JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_TVJm3QD.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet ||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||H|H||||||||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 8|0|6|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|2|5|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|4|0|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|1|1|8|8|7|4|6|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|0|3|6|7|7|7|7|7|7|7|7|6|4|3|5|8|9|9|9|9|9|9|9|8|6|1|1|8|8|7|4|6|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|4|0|5|7|7|8|8|7|7|6|2|0|2|3|4|9|9|9|9|9|9|9|9|9|7|5|1|7|8|8|7|5|2|7|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|3|1|7|8|8|7|3|2|1|1|3|6|7|7|7|7|6|6|7|7|7|7|7|7|7|7|6|4|4|2|1|3|0|3|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|1|0|7|8|8|7|0|2|7|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|0|3|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|6|7|7|6|2|7|8|9|9|9|9|9|9|9|7|4|2|2|8|8|5|6|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|1|6|7|7|7|7|7|7|7|6|4|4|1|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|4|4|8|7|0|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|2|2|3|6|7|7|8|7|7|7|7|7|1|1|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|2|4|7|8|8|8|7|6|5|1|2|0|1|1|1|2|5|7|8|8|8|9|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|-|-|B|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|B|B|-|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||E|E|E|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||H|H|H|H|H|||||||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree |*| | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*| | | | | | | | | | | |*| | | | | |*| | 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