JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_M9iMbkv.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E|E|E|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|||||||||||||||||||E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 8|7|2|1|3|6|7|8|8|4|0|2|9|9|8|8|8|9|9|9|6|4|8|8|8|0|5|8|8|8|8|8|9|9|2|3|6|8|8|7|3|4|6|4|2|1|5|3|2|1|0|3|2|1|2|8|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|0|3|6|8|8|8|7|5|1|6|7|7|6|1|5|7|7|7|7|7|7|7|7|6|3|0|2|8|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|0|4|6|7|7|7|7|7|0|3|6|8|8|8|7|0|4|5|7|0|3|0|3|7|7|7|1|2|7|8|9|9|9|9|8|7|4|4|8|7|1|1|2|1|5|2|2|2|1|2|4|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|4|4|7|8|7|0|1|5|5|8|8|9|9|8|8|6|0|3|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|8|8|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|-|-|B|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|B|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles ||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E|E|E||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|||||||||||||||||||E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles |||E|||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E|E|E|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E|E|E|E|E||||E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | |*| | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | |*|*| | | | | | | | |*|*| |*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | |*| | | | | | | |*| | | | | | |*|*| | |*| |*| | | | |*| | | | | | | | | | | | | |*| | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |