Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 S 5 -3 -2 -3 -2 -2 -2 -2 -3 -3 -4 -2 -3 -4 -3 3 3 -5 -4 -2 54 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30 17 0 0 0 0.86 0.77 2 L -4 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -5 3 4 -5 -1 5 -6 -5 -4 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 44 0 0 29 0 0 0 4 2 5 1.04 1.10 3 T 2 -1 1 -2 -4 -1 -4 -3 -1 -3 1 -2 4 -2 3 -2 3 -5 -4 -1 16 3 7 2 0 3 0 1 2 0 12 2 11 1 17 1 18 0 0 3 0.44 1.27 4 H -2 -3 2 0 -4 -2 -3 -1 2 -5 -4 -3 -4 -5 0 6 0 -6 -5 -2 0 1 7 4 0 1 1 3 4 0 2 1 0 0 4 65 5 0 0 3 1.03 1.54 5 R -2 3 1 4 -6 1 4 1 -1 -6 -5 2 -2 -6 -3 -2 -3 -6 -4 -4 2 15 5 20 0 4 23 11 1 0 0 10 1 0 1 3 1 0 1 1 0.65 1.57 6 K 1 -1 -4 -4 -1 3 2 -3 -3 -3 -1 0 -4 -1 0 0 3 -5 1 -2 13 3 0 0 1 15 12 1 0 1 8 5 0 3 5 6 19 0 5 3 0.35 1.65 7 F -4 -5 -6 -7 -3 -4 -4 -5 -3 -2 -1 -5 -4 5 -7 -5 -4 10 5 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 4 0 0 27 0 0 0 36 18 9 1.89 1.84 8 G -2 -6 -3 -5 -6 -3 -5 7 -5 -4 -7 -3 -1 -7 -6 -4 -5 -6 -6 -4 2 0 0 0 0 1 0 92 0 1 0 2 2 0 0 0 0 0 0 1 2.15 1.93 9 G -2 -3 -1 -3 -6 -5 -4 7 -5 -7 -6 -4 -6 -7 -3 -2 -2 -3 -6 -6 2 1 3 1 0 0 1 84 0 0 1 0 0 0 1 3 2 0 0 0 1.87 1.95 10 S -2 -2 4 1 -1 0 1 -3 0 -3 -4 1 0 -5 3 1 1 -2 -3 -4 3 2 17 8 1 4 8 2 2 2 1 9 2 0 17 10 8 1 1 1 0.43 1.98 11 G -2 -2 -2 -2 -4 -3 -3 6 6 -5 -3 -2 -2 -5 -5 -2 -3 -6 -3 -3 3 2 2 2 0 1 2 57 17 0 3 2 1 0 0 3 2 0 1 2 1.20 1.98 12 G -2 -5 -2 -4 -6 -4 -5 7 -5 -7 -6 -5 -6 -7 -6 -2 -2 -6 -7 -7 1 0 2 0 0 0 1 90 0 0 0 0 0 0 0 1 3 0 0 0 2.13 1.99 13 S -1 0 2 3 -3 -1 -1 0 2 -3 -4 1 -3 -4 -3 2 3 -6 -3 -2 6 4 8 14 0 3 4 8 4 1 1 7 0 1 1 17 16 0 1 3 0.36 2.02 14 P 3 -1 -3 0 -4 -1 0 -4 -2 -1 -3 -1 -4 -3 5 0 -1 2 0 -1 22 4 1 4 0 2 6 1 1 4 3 4 0 1 27 7 3 3 3 4 0.55 2.01 15 F -4 -5 -6 -5 -4 -3 -4 -6 -1 -2 -3 -5 -2 7 2 -4 -4 8 3 -3 1 1 0 0 0 1 1 0 1 2 1 0 1 42 12 1 1 23 10 1 1.66 1.99 16 S -2 -2 2 4 0 1 -1 -2 1 -4 -5 0 -3 -5 -4 3 2 -6 -1 -3 3 2 10 21 2 5 3 2 3 1 0 6 1 0 1 25 12 0 2 2 0.55 1.99 17 G -3 3 -2 6 -1 -2 -1 2 2 -5 -5 -2 -5 -4 -4 -1 -1 -6 -3 -5 2 19 1 39 2 1 2 15 5 1 1 2 0 1 1 4 4 0 1 0 0.91 2.01 18 L -3 -4 -4 -6 -5 -6 -6 -4 -6 5 3 -5 -1 -2 -5 -5 -4 -6 -5 4 2 1 1 0 0 0 0 2 0 33 30 0 1 1 0 1 0 0 0 28 1.11 2.03 19 S -1 4 -1 -1 -4 -1 1 -3 0 -2 -3 2 -3 -4 -4 2 3 -6 -3 -1 5 21 3 3 0 2 8 2 2 2 2 14 1 1 0 13 15 0 1 5 0.46 2.05 20 S 1 0 -1 -3 -1 1 0 0 -1 -5 -5 4 -3 -5 -4 4 -1 -6 -3 -4 10 5 3 1 1 7 6 7 1 0 1 22 1 0 0 31 3 0 1 1 0.59 2.06 21 I -4 -6 -4 -5 -5 -4 -6 -7 -4 6 1 -6 0 -1 -5 -5 -4 -6 -2 4 0 0 1 1 0 1 0 0 0 53 9 0 2 2 1 0 0 0 1 28 1.38 2.06 22 A -2 2 -1 -3 -3 1 -1 -3 1 0 -3 0 -1 -2 -4 0 4 1 3 1 3 9 3 2 1 7 4 2 4 4 2 7 2 1 1 6 25 2 9 8 0.36 2.09 23 V -3 -6 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -6 5 2 -6 0 0 -6 -5 -2 -6 -4 5 1 0 1 0 0 0 0 1 0 33 20 0 2 3 0 0 2 0 0 36 1.14 2.09 24 R -2 5 -2 -3 1 -1 -2 0 1 -4 -3 -1 -3 0 -5 0 0 5 3 -2 3 33 2 1 3 2 3 8 3 1 2 4 1 3 0 7 5 7 10 3 0.61 2.09 25 S 1 -3 -2 -3 2 0 -3 1 6 -4 -4 -3 -4 -1 -5 3 -1 0 4 -1 10 1 2 1 4 4 1 12 17 1 1 1 0 2 0 20 4 1 13 5 0.59 2.09 26 G 0 -5 1 0 -4 -3 -2 6 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -2 -1 -3 0 -4 -4 6 0 6 6 0 1 2 62 0 1 1 2 0 0 2 4 1 2 1 2 1.18 2.12 27 S 0 0 2 2 -6 1 2 0 0 -3 -3 1 -2 -2 -4 2 0 1 -1 -3 7 5 8 13 0 5 13 6 2 2 2 7 1 2 0 16 5 2 2 2 0.29 2.10 28 Y 2 3 0 -3 2 -3 -3 -1 0 0 -2 -2 -3 1 -5 -2 -2 1 2 2 16 19 4 2 4 1 1 5 2 6 3 2 1 5 0 3 2 2 8 12 0.33 2.05 29 L -4 -5 -5 -6 -1 -2 -4 -4 -5 6 1 -4 -2 -1 -4 -3 -3 -2 -3 4 1 0 1 0 1 2 1 1 0 39 13 1 1 2 1 2 1 1 1 32 1.04 2.02 30 D -3 -1 1 7 -3 -1 0 -2 1 -3 -5 -1 -5 -4 -4 -1 -1 -6 0 -2 2 3 6 54 1 3 4 2 3 2 1 3 0 1 1 4 4 0 3 3 1.05 2.05 31 A 2 -2 -2 -3 0 -1 -3 4 -1 -5 -5 -2 -3 -3 -4 4 -3 -2 1 -4 15 2 2 1 2 3 2 28 1 1 1 2 1 1 1 30 1 1 5 1 0.69 2.08 32 I -4 -4 -5 -5 -2 -3 -4 -6 -3 6 2 -3 1 1 -3 -4 -2 -5 -2 3 0 1 1 1 1 2 1 0 1 41 17 1 4 6 1 1 2 0 1 19 0.95 2.07 33 I 0 0 -2 -3 -3 5 1 0 -2 -2 -4 2 -2 -4 -3 2 0 -3 -2 -1 8 5 1 1 1 23 10 6 1 2 1 10 1 1 1 15 6 0 1 5 0.43 2.09 34 I -3 -4 -4 -6 -2 -4 -5 -4 -3 2 1 -4 -1 6 -5 -4 -1 -4 0 4 2 1 1 0 1 1 1 1 1 12 12 1 1 33 1 1 4 0 2 26 0.93 2.10 35 D -2 -1 -2 1 -1 1 1 -3 -1 -1 -2 -2 -2 -3 -3 2 3 6 -2 -1 3 3 2 8 1 5 11 1 2 4 3 2 1 1 1 14 18 12 1 5 0.45 2.14 36 G -2 -4 -2 -5 -3 -3 -3 2 -2 -2 -3 -4 -3 0 -6 1 0 1 7 -2 4 1 2 0 1 1 1 17 1 2 3 1 1 2 0 13 7 2 40 3 0.98 2.15 37 V 0 -2 -2 1 -2 1 2 -1 -1 0 -1 -2 -1 -1 1 -1 2 -3 -3 2 7 2 2 7 1 6 13 4 1 5 6 2 1 2 7 5 12 0 1 14 0.17 2.17 38 H -3 2 1 3 -6 0 -1 -3 2 -2 -1 4 -2 -3 -1 -2 0 -2 1 -3 1 10 7 16 0 4 3 2 4 2 8 22 1 1 3 3 5 1 5 2 0.37 2.16 39 H -3 1 -1 -2 -3 0 -1 -3 9 -4 -3 -2 -3 1 -4 -2 -2 4 1 -2 2 6 3 2 1 4 4 2 44 1 2 3 1 7 1 3 2 6 4 3 1.18 2.18 40 G -1 -3 -2 -1 -3 -3 -4 7 -1 -5 -5 -3 -3 -1 -4 -2 -3 -2 -3 -5 4 1 1 4 1 1 1 71 1 1 1 1 1 2 1 3 2 1 1 1 1.42 2.17 41 G -2 -2 0 -2 -3 -1 -2 6 -2 -5 -5 0 -3 -4 -3 0 -1 1 -3 -4 2 2 5 2 1 2 2 58 1 1 1 7 1 1 2 6 4 2 1 2 1.02 2.18 42 S -1 0 2 0 -1 1 0 -1 -2 -3 -3 2 -2 -3 1 2 2 -1 -2 -1 4 6 9 5 1 6 5 5 1 1 2 14 1 1 6 14 11 1 2 4 0.24 2.18 43 G -1 0 0 -2 -2 0 -1 5 -1 -3 -3 -1 -2 -2 0 -1 2 0 -3 -2 4 6 4 2 1 4 5 38 1 2 2 4 1 2 4 4 11 1 1 3 0.48 2.15 44 G -2 -3 -2 -1 -1 -2 -2 6 0 -4 -3 -2 -2 -3 -2 0 -2 -1 -3 -3 3 1 2 4 1 2 3 60 2 1 3 2 1 1 2 6 2 1 1 2 1.01 2.16 45 N -2 -2 3 1 -1 -1 0 2 1 -3 -3 0 -1 -2 -2 2 2 0 -2 -2 4 2 11 8 1 3 5 16 3 2 3 5 1 2 2 13 13 1 1 3 0.25 2.15 46 L 0 1 -1 1 1 -1 1 -2 1 -1 -1 1 0 -1 1 0 0 1 0 -1 7 7 3 7 3 3 10 4 3 4 8 8 2 2 6 8 5 2 3 4 0.06 2.08 47 S 0 -1 0 -1 0 0 1 -1 2 -2 -3 1 -1 0 0 2 2 1 0 -2 6 3 5 4 2 4 9 6 5 3 2 7 2 4 4 14 12 2 4 3 0.13 2.08 48 P -1 0 0 2 -5 0 2 -2 2 -1 -2 0 0 2 0 -1 1 2 0 -1 5 5 4 10 0 5 11 3 4 5 4 5 3 8 5 4 7 3 3 4 0.12 2.04 49 T -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.09 2.12 50 F -3 -3 -4 -5 -3 -5 -4 -4 -3 4 3 -4 1 5 -4 -4 -3 0 0 1 1 2 1 1 1 0 1 2 0 24 24 1 3 25 1 1 1 1 2 8 0.80 1.86 51 T -1 -2 1 2 -1 0 2 -3 0 0 -1 1 -1 -1 -3 -1 3 -3 -2 0 6 2 5 11 1 4 12 2 3 5 6 7 1 2 1 4 16 0 1 8 0.19 1.83 52 F -3 -4 -3 -1 -5 -2 -4 -5 -3 1 5 -4 0 2 -3 -5 -1 -2 -3 0 1 1 2 4 0 2 1 1 1 7 58 1 2 9 1 0 3 1 1 5 0.86 1.85 53 G 1 0 1 1 -3 1 1 3 0 -4 -3 -2 -3 -1 -2 -1 -1 -2 2 -4 12 5 6 9 0 6 9 21 3 1 2 2 1 3 2 5 5 1 6 1 0.27 1.83 54 S 0 0 -1 2 -5 -1 1 -2 -1 -4 -3 -1 -2 -3 6 0 -2 -6 -3 -2 7 5 2 11 0 3 8 3 2 1 2 3 1 1 37 8 3 0 1 3 0.73 1.80 55 G -2 0 2 3 -3 -2 -1 5 -1 -4 -4 -2 -3 -4 -5 1 -1 -2 -2 -4 2 5 8 17 1 1 3 40 2 1 1 2 1 1 0 10 3 1 1 1 0.72 1.77 56 E -3 -2 -1 1 -6 -1 7 -4 -3 -4 -5 -2 -5 -6 -4 -2 -3 -1 -5 -4 1 1 3 6 0 1 78 1 0 1 0 1 0 0 0 2 1 1 0 1 1.59 1.76 57 Y -3 -2 -3 -3 -1 -2 -3 -1 5 -1 -3 -1 -2 3 -2 -1 -1 0 7 -1 1 3 1 2 1 1 2 5 12 3 2 4 1 11 2 4 4 1 35 5 0.83 1.80 58 I -3 -5 -5 -6 -4 -2 -5 -3 -5 6 3 -5 0 0 -5 -3 -3 4 -4 3 1 0 0 0 0 2 0 2 0 39 23 0 1 3 0 2 1 5 0 17 0.95 1.80 59 S 0 -2 0 -2 -2 -1 -2 -5 -2 1 -2 1 1 -3 -5 -1 5 -5 -3 2 6 1 4 2 1 3 2 0 1 8 3 8 3 1 0 3 38 0 1 14 0.58 1.84 60 N -1 1 0 -2 -1 2 2 2 -1 -5 -4 1 -1 -3 -3 3 -1 -1 -2 -3 5 6 4 1 1 8 12 17 2 0 1 8 2 1 1 23 3 1 1 2 0.38 1.89 61 M 0 -5 -5 -6 0 -5 -5 -3 -5 3 0 -5 4 3 -5 -3 -1 1 -1 5 6 0 0 0 2 0 0 2 0 14 7 0 9 11 0 2 3 2 2 39 0.81 1.86 62 T -2 0 1 1 -1 1 3 -3 1 -3 -2 1 -4 -2 -5 2 1 -5 2 -2 3 4 5 6 1 7 18 2 3 2 4 8 0 2 0 15 8 0 8 4 0.28 1.86 63 I -1 -3 -4 -5 -1 -3 -3 4 -5 1 1 -5 0 -1 -5 -3 -2 1 -1 3 6 2 0 0 1 1 2 34 0 7 14 0 2 2 0 2 2 2 2 18 0.54 1.85 64 R -3 4 -1 -3 5 -2 -2 -2 4 -3 -3 -1 -2 -1 -3 0 2 0 3 -3 2 20 2 1 13 1 2 3 9 2 2 4 1 2 1 8 13 1 9 1 0.52 1.83 65 S -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 0 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 66 G -2 -1 0 1 0 -1 -2 5 1 -5 -5 0 -1 -2 -2 -1 -1 -5 0 -3 3 3 4 8 2 2 3 41 3 0 0 5 2 2 2 5 4 0 3 2 0.54 2.09 67 D 0 0 1 2 0 1 0 -2 2 -2 -2 0 0 -1 -1 0 1 2 0 -2 8 5 7 10 2 5 5 4 5 3 4 7 3 3 4 6 8 3 3 4 0.04 2.19 68 Y -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 -5 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 5 5 5 0.07 2.12 69 I -2 -3 -1 -2 -4 -2 -3 -3 -5 5 1 -5 1 -4 -2 -2 -1 -5 -1 4 2 2 3 2 0 2 2 2 0 33 13 0 3 0 2 3 3 0 2 25 0.63 1.77 70 D -3 2 1 3 -1 -1 -2 0 0 -3 -3 -1 -1 4 -3 -1 1 0 -1 -2 2 12 6 17 1 3 2 7 2 2 2 3 1 15 1 5 10 1 2 3 0.30 1.77 71 N 0 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