Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 N -2 -2 6 4 -4 -1 -1 -2 -1 -4 -5 -2 -4 -4 -3 2 -1 -5 -4 -4 0 0 50 29 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21 0 0 0 0 0.95 0.46 2 V -1 -4 -5 -5 -2 -4 -4 -5 -5 3 0 -4 1 -2 -2 -3 -2 -4 -3 6 3 0 0 0 0 0 0 0 0 13 2 0 3 0 2 0 0 0 0 78 0.99 0.63 3 T -1 -1 1 3 -3 1 1 -3 -3 -1 -3 -1 -3 -4 -3 1 5 -4 -3 -1 2 2 5 16 0 5 10 0 0 3 0 2 0 0 0 8 43 0 0 4 0.54 0.63 4 Q 2 0 0 -2 0 6 -1 -3 -2 -3 -3 1 0 -4 -3 0 1 -4 -3 -1 17 2 4 0 2 47 0 0 0 0 0 8 2 0 0 6 8 0 0 3 0.64 0.63 5 A 1 -4 1 -4 7 -3 -4 -4 -4 -1 -1 -4 2 1 -4 -2 -2 -4 -2 3 12 0 9 0 32 0 0 0 0 0 2 0 7 8 0 0 0 0 0 30 0.77 0.63 6 F -4 -4 -5 -5 -4 -5 -5 -5 -2 -2 -1 -5 -2 8 -5 -4 -4 0 4 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 85 0 0 0 0 13 0 1.64 0.62 7 G -1 -4 -2 -3 -4 -3 -4 7 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -4 -2 -3 -4 -5 -5 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.80 0.62 8 R 1 3 0 -2 -3 1 -1 -2 0 -3 -1 3 -1 -3 4 0 -1 -3 -3 -3 11 17 4 1 0 6 3 1 2 1 5 18 2 1 20 6 2 0 0 1 0.39 0.52 9 R -2 7 -2 -2 -4 0 -1 -3 -1 -3 -3 1 -2 -3 -3 -2 -2 -3 -3 -3 1 86 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 1 0 0 1 1.29 0.52 10 G -1 1 -1 -1 -2 0 -1 4 -2 -2 -2 -1 -2 -2 -2 1 1 -2 -2 -2 3 8 2 4 1 5 2 38 1 2 3 4 1 1 2 11 10 0 1 2 0.38 0.42 11 P -1 -1 -1 -2 -3 -2 -2 0 -2 -3 -3 2 -3 -3 7 -1 -2 -3 -3 -3 4 3 3 1 0 1 1 8 0 1 2 14 0 1 53 2 1 0 1 1 1.05 0.51 12 E -1 3 1 -1 -2 -1 0 4 -2 -2 -2 -1 -2 0 -2 1 -1 1 -2 -2 2 18 8 2 1 1 5 32 1 2 3 2 1 4 2 9 2 2 1 2 0.36 0.44 13 Q -2 1 -1 4 -3 2 0 -2 -2 -3 -3 3 -3 -3 1 2 -1 -3 -3 -3 1 8 1 25 0 10 3 1 0 1 1 19 0 1 8 17 1 0 1 1 0.46 0.55 14 T 2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -1 1 -2 0 1 -2 1 2 -2 0 0 19 2 1 2 1 1 2 2 1 2 18 2 3 5 2 10 18 0 3 7 0.18 0.45 15 Q -1 -2 1 1 -3 2 3 1 -2 -4 -3 0 -3 -3 0 2 -1 -3 -1 -3 2 1 5 6 0 12 25 11 0 1 2 4 0 0 5 19 2 0 2 1 0.37 0.58 16 G 3 3 -2 -2 -3 -1 -2 3 3 -3 -3 0 -3 -3 -2 0 -2 -3 -2 -3 27 17 1 1 0 1 1 25 10 1 1 6 0 1 1 6 1 0 0 1 0.46 0.56 17 N -3 -2 8 0 -4 -2 -2 -2 -1 -5 -5 -2 -4 -5 -4 -1 -2 -6 -4 -5 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.76 0.65 18 F -3 -4 -5 -5 2 -5 -5 -5 -3 -1 -1 -5 1 8 -5 -4 -3 -1 1 1 0 0 0 0 5 0 0 0 0 0 0 0 3 78 0 0 0 0 0 14 1.38 0.65 19 G -1 -4 -2 -3 -4 -3 -4 7 -4 -6 -5 -3 -4 -5 -4 -2 -3 -4 -5 -5 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.83 0.65 20 D -1 -3 1 6 -4 -2 -1 0 -3 -4 -5 -2 -4 -5 -3 3 0 -5 -4 -4 5 0 5 58 0 0 0 5 0 0 0 0 0 0 0 23 5 0 0 0 0.97 0.65 21 Q 3 -2 -2 2 -3 2 -2 -1 -3 -3 0 0 0 -4 1 2 -1 -4 -4 -3 27 1 0 16 0 9 0 3 0 0 9 5 3 0 7 18 3 0 0 0 0.33 0.65 22 D -3 -2 0 5 -5 1 3 -1 -2 -5 -5 3 -4 -5 -3 0 -1 -5 -4 -4 0 0 3 36 0 3 26 5 0 0 0 18 0 0 0 5 3 0 0 0 0.76 0.65 23 L -3 -4 -4 -5 -3 -3 -4 -5 -3 1 3 -4 6 3 -4 -3 1 -3 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 31 0 32 11 0 0 12 0 4 7 0.70 0.64 24 I -2 -3 2 -3 1 -2 2 -4 -3 3 1 -3 -1 -3 -4 -3 -2 -4 -3 4 0 0 12 0 4 0 15 0 0 15 13 0 0 0 0 0 0 0 0 41 0.51 0.64 25 R 2 1 -1 -2 -4 2 2 -3 -2 -4 -4 5 -3 -5 -3 -1 -2 -4 -3 -2 20 5 2 0 0 7 16 0 0 0 0 48 0 0 0 0 0 0 0 2 0.70 0.64 26 Q -1 -2 2 -1 -4 0 3 -3 0 -2 2 1 0 -2 -3 -1 1 -4 -1 -1 4 0 13 2 0 2 24 0 2 0 22 8 1 2 0 2 12 0 2 4 0.29 0.64 27 G -1 -4 -2 -3 -4 -3 -4 7 -4 -6 -5 -3 -4 -5 -4 -2 -3 -4 -5 -5 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.82 0.64 28 T 0 -3 1 -3 -3 -3 -3 -4 -4 2 0 -3 4 -3 -4 1 3 -4 -3 3 5 0 7 0 0 0 0 0 0 12 4 0 15 0 0 9 22 0 0 27 0.46 0.64 29 D 2 1 0 3 -4 1 2 -1 -2 -4 -4 2 -3 -5 -3 2 -2 -5 -4 -3 22 6 3 21 0 6 12 4 0 0 0 12 0 0 0 14 0 0 0 0 0.45 0.64 30 Y 2 -3 -1 6 -4 -2 -1 0 2 -4 -4 -2 -4 -3 -3 -1 -2 -4 1 -3 26 0 0 56 0 0 0 5 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0.86 0.58 31 K -2 -2 -2 -2 -4 -2 0 2 -3 -4 -4 3 -4 -5 6 0 -1 -5 -4 -4 0 0 0 0 0 0 5 17 0 0 0 27 0 0 40 8 3 0 0 0 0.94 0.58 32 H -3 6 1 -3 0 2 -1 1 5 -5 -4 1 -3 -4 -4 -2 -3 -4 0 -4 0 50 5 0 3 10 2 10 15 0 0 3 0 0 0 0 0 0 2 0 0.80 0.58 33 W -3 -4 -4 -5 -3 -4 -4 -5 -2 1 0 -4 -1 5 -5 -3 -1 5 5 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 9 0 0 33 0 0 5 9 27 11 0.90 0.58 34 P 0 -3 -3 -3 -3 -2 -2 -3 -3 -3 -2 -2 4 -4 7 -2 2 -4 -3 -2 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 14 0 58 0 16 0 0 0 1.30 0.55 35 Q 3 -1 -2 -2 -3 5 -1 -2 -2 0 -1 -1 -2 -3 -2 -1 -1 -3 -3 -1 37 0 0 0 0 42 0 0 0 6 5 0 0 0 0 0 3 0 0 3 0.61 0.55 36 I 0 -4 -4 -5 -3 -3 -4 -4 -4 3 3 -3 5 1 -4 -3 0 -3 -2 1 11 0 0 0 0 0 0 0 0 19 36 0 17 4 0 0 6 0 0 6 0.55 0.58 37 A 5 -3 -3 -4 -2 -2 -3 -2 -3 -2 1 -2 1 -3 -3 0 -2 -4 -3 -1 76 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16 0 4 0 0 4 0 0 0 0 0.79 0.58 38 Q -1 2 3 0 -4 3 5 -3 -1 -4 -4 0 -3 -4 -3 0 -2 -4 -3 -4 5 14 15 1 0 13 44 0 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 0 0.69 0.52 39 F -3 -3 -4 -5 3 -2 -4 -5 2 0 4 -4 4 2 -4 -3 -3 -3 1 -1 0 0 0 0 8 2 0 0 6 0 61 0 12 7 0 0 0 0 4 0 0.70 0.52 40 A 3 -4 -4 -4 -2 -3 -3 -3 -4 2 0 -3 -1 -2 -3 -2 1 -4 -3 4 29 0 0 0 0 0 0 0 0 11 4 0 0 0 0 0 7 0 0 50 0.59 0.52 41 P -2 -4 -3 -3 -4 -3 -2 -4 -4 -4 -4 -2 -4 -5 8 -2 -2 -5 -4 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 2.57 0.52 42 S -1 -2 3 -2 -3 -2 -2 2 0 -4 -4 -2 -3 -4 -3 4 3 -4 -3 -3 0 0 14 0 0 0 0 19 2 0 0 0 0 0 0 37 27 0 0 0 0.63 0.52 43 A 1 -3 -2 -3 -3 1 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 4 1 2 -4 -3 3 13 0 0 0 0 8 0 0 0 0 0 0 0 0 21 11 18 0 0 28 0.51 0.52 44 S 3 -2 -2 -2 -3 2 -1 1 4 -4 -4 -2 -3 -4 -3 3 -1 -4 -2 -3 36 0 0 0 0 14 0 11 15 0 0 0 0 0 0 24 0 0 0 0 0.56 0.52 45 A 5 -2 -2 -2 -2 -1 2 -1 -3 -3 -3 -2 -3 -4 -2 2 -1 -4 -3 -2 67 0 0 0 0 0 14 0 0 0 0 0 0 0 0 18 0 0 0 0 0.75 0.52 46 F -1 -4 -4 -5 4 -3 -4 -4 -4 1 3 -4 4 4 -4 -3 -3 -2 -1 0 4 0 0 0 11 0 0 0 0 8 34 0 16 25 0 0 0 0 0 2 0.67 0.52 47 F -1 -4 -5 -5 -3 -3 -4 -5 -4 1 4 -4 3 3 -4 -3 -3 -3 -1 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 4 63 0 10 16 0 0 0 0 0 4 0.75 0.52 48 G -3 -4 -4 -5 -4 -4 -4 0 -3 -2 0 -4 -1 8 -5 -1 -3 -1 1 -2 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 4 0 0 84 0 5 0 0 0 0 1.31 0.52 49 M 1 -3 -2 0 -3 -3 -3 5 -3 -3 -3 -3 4 -4 -3 -1 -1 -4 -4 -3 14 0 0 6 0 0 0 59 0 0 0 0 18 0 0 0 2 0 0 0 0.88 0.52 50 S 0 -2 -1 -2 -3 -2 -2 3 -3 -4 -4 -1 -3 -4 -3 5 0 -4 -3 -3 0 0 0 0 0 0 0 28 0 0 0 3 0 0 0 69 0 0 0 0 0.88 0.52 51 R -3 2 1 -2 -4 3 2 -3 6 -4 -3 1 -1 -3 -3 -2 -2 2 1 -4 0 15 8 0 0 13 13 0 32 0 1 9 2 0 0 0 2 3 4 0 0.67 0.52 52 I -2 -4 -5 -5 -3 -4 -4 -5 -4 2 2 -4 -1 2 -4 -3 -1 6 -1 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13 19 0 0 11 0 0 3 14 0 40 0.72 0.54 53 G 0 -2 -1 1 -3 1 1 -1 -2 -3 -3 1 -3 -4 -2 3 3 -4 -3 -2 6 0 0 7 0 5 11 3 0 0 0 10 0 0 0 28 28 0 0 2 0.44 0.54 54 M 1 -3 -2 -3 -3 -2 -3 -2 2 -1 1 -1 1 -3 1 2 2 -4 -3 2 14 0 0 0 0 0 0 2 6 0 14 3 4 0 7 16 17 0 0 15 0.28 0.64 55 E -2 3 0 -1 -5 2 3 -3 -2 -4 -4 5 -3 -2 -3 -2 0 -4 -3 -1 0 15 4 1 0 10 17 0 0 0 0 39 0 2 0 0 7 0 0 4 0.62 0.64 56 V -2 -2 -2 1 -4 1 5 -4 3 -3 1 0 0 1 -1 -2 -3 -4 -1 -1 1 0 0 5 0 5 44 0 7 0 13 5 3 8 3 0 0 0 2 4 0.49 0.64 57 T 0 0 0 1 -4 5 2 -3 0 -3 -1 0 -1 -2 -3 0 0 -4 -1 -1 8 4 3 8 0 31 11 0 2 0 5 5 1 2 0 7 6 0 2 5 0.36 0.64 58 P 0 -3 2 0 -4 -2 -1 3 -1 -4 -4 1 -4 -5 4 1 -1 -5 -4 -3 9 0 9 6 0 0 3 27 1 0 0 9 0 0 23 9 2 0 0 2 0.57 0.64 59 S -3 -3 3 6 -5 -2 1 1 -2 -5 -5 -1 -4 -5 -3 -1 -1 -5 -4 -5 0 0 13 60 0 0 8 12 0 0 0 2 0 0 0 2 2 0 0 0 1.06 0.65 60 G 1 -3 0 4 -4 1 0 3 -3 -4 -4 -2 -3 -2 -3 -1 0 -4 -4 -1 14 0 3 27 0 9 5 27 0 0 0 0 0 2 0 3 5 0 0 5 0.50 0.65 61 T -2 -4 -4 -5 -3 -4 -4 -5 -3 2 3 -4 -1 0 -4 -3 0 -3 3 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13 26 0 0 3 0 0 7 0 15 37 0.64 0.65 62 W -2 -2 -3 -2 -4 1 4 -4 4 -1 -3 0 -1 1 -4 -2 1 6 -2 1 1 0 0 0 0 4 31 0 11 3 0 5 2 5 0 0 12 14 0 11 0.59 0.70 63 L -3 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -5 -5 3 4 -4 0 -2 -5 -4 -2 -4 -3 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21 55 0 0 0 0 0 0 0 0 24 0.90 0.70 64 T -1 1 0 -1 -3 0 -1 -3 1 -3 -3 1 -1 -4 -3 1 5 -4 -3 -2 3 9 2 2 0 4 3 0 4 0 0 10 2 0 0 6 56 0 0 0 0.70 0.70 65 Y -4 -4 -4 -5 -4 -4 -4 -5 -1 -2 0 -4 -2 6 -5 -4 -3 2 7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 36 0 0 0 2 51 6 1.38 0.70 66 H -2 0 2 -2 -3 -1 0 -3 4 -3 -4 2 -3 -4 -3 2 4 -5 -3 -2 0 4 11 0 0 0 5 0 12 0 0 15 0 0 0 16 36 0 0 3 0.58 0.70 67 G -3 -4 -3 -4 -4 -3 -4 3 4 -3 -3 -3 -3 3 -4 -3 -1 -1 7 -3 0 0 0 0 0 0 0 27 9 0 0 0 0 12 0 0 4 0 46 0 1.07 0.70 68 A 2 2 -2 -1 -3 -1 0 -3 -3 -3 -4 3 -3 -4 -3 3 2 -4 -1 -2 21 9 0 2 0 0 3 0 0 0 0 23 0 0 0 21 16 0 3 2 0.45 0.70 69 I -2 -4 -4 -4 -3 -3 -4 -5 -3 5 -1 -4 5 -1 -4 -3 2 -3 4 1 2 0 0 0 0 0 0 0 0 38 0 0 20 0 0 0 16 0 15 8 0.73 0.70 70 K -2 1 0 -3 -4 0 -2 -4 2 -2 -1 4 -2 -3 -3 -1 3 -4 1 1 0 7 3 0 0 3 0 0 6 0 7 31 0 0 0 2 26 0 5 11 0.44 0.70 71 L -2 -4 -5 -5 -3 -4 -4 -3 -5 1 3 -4 0 2 -4 -4 -1 -4 -2 5 0 0 0 0 0 0 0 2 0 2 35 0 0 9 0 0 3 0 0 49 0.77 0.70 72 D -2 -2 -2 3 -5 -2 -2 -3 -1 -5 -5 2 -4 -5 7 -1 -3 -5 -4 -4 2 0 0 21 0 0 0 0 2 0 0 17 0 0 53 4 0 0 0 0 1.32 0.70 73 D -2 3 -2 1 -5 -1 1 -3 -2 -5 -4 5 -3 -5 2 0 -2 -5 -4 -4 0 15 0 9 0 0 6 0 0 0 0 54 0 0 9 8 0 0 0 0 0.83 0.70 74 K -2 -2 2 5 -4 -2 1 1 -3 -4 -5 1 -4 -5 -3 1 2 -5 -4 -4 0 0 8 40 0 0 6 11 0 0 0 11 0 0 0 8 15 0 0 0 0.70 0.70 75 D -3 -3 3 6 -4 -2 -1 -3 2 -4 -1 -2 -3 -4 -3 0 0 -5 -3 -4 1 0 14 58 0 0 0 0 5 0 7 0 0 0 0 8 5 0 0 0 0.92 0.65 76 P 0 -2 -2 -2 -3 -2 0 -3 -3 -3 -3 0 -3 -4 7 0 -2 -4 -3 -3 6 1 1 1 0 1 5 1 0 1 1 7 0 1 67 5 1 0 0 1 1.46 0.59 77 Q -2 0 4 3 -3 3 -1 0 1 -3 -3 2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 -3 -3 2 5 27 18 0 15 1 7 4 1 2 12 0 1 1 1 1 0 1 1 0.50 0.56 78 F -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 1 -1 0 -2 -1 5 -2 -2 1 0 5 -2 2 2 1 2 1 1 2 2 3 2 7 2 1 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