Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 S 1 -1 0 -1 -1 0 0 -1 -1 -3 -3 0 -2 -3 -1 5 1 -3 -2 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0.57 0.09 2 F -2 -3 -4 -4 -3 -3 -4 -4 -2 0 2 -3 0 6 -4 -3 -2 0 2 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26 0 0 74 0 0 0 0 0 0 0.72 0.11 3 V -1 -3 -4 -4 -1 -3 -3 -4 -4 2 2 -3 1 -1 -3 -2 -1 -3 -2 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24 0 0 0 0 0 0 0 0 76 0.53 0.18 4 G -1 -3 -1 -2 -3 -3 -3 7 -3 -5 -5 -2 -4 -4 -3 -1 -2 -3 -4 -4 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.41 0.25 5 L -2 -3 -4 -4 -2 -3 -3 -4 -4 1 4 -3 4 -1 -4 -3 -2 -3 -2 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 59 0 15 0 0 0 0 0 0 26 0.58 0.25 6 R -2 6 -2 -3 -4 0 -1 -4 -1 -3 0 1 -2 2 -3 -2 -2 -3 -1 -3 0 77 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0 0 13 0 0 0 0 0 0 0.86 0.30 7 V -1 -4 -4 -4 -2 -3 -3 -4 -4 2 0 -3 0 -2 -3 -3 -1 -4 -2 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0.83 0.30 8 V -2 -3 -4 -4 -2 -3 -4 -4 -2 1 0 -3 1 4 -4 -3 -2 -1 4 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 0 5 24 0 0 0 0 23 44 0.59 0.30 9 A 5 -2 -2 -3 -1 -2 -2 -1 -3 -2 -2 -2 -2 -3 -2 0 1 -4 -3 -1 88 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 0.72 0.30 10 K -2 3 -1 -2 -4 0 0 -3 -2 -3 0 6 -2 -3 -2 -1 -2 -4 -3 -3 0 12 0 0 0 0 0 0 0 0 12 76 0 0 0 0 0 0 0 0 0.72 0.30 11 W -4 -4 -5 -5 -3 -3 -4 -4 -3 -4 -3 -4 -2 0 -5 -4 -3 12 2 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 3.02 0.30 12 S 0 -2 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -3 -3 -1 -2 -1 -2 5 0 6 2 -2 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 1 66 1 13 10 1 0.61 0.27 13 S 0 -2 2 -1 -2 -1 -1 1 -2 -3 -1 -1 3 -3 -2 4 0 -4 -3 -2 0 0 13 0 0 0 0 12 0 0 4 0 12 0 0 59 0 0 0 0 0.48 0.30 14 N -2 -1 7 2 -3 -1 -1 -1 -1 -4 -4 -1 -3 -4 -3 1 -1 -5 -3 -4 0 0 75 12 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13 0 0 0 0 0.97 0.30 15 G -1 -1 2 -1 -3 -1 0 5 -2 -4 -4 2 -3 -4 -3 1 -2 -4 -3 -4 0 0 13 0 0 0 7 50 0 0 0 21 0 0 0 9 0 0 0 0 0.65 0.30 16 Y -3 -2 -3 -4 -3 -2 -3 -4 0 -1 1 1 -1 5 -4 -3 -2 0 6 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12 13 0 30 0 0 0 0 45 0 0.78 0.30 17 F -3 -3 -4 -4 -3 -4 -4 -4 -1 -1 -1 -4 -1 7 -4 -3 -3 1 5 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 71 0 0 0 0 29 0 1.20 0.30 18 Y -3 -3 -3 -4 -3 -3 -3 -4 1 -2 -2 -3 -2 4 -4 -3 -3 1 8 