Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 D -4 -3 3 5 -6 3 5 -4 -3 -6 -6 -2 -5 -6 -4 -2 -3 -6 -5 -5 0 0 17 30 0 12 41 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.23 1.19 2 L -1 -2 -5 -5 -2 -3 -5 -6 -4 3 3 -3 1 0 -5 -2 -1 -5 -2 4 5 2 0 0 1 1 0 0 0 16 32 1 4 4 0 2 3 0 1 26 0.65 1.36 3 E 1 2 -1 1 -4 2 4 -4 -2 -3 -4 1 -3 -4 -4 1 0 -5 -3 -3 12 13 3 7 0 7 27 0 1 1 0 7 0 1 0 13 4 0 1 1 0.50 1.38 4 E -3 -3 3 2 -6 0 6 -3 -1 -5 -6 -2 -5 -6 -4 -1 -2 -6 -5 -5 1 0 14 8 0 2 67 1 1 0 0 1 0 0 0 2 2 0 0 0 1.34 1.38 5 T -2 -2 -3 -4 -4 -1 0 -4 -1 3 -2 -3 -2 -2 -5 -1 4 -5 -1 4 2 2 1 0 0 3 6 1 1 15 0 0 1 2 0 4 24 0 2 35 0.64 1.40 6 G -3 -5 -3 -2 -5 -3 -5 7 -5 -7 -7 -3 -6 -6 -5 -2 -4 -5 -6 -6 0 0 0 1 0 1 0 95 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 2.12 1.42 7 R -3 4 -2 -4 -2 -1 -1 -5 2 0 -3 1 -3 -1 -4 -1 5 -2 0 0 1 22 1 0 1 2 3 0 5 6 1 7 0 2 0 2 34 0 4 8 0.61 1.46 8 V -2 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -6 3 -1 -5 -2 -4 -5 -4 -2 -6 -4 7 1 0 0 0 0 0 0 0 0 14 2 0 0 0 0 0 1 0 0 82 1.60 1.43 9 L -2 -3 -3 -4 -3 -3 0 -5 -3 3 3 -2 0 -2 -5 -2 2 -5 -3 3 2 1 1 0 0 1 7 0 1 19 32 2 2 1 0 2 12 0 0 17 0.56 1.48 10 S -1 -1 0 -1 -4 3 1 -3 -1 -4 -4 0 -2 -2 -3 5 1 0 1 -4 3 2 3 2 0 12 7 1 2 0 1 5 1 1 1 42 8 2 6 0 0.60 1.47 11 I -1 -5 -3 -6 -2 -4 -5 -6 -5 4 0 -5 0 -2 -5 -3 -1 -5 -1 6 4 0 1 0 1 0 0 0 0 20 5 0 2 1 0 2 3 0 2 58 1.07 1.44 12 G 0 -2 -2 -1 -3 -2 -3 6 -2 -5 -5 -1 -4 -4 -4 1 -1 0 -3 -4 8 2 1 3 0 1 1 60 1 0 1 3 0 1 0 12 3 1 1 1 1.05 1.43 13 D -3 -2 0 7 -5 -2 -1 -2 -2 -4 -5 -2 -5 -4 -3 -2 -2 -5 -5 -3 2 2 3 78 0 1 1 2 1 1 1 1 0 1 1 1 2 0 0 2 1.60 1.31 14 G -2 -4 -2 -2 -4 -1 -3 7 -4 -5 -5 -4 -4 -3 -3 -1 -3 1 -2 -5 1 0 1 2 0 3 1 79 0 0 1 0 0 1 1 3 1 2 1 0 1.54 1.31 15 I -3 -5 -5 -5 -3 -4 -5 -5 -3 7 0 -4 -1 -2 -4 -2 -2 -4 -2 3 1 0 0 0 0 0 0 1 1 64 4 0 1 1 0 2 2 0 1 20 1.23 1.30 16 A 6 -4 -4 -4 0 -3 -3 -3 -4 0 -2 -3 -3 -4 -3 -1 -1 -4 -4 2 67 0 0 1 2 0 1 1 0 6 3 1 0 0 1 2 2 0 0 13 0.99 1.30 17 R -3 6 -1 -3 -1 2 -2 -4 2 -1 -2 1 -1 0 -4 -2 0 4 -2 -2 1 44 2 1 1 8 2 1 4 4 4 6 1 5 0 2 6 6 1 2 0.75 1.38 18 V 1 -4 -4 -5 0 -4 -4 -4 -5 4 0 -4 0 -3 -4 -2 -2 -5 -4 5 10 0 0 0 2 0 0 1 0 27 6 0 1 0 0 3 1 0 0 46 0.91 1.33 19 H -2 -1 -1 0 -2 -2 0 -2 5 -2 -3 -2 -2 0 -4 2 -1 0 5 -2 2 4 2 5 1 1 6 2 15 3 1 2 1 3 0 20 2 1 24 3 0.60 1.38 20 G -1 -3 -1 -2 -4 -4 -4 7 -4 -5 -4 -2 -4 -5 -4 -2 -4 0 -5 -5 2 1 2 1 0 0 0 82 0 0 2 2 0 0 0 2 0 1 0 0 1.64 1.32 21 L -4 -4 -5 -5 -1 -4 -5 -5 -5 0 6 -4 1 -1 -3 -2 -1 -4 -3 -1 1 0 0 0 1 0 0 1 0 4 77 0 3 1 2 2 3 0 0 2 1.17 1.36 22 R -1 1 1 2 -5 0 2 -1 -1 -4 -4 0 -2 -3 4 1 -1 0 -3 -3 6 6 7 12 0 4 14 5 1 1 2 5 1 1 20 9 2 2 1 2 0.40 1.42 23 N -2 0 5 2 -4 0 0 1 1 -5 -3 1 -2 -3 -4 2 -1 -5 -2 -4 3 4 31 11 0 3 4 9 3 0 2 8 1 1 0 13 2 0 1 0 0.57 1.34 24 V 4 -2 -1 -4 4 -4 -4 -4 -4 1 -2 -4 1 -4 -1 -2 -1 -5 -4 4 38 2 3 0 7 0 0 1 0 7 3 0 4 0 2 2 3 0 0 27 0.67 1.35 25 Q 1 1 -2 -2 -1 2 -1 0 -4 -2 -2 1 6 -1 -1 -2 -2 -4 -2 -1 13 6 1 2 1 10 3 9 0 2 3 7 27 3 3 2 2 0 1 4 0.45 1.39 26 A 3 -2 -2 -4 0 -1 -2 -3 0 0 1 -3 2 0 -4 1 -1 -3 3 -1 26 2 2 0 2 3 2 1 2 5 14 0 6 4 0 12 3 0 12 4 0.34 1.26 27 E -1 -3 1 1 -4 1 0 4 4 -4 -2 -1 0 -1 -4 -1 -3 -4 2 -4 3 0 6 7 0 7 7 32 10 0 4 3 3 3 0 4 1 0 7 1 0.49 1.18 28 E -1 -2 -2 1 -5 3 6 -1 -3 -5 -4 0 -4 -5 -3 -2 -3 -4 -4 -4 5 0 0 6 0 10 63 6 0 0 1 5 0 0 0 1 0 0 0 1 1.12 1.19 29 M 0 0 1 -4 3 1 0 -4 -4 0 -1 0 2 1 1 0 0 -5 -4 0 6 6 6 0 6 6 6 0 0 6 6 6 6 6 6 6 6 0 0 6 0.10 1.67 30 V -3 -4 -5 -5 1 -4 -2 -5 -4 3 3 -4 1 -2 -4 -4 -3 -4 1 4 1 0 0 0 3 0 4 1 0 13 33 0 3 0 0 1 0 0 6 32 0.79 1.41 31 E -2 0 -1 0 0 1 5 -3 1 -1 -2 0 0 -2 -4 0 0 2 -1 -2 3 4 2 4 2 5 36 2 4 3 5 6 2 2 0 8 6 2 2 3 0.44 1.66 32 F -4 -4 1 -5 3 -4 -5 -5 -4 1 0 -4 2 7 -5 -1 0 -3 2 0 1 0 7 0 6 0 0 1 0 7 8 0 5 43 0 5 5 0 5 5 0.91 1.50 33 S -1 -1 -1 1 1 0 2 0 1 -1 -2 -1 0 -4 3 0 -1 -5 -1 -2 5 4 3 8 3 3 14 8 3 3 3 4 3 0 13 7 4 0 3 3 0.15 1.50 34 S -2 -1 4 2 0 0 0 3 1 -5 -3 -1 -5 -5 -1 0 -1 -5 -1 -3 3 4 19 11 2 4 7 21 3 0 2 3 0 0 3 8 4 0 2 2 0.42 1.84 35 G -2 -1 2 1 2 -1 -1 5 0 -2 -5 -1 -5 -5 -1 -1 -2 1 -1 -3 2 3 9 8 4 3 4 43 2 3 0 3 0 0 3 3 3 2 2 2 0.65 1.84 36 L -1 0 0 0 3 1 0 -1 2 0 -1 0 2 1 -5 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 