Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 G -2 -5 -3 -4 -5 -5 -5 7 -5 -7 -7 -4 -6 -6 -5 -3 -4 -5 -6 -6 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.26 1.31 2 R -4 8 -3 -5 -7 -2 -3 -5 1 -6 -5 -1 -4 -6 -5 -4 -4 -6 -5 -6 0 97 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.31 1.49 3 R -4 7 -4 -5 -4 -2 -3 -6 -2 -2 -1 -1 -1 0 -5 -2 -3 5 2 -2 0 62 0 0 0 1 0 0 1 2 6 2 1 4 0 3 1 8 6 2 1.29 1.57 4 I -1 -4 -3 -4 -2 -2 -4 -5 -5 4 -1 -3 1 -2 -5 0 3 -6 -3 4 4 1 1 1 1 2 0 1 0 24 5 1 4 2 0 7 20 0 1 27 0.64 1.56 5 C -3 -6 -3 -4 11 -5 -6 -5 5 -4 -4 -5 -4 -5 -6 -2 -4 -5 -4 -4 1 0 1 1 80 0 0 0 14 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 2.77 1.53 6 R 0 3 -2 -1 -5 -1 0 -1 -2 -3 -2 2 -3 -6 4 1 -1 -6 -5 -2 8 19 2 3 0 2 6 5 1 1 5 10 1 0 23 10 3 0 0 3 0.50 1.59 7 N 1 -1 3 1 -3 0 -1 0 -1 -4 -5 3 -4 -6 -1 2 0 -6 -3 -1 12 2 15 9 0 5 3 8 1 1 1 16 0 0 2 16 4 0 1 4 0.37 1.60 8 C -3 -4 -3 -3 11 -4 -4 -4 -3 -5 -5 -5 -5 -6 -4 2 -3 -6 -5 -4 1 1 1 2 76 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 15 1 0 0 0 2.50 1.59 9 G -2 -4 0 -3 -2 -2 -4 7 -2 -7 -5 -1 -6 -6 -5 -1 -3 -6 -6 -6 1 1 4 1 1 2 1 81 1 0 1 4 0 0 0 3 1 0 0 0 1.68 1.59 10 A 3 4 -2 -3 -3 -1 2 -2 3 -5 -3 1 -1 -3 -4 0 1 -5 -4 -3 28 21 2 1 1 2 12 2 6 0 2 6 1 1 0 5 8 0 0 2 0.51 1.53 11 T -2 -4 -1 -2 -2 -3 -4 0 -3 3 -2 -4 0 -4 -1 2 3 -5 -4 3 2 0 3 2 1 1 0 9 1 15 3 0 3 0 3 15 19 0 0 24 0.49 1.53 12 Y -4 -3 -5 -6 0 -3 -5 -6 0 -4 -4 -5 -4 3 -6 -3 -4 2 9 -4 0 1 0 0 2 1 0 0 2 0 0 0 0 11 0 2 0 2 76 0 2.13 1.53 13 H -4 -2 5 -3 -5 -1 -3 -3 10 -6 -5 -3 0 -4 -5 -2 -4 -5 -2 -6 0 2 28 0 0 2 0 2 61 0 0 0 2 0 0 2 0 0 0 0 1.98 1.53 14 L -2 -1 -3 2 -4 -3 -2 -3 -5 4 1 -1 0 -4 -5 -3 0 -5 -3 3 2 4 1 10 0 1 2 2 0 24 14 5 2 0 0 1 7 0 1 23 0.47 1.52 15 I -2 -2 -2 1 -5 0 3 -3 0 1 -1 1 -1 -1 -4 -1 1 -4 2 1 2 2 1 6 0 4 19 2 2 8 6 8 2 2 1 5 10 0 8 11 0.24 1.53 16 F -2 -3 0 -3 -5 -3 -4 -4 1 -4 -2 -4 -1 6 -5 -1 2 -1 5 -2 3 1 6 2 0 1 1 1 3 0 3 1 1 38 0 5 13 1 20 2 0.95 1.57 17 H -2 1 5 2 -2 0 -1 -4 1 -3 -1 3 1 -3 -5 0 0 -6 -3 -4 3 6 25 9 1 3 3 0 4 2 6 17 3 1 0 7 7 0 1 1 0.47 1.57 18 P 0 -1 -3 -3 -5 -1 -3 -4 -3 -4 -4 2 -2 -6 7 -2 -2 -6 -5 -4 7 4 1 1 0 3 1 1 1 1 1 11 1 0 60 2 2 0 0 1 1.47 1.57 19 P -3 -5 -5 -1 -6 -3 -3 -3 -3 -4 -3 -4 -5 -4 8 -1 0 -2 -3 -4 1 0 0 3 0 1 1 2 1 1 2 0 0 1 75 5 5 1 1 1 1.96 1.58 20 A 1 1 -3 -3 -6 0 0 -4 -2 -3 -1 6 -2 -6 -1 -2 -2 -6 -4 -3 10 6 1 1 0 3 4 1 1 2 5 57 1 0 4 2 2 0 0 1 0.93 1.58 21 K -1 0 -1 -2 -5 1 1 -2 -1 0 -2 2 -2 -4 -4 -2 0 -6 -5 4 6 4 3 1 0 6 10 3 1 4 3 14 0 1 1 2 6 0 0 36 0.45 1.57 22 P 1 -3 -1 3 -5 -1 5 -1 -1 -2 -4 -1 -3 -4 2 -2 -2 -2 -3 -1 11 1 2 17 0 1 34 4 2 2 1 3 1 1 12 2 1 1 1 4 0.61 1.53 23 G -2 -4 0 2 -3 -3 -1 6 -3 -5 -4 -3 0 -5 -4 -2 -3 -1 -5 -5 2 1 5 11 0 1 4 64 0 1 2 1 2 0 1 1 2 1 0 1 1.18 1.53 24 V -3 0 -3 -5 -2 -2 -3 -5 -1 4 -1 3 0 -2 -5 -2 1 -5 -2 4 1 4 1 0 1 1 1 0 2 20 4 20 2 2 0 2 8 0 1 32 0.63 1.55 25 C -2 -6 -5 3 11 -5 -5 -5 -6 -5 -5 -6 -5 -6 -6 -4 -4 -6 -6 -4 2 0 0 17 82 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.84 1.59 26 D -3 -3 -1 8 -6 -2 1 -4 -4 -6 -6 -2 -6 -7 0 -3 -3 -7 -6 -4 1 1 2 79 0 1 6 1 0 0 0 1 0 0 5 1 1 0 0 1 1.80 1.58 27 K -1 2 1 0 -3 -1 0 -5 -1 1 0 4 -2 -2 -4 -1 -2 -6 -2 2 4 9 6 5 0 2 6 0 2 7 8 22 1 2 0 5 1 0 1 18 0.31 1.61 28 C -3 -6 -4 1 10 -5 -4 -3 -6 -3 -5 -5 -4 -6 -5 -3 3 -6 -6 -3 0 0 0 10 69 0 1 2 0 1 0 0 0 0 0 1 16 0 0 1 2.26 1.57 29 G -3 -4 0 -2 -4 0 -4 7 -2 -7 -6 -1 -6 -6 -5 -1 -4 -6 -6 -6 1 1 5 1 0 4 1 79 1 0 0 3 0 0 0 3 1 0 0 0 1.63 1.55 30 G 0 -4 -2 -1 -2 -2 3 5 0 -4 -6 -2 -5 -5 -5 2 0 -6 -5 -3 8 0 2 2 1 1 18 41 2 1 0 1 0 0 0 15 7 0 0 1 0.78 1.55 31 E -1 -2 -2 1 -6 -1 5 -3 0 -4 -5 1 -3 -5 3 -1 1 -6 -4 -3 5 2 1 9 0 2 34 2 2 1 1 10 0 0 17 3 10 0 0 1 0.67 1.57 32 L -4 -5 -4 -2 -5 -4 -1 -7 -3 -1 6 -4 2 0 -6 -4 -3 -5 -4 -1 0 0 1 2 0 0 5 0 1 1 77 0 3 3 0 0 1 0 0 3 1.22 1.56 33 Y -4 -4 -4 -5 -3 -4 -3 -6 -1 5 -2 -4 1 3 -6 -3 -1 -3 5 3 0 1 0 0 0 1 2 0 1 29 2 1 3 12 0 1 3 0 22 20 0.88 1.56 34 Q -3 0 -3 -4 -4 7 -2 -5 1 0 -2 2 -2 -5 -4 -2 0 -3 -4 -2 1 3 0 0 0 62 0 0 3 5 3 9 1 0 0 1 7 0 0 3 1.25 1.57 35 R -4 8 -3 -5 -7 -2 -3 -5 -3 -6 -5 0 -4 -6 -5 -4 -4 -6 -5 -6 0 98 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 2.35 1.52 K Lambda Standard Ungapped 0.1500 0.3291 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1995 0.3185 PSI Gapped 0.0611 0.2670