Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 M -3 -4 -4 -5 -3 -3 -4 -5 -4 4 1 -4 8 -2 -4 -3 -2 -4 -3 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22 3 0 53 0 0 0 0 0 0 21 1.08 0.67 2 V -1 -1 0 3 -4 -2 0 -1 1 -2 -3 -3 -3 -4 2 0 3 -5 0 2 3 3 3 18 0 0 5 3 4 0 0 0 0 0 9 7 21 0 4 19 0.35 0.81 3 P 0 -3 -3 0 -5 0 -1 -1 -4 -5 -5 -3 -5 -6 8 0 -2 -6 -5 -5 6 1 0 5 0 3 3 6 0 0 0 0 0 0 68 5 2 0 0 0 1.64 1.01 4 D 4 2 -2 0 -4 -1 2 1 -3 -4 -1 -2 -4 -4 -2 1 -2 -5 -2 -4 33 11 1 5 0 1 15 11 0 0 8 1 0 1 1 11 1 0 1 0 0.43 1.21 5 W -3 -5 -6 -6 -5 -5 -6 -4 -4 -1 3 -5 -1 6 -6 -5 -4 5 4 -2 1 0 0 0 0 0 0 1 0 1 35 0 1 39 0 0 0 9 12 1 1.24 1.23 6 E -1 4 -2 1 -3 1 2 -3 -2 -1 0 0 -1 -3 -3 -2 -2 3 -4 0 5 25 1 9 0 7 12 1 0 3 10 5 1 1 1 1 2 5 0 8 0.38 1.28 7 E 2 1 -1 0 -3 3 4 -4 1 -2 -3 0 -3 -3 -4 -2 -1 0 1 -2 16 8 2 3 1 13 28 1 3 2 2 5 0 1 0 1 4 1 5 2 0.43 1.27 8 V 4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 5 -4 -5 -3 -4 -4 3 -4 -2 -2 -4 0 -3 37 1 0 0 0 0 0 44 0 0 1 0 0 11 0 1 1 0 4 1 1.03 1.29 9 L -1 0 -5 -5 -4 2 -2 -5 -5 4 2 -2 -1 -1 -5 -3 -2 0 -4 4 4 6 0 0 0 11 2 0 0 24 16 2 1 2 0 1 2 1 0 28 0.60 1.30 10 G 2 3 -1 2 -5 0 2 -3 1 -2 -3 0 -3 -3 -4 -1 -1 -3 -1 -1 21 19 2 12 0 3 16 1 3 2 1 4 0 1 0 3 3 0 2 5 0.40 1.30 11 L -2 -2 -4 -5 -2 0 -1 -6 0 0 5 -3 1 0 -5 -4 -3 -4 1 -1 3 2 1 0 1 6 4 0 3 3 64 1 2 3 0 0 0 0 5 2 0.83 1.29 12 W -5 -5 -2 -6 -5 -5 -5 -6 0 -1 1 -5 -1 7 -6 -5 -4 4 5 -2 0 0 3 0 0 0 0 0 2 3 13 0 1 54 0 0 0 6 17 1 1.42 1.28 13 R -3 0 7 3 -6 -1 0 -3 2 -5 -5 -2 -5 -3 -5 -2 -2 -6 -2 -4 2 4 60 15 0 1 4 1 4 0 1 2 0 1 0 1 1 0 2 1 1.24 1.30 14 A 3 1 -1 2 -2 2 2 0 1 -4 -4 -1 -3 -1 -4 0 -1 -5 -1 -3 26 8 3 11 1 8 14 6 4 0 1 3 0 3 0 5 3 0 2 1 0.34 1.28 15 G -1 0 -1 -1 -1 0 1 6 -2 -6 -6 -2 -2 -4 -5 -1 -3 -5 -5 -5 4 7 2 3 1 4 11 61 1 0 0 1 1 1 0 3 1 0 0 0 1.05 1.24 16 R 0 3 -2 4 -3 1 2 -5 2 -5 -1 0 -1 -1 -4 -3 -3 -4 3 -4 7 18 1 21 1 5 14 0 4 0 6 5 2 2 0 1 1 0 12 0 0.52 1.24 17 Y -2 -4 -5 -6 -5 -4 -5 -5 -1 -4 -3 -5 -3 6 1 -4 -3 6 7 -2 3 1 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 29 7 1 1 10 45 2 1.51 1.21 18 Y -5 -2 -5 -4 -5 -4 -5 -5 4 -4 -1 -5 -3 6 -6 -5 -5 9 5 -4 0 3 0 1 0 0 0 0 12 0 4 0 0 33 0 0 0 26 22 0 1.67 1.22 19 E 1 -2 -2 1 -5 -1 6 -3 3 -4 -4 -1 -2 -5 -3 -1 0 -6 -4 -3 15 1 1 5 0 1 56 1 7 1 1 2 1 0 1 2 5 0 0 1 0.92 1.22 20 V 4 -5 -4 -5 8 -3 -4 -3 -5 -4 -3 -4 -4 -3 -4 1 -2 -5 -3 -2 44 0 0 0 37 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 10 2 0 1 2 1.32 1.22 21 H -4 -3 -2 -4 -6 1 -3 -2 11 -6 -6 -3 -4 -4 -5 -3 -4 -5 -1 -6 0 0 0 0 0 5 0 2 93 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.65 1.22 22 E -3 -3 -1 4 -6 -1 6 -1 -3 -6 -6 -2 -5 -6 -4 -3 -3 -6 -3 -4 1 0 1 27 0 0 64 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1.38 1.22 23 V 1 -4 -5 -4 3 -3 -1 -4 -3 2 0 -4 -2 -2 -1 -2 0 3 -1 4 13 0 0 0 5 1 5 1 1 13 6 0 0 1 3 1 7 5 2 35 0.51 1.22 24 L -3 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -4 -5 -1 5 -5 1 3 -6 -4 -4 8 -1 -1 1 0 0 0 0 0 0 1 0 2 55 0 2 14 0 1 0 21 1 3 1.29 1.22 25 E -3 -3 -3 1 -6 -1 7 -5 -3 -6 -6 -2 -5 -6 -4 -3 -3 -6 -5 -5 0 0 0 4 0 0 96 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.93 1.22 26 P 2 -1 -2 3 -5 0 4 0 -1 -2 -4 -1 0 -2 0 0 -2 -2 -4 -3 19 4 1 14 0 3 27 7 1 2 1 2 2 2 4 8 2 1 0 2 0.41 1.22 27 Y 0 -1 0 -5 -1 -1 -1 -4 2 1 3 -2 0 -1 -2 -4 -2 0 2 1 9 3 5 0 1 2 5 1 4 7 33 2 2 2 2 0 2 1 8 9 0.35 1.62 28 W -5 -1 -6 -6 -5 -4 -5 -5 -4 -5 -2 -5 -4 -2 -6 -5 -5 12 2 -5 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 0 0 82 5 0 3.37 1.53 29 L -2 2 -1 -4 -5 0 -1 -2 3 -1 1 4 3 -1 -5 -2 -2 -5 2 -2 3 9 3 0 0 3 3 3 7 4 12 28 7 2 0 3 2 0 6 3 0.44 1.84 30 K 0 0 2 1 2 0 3 -1 0 -2 -2 1 -4 -5 -2 0 0 2 -5 -2 9 4 8 7 4 4 22 4 2 2 5 9 0 0 2 6 5 3 0 3 0.27 1.88 31 A 3 0 -1 -1 1 -1 1 -1 0 -2 0 -2 0 0 -2 1 0 -5 1 0 23 5 2 4 3 2 8 5 2 2 8 2 2 4 2 9 5 0 5 6 0.15 1.84 32 T -1 1 -1 1 -5 0 1 0 0 -3 -4 1 -2 -3 5 -1 1 -3 -1 -3 5 9 3 7 0 4 10 7 2 2 1 7 1 1 25 4 7 0 2 2 0.42 1.53 33 G -1 -1 0 2 -5 -2 2 4 -1 -5 -5 0 -4 -3 0 1 -1 -3 -4 -4 4 3 3 12 0 2 12 33 1 1 1 4 0 1 6 11 4 0 1 1 0.52 1.53 34 E 0 0 1 3 -5 -1 1 -1 -1 -2 -4 0 0 -3 4 -1 0 -6 -2 -3 7 5 6 17 0 2 11 5 1 2 2 5 2 1 22 4 5 0 1 2 0.43 1.56 35 E -3 2 1 3 -2 0 4 -4 0 -4 -1 0 -3 -4 -3 -2 -1 -3 -2 -2 1 11 5 17 1 4 33 1 2 1 6 5 0 1 1 2 4 0 1 3 0.56 1.55 36 R -2 6 -1 -1 -5 -1 1 -3 -1 -4 -4 4 -3 -5 -3 0 -3 -5 -2 -5 3 40 2 3 0 1 8 2 1 1 1 26 1 0 1 6 1 0 1 0 0.91 1.50 37 R 0 2 0 2 -5 0 1 -2 2 -1 -1 0 0 -4 0 0 1 0 -1 -3 10 10 4 11 0 4 9 3 6 4 6 6 3 0 5 7 9 1 2 1 0.17 1.51 38 L -2 -3 -4 -4 1 -4 -4 -4 0 1 3 -4 0 5 -1 -2 -2 0 1 1 3 1 1 1 2 1 1 1 2 6 32 1 2 27 3 3 3 1 3 8 0.64 1.54 39 L -4 -5 -6 -7 -1 -4 -5 -6 -2 1 3 -5 -1 1 -6 -4 -2 8 5 0 1 0 0 0 1 1 1 0 1 6 34 0 1 5 0 1 2 21 21 6 1.20 1.58 40 Q -3 2 -2 -4 -5 6 -2 -5 6 -3 -3 2 -3 -5 -4 -3 -2 3 -3 1 2 10 1 0 0 37 0 0 18 1 2 11 0 0 1 1 2 4 0 11 0.96 1.55 41 G 2 -5 -3 -4 -2 -4 -3 7 -5 -5 -5 -4 -5 -4 -5 -1 -3 -5 -4 -3 15 0 1 0 1 0 2 72 0 1 1 0 0 1 0 3 1 0 1 2 1.46 1.56 42 V -3 -5 -6 -7 -1 -5 -6 -7 -3 3 5 -6 3 1 -6 -5 -4 1 -1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 15 62 0 7 4 0 0 0 2 2 5 1.14 1.58 43 I 0 -6 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 7 2 -5 -2 -3 -6 -5 -2 -6 -4 2 10 0 0 0 0 0 0 0 0 59 21 0 0 0 0 0 2 0 0 8 1.27 1.58 44 L -3 0 -2 -4 -6 8 -2 -3 0 -3 1 -1 -1 -5 -5 -3 -4 -1 -4 -4 1 4 2 0 0 72 0 2 2 1 13 2 1 0 0 0 0 1 0 1 1.51 1.58 45 L 0 -5 -6 -6 2 -5 -6 -5 -6 4 4 -5 2 0 -6 -4 -1 -5 0 3 6 0 0 0 4 0 0 1 0 24 33 0 5 4 0 1 3 0 3 17 