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13 0 0 0 0 87 0 1.37 0.30 19 S 2 -2 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -2 -3 -3 -1 -2 -4 4 4 0 -4 -3 -2 23 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24 53 0 0 0 0 0.72 0.30 20 G -1 -3 -1 -2 -4 -3 -3 7 -3 -5 -5 -2 -4 -4 -3 -1 -3 -4 -4 -4 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.47 0.30 21 K -1 3 -1 -2 1 2 -1 -3 -2 1 -2 3 -2 -3 -2 0 3 -4 -3 -1 0 18 0 0 3 9 0 0 0 12 0 23 0 0 0 4 31 0 0 0 0.36 0.30 22 I -2 -4 -4 -4 -2 -4 -4 -5 -4 6 1 -4 0 -1 -4 -3 -2 -4 -2 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 80 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20 0.86 0.34 23 T 2 -2 -1 -2 -2 -1 -2 -2 -3 -1 -2 1 0 -3 -2 2 4 -4 -3 1 20 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11 4 0 0 12 41 0 0 12 0.40 0.34 24 R -2 3 -1 -1 -4 4 3 0 -1 -4 -4 4 -2 -4 -2 -1 -2 -4 -3 -3 0 20 0 0 0 21 22 8 0 0 0 29 0 0 0 0 0 0 0 0 0.62 0.34 25 D -1 -2 0 5 -3 -1 3 -2 -2 -4 -4 -1 -3 -4 -2 2 1 -4 -3 -3 3 0 0 45 0 0 18 0 0 0 0 0 0 0 0 24 9 0 0 0 0.69 0.34 26 V 1 0 -2 -2 -2 -2 1 -1 -3 0 1 -2 -1 -2 -3 1 -1 -4 -3 3 17 8 0 0 0 0 11 4 0 0 19 0 0 0 0 12 0 0 0 29 0.20 0.34 27 G 1 -2 -1 -2 -3 -2 0 5 -3 -4 -4 1 -3 -4 -3 1 -2 -4 -4 -3 9 0 0 0 0 0 8 61 0 0 0 11 0 0 0 11 0 0 0 0 0.79 0.34 28 A 2 -2 3 3 -3 -1 3 1 -2 -4 -4 -1 -3 -4 -2 0 -1 -4 -3 -3 23 0 22 20 0 0 21 11 0 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0.48 0.34 29 G 0 -3 3 1 -3 -2 -2 5 -2 -4 -4 -2 -3 -4 -3 0 0 -4 -4 -4 4 0 18 9 0 0 0 60 0 0 0 0 0 0 0 4 4 0 0 0 0.83 0.34 30 K -2 6 -1 -2 -4 0 -1 -3 -1 -4 -3 5 -2 -4 -3 -1 -2 -4 -3 -3 0 53 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47 0 0 0 0 0 0 0 0 0.97 0.34 31 Y -3 -3 -4 -4 2 -3 -4 -4 0 -1 1 -3 -1 5 -4 -3 -3 1 6 -2 0 0 0 0 5 0 0 0 0 0 11 0 0 38 0 0 0 0 45 0 0.94 0.30 32 K -2 4 2 -1 -4 3 0 -1 -1 -4 -3 4 -2 -4 -2 -1 -2 -4 -3 -3 0 30 14 0 0 13 0 5 0 0 0 38 0 0 0 0 0 0 0 0 0.63 0.30 33 L -2 -4 -4 -4 -2 -3 -4 -5 -4 5 4 -4 1 -1 -4 -3 -2 -3 -2 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47 45 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0.66 0.30 34 L 0 2 -3 -2 1 -1 1 -3 -2 -1 3 2 0 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -1 11 12 0 0 4 0 13 0 0 0 46 14 0 0 0 0 0 0 0 0 0.28 0.30 35 F -3 -4 -4 -5 -3 -4 -4 -4 -2 -1 0 -4 -1 8 -5 -3 -3 0 2 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 1.36 0.30 36 D -3 -2 0 7 -5 -1 2 -2 -2 -4 -5 -1 -4 -5 -2 -1 -2 -5 -4 -4 0 0 