JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_m72hexw.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |||||E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|9|8|8|1|2|1|5|7|7|4|2|8|9|8|8|8|7|5|1|7|8|8|5|6|8|9|9|9|9|9|9|8|6|3|6|8|1|4|7|7|4|0|7|8|8|7|4|0|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|3|0|6|8|7|2|6|8|9|8|7|4|3|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|1|1|1|3|2|8|9|9|9|9|9|8|8|5|1|7|8|8|0|5|8|8|8|7|4|3|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|2|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|8|5|3|8|9|7|0|6|8|8|7|4|4|7|7|8|8|7|6|4|2|8|9|9|9|9|9|8|8|5|1|6|7|8|8|7|5|1|6|8|7|4|0|7|7|8|8|7|6|4|3|5|8|9|9|9|9|9|9|9|9|8|8|5|2|7|8|8|6|1|6|8|7|4|1|6|7|7|7|7|6|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|4|5|6|6|7|6|7|6|7|7|7|7|7|4|4|7|8|8|8|6|3|3|6|7|7|7|7|6|7|7|7|7|8|7|7|1|4|7|8|9|9|9|9|9|8|6|2|8|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|B|B|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|B|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|B|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|B|B|-|B|B|-|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|B|-|B|-|B|-|B|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles ||||E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles |||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E|||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E||||||||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | |*|*|*| | | | | | | | | | | | |*| | 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