0.78 1.58 46 A 6 -5 -3 -5 2 -4 -4 -2 -5 -4 -3 -4 -2 -5 -4 1 -1 -6 -5 -1 76 0 1 0 4 0 0 2 0 0 2 0 1 0 0 8 4 0 0 3 1.29 1.58 47 A 3 -5 -1 -5 -4 -5 -5 -2 -6 0 -2 -5 -1 -4 -5 -3 1 -6 -5 6 22 0 3 0 0 0 0 3 0 3 1 0 1 0 0 1 7 0 0 60 1.08 1.58 48 A 5 -5 -4 -3 -1 -4 -3 5 -2 -3 -5 -4 -5 -6 -4 1 -2 -6 -4 -3 44 0 0 1 1 0 1 36 1 1 0 0 0 0 0 12 1 0 1 1 1.04 1.58 49 L -1 -3 -2 -6 1 0 -4 -2 -1 0 4 -5 3 3 -6 -5 -3 -2 2 1 4 1 2 0 3 5 1 3 2 5 39 0 7 12 0 0 1 0 7 8 0.58 1.57 50 H -3 -4 -2 -5 -5 -4 -2 -5 7 -1 -1 -3 -4 0 -5 -4 0 -1 7 1 2 0 1 0 0 0 3 0 28 2 5 1 0 2 0 0 6 0 36 12 1.22 1.56 51 Q -3 -1 -2 -3 -6 -1 -3 -4 9 -3 -1 3 -2 -3 -4 -4 -4 -5 -1 -4 1 3 0 1 0 2 0 1 60 2 6 20 1 0 0 0 0 0 1 1 1.68 1.56 52 R 1 3 0 -2 -2 2 0 -4 2 0 1 -1 -2 0 -5 -2 -3 5 2 -2 13 15 4 2 1 8 5 1 5 5 12 3 1 4 0 2 1 8 8 2 0.32 1.58 53 R -1 6 -2 -2 -2 2 0 -1 2 -4 -3 0 -1 -3 -4 -2 -2 -2 -1 -3 5 45 1 2 1 11 7 4 4 1 3 5 2 1 1 3 2 0 2 2 0.77 1.57 54 L -3 4 4 0 -3 -1 0 1 -1 -5 -2 0 2 -3 -5 -2 -2 -3 0 -3 1 25 22 6 1 3 6 13 1 0 3 3 6 1 0 2 2 0 3 1 0.58 1.62 55 G -2 -2 4 0 -6 0 -3 5 1 -6 -4 -2 -3 -4 -4 -2 -4 3 -3 -3 2 3 22 5 0 4 1 45 4 0 1 2 0 1 1 3 0 4 1 2 0.91 1.63 56 R -2 4 5 0 -6 0 -1 -4 -2 -5 -3 2 -4 -4 -1 0 -2 -2 -4 -4 3 25 33 5 0 3 3 1 0 0 3 11 0 1 3 6 1 1 0 1 0.79 1.64 57 P -2 1 0 -2 -5 -3 -3 5 -2 -1 -3 1 -5 -3 2 -1 0 -6 -4 -2 2 7 4 2 0 1 1 45 1 3 3 8 0 1 9 5 6 0 0 4 0.66 1.65 58 G 5 -5 1 -2 -2 -3 -3 4 -5 -4 -5 -3 0 -5 -4 -1 -2 -6 -3 -3 44 0 7 2 1 0 2 32 0 0 1 1 3 0 0 3 2 0 1 1 0.91 1.65 59 L 3 1 -5 -4 -1 -3 -1 -2 1 1 0 -2 2 -3 -5 -2 -2 3 -2 2 30 8 0 1 1 1 4 2 3 6 10 3 6 1 0 3 1 4 1 15 0.39 1.66 60 R -1 6 -1 -3 -4 -1 -2 0 -2 0 -3 2 1 -4 -5 1 1 -6 -5 -3 4 40 2 1 0 2 1 7 1 5 2 13 4 1 0 10 7 0 0 1 0.71 1.66 61 N -2 -2 1 -3 0 -2 -2 0 -1 1 4 -2 4 -4 -5 0 -1 -5 -4 0 2 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