JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_iIbvWaE.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|E||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 8|8|4|1|4|6|7|7|7|7|7|7|4|0|8|8|8|8|8|4|3|6|7|7|7|7|6|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|1|6|6|8|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|0|4|7|8|7|3|1|8|8|9|8|6|4|8|8|6|1|7|8|8|8|1|3|6|7|7|7|7|6|0|3|3|4|2|4|7|8|5|0|8|9|8|8|7|5|1|1|4|4|2|4|1|3|5|2|6|8|8|5|4|7|6|2|1|1|2|1|0|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|7|5|2|6|7|8|7|6|5|0|5|7|7|6|0|3|4|7|7|7|7|8|7|6|6|2|7|8|9|9|9|9|9|9|7|1|2|6|7|5|1|3|3|2|1|5|7|7|7|5|2|1|3|3|9|9|9|9|9|9|9|8|7|2|0|8|8|8|4|1|2|7|5|3|6|7|7|6|3|3|3|6|7|7|7|7|4|1|2|5|7|7|5|0|1|5|5|7|6|6|5|3|4|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|B|B|B|-|-|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|B|-|-|-|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|B|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|B|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|B|-|-|B|-|-|B|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|B|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|B|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles ||||||||||||||E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles |||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E||||||||||E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|||H|H|H|H|E|E|E||||||E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|||||||E|||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | |*|*| | | | | | | |*| | | | | | | | |*|*|*|*| | | |*| | | | | | | | |*|*| | |*| | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | |*|*|*| | | | | | |*|*|*|*| | | | | | | | | | |*| | | | |*|*| | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | |