Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 L -4 -5 -6 -7 -4 -5 -6 -7 -6 3 6 -5 1 2 -6 -5 -4 -4 -3 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13 76 0 2 8 0 0 0 0 0 0 1.33 1.27 2 F -5 -5 -6 -7 -5 -5 -6 -6 -5 0 5 -3 1 6 -6 -5 -4 -3 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 51 2 3 38 0 0 0 0 0 5 1.27 1.33 3 D -4 -4 3 7 -6 -2 -1 1 -4 -6 -5 -2 -6 -6 -5 -1 -3 -7 -6 -6 0 0 13 66 0 1 2 10 0 0 1 1 0 0 0 4 1 0 0 0 1.46 1.40 4 E -1 -3 1 2 -5 4 0 0 -4 -5 -5 0 -1 -6 -4 4 1 -6 -5 -3 4 0 7 13 0 17 6 8 0 0 0 5 2 0 0 28 9 0 0 2 0.58 1.44 5 V 2 -5 -6 -4 -4 -5 -5 -4 -6 4 3 -5 3 -2 -5 -4 -4 -5 -4 4 16 0 0 1 0 0 0 1 0 19 30 0 6 1 0 0 0 0 0 25 0.81 1.47 6 V 2 -4 -5 -5 -4 -3 -2 -1 -5 1 3 -3 4 -3 -4 -1 1 -5 -4 2 16 1 0 0 0 1 2 6 0 6 28 1 11 1 1 4 8 0 0 16 0.48 1.49 7 G -1 -3 2 -2 -5 -4 -4 6 -4 -6 -6 -3 -5 -6 -5 2 -1 -6 -6 -6 4 1 10 1 0 0 0 61 0 0 0 1 0 0 0 18 3 0 0 0 1.27 1.52 8 A 4 -2 0 -2 -4 2 -4 1 -4 -2 -1 -1 4 -5 -4 3 -2 -6 -5 -2 34 2 4 2 0 9 0 8 0 2 6 3 10 0 0 18 2 0 0 2 0.55 1.55 9 F 2 -4 -3 -3 -4 -5 -5 -3 -5 0 4 -3 2 1 -5 -2 -2 -5 -4 3 17 1 1 2 0 0 0 2 0 3 38 1 4 5 0 3 1 0 0 22 0.61 1.54 10 L 1 -3 -2 -3 -5 -1 -2 3 -5 0 2 -3 3 -1 -3 0 -1 -5 -4 0 10 2 2 1 0 3 3 25 0 5 20 1 7 3 1 6 4 0 0 5 0.32 1.54 11 K 0 -3 3 -1 -5 0 -2 5 -4 -5 -6 -1 -5 -6 -4 2 -3 -6 -5 -2 7 1 11 3 0 5 2 43 0 0 0 4 0 0 1 14 1 0 0 3 0.74 1.54 12 G 0 -4 0 1 -5 1 -1 6 -2 -5 -3 -1 -5 -6 -3 -1 -1 -6 -5 -3 6 0 5 8 0 6 4 49 1 0 3 3 0 0 1 4 5 0 0 2 0.75 1.55 13 D -1 -2 3 3 -5 3 0 0 -4 -3 1 1 -1 -3 -3 0 -2 -5 -4 -2 5 2 12 14 0 15 5 6 0 1 13 8 2 1 1 6 3 0 0 3 0.25 1.52 14 A 3 -3 1 -4 -4 0 -1 2 2 -2 -3 -2 -1 -4 0 3 -1 -6 -5 -4 24 1 8 0 0 5 5 14 5 2 3 2 2 1 4 19 2 0 0 0 0.36 1.56 15 G 2 -2 0 0 -5 3 0 4 -4 -5 -4 -2 -2 -6 0 1 -3 -6 -5 -2 14 2 5 5 0 12 6 32 0 0 1 2 1 0 4 9 1 0 0 3 0.49 1.57 16 K 1 -3 -1 0 -5 2 -2 -1 -3 -1 2 2 1 -4 -1 -1 -2 -5 -5 -1 12 0 3 5 0 11 2 4 0 3 23 15 4 0 3 4 2 0 0 4 0.24 1.55 17 Y -2 -3 -3 -3 -4 -3 -2 -5 -3 2 4 -3 3 0 0 -3 -2 -4 1 2 3 1 1 2 0 1 3 1 1 13 36 1 7 4 4 1 2 0 4 11 0.46 1.56 18 Q 1 -3 0 0 -5 5 -1 0 2 -4 -3 -1 -1 -5 2 2 -1 -5 -4 -3 11 1 4 5 0 26 3 7 4 1 3 3 2 0 8 15 4 0 0 2 0.41 1.54 19 A 3 -4 0 -2 -4 -1 -2 1 0 -1 0 -2 1 -4 -2 1 0 -5 -4 0 29 0 4 2 0 3 2 11 2 3 10 2 3 0 1 11 6 0 0 6 0.27 1.48 20 I 2 -3 -5 -4 -4 -1 -3 -1 -3 3 2 -4 1 -3 -5 -2 -3 -5 0 4 16 1 0 1 0 3 1 4 1 15 16 0 3 1 0 3 0 0 3 28 0.44 1.47 21 L 0 -4 -2 -5 -4 -1 -5 -2 -5 2 4 -2 4 1 -2 -3 -2 0 -4 0 7 1 2 0 0 3 0 4 0 10 36 2 10 7 3 2 2 1 0 6 0.44 1.49 22 S 2 -3 0 1 -5 3 1 3 -1 -5 -4 -1 -1 -5 -2 2 -1 -5 -5 -3 15 1 4 8 0 11 9 19 1 0 1 2 1 0 1 18 3 0 0 1 0.39 1.49 23 W -2 -3 -2 -2 -5 0 -1 0 -2 -1 2 -2 4 0 -5 -1 -2 8 2 -3 3 1 2 2 0 4 4 8 1 3 22 2 10 3 0 4 3 19 6 1 0.59 1.46 24 V -1 -3 -4 -5 -4 -2 -3 -3 -5 4 3 -4 3 1 -5 -4 -3 -4 -1 3 5 1 1 0 0 2 2 2 0 21 29 0 6 6 0 0 1 0 2 19 0.59 1.44 25 E -2 -1 2 0 -5 3 3 1 -3 -3 1 0 -1 -2 -3 1 -1 -5 -4 -3 3 2 11 5 0 12 20 9 0 1 13 5 1 2 1 9 4 0 0 2 0.28 1.40 26 E -2 1 0 2 -5 4 1 1 2 -5 -3 2 -2 -5 -4 0 -1 -5 -1 -3 2 8 5 9 0 19 10 11 5 0 2 11 1 0 0 8 3 0 2 2 0.38 1.40 27 Q 0 -1 3 -1 -2 5 -1 0 3 -5 -4 -2 -2 -4 3 0 -1 -5 -1 -3 8 2 13 3 1 24 3 7 6 0 1 1 1 1 13 8 3 0 3 1 0.49 1.38 28 G -1 -3 -1 -1 -5 0 -1 7 -4 -4 -4 -3 -5 -5 -3 -1 -2 -5 -3 -5 4 1 2 4 0 5 3 69 0 1 1 1 0 0 1 4 2 0 1 0 1.23 1.35 29 G -3 -5 -1 -1 -5 -1 -4 7 -4 -6 -4 -4 -2 -5 -2 -2 -2 -5 -5 -5 0 0 2 3 0 3 0 81 0 0 2 0 1 0 2 2 3 0 0 0 1.57 1.34 30 I -3 -2 -5 -6 -2 -3 -3 -1 -5 3 4 -4 1 2 -3 -5 -4 -1 -2 1 1 2 0 0 1 1 1 5 0 16 45 1 3 7 2 0 0 1 1 10 0.63 1.40 31 Q 0 1 1 0 -5 3 1 3 -1 -5 -4 -1 -2 -5 -1 1 -2 -5 -5 -4 7 6 5 5 0 15 7 23 2 0 1 3 1 0 3 12 2 0 0 1 0.35 1.38 32 V 1 -4 0 1 2 -2 0 4 0 -5 -2 -3 -2 -5 -2 -1 -1 -5 -5 -3 12 0 4 7 4 1 8 36 2 0 4 1 1 0 2 3 4 0 0 2 0.43 1.38 33 L 0 -5 -5 -6 2 0 -5 -3 -5 2 4 -5 1 0 -5 -4 -2 -5 -4 2 8 0 0 0 4 4 0 2 0 12 42 0 2 4 0 0 2 0 0 12 0.54 1.28 34 L 0 -1 -5 -5 -4 0 -5 -2 -1 2 3 -4 1 -1 -5 -4 -1 2 -4 3 7 3 0 0 0 4 0 3 2 10 32 0 3 2 0 0 3 3 0 20 0.40 1.31 35 E 0 -1 0 3 -5 3 2 0 0 -5 -3 1 -4 -6 -4 1 -1 -6 -5 -5 7 3 4 14 0 15 14 6 2 0 2 10 0 0 0 9 4 0 0 0 0.34 1.31 36 K -2 2 0 -1 -5 3 -1 -2 1 -2 -3 4 1 -5 -2 -1 0 -5 -4 -2 3 12 5 2 0 13 2 3 3 3 3 26 4 0 2 4 6 0 0 3 0.32 1.30 37 L 0 -5 -5 -5 3 -5 -5 -5 -4 1 3 -5 3 5 -5 -4 -3 -3 -2 0 10 0 0 0 6 0 0 0 0 8 23 0 7 28 0 0 0 0 0 7 0.60 1.06 38 Q 0 1 1 1 -5 2 1 0 3 -5 -1 1 -4 -5 -4 0 1 -5 -4 -4 8 8 8 8 0 8 8 8 8 0 8 8 0 0 0 8 8 0 0 0 0.19 1.33 39 S 0 2 3 0 -5 5 1 0 0 -4 -4 1 -2 -6 -4 0 -1 -5 -5 -5 7 10 12 6 0 28 8 6 2 1 1 8 1 0 0 7 3 0 0 0 0.52 1.27 40 G 3 -3 3 -3 -4 1 -1 3 0 -3 -4 -1 0 -5 -4 1 -1 -5 -4 -1 23 1 14 0 0 5 3 21 3 1 1 3 2 0 0 11 2 0 0 4 0.41 1.22 41 G -2 -3 -2 0 -5 -3 -3 7 -5 -7 -6 -4 -5 -6 -5 -2 -4 -5 -6 -6 1 2 1 5 0 1 1 85 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1.70 1.27 42 L -2 -3 -3 -6 -1 -1 -5 -6 4 -1 5 -5 2 1 -5 -3 -4 -4 1 -1 3 1 1 0 1 3 0 0 9 1 61 0 5 5 0 1 0 0 4 3 0.86 1.25 43 G 1 -2 -2 0 -5 -1 1 6 -1 -5 -5 -2 -3 -6 0 -1 0 -5 -5 -3 9 2 1 5 0 2 9 52 1 0 0 1 1 0 4 4 5 0 0 1 0.80 1.24 44 A 2 -2 1 5 -5 0 3 0 0 -5 -6 -2 -5 -6 -2 0 -2 -6 -5 -5 19 1 7 28 0 3 23 5 2 0 0 2 0 0 2 7 1 0 0 0 0.67 1.20 45 I 1 -1 -3 -4 -4 5 0 -4 2 2 -1 1 0 -4 -4 -3 0 -5 -3 1 12 3 0 0 0 24 4 0 6 15 6 8 2 0 0 0 5 0 0 12 0.42 1.14 46 L 2 -4 -5 -5 -3 -4 -4 -4 -5 1 1 -3 1 1 -4 -3 -2 0 -2 5 20 0 0 0 0 0 0 0 0 7 13 1 3 5 0 0 2 1 1 44 0.69 1.14 47 S 0 2 2 2 -5 4 1 0 1 -5 -5 1 -4 -5 -4 2 -1 -5 -4 -4 9 11 8 12 0 18 7 6 4 0 0 8 0 0 0 13 3 0 0 0 0.44 1.14 48 T -1 -1 0 0 -1 0 -1 -1 -3 -5 -5 0 -4 -5 -3 6 1 -5 -4 -4 3 2 2 4 1 4 3 3 0 0 0 5 0 0 0 65 5 0 0 0 0.91 1.14 49 W -5 -2 -6 -6 -5 -4 -5 -5 -4 -5 -4 -5 1 -2 -6 -5 -5 13 0 -5 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 88 0 0 3.45 1.14 50 L -1 -1 -4 -5 -3 -2 -4 -3 -4 4 2 -4 1 -1 -4 -3 0 -4 -3 4 3 4 0 0 0 2 1 2 0 20 20 0 4 2 0 1 6 0 0 34 0.60 1.10 51 S -1 -1 -1 1 -4 0 -1 4 -3 -5 -5 -1 0 -5 0 3 -2 -5 -4 -4 4 3 2 8 0 5 4 37 0 0 1 3 3 0 5 23 2 0 0 0 0.60 1.11 52 N -1 -1 4 -1 -2 -2 -1 0 1 -3 -3 -1 -4 -5 3 0 3 -5 -4 -3 6 3 19 4 1 1 4 8 4 1 2 4 0 0 14 6 23 0 0 2 0.44 1.11 53 Q -2 -1 0 0 -5 3 -2 6 2 -3 -5 -2 -4 -5 -3 -1 -2 -5 -4 -5 2 3 5 4 0 14 2 54 5 2 0 2 0 0 1 3 2 0 0 0 0.91 1.14 54 Q 0 -1 -1 -1 -3 4 3 1 -1 -3 -2 -1 -1 -3 0 0 -1 -3 -3 -1 8 2 3 3 1 17 20 12 1 1 5 3 1 1 5 5 4 0 1 5 0.29 1.03 55 R 1 -1 1 2 -3 -1 0 -1 0 -3 -2 -1 -3 -3 4 1 -1 -4 -3 -1 14 3 6 10 0 2 6 5 3 1 4 4 0 1 20 10 4 0 1 5 0.31 1.13 56 N -2 -1 8 0 -5 -1 -2 -3 -2 -5 -4 -3 -4 -5 -2 -1 -1 -6 -4 -5 2 2 76 3 0 2 1 0 0 0 1 0 0 0 2 3 3 0 0 0 1.60 1.36 57 Q 0 2 -1 -1 -5 5 0 -3 1 -3 1 1 -1 -5 -1 -2 -1 -5 -4 -2 7 9 3 3 0 30 5 2 4 1 17 7 1 0 3 2 4 0 0 3 0.47 1.42 58 S 0 -3 0 0 -5 -1 1 -2 -2 -3 -3 -2 -5 -6 7 1 -1 -6 -5 -2 9 1 4 5 0 3 9 3 1 1 2 2 0 0 45 9 3 0 0 3 0.94 1.43 59 V -1 -5 -3 -6 -4 -5 -5 -6 -6 6 1 -5 3 -1 -3 -4 -2 -5 -4 4 5 0 1 0 0 0 0 0 0 41 13 0 6 2 2 0 2 0 0 28 0.95 1.35 60 S 1 -2 1 2 -5 0 0 -1 -1 -5 -4 -3 -4 -6 2 4 2 -6 -5 -3 9 1 5 13 0 4 6 5 1 0 1 0 0 0 8 33 12 0 0 1 0.54 1.38 61 G 3 -2 -2 -1 -5 0 0 0 -2 -3 -4 -2 -2 -6 6 -1 -1 -6 -5 -2 26 2 2 3 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