5 3 3 -5 -5 -5 8 8 -4 1 0 0 0 0 1 0 0 7 0 3 0 7 9 1 0 0 22 50 0 1.92 1.69 4 S -3 3 -1 -3 -4 3 3 -5 -2 2 -2 0 1 -1 -5 -3 -2 -6 -3 2 1 14 2 0 0 15 20 0 1 12 3 6 4 2 0 1 1 0 0 16 0.52 1.72 5 C -4 -7 -6 -7 12 -6 -7 -6 -6 -4 -4 -6 -5 -6 -6 -4 -4 -6 -6 -4 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.67 1.71 6 K -2 2 0 -1 -5 1 -1 -1 -3 0 -1 2 0 -4 3 0 2 -6 -5 0 2 10 4 3 0 5 3 5 0 5 6 15 2 0 13 7 13 0 0 6 0.29 1.79 7 I -1 -1 1 0 -2 -2 -2 0 0 3 -1 -3 -1 -2 -1 0 -2 -6 -3 4 5 3 6 6 1 2 2 7 3 19 5 1 1 1 3 6 1 0 1 27 0.36 1.77 8 C -3 -6 -6 -6 11 -6 -6 -3 -6 -4 -4 -6 -5 -5 -6 -4 -4 -5 -5 -4 0 0 0 0 95 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.43 1.74 9 G -3 -3 -1 0 -6 -1 -2 6 -2 -5 -3 -3 -2 -3 -5 -2 -4 5 -3 -6 1 1 2 5 0 3 3 66 1 0 3 1 1 1 0 3 0 7 1 0 1.31 1.87 10 Y -4 -4 -4 -5 -3 -4 -5 -6 2 -4 -3 -4 -2 3 -6 -3 0 7 8 -4 1 0 1 0 0 0 0 0 4 0 2 1 1 9 0 2 5 13 59 1 1.84 1.87 11 I -3 -1 -4 -5 -2 -3 1 -5 -3 5 -1 -3 -2 -4 -3 -3 -1 -6 -3 5 1 3 1 0 1 1 10 1 1 36 2 1 1 0 1 1 4 0 1 35 0.94 1.85 12 Y -5 -5 -5 -6 -2 -4 -5 -6 1 -3 -3 -5 -4 1 -5 -4 -3 1 9 -3 0 0 0 0 1 0 0 0 2 1 2 0 0 2 0 0 1 1 86 1 2.45 1.78 13 D -3 -2 1 7 -3 -2 1 -4 -1 -3 -4 -2 -4 -3 -2 -2 -2 -5 -3 -3 2 2 7 62 1 1 9 1 2 1 2 2 0 1 2 2 2 0 1 2 1.26 1.67 14 E -3 -3 -3 -1 -5 -1 4 -2 -4 -4 -4 -2 -2 -3 6 -2 -2 -5 -4 -3 2 1 1 3 0 2 30 3 0 1 2 1 1 1 45 2 2 0 0 2 1.25 1.73 15 D 4 -2 -1 0 -2 0 3 -2 -2 -3 -3 0 -2 -3 -4 0 -1 -1 -1 -1 34 2 2 4 1 3 22 2 1 2 2 5 1 1 0 6 4 1 2 3 0.48 1.79 16 E 0 0 -2 -2 -3 0 3 -4 -2 0 0 3 -2 -2 -3 -1 -1 -2 1 1 7 4 2 2 1 4 20 1 1 5 10 16 1 1 1 3 4 1 6 10 0.27 1.82 17 G -2 -4 -2 -2 -2 -3 -3 7 -2 -3 -5 -4 -2 -5 -4 -2 -4 1 -5 -3 1 0 2 2 1 1 1 78 1 2 1 1 1 0 0 2 1 2 0 2 1.62 1.80 18 D -2 -3 0 7 0 -2 1 -3 -2 -3 -2 -3 -2 -3 -3 -2 -2 3 -2 -3 4 1 4 56 2 1 8 2 1 2 4 1 1 1 1 2 2 4 1 2 1.08 1.78 19 P -1 -2 -2 0 -2 -2 0 -3 -2 -2 -3 0 -2 -3 6 0 -1 -4 -1 -2 5 2 1 4 1 2 7 2 1 3 3 5 1 1 46 8 3 0 2 2 0.91 1.68 20 D -1 1 0 4 -2 -1 2 -2 3 -2 -2 1 -1 -2 -3 0 -1 -1 -1 -1 4 7 4 20 1 2 14 3 6 2 5 10 2 2 1 6 4 1 2 4 0.29 1.84 21 N -1 0 2 0 -1 1 2 1 1 -3 -2 -2 0 -2 -2 1 0 3 0 -3 6 5 10 5 1 6 14 12 4 2 3 2 2 2 2 9 7 4 3 2 0.20 1.77 22 G -2 -1 1 1 -5 1 0 5 -1 -5 -3 -1 -1 -2 0 -2 -2 1 -2 -5 2 3 7 8 0 6 6 43 2 0 2 3 2 2 5 2 2 2 2 1 0.64 1.76 23 I -1 -4 -1 -1 -4 -4 -1 -5 -4 5 -1 -1 1 2 -1 -4 -1 3 0 2 4 0 4 4 0 0 4 1 0 33 5 4 4 7 4 1 4 3 4 14 0.50 1.61 24 S 2 -1 -1 -1 1 2 1 -2 1 -1 -2 0 0 -5 4 -1 -1 -5 0 -2 18 3 3 4 3 8 10 3 3 3 4 5 3 0 18 3 3 0 3 3 0.30 1.67 25 P 1 -1 -4 -2 -4 -1 1 -2 -4 -2 -2 0 0 -4 6 -1 -1 -5 -4 -2 12 4 1 2 0 3 9 3 0 2 3 5 2 0 44 3 3 0 0 3 0.90 1.62 26 G -2 -2 0 -1 -5 -2 -2 6 1 -5 -4 -2 -4 -5 -2 -1 -2 2 -1 -3 2 2 4 3 0 2 2 59 3 0 2 3 0 0 2 4 3 3 2 2 1.00 1.69 27 T -1 -2 -2 -2 -4 -1 -2 -2 -4 -1 -2 -2 0 -2 -2 -1 6 -5 -1 2 4 2 2 2 0 2 2 2 0 3 3 3 2 2 2 2 52 0 2 13 0.80 1.71 28 K 1 1 -2 1 -1 0 0 -3 -1 -3 -1 1 -1 -2 4 0 -2 -5 -2 -3 13 9 2 9 1 4 6 2 1 2 6 9 2 2 22 6 3 0 1 2 0.36 1.74 29 F -4 -3 -5 -5 -4 -4 -5 -4 -4 -2 -1 -3 -1 8 -2 -4 -4 8 1 -3 1 2 0 1 0 0 1 2 0 2 3 2 1 60 2 1 1 18 2 2 1.73 1.56 30 E 0 -2 0 3 -3 1 5 -3 -2 -3 -4 0 -2 -3 -3 0 -1 -5 -2 -3 9 2 4 14 1 5 38 2 1 1 2 6 1 1 1 8 3 0 1 1 0.61 1.60 31 D 0 -1 1 5 -3 1 3 -2 -1 -5 -4 1 -3 -2 -3 -1 -2 -5 -3 -4 6 2 5 36 1 5 18 2 1 0 2 8 1 2 1 5 2 0 1 1 0.70 1.65 32 L -3 -5 -6 -6 -4 -2 -3 -6 -5 3 5 -4 0 0 -3 -5 -3 -5 -1 2 1 0 0 0 0 2 2 0 0 15 58 1 1 3 1 0 1 0 2 12 0.99 1.68 33 P -2 -2 -3 -1 -6 -2 -3 -2 -5 -5 -4 -2 -5 -4 8 -2 -2 -6 -6 -4 3 2 1 4 0 2 1 3 0 0 1 2 0 1 74 3 2 0 0 1 1.95 1.69 34 D 0 -3 0 6 -3 -2 4 -2 -2 -3 -4 -2 -2 -5 -2 -1 -3 -6 -5 -3 7 1 3 40 1 1 30 3 1 1 2 2 1 0 2 3 1 0 0 1 0.93 1.59 35 D -3 -3 2 6 -3 -2 0 -2 0 -4 -5 -3 -3 -3 -4 1 0 -3 -1 -4 1 1 9 51 1 1 5 3 2 1 1 1 1 1 0 11 5 0 2 1 0.99 1.53 36 W -5 -3 -5 -6 -5 -4 -5 -5 -4 -3 -3 -5 -4 4 -5 -5 -5 11 5 -4 1 1 0 0 0 0 0 0 0 1 2 0 0 14 0 0 0 61 16 0 2.64 1.52 37 V -1 3 -2 -4 2 -1 -2 -3 0 1 -1 1 -1 -1 -3 -1 2 -5 -3 3 4 15 2 1 5 2 2 2 3 7 6 8 1 3 1 4 11 0 1 24 0.34 1.58 38 C -3 -3 -6 -7 11 -6 -7 -6 -6 -4 -4 -6 -5 -5 -6 -2 -4 -5 -2 -4 0 2 0 0 95 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 2 0 3.32 1.63 39 P -3 -4 -4 -4 -6 -3 -4 -4 -3 -6 -5 -4 -5 -6 8 -2 -3 -7 -4 -5 1 1 1 0 0 1 0 1 1 0 1 0 0 0 91 3 1 0 1 1 2.66 1.54 40 L -2 -2 -1 2 -5 0 1 -4 -1 2 1 -3 -1 -3 -4 -3 0 -2 -3 4 2 2 2 14 0 5 11 1 1 12 13 1 1 0 0 1 5 1 0 26 0.41 1.54 41 C -3 -2 -5 -6 11 -6 -6 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -6 -1 -4 -5 -5 -4 0 3 0 0 94 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 3.24 1.54 42 G -1 0 0 1 -4 -2 -1 6 -1 -5 -5 1 -3 -3 -4 -1 -3 -3 -4 -5 3 5 4 7 0 1 3 56 2 0 1 8 1 1 0 5 1 0 0 0 0.93 1.57 43 A 5 -3 -3 -4 -1 0 0 -2 2 -2 -2 -3 -1 -3 -4 0 -2 -6 -3 3 45 1 1 0 1 3 7 3 5 1 3 1 1 1 0 5 1 0 0 19 0.62 1.59 44 P 1 1 -2 1 -3 -3 -1 3 -4 -6 -5 -1 -3 -6 5 1 -1 -2 -4 -4 11 8 2 7 0 0 5 22 0 0 1 3 0 0 25 10 4 1 0 0 0.63 1.60 45 K 0 1 -3 -4 -6 0 -2 -4 -2 -3 -5 7 -3 -6 -2 -3 -3 -6 -4 -3 8 4 1 0 0 3 0 1 1 1 1 77 1 0 2 1 1 0 0 1 1.45 1.60 46 S 0 -1 0 3 -4 -1 3 -2 -1 -3 -3 0 -3 -4 -2 3 0 -2 -4 -2 8 3 4 19 0 1 17 2 1 2 2 5 0 0 2 24 4 1 0 3 0.45 1.62 47 E 0 1 0 4 -2 2 1 -3 0 -4 -2 1 1 -1 -5 -1 -2 -3 -1 -1 7 6 4 27 1 11 8 1 3 1 3 8 4 3 0 4 1 0 2 5 0.41 1.64 48 F -5 -6 -6 -7 -6 -4 -6 -6 -2 -2 -2 -6 -2 9 -7 -5 -5 -1 1 -4 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 2 0 1 92 0 0 0 1 2 0 2.45 1.61 49 E -1 1 -2 0 -5 0 5 -5 -3 1 -3 2 2 -4 -5 -1 -2 -3 -3 1 4 6 1 4 0 3 35 0 0 8 1 14 5 1 0 5 2 0 1 8 0.54 1.61 50 R -1 0 0 -2 -5 -1 2 -5 -3 -3 -1 3 4 -4 5 -2 -3 -2 -4 0 4 6 4 2 0 2 13 0 0 1 6 17 11 0 24 2 1 1 0 6 0.59 1.60 51 I -3 -4 -6 -5 -3 -3 -3 -6 -4 4 2 -4 3 -2 -5 -4 -2 -4 3 4 1 1 0 0 0 1 1 0 0 27 20 0 8 1 0 0 2 0 10 27 0.83 1.58 52 E -4 -3 -3 4 -6 2 6 -5 -3 -6 -6 2 -5 -6 -4 -3 -4 -6 -5 -5 0 0 0 19 0 6 65 0 0 0 0 10 0 0 0 0 0 0 0 0 1.46 1.40 K Lambda Standard Ungapped 0.1438 0.3161 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1843 0.3183 PSI Gapped 0.0564 0.2670