JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_3bHek5_.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |||E|E|E||||||E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E|H|H|H|H|H|E|E|||||||||||E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E||||||||||H|H|H|H|H||E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||E|||||||E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|7|1|8|8|6|3|8|8|8|4|5|8|8|8|8|1|3|7|8|8|8|7|5|1|5|6|7|2|0|1|0|2|0|1|1|1|3|5|7|7|8|7|7|7|4|1|8|8|9|8|2|4|7|8|7|5|0|7|8|8|8|7|1|5|8|8|8|4|5|8|9|9|8|6|0|7|8|8|5|0|4|4|3|2|1|1|1|3|7|8|8|7|5|1|1|1|1|2|3|0|0|5|7|8|7|3|5|7|8|8|1|4|8|8|5|5|8|9|8|5|1|7|7|8|8|7|7|5|2|2|3|1|1|2|1|0|4|7|8|1|2|3|2|5|7|8|4|5|8|9|9|9|2|0|0|3|8|8|7|4|0|1|1|5|7|8|8|4|5|8|8|8|6|1|5|7|7|6|5|5|6|6|6|6|3|1|0|2|0|5|8|8|5|1|8|9|9|8|1|4|7|6|0|3|1|7|7|8|6|1|7|8|8|4|6|8|8|8|2|3|5|7|7|7|7|5|2|3|5|3|2|0|1|3|3|4|6|8|9|8|8|8|5|0|8 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|-|B|-|B|-|-|-|B|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|B|B|-|-|B|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|B|B|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|-|-|-|B|-|-|B|B|B|B|-|-|-|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |||E|E|E||||||E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E||||||||||H|H|H|H|H|H|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E||||||||||||||||||||||E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E|E|||E|E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E||||||||||E|E|H|H||||E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E||||||||||||E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|||||||||||E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | |*| | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | |*|*|*|*|*|*|*|*|*|*| | | | | | | | |*| | | | |*| | | | | |*| | | | | |*| | | | | | | | | | | |*| | | | |*|*|*|*|*|*|*|*| | | | | | |*| | | | | |*| | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | |*| | | | | | | | |*|*| | |*|*|*| | | |*|*|*|*| | | | | | | | | |*|*|*|*| | | | |*|*|*| | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | |*|*|*| | | | | |*| | | | |*| | | | |*|*| | | | |*| | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | |*|*|*|*|*|*| | | | | | | | |