JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_hKhuKuD.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E|E||E|E|E|||H|H|H|H|H||||H|H|||||||||||||||||||||E|||||||||||E|E||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 8|9|8|8|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|7|6|3|3|2|1|8|8|8|9|7|2|5|7|8|8|7|3|5|8|8|7|5|3|6|7|8|8|7|7|3|5|8|8|6|0|0|2|3|1|1|6|3|1|3|1|1|2|2|2|0|2|2|0|4|5|3|3|5|7|7|7|6|5|2|2|5|7|7|7|7|6|1|0|0|3|3|3|5|6|7|6|5|3|1|1|4|6|7|7|7|7|5|1|6|8|8|9|8|6|1|7|8|8|6|0|7|8|9|8|8|8|6|3|7|8|8|8|7|2|5|7|7|4|3|6|7|7|7|7|7|7|7|6|5|2|7|8|9|9|9|9|9|9|9|8|7|2|8|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|B|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|B|-|B|-|-|B|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|B|B|B|-|B|-|-|-|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|B|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles ||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H||||H|H|H|||||||||||||||||||E|E|E||||||||||E|E||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles |||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E||||E||||||H|H||||H|H||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*| |*| | |*|*| | |*| | |*| |*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*| | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |