Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 D -5 -4 3 8 -6 -3 1 -4 -4 -6 -7 -3 -6 -6 -4 -3 -4 -7 -6 -6 0 0 12 81 0 0 7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.96 1.41 2 A -1 1 -3 -1 -4 -1 1 -4 2 -4 -5 3 -5 -6 6 -2 -1 -6 -4 -4 5 8 1 3 0 2 9 1 5 1 1 20 0 0 38 2 3 0 0 1 0.96 1.52 3 K -1 3 -2 0 -6 1 2 -4 -1 -4 -4 4 -4 -2 -2 0 0 3 -4 -1 6 16 2 4 0 6 15 0 1 1 1 25 0 2 1 6 5 5 0 4 0.52 1.53 4 F -4 -4 -5 -7 -4 -4 -6 -7 -2 -1 6 -5 4 0 -4 -5 -3 -2 -1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 2 75 0 8 4 1 0 1 1 2 4 1.27 1.53 5 L -4 -1 -5 -6 -1 -4 -6 -7 -4 0 6 -4 3 -2 -4 -4 -3 -5 -3 -2 1 4 0 0 1 0 0 0 0 3 80 1 5 1 1 1 1 0 0 1 1.31 1.55 6 E 0 -2 0 4 -6 1 6 -3 -2 -6 -6 0 -5 -6 -4 0 -3 -6 -5 -5 7 1 3 24 0 4 47 1 1 0 0 5 0 0 0 6 1 0 0 0 1.07 1.57 7 I -2 -2 -4 -6 -4 -5 -6 -6 -2 6 1 -2 2 2 -6 -4 -3 -2 -3 1 4 2 1 0 0 0 0 0 1 56 12 2 4 8 0 1 1 0 0 8 1.06 1.59 8 L -3 -5 -7 -7 -4 -5 -6 -7 -6 2 6 -6 1 -2 -6 -5 -4 -5 -4 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 7 85 0 2 1 0 0 0 0 0 4 1.53 1.58 9 V 4 1 -5 -6 3 -3 -5 -3 -5 0 -3 -4 -3 -3 -5 -3 -3 -6 -5 5 33 9 0 0 7 1 0 2 0 3 1 0 0 1 0 1 0 0 0 44 0.95 1.62 10 C -2 -7 -6 -3 11 -6 -7 -6 -6 -4 -4 -6 -5 -6 -6 -3 -4 -6 -6 -4 2 0 0 2 96 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 3.38 1.64 11 P -4 -5 -5 -5 -6 -4 -4 -5 -5 -6 -3 -4 -2 -7 9 -4 -4 -7 -6 -5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 1 0 96 0 0 0 0 0 2.94 1.64 12 L 0 -1 -3 -3 -3 1 -2 -3 -1 1 2 1 1 -2 -3 -3 -3 -5 -3 4 8 3 1 1 0 7 2 2 2 8 19 9 3 2 1 2 1 0 1 28 0.39 1.63 13 C -3 -5 -2 3 9 -5 -4 -4 -3 -5 -5 -4 -5 -4 -5 2 3 -6 -5 -4 1 0 1 15 44 0 0 1 1 0 0 1 0 0 0 16 20 0 0 0 1.58 1.73 14 K -4 2 0 -4 -6 1 -2 -1 4 -6 -4 6 -3 -3 -3 -3 -3 -6 -3 -5 0 10 3 0 0 5 1 5 11 0 2 57 0 1 1 1 1 0 1 0 1.17 1.72 15 G 1 -3 -2 -3 -4 1 -2 5 -1 -6 -5 0 -3 -5 -5 0 0 -2 -3 -4 13 1 2 1 0 6 3 49 2 0 1 7 1 0 0 8 5 1 1 1 0.84 1.76 16 P -2 1 -2 1 -6 -1 1 -2 -3 -5 -5 2 -5 -5 6 -1 -1 -7 -6 -4 3 6 2 9 0 2 9 3 0 0 1 12 0 0 42 5 4 0 0 1 0.96 1.76 17 L -4 -5 -7 -7 -5 -4 -6 -5 -6 0 6 -6 -1 -1 -4 -6 -4 -5 -4 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 2 86 0 1 2 1 0 0 0 0 6 1.56 1.75 18 V -2 3 -3 -1 -5 0 3 -4 2 0 -1 0 -1 -3 -5 0 1 -3 -1 1 3 18 1 3 0 3 19 1 4 6 7 6 1 1 0 7 9 0 2 10 0.34 1.78 19 F -2 -4 -4 -2 -1 -3 -3 -5 2 -2 3 -4 -1 2 -1 -4 -3 3 6 -1 3 1 0 3 1 1 1 1 4 1 29 1 1 7 4 1 1 4 33 4 0.85 1.73 20 D -1 -1 2 5 1 0 1 -3 0 -2 -1 -1 -3 -4 -3 -1 -1 -6 -3 0 4 4 9 37 3 3 9 1 2 3 5 3 1 1 1 3 3 0 1 7 0.56 1.71 21 K 2 2 -2 1 -5 0 3 0 -1 -3 -4 2 -3 -4 1 -1 -1 -5 -3 -2 16 10 1 6 0 4 19 6 1 2 2 13 0 0 7 5 3 0 1 3 0.34 1.73 22 S 1 -2 -1 3 -5 0 4 -1 -1 -3 -4 1 -2 -5 -2 1 -1 -6 -5 -3 13 1 3 14 0 4 29 5 1 1 1 7 1 0 2 10 4 0 0 1 0.49 1.67 23 K 2 2 1 0 -5 0 2 1 0 -4 -4 2 -3 -3 0 -1 2 -2 -3 -3 15 9 7 5 0 4 12 10 2 1 1 11 0 1 4 4 11 1 1 1 0.28 1.68 24 D -1 -1 3 3 -3 4 1 1 -1 -4 -4 -1 -2 -4 -1 -1 -1 -5 -3 -3 5 2 15 14 1 21 9 10 1 1 2 4 1 1 3 5 3 0 1 2 0.46 1.68 25 E 0 0 -3 -2 -1 0 6 0 -1 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -1 -2 1 -1 -1 7 4 1 1 1 3 52 8 1 2 3 2 1 1 0 4 2 2 2 4 0.77 1.69 26 L -3 -5 -6 -6 0 -3 -6 -6 -6 0 6 -5 0 -1 -6 -3 -4 -5 -2 0 1 0 0 0 2 1 0 0 0 2 82 0 1 2 0 2 0 0 1 5 1.37 1.59 27 I -1 -1 -4 -4 -1 -2 -4 -6 1 5 0 -2 -1 -1 -6 -3 -1 0 2 4 4 3 1 1 1 2 1 0 3 34 6 2 1 2 0 1 4 1 7 26 0.71 1.66 28 C -2 -3 3 -2 10 -3 -5 -3 -5 -5 -5 -5 -5 -3 -5 3 -1 -6 -5 -4 2 1 16 2 51 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 21 3 0 0 0 1.73 1.67 29 K -1 2 -2 1 -1 -1 2 -2 -1 -4 -3 2 -3 -2 3 -2 2 0 -1 -3 4 11 2 9 1 2 14 2 2 1 2 12 1 2 16 2 12 1 3 2 0.36 1.66 30 G 2 2 1 1 -2 0 2 -1 -2 -3 -4 2 -3 -1 -2 0 -2 -2 -1 -1 17 12 6 6 1 3 14 4 1 1 1 12 1 3 2 8 2 1 2 4 0.26 1.67 31 D 2 -2 -3 2 8 -4 -3 -1 -2 -2 0 -4 -2 -5 -2 0 -2 -6 -5 -3 16 2 1 12 35 0 2 4 1 2 12 1 1 0 2 7 1 0 0 1 0.95 1.66 32 R -1 3 1 -1 -1 0 -1 4 2 -5 -2 1 -1 -2 -2 -1 -2 -6 -5 -5 3 16 8 2 2 5 3 33 4 0 4 8 2 2 2 4 2 0 0 0 0.53 1.47 33 L -2 3 -5 -5 -5 -1 -1 -3 -1 3 3 -1 0 -1 -3 -3 -2 -5 -1 1 3 15 0 0 0 3 5 2 2 16 34 3 2 2 2 2 3 0 2 7 0.45 1.47 34 A 5 2 -2 -2 0 -2 -2 -1 0 -2 -2 -1 -1 -1 -2 0 -1 -5 -1 0 45 10 2 2 2 2 2 4 2 2 3 2 1 2 1 7 3 0 2 5 0.48 1.47 35 F -5 -5 -5 -6 2 -5 -5 -6 2 -4 -4 -5 -4 5 -6 -1 -4 4 8 -4 0 0 0 0 4 0 0 0 4 0 0 0 0 21 0 4 0 5 62 0 1.90 1.47 36 P -1 0 -4 -1 -5 -1 0 -3 -1 -5 -2 -2 -4 -5 7 -2 -2 -5 -2 -3 4 5 0 3 0 2 7 2 2 0 5 2 0 0 61 2 2 0 2 2 1.40 1.40 37 I -3 -5 -5 -5 -3 -4 -5 -5 -5 6 0 -5 1 0 -5 -4 -1 -4 -3 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 57 4 0 3 3 0 0 3 0 0 26 1.18 1.23 38 K -3 5 -1 1 -2 0 2 -4 -1 2 -2 1 -2 -4 -4 -2 -1 0 -4 0 2 30 2 7 1 3 12 0 2 13 3 9 1 0 0 3 4 1 0 7 0.48 1.29 39 D -3 -2 2 7 -5 1 2 -2 -1 -5 -5 -2 -5 -5 -4 -2 -2 -5 -2 -5 2 1 9 56 0 5 13 2 2 0 1 2 0 0 0 2 2 0 2 0 1.15 1.29 40 G -2 -2 0 2 -5 -2 -1 6 -1 -5 -5 -2 -5 -5 -4 -2 -2 -5 -5 -5 2 2 4 11 0 2 3 66 1 0 1 2 0 0 0 2 2 0 0 0 1.22 1.27 41 I -3 -5 -5 -5 -1 -4 -5 -5 -5 7 0 -3 0 -1 -5 -4 -2 -4 -3 2 2 0 0 0 1 0 0 1 0 74 3 1 2 2 0 0 1 0 0 10 1.35 1.23 42 P -2 -4 -4 -4 -4 -3 -3 -4 -4 -4 -3 -3 -4 -5 8 -3 -3 -5 -1 -4 3 0 0 0 0 0 1 1 0 0 3 0 0 0 86 1 0 0 2 1 2.33 1.14 43 M -3 -2 3 -2 0 -1 -3 -5 -2 4 -2 -4 0 -3 -5 -3 -2 -5 -2 4 1 2 17 2 2 3 1 0 1 29 1 0 2 0 0 1 1 0 1 37 0.76 1.23 44 M -4 -4 -3 -6 -4 -4 -5 -6 -5 -1 4 -4 8 -1 -5 -4 -3 -4 -3 -1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 46 0 47 1 0 0 1 0 0 2 1.44 1.22 45 L -3 -3 -4 -4 -4 -4 -5 -6 -1 2 5 -5 0 -2 -4 -3 -1 -1 -4 1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 9 69 0 1 1 0 2 3 1 0 8 0.99 1.25 46 E 1 -3 -3 -3 -2 -2 2 -4 -4 2 -2 -2 -2 -4 5 -2 -3 -6 -2 1 13 1 1 1 1 1 16 0 0 13 4 2 0 0 33 1 1 0 2 12 0.70 1.30 47 S -1 -2 2 5 -3 2 2 -2 -1 -5 -5 -1 -5 -6 1 1 -1 -6 -4 -4 4 1 8 36 0 8 15 2 2 0 0 2 0 0 7 11 3 0 0 1 0.72 1.31 48 E 0 -1 -2 2 -6 1 6 -4 -1 -6 -5 0 -4 -3 -4 -1 -2 -6 -5 -4 9 3 1 9 0 6 59 0 1 0 1 4 0 1 0 4 1 0 0 0 1.05 1.31 49 A 6 -4 -4 -4 -3 -2 -2 1 -2 -3 -2 -3 -1 -3 -4 -1 -2 -5 -2 -3 78 0 0 0 0 1 1 8 1 1 3 0 2 1 0 3 1 0 1 0 1.17 1.30 50 R -3 7 -3 -3 -6 0 0 -4 -2 -2 -4 2 -2 -5 -5 -1 -1 -5 -3 -1 1 67 0 1 0 2 5 0 1 3 1 9 1 0 0 3 4 0 0 4 1.26 1.30 51 E 0 0 -2 2 -5 1 1 -4 -1 0 -2 1 0 -4 3 0 0 -5 -2 -1 7 6 1 11 0 6 10 0 1 5 3 10 3 1 15 8 7 0 2 4 0.28 1.29 52 L -2 -4 -6 -5 -3 -5 -3 -5 -4 3 5 -2 1 -1 -1 -4 -2 2 -3 2 2 0 0 0 0 0 2 0 0 13 52 2 2 2 4 1 2 3 0 13 0.76 1.31 53 A 0 -2 1 3 -2 0 1 -1 -1 -3 -5 -1 -4 -5 0 3 3 -3 -5 -4 7 1 6 19 1 3 10 3 2 2 0 3 0 0 5 21 16 0 0 1 0.46 1.31 54 P 2 -3 -1 4 -5 1 2 -2 -2 -2 0 -2 -3 -4 2 0 -1 -6 -3 -3 16 1 3 20 0 6 15 2 1 2 9 2 1 0 10 7 4 0 1 2 0.37 1.32 55 E -1 -3 1 5 -3 -1 5 -3 0 -5 -5 -1 -5 -5 -3 -1 -1 1 -3 -4 6 1 5 34 1 2 37 1 2 0 1 2 0 0 0 3 3 2 1 0 0.92 1.23 56 E -2 -2 0 2 -6 1 7 -5 -2 -5 -5 0 -5 -6 -2 -2 -2 -6 -5 -4 2 1 4 10 0 5 70 0 1 0 0 3 0 0 1 1 1 0 0 0 1.29 1.23 57 E -2 2 -2 0 -5 0 3 -4 6 -5 -4 4 -4 -5 -2 -1 -2 -5 -1 -5 3 11 1 5 0 3 20 0 21 0 1 26 0 0 2 4 1 0 2 0 0.74 1.11 58 V 1 -2 -2 -1 -4 1 2 -1 -4 1 3 -2 -2 -3 -3 -1 0 -5 -4 1 15 2 1 3 0 7 14 4 0 6 27 1 0 0 1 3 5 0 0 11 0.26 0.97 59 K -3 5 -1 -2 -6 2 3 -4 2 -5 -5 5 -4 -5 -4 -2 -3 -5 -4 -5 0 33 1 0 0 6 21 0 4 0 0 34 0 0 0 0 0 0 0 0 1.00 0.88 K Lambda Standard Ungapped 0.1427 0.3204 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1950 0.3180 PSI Gapped 0.0597 0.2670