0 87 0 0 13 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.26 0.30 37 D -3 -3 1 7 -5 -1 1 -2 -2 -4 -5 -2 -4 -5 -2 -1 -2 -5 -4 -4 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.42 0.30 38 G -1 -2 4 2 -4 -2 -2 5 -2 -4 -4 -2 -3 -4 -3 -1 0 -4 -4 -4 0 0 30 14 0 0 0 52 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0.81 0.30 39 Y 1 -2 -1 1 -3 1 -1 -2 3 -3 -3 -2 -2 0 -3 2 -1 -1 5 -2 14 0 0 11 0 8 0 0 8 0 0 0 0 0 0 21 0 0 37 0 0.47 0.30 40 E 1 -1 -1 0 -4 2 5 -3 -1 -3 -2 0 2 -3 -2 -1 -2 -4 -3 -2 13 0 0 0 0 8 68 0 0 0 0 0 11 0 0 0 0 0 0 0 0.71 0.30 41 C 1 2 -2 -3 8 -2 -3 1 -3 -3 -3 0 -2 -4 -3 -1 -2 -3 -3 -2 13 16 0 0 49 0 0 14 0 0 0 8 0 0 0 0 0 0 0 0 0.82 0.30 42 D -2 -2 2 4 -4 0 4 -2 -2 -4 -4 -1 -3 -4 -2 1 2 -4 -3 -3 0 0 8 36 0 0 31 0 0 0 0 0 0 0 0 11 14 0 0 0 0.64 0.30 43 V -1 -4 -4 -4 -2 -3 -3 -4 -4 2 0 -3 0 -2 -3 -3 -1 -4 -2 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0.82 0.30 44 L 1 -2 2 -2 -2 1 -2 -2 -2 -1 2 -2 -1 -2 0 1 2 -3 -2 -1 12 0 11 0 0 8 0 0 0 0 30 0 0 0 3 14 21 0 0 0 0.24 0.30 45 G 2 -3 -1 -2 -3 -2 -2 5 -3 -3 -4 -2 -3 -4 -2 1 1 -4 -3 -3 17 0 0 0 0 0 0 58 0 0 0 0 0 0 0 11 14 0 0 0 0.76 0.30 46 K -2 4 -1 2 -4 0 0 -3 -1 -4 -3 5 -2 -4 -2 -1 -2 -4 -3 -3 0 34 0 14 0 0 0 0 0 0 0 51 0 0 0 0 0 0 0 0 0.76 0.30 47 D -3 -2 4 6 -4 -1 0 -2 -2 -4 -5 -1 -4 -4 -3 -1 -2 -5 -4 -4 0 0 21 79 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.18 0.30 48 I -2 -4 -4 -4 -2 -3 -4 -4 -4 5 1 -3 4 -1 -4 -3 -1 -3 -2 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 53 0 0 14 0 0 0 0 0 0 33 0.67 0.30 49 L -2 -3 -4 -4 -2 -3 -4 -5 -4 4 4 -3 1 0 -4 -3 -2 -3 -2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41 59 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.63 0.22 50 L -2 -3 -4 -4 -2 -3 -4 -5 -4 2 5 -3 1 0 -4 -3 -2 -3 -2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 85 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.70 0.22 51 C 1 -2 -2 -3 8 -2 -2 -3 -3 -2 -2 1 -2 -3 -3 -1 2 -3 -3 -1 11 0 0 0 59 0 0 0 0 0 0 15 0 0 0 0 15 0 0 0 0.90 0.22 52 D -2 -2 0 6 -4 0 3 -2 -2 -4 -4 -1 -4 -4 -2 -1 -2 -5 -4 -4 0 0 0 74 0 0 26 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.05 0.22 53 P -1 -3 -2 -2 -3 -2 -1 -3 -3 -3 -3 -1 -3 -4 8 -1 -1 -4 -3 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 2.15 0.09 K Lambda Standard Ungapped 0.1465 0.3231 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1757 0.3169 PSI Gapped 0.0538 0.2670