5 5 5 0.13 2.01 37 K -2 1 -1 -1 1 1 -1 -2 0 1 -2 3 2 0 -1 -2 0 2 1 -1 3 7 3 3 3 6 3 3 3 10 4 22 6 4 3 3 6 3 5 3 0.22 1.49 38 G 1 -3 -2 2 4 -2 1 1 4 -3 -3 -3 3 -3 -3 1 -2 5 -2 -3 11 1 0 11 10 0 11 11 10 1 1 1 10 0 1 11 1 10 0 1 0.50 0.90 39 M -3 1 -4 -4 -4 1 0 -4 3 1 0 1 3 2 -4 -3 1 5 2 0 1 8 0 0 0 7 8 1 7 8 8 8 7 7 0 1 8 7 7 8 0.36 1.34 40 S 3 -4 -3 0 4 -3 -3 1 -4 1 -3 -3 -3 -4 -3 0 0 -4 -4 3 30 0 0 6 10 0 1 10 0 6 1 1 0 0 0 6 6 0 0 20 0.47 1.01 41 L -2 -1 -4 -2 -4 1 -1 -4 1 0 4 -3 3 2 -2 -1 -1 -3 0 -1 3 3 0 3 0 8 4 1 4 5 37 0 7 9 3 4 3 0 3 3 0.39 1.19 42 N -1 -3 6 2 -4 0 -1 0 1 -1 -4 -1 0 -4 -1 -1 -1 -5 0 -2 4 0 39 11 0 3 4 5 3 4 1 4 3 0 4 4 4 0 3 4 0.61 1.24 43 L 1 2 -3 -3 -3 -3 -3 -3 4 2 0 -2 -2 2 2 1 -2 -3 -2 1 11 11 0 1 0 0 1 1 10 11 11 1 0 10 11 11 1 0 0 11 0.30 0.90 44 E -2 1 2 2 1 0 4 -2 1 -4 -2 0 0 -4 -4 0 -1 2 0 -4 3 6 8 13 3 4 29 4 3 0 4 4 3 0 0 5 3 3 3 0 0.43 1.30 45 P -1 2 2 -1 0 0 3 -4 0 -2 -3 1 0 -2 3 0 -1 -4 0 -2 4 10 10 3 2 4 19 1 2 2 3 7 2 2 13 6 4 0 3 3 0.29 1.44 46 D -3 0 2 6 -5 0 2 0 0 -5 -4 -1 -2 -3 -4 -1 -1 -5 -2 -5 2 5 8 42 0 4 12 8 2 0 2 4 1 1 0 3 3 0 1 0 0.76 1.47 47 N -1 0 1 1 1 0 1 -1 1 -1 0 -1 1 0 -4 2 0 -4 0 -1 4 6 7 8 3 4 8 4 3 4 12 3 3 3 0 14 7 0 3 4 0.11 1.44 48 V 1 -3 -3 -4 4 2 -3 1 -3 1 0 -3 3 -3 -3 1 1 -4 -3 1 10 0 0 0 9 9 1 10 0 10 10 1 9 0 0 10 10 0 0 10 0.31 1.01 49 G -1 -2 -1 -2 1 -1 -2 6 -3 -4 -3 -2 -1 -4 -4 0 -2 0 0 -4 2 2 2 2 3 2 2 62 0 0 2 2 2 0 0 7 2 1 4 1 0.98 1.14 50 V 3 -4 -4 -4 4 -4 -4 -2 -4 3 0 -4 -2 -3 -4 -1 0 -4 -4 4 23 0 0 0 8 0 0 3 0 20 8 0 0 0 0 3 5 0 0 27 0.60 1.15 51 V 0 -4 -4 -4 1 -4 -4 -3 -4 3 -1 -2 1 -1 -2 -2 -1 -4 -3 5 9 0 0 0 2 0 0 2 0 13 3 3 3 2 2 2 2 0 0 54 0.77 1.15 52 V -1 -4 -4 -5 0 -4 -4 -5 -4 4 3 -4 2 -1 -2 -2 0 -4 -3 3 4 0 0 0 2 0 0 1 0 22 32 0 6 2 2 2 5 0 0 17 0.59 1.15 53 F -2 -4 -4 -5 -4 -4 -4 -5 1 0 4 -4 3 5 -5 -2 0 -3 0 -1 2 0 0 0 0 0 0 0 3 5 44 0 7 23 0 3 7 0 2 2 0.77 1.16 54 G -2 -3 -1 1 -1 -2 -1 6 -1 -3 -4 -1 0 -5 -4 -1 -2 -5 -3 -3 2 1 2 10 2 1 3 59 2 1 1 3 3 0 0 5 2 0 1 1 0.96 1.24 55 N -1 -2 2 4 -5 0 1 0 -1 -3 -4 0 -3 -4 1 2 -2 -1 -3 -3 5 2 11 25 0 4 10 6 1 1 1 4 1 1 7 16 1 1 1 1 0.47 1.50 56 D -1 -3 1 4 -2 -1 1 1 -1 -3 -4 -3 -3 1 -3 0 1 -2 4 -3 5 1 6 25 1 2 7 9 1 1 1 1 1 7 1 8 8 1 13 2 0.43 1.50 57 K -1 2 0 1 1 1 2 -1 0 -2 -1 1 -2 -3 -3 1 2 -1 -2 -1 5 10 4 8 3 5 12 4 2 2 5 8 1 1 1 8 15 1 1 4 0.19 1.49 58 L 0 -1 1 2 -3 0 1 2 4 -4 -1 0 -2 -2 -2 0 0 3 -2 -4 8 3 6 10 1 4 8 14 9 1 6 6 1 2 2 6 6 4 1 1 0.19 1.50 59 I -3 -5 -5 -5 -4 -3 -5 -6 -5 6 2 -5 -1 -3 -3 -4 -2 -5 0 3 1 0 0 0 0 1 0 0 0 50 18 0 1 0 2 0 2 0 3 18 1.06 1.52 60 K -1 2 -1 -2 -3 2 1 -2 1 -4 -3 4 -2 -3 -4 0 0 -5 -3 -1 5 10 3 1 1 10 11 3 4 1 2 29 1 1 0 6 6 0 0 5 0.46 1.59 61 E 1 -2 -3 -2 -5 1 6 -4 -3 -3 -4 -2 -3 -5 -2 -1 -3 -5 -4 -2 14 1 0 1 0 5 66 0 0 2 1 1 1 0 1 3 1 0 0 3 1.21 1.54 62 G -2 -3 -1 -3 -3 -3 -3 7 -3 -6 -4 -3 -5 -5 -5 -2 -4 0 -5 -6 1 1 2 1 0 1 2 85 1 0 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 1.80 1.58 63 D -2 -4 -1 5 -3 1 1 -2 -2 -3 -4 -3 3 -3 -4 2 1 -5 -3 -3 2 0 1 36 1 7 8 2 1 2 1 0 8 1 0 16 10 0 1 1 0.69 1.58 64 I -2 0 -2 -1 -3 0 2 -4 -2 2 0 1 0 -1 -1 1 2 -3 -3 0 3 6 1 3 0 4 14 1 1 11 7 8 2 3 3 10 16 0 1 5 0.19 1.60 65 V 0 -5 -5 -5 2 -5 -5 -4 -5 0 -2 -3 0 -2 -5 -4 -3 -5 -4 7 9 0 0 0 4 0 0 1 0 1 1 2 1 1 0 0 1 0 0 75 1.34 1.60 66 K -2 4 -2 -4 -4 -1 -1 -4 1 -2 -3 5 -3 -2 -5 -2 0 -2 0 -2 2 20 2 0 0 2 2 0 3 2 3 45 1 2 0 2 6 1 3 2 0.82 1.68 67 R 1 7 -3 -4 3 -2 -3 -1 -1 -5 -4 -1 -4 -6 -4 -1 0 -6 -5 -4 11 63 0 0 6 0 0 4 1 0 1 2 0 0 1 5 5 0 0 1 1.27 1.67 68 T -2 -3 -3 -4 -3 -4 -3 -4 -5 -3 -3 -3 -2 -5 -4 0 7 -6 -5 -3 1 1 0 0 0 0 0 1 0 1 2 1 1 0 0 4 89 0 0 1 1.80 1.65 69 G -3 -1 0 -3 -6 -3 -3 7 0 -7 -6 -1 -5 -4 -5 -2 -4 -1 -5 -6 1 4 5 1 0 1 2 79 2 0 0 4 0 1 0 1 0 1 0 0 1.61 1.56 70 A -1 5 -1 -1 -4 1 2 -4 1 -5 -5 4 -3 -3 -5 0 -2 -6 -3 -5 5 38 2 2 0 4 11 0 3 0 0 23 1 1 0 5 2 0 1 0 0.86 1.56 71 I -4 -6 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 6 -1 -5 -2 -3 -6 -5 -3 -6 -4 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40 1.61 1.44 K Lambda Standard Ungapped 0.1390 0.3148 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1769 0.3184 PSI Gapped 0.0542 0.2670