Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 E -2 4 -1 -2 -5 0 0 -3 4 -4 -4 5 -3 -4 -3 -2 -2 -4 -2 -4 0 25 0 0 0 0 3 0 13 0 0 59 0 0 0 0 0 0 0 0 0.95 0.51 2 M -1 -3 -3 -4 -3 0 -3 -2 -3 -1 0 -3 7 3 -2 0 1 4 -1 -1 4 0 0 0 0 4 0 3 0 0 1 0 48 15 2 6 8 6 0 3 0.77 0.70 3 R -2 4 0 -1 -5 1 -2 -4 4 -2 0 4 -2 -4 -4 -2 -3 -4 0 -4 2 25 3 4 0 7 0 0 10 1 11 34 0 0 0 0 0 0 3 0 0.64 0.78 4 M -3 -5 -5 -6 -4 -4 -5 -6 -5 5 4 -5 6 -2 -5 -4 -3 -4 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39 36 0 25 0 0 0 0 0 0 0 1.17 1.00 5 K -3 7 -2 -4 -2 1 -2 -4 0 -5 -2 2 1 -4 -4 -2 -3 -4 0 -4 0 69 1 0 1 5 0 0 2 0 3 11 4 0 0 1 0 0 4 0 1.28 1.00 6 K -3 4 -3 -4 -1 -2 -2 -4 -1 -1 -3 6 -3 -1 -4 -3 -3 -4 3 0 0 22 0 0 1 0 0 0 1 3 1 51 0 2 0 0 0 0 10 9 0.92 1.04 7 C -3 -6 -5 -6 11 -5 -6 -5 -4 -4 -4 -5 -4 -4 -5 -3 -3 -4 2 -3 0 0 0 0 91 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0 2.80 1.05 8 P -1 1 -2 -2 -2 -1 1 -2 -4 -3 -3 1 0 -5 5 2 0 -5 -4 -2 4 8 1 2 1 1 9 2 0 1 2 9 3 0 32 16 6 0 0 3 0.62 1.11 9 K 1 2 2 1 -4 1 1 -2 -1 -3 -4 3 -4 -3 -2 1 -1 -5 -4 0 12 10 12 6 0 5 8 1 1 1 0 20 0 1 1 12 2 0 0 9 0.35 1.11 10 C -3 -5 -3 4 10 -4 -3 -5 -1 -4 -4 -5 -4 -5 -5 -3 -3 2 -5 -4 0 0 0 30 66 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 2.14 1.11 11 G -1 2 3 -2 -3 0 -1 4 2 -6 -5 2 -3 -4 -3 -1 -3 -2 -2 -5 3 13 13 2 1 4 3 36 4 0 0 15 1 1 1 3 0 1 1 0 0.67 1.16 12 L -2 3 -3 -3 -4 -1 0 -4 -2 2 -2 0 -1 -4 -5 -2 0 -2 -4 5 2 15 1 1 0 2 6 1 1 11 2 6 1 0 0 2 7 1 0 42 0.58 1.26 13 Y -4 -4 -5 -6 -5 -4 -5 -6 -1 -4 -4 -4 -4 1 -6 -4 -4 0 9 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 2.66 1.24 14 T -1 -4 -3 -4 -3 -3 -3 -2 -4 -3 -4 -3 -3 -5 -4 1 7 -5 -4 -3 2 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 7 88 0 0 0 1.63 1.24 15 L -4 -5 -3 -6 -4 -5 -5 -6 -5 1 6 -5 3 1 -5 -5 0 -4 -3 -2 0 0 1 0 0 0 0 0 0 6 78 0 5 4 0 0 5 0 0 0 1.25 1.24 16 K -1 1 -1 -2 -5 1 0 -2 -1 -5 -4 6 -4 -2 -4 0 -2 -5 -3 -5 3 7 3 1 0 5 5 3 1 0 1 57 0 2 0 8 2 0 1 0 0.95 1.46 17 E -2 -1 1 4 -6 0 3 -3 -1 -3 -3 5 -2 -4 -2 -1 -1 -6 -5 -5 3 1 5 20 0 2 16 2 1 1 2 36 1 1 2 3 4 0 0 0 0.72 1.46 18 I -1 0 -2 -2 -1 -1 0 -5 0 2 -1 2 -1 0 -5 -1 2 -5 -1 3 3 6 1 2 1 2 5 0 3 12 5 12 1 4 0 4 16 0 2 21 0.32 1.48 19 C 0 -4 -1 2 9 -4 -4 -1 -4 -4 -2 -4 -4 -4 -4 0 0 -4 -4 -2 6 0 3 11 53 0 1 5 0 0 4 0 0 0 0 7 7 0 0 2 1.46 1.36 20 P -2 -3 -2 0 -5 -1 -1 -4 -1 -3 -4 -1 -4 -5 8 -1 -1 -5 -5 -4 2 1 1 5 0 2 4 0 1 1 1 3 0 0 68 3 4 0 0 0 1.69 1.39 21 K -1 0 1 2 -4 -1 2 -4 1 -1 -2 2 -1 -3 -4 0 -2 -4 1 1 6 5 8 11 0 2 15 0 4 4 3 13 1 1 0 7 2 0 6 11 0.25 1.39 22 C -1 -3 0 -1 9 -2 -2 -1 -1 -2 -2 -2 0 -2 -2 -1 -2 -2 -2 -2 4 2 6 3 52 1 2 4 2 2 4 2 2 1 2 5 2 0 1 2 1.29 0.99 23 G -3 -2 0 -1 -5 -2 -4 6 0 -6 -4 -1 -5 -6 -2 -1 -4 -6 -5 -6 0 2 5 3 0 2 0 75 3 0 2 3 0 0 2 3 0 0 0 0 1.46 1.49 24 E 1 -1 -2 -3 -1 1 3 3 -1 -3 -3 1 -1 -5 -4 0 -1 -6 -5 -1 12 3 2 0 1 5 20 26 2 1 2 10 1 0 0 7 3 0 0 4 0.46 1.49 25 K 0 -1 -2 0 -1 1 2 -3 0 -2 -5 2 -2 -2 5 -2 -2 -5 -1 -1 7 2 2 5 1 6 12 1 2 2 0 15 1 2 29 3 2 0 2 6 0.56 1.46 26 T 0 -4 -1 -4 2 -4 -4 -5 -5 -1 0 -4 -3 -5 -1 -1 6 -5 -5 0 7 0 2 0 4 0 0 0 0 2 8 0 0 0 2 3 66 0 0 5 1.14 1.49 27 V -2 2 -2 -2 0 1 2 -2 -1 1 0 2 0 0 -5 -1 -1 1 -1 2 2 10 1 1 2 7 15 3 1 7 8 11 2 5 0 4 3 2 2 13 0.21 1.49 28 I -2 -2 4 -2 -4 -2 -2 -2 -3 1 -2 -2 0 -3 -1 4 1 -5 -3 1 0 2 19 1 0 1 1 2 0 7 3 1 3 1 2 36 9 0 1 12 0.50 1.08 29 P 4 -4 -1 -4 -3 -3 -3 -3 -4 0 -4 -3 -3 -5 4 2 0 -5 -4 -1 45 0 2 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 24 14 5 0 0 4 0.85 1.08 30 K 2 -2 -1 -2 -5 -1 -3 -2 8 -1 -3 0 -4 -2 2 -2 -3 -4 1 -2 16 1 1 2 0 1 0 2 45 4 2 7 0 1 10 1 0 0 4 2 1.00 1.08 31 P -3 -4 -4 -4 -5 -3 -3 -4 -4 -5 -5 -3 -5 -6 8 1 -3 -6 -5 -5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 90 10 0 0 0 0 2.53 1.08 32 P 5 -4 -4 -4 -3 -1 -3 -2 -1 -4 -3 -3 -1 -5 4 -1 1 -5 -4 -1 54 0 0 0 0 2 0 2 1 0 2 0 2 0 23 1 10 0 0 3 0.93 1.08 33 K -3 6 -3 -3 -6 0 1 -4 -3 -5 -5 3 -4 -5 3 -3 -3 -5 -4 -5 0 53 0 0 0 2 10 0 0 0 0 20 0 0 15 0 0 0 0 0 1.24 1.08 34 F -3 -5 -5 -6 -5 -5 -5 -5 -3 -2 -1 -5 -2 8 -6 -4 -4 1 5 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 67 0 0 0 2 19 10 1.64 1.08 35 S -1 -1 0 1 -4 2 -2 -2 -3 -5 -5 -2 -4 -5 -3 6 -1 -5 -4 -4 0 2 3 7 0 10 0 2 0 0 0 0 0 0 0 75 1 0 0 0 1.14 1.08 36 L -3 -4 -4 -4 -5 -3 -3 -5 -4 -2 -2 -1 -4 -5 8 -3 -2 -6 -5 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 4 5 0 0 85 0 2 0 0 2 2.24 1.02 37 E -1 -2 -1 5 -5 0 5 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -5 -4 -1 -1 -5 -4 -2 5 1 2 30 0 3 41 3 1 1 2 2 1 0 0 2 4 0 0 3 0.80 1.02 38 D -4 -4 0 8 -6 -2 1 -4 -3 -6 -6 -3 -5 -6 -4 -2 -3 -7 -5 -5 0 0 2 93 0 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.00 1.02 39 R -2 3 -2 -3 -5 -1 -2 -4 -2 -5 -5 5 -4 -5 4 -2 0 -5 -4 -3 2 17 1 0 0 1 0 0 1 0 0 51 0 0 19 2 7 0 0 1 1.01 1.01 40 W -4 -4 -2 -5 -5 -4 -4 -5 2 -3 -2 -4 -1 4 -5 -3 -4 4 8 -1 0 0 2 0 0 0 0 0 5 0 2 0 1 15 0 1 0 6 63 5 1.58 1.01 41 G 0 -3 -3 -3 -4 3 -3 5 -4 -2 -4 -2 -1 -5 -4 3 -2 -1 -4 -1 6 1 0 0 0 15 0 42 0 3 1 1 1 0 0 24 0 1 0 6 0.73 1.01 42 K -2 4 -3 -2 -5 0 2 -4 -3 -2 -4 5 -2 -4 -4 -2 -3 -5 1 0 2 25 0 1 0 2 17 0 0 2 1 36 1 0 0 1 1 0 5 8 0.76 1.03 43 Y -4 -3 -3 -4 -5 1 -1 -5 4 -4 -3 -3 -3 1 -3 -4 -4 -1 8 -4 0 0 1 0 0 7 4 0 11 0 1 0 0 1 1 0 0 0 75 0 1.75 1.02 44 R -4 8 -3 -4 -6 -1 -2 -5 -2 -5 -4 0 -4 -5 -4 -3 -3 -5 -4 -5 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.01 0.95 45 R -3 5 -4 -4 -4 -2 -3 -5 -3 4 0 -1 -2 -2 -4 -3 -3 -2 1 2 1 42 0 0 0 0 0 0 0 28 7 1 0 1 0 0 1 1 5 14 0.81 0.93 46 M 2 1 -3 -2 -4 0 1 -4 -3 1 0 2 3 -3 -4 -1 2 -5 -4 -2 17 6 0 1 0 4 8 0 0 11 9 17 10 0 0 2 15 0 0 1 0.32 0.95 47 L 0 -3 -5 -2 -1 -3 -3 -4 -4 2 4 -4 4 -2 -5 -2 -1 -2 -2 0 7 1 0 3 1 1 1 1 0 12 54 0 10 1 0 3 2 0 1 3 0.69 0.98 48 K -3 3 -2 -3 -5 1 -1 -4 -2 -5 -3 7 -3 -2 -3 -2 -3 -5 -4 -4 0 12 0 0 0 4 1 0 1 0 3 77 0 2 0 1 0 0 0 0 1.30 0.97 49 R -3 4 -2 0 -5 1 0 -3 -3 -4 -3 6 -3 -5 -3 -2 -2 -5 -2 -3 0 27 0 5 0 4 4 1 0 0 3 53 0 0 0 2 1 0 1 1 0.97 0.88 50 A 0 6 -2 -2 -5 1 3 -1 -1 -5 -3 1 -3 -5 -4 -1 -3 0 -4 -4 7 48 0 0 0 4 23 5 1 0 1 5 0 0 0 3 0 1 0 0 0.85 0.86 51 L -1 -2 -3 -2 -3 -1 -1 -4 3 2 2 -3 0 2 -4 -1 0 -2 4 1 5 1 0 1 0 3 5 0 8 11 22 0 2 7 0 4 7 0 17 10 0.33 0.75 52 K -2 3 0 -2 -4 -1 -1 3 -3 -3 0 3 1 -1 -4 -1 -1 -4 -2 -3 0 17 5 2 0 1 3 27 0 0 13 20 4 3 0 2 3 0 1 0 0.41 0.79 53 N 0 -2 3 1 3 3 0 3 -2 -4 -2 0 -3 1 -3 -1 -2 -4 -1 -4 9 0 17 7 7 16 4 23 0 0 3 5 0 7 0 2 0 0 2 0 0.38 0.66 54 K -2 2 -2 -2 -4 0 0 -2 -2 -3 0 5 -2 1 -3 0 0 -4 -2 -3 0 7 0 0 0 3 4 3 0 0 11 47 0 8 0 8 7 0 0 0 0.47 0.55 55 N -2 -2 6 0 -3 -1 -1 1 3 -4 -4 -1 -3 -4 -3 2 -1 -5 -3 -4 0 0 61 0 0 0 0 9 10 0 0 0 0 0 0 20 0 0 0 0 0.88 0.41 K Lambda Standard Ungapped 0.1390 0.3216 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1870 0.3188 PSI Gapped 0.0572 0.2670