JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_qHRYzbu.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||E|E|E|E|E||||||||E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 7|0|7|8|9|9|9|9|8|7|2|3|6|8|8|6|1|6|8|9|9|8|8|6|3|7|8|8|8|4|5|8|8|8|8|8|5|3|6|7|7|7|7|7|5|1|6|8|7|6|2|3|6|7|8|8|7|3|2|3|2|1|4|5|7|8|8|7|0|3|6|8|9|9|9|9|9|8|6|2|2|7|7|2|5|8|8|8|6|0|5|7|8|8|7|1|2|7|9|9|9|9|9|9|9|8|2|1|1|5|7|7|7|5|3|0|3|1|4|6|7|7|7|7|7|6|5|1|0|1|1|8|9|9|9|9|8|8|7|1|6|8|3|6|8|9|8|5|3|7|7|7|7|5|1|0|1|2|1|6|7|4|0|8|9|9|9|9|9|8|4|7|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|B|B|-|B|-|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|B|-|-|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|B|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|B|-|B|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles ||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||E|E|E|E|E||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|||||||||||E|||||E|E|E|E|E|E|E|E|| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles |E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||H||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E||||||||E|||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree |*| | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | |*| | | | | | | |*|*|*|*|*| | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | |*| | |*| | | |*| | | | | | | | | |