Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 1 2 -1 5 0 -3 -1 -1 -1 -1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.00 0.00 2 G 0 -3 -1 -2 -3 -3 -3 7 -3 -5 -5 -2 -4 -4 -3 -1 -2 -3 -4 -4 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.34 0.20 3 G -2 -4 -2 -3 -5 -4 -4 7 -4 -6 -6 -4 -5 -5 -4 -2 -4 -5 -5 -5 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.97 0.83 4 L -4 -5 -6 -6 -4 -4 -5 -6 -5 2 5 -5 4 3 -5 -5 -3 -3 -2 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8 70 0 9 12 0 0 0 0 0 2 1.09 0.92 5 L -2 -4 -3 -3 -4 -3 -3 1 -3 -4 -1 -3 0 4 -4 5 -2 -3 2 -3 0 0 0 0 0 0 0 13 0 0 7 0 3 20 0 51 0 0 7 0 0.75 0.94 6 F -4 -5 -5 -6 -1 -5 -5 -6 -3 -2 1 -5 -2 8 -6 -5 -4 -1 4 -3 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 15 0 0 70 0 0 0 0 13 0 1.64 1.00 7 S -3 -4 5 -2 1 -1 -3 -1 -3 -5 -4 -2 -1 -3 -4 3 1 8 0 -4 0 0 29 1 3 2 0 4 0 0 1 1 1 0 0 24 7 24 3 0 1.06 1.10 8 S 4 -4 -2 -3 -3 -3 -3 -2 -2 -3 -3 -2 -4 -5 -3 5 2 -5 -4 -3 35 0 1 0 0 0 0 1 1 1 2 1 0 0 0 42 15 0 0 1 0.85 1.14 9 L -3 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -5 2 4 -5 3 4 -6 -3 -4 -4 -2 3 1 0 0 0 0 0 0 0 0 10 46 0 8 16 0 2 0 0 0 17 0.91 1.21 10 Q -3 4 2 -2 -5 2 -1 -2 2 -4 -5 4 -3 -5 -4 1 2 -6 -3 -3 1 19 9 2 0 8 2 2 6 1 0 28 1 0 0 9 12 0 0 2 0.62 1.28 11 H -1 0 4 3 -5 2 0 -2 4 -4 -2 -2 -4 -3 -4 2 -1 -6 -4 -4 4 5 23 14 0 11 5 3 11 0 4 2 0 1 0 14 2 0 0 1 0.55 1.27 12 C -1 -4 3 6 -3 -2 -2 0 -4 -3 -5 -3 -5 -6 -4 0 2 -6 -5 -2 6 0 12 50 1 1 0 7 0 2 0 0 0 0 0 7 11 0 0 4 0.96 1.27 13 Q -1 3 2 1 -5 3 -2 -3 0 -5 -4 4 -4 -2 -4 -1 0 -5 -1 -5 5 17 11 6 0 16 0 1 2 0 1 28 0 2 0 3 6 0 2 0 0.64 1.30 14 Q -2 0 2 3 -5 4 3 -3 4 -3 -3 0 -3 -1 -4 -1 -1 -5 -4 0 2 5 8 14 0 19 16 1 9 1 3 5 0 2 0 3 3 0 0 7 0.47 1.30 15 G -1 -3 7 2 -5 -1 -2 0 1 -1 -5 -2 -4 -5 -4 2 -2 -6 -4 -5 4 1 48 10 0 1 1 6 3 4 1 1 0 0 0 18 2 0 0 0 0.94 1.28 16 F -4 -5 -3 -1 -5 -5 -1 -6 -4 1 2 -5 0 7 -6 -2 -4 -3 1 1 0 0 1 4 0 0 5 0 0 6 17 0 2 50 0 3 0 0 3 8 1.01 1.26 17 V 2 -1 2 0 -4 3 0 -2 2 -1 -2 0 -2 -5 -4 1 2 -5 -3 -1 16 2 10 4 0 15 6 3 4 3 4 4 1 0 0 10 13 0 0 5 0.28 1.28 18 I 0 0 0 -3 -4 2 0 -4 0 1 0 -1 2 -1 -5 0 1 -5 -1 2 9 5 5 1 0 12 5 1 3 7 10 4 5 3 0 5 8 0 3 15 0.19 1.27 19 S 1 -2 4 -2 -4 -3 -4 -3 -4 1 1 -4 -3 -3 -4 3 1 -5 -3 2 9 2 18 1 0 1 0 1 0 7 16 0 0 1 0 23 7 0 1 13 0.40 1.25 20 N -3 -1 4 1 -5 5 3 -1 2 0 -3 -2 0 -5 -4 0 -1 -5 -1 -3 1 2 20 6 0 25 16 4 4 6 2 1 2 0 0 6 2 0 2 1 0.57 1.25 21 E 1 0 1 -1 -4 3 -1 -4 0 0 1 -2 -2 -4 -4 -1 2 -5 0 2 13 5 7 3 0 15 4 1 3 6 12 1 0 0 0 4 11 0 3 13 0.24 1.25 22 L 1 -4 -3 -4 -4 -3 -3 -3 -5 2 4 -4 2 -2 -5 2 -2 -5 0 -1 12 0 1 1 0 1 1 2 0 13 39 0 4 1 0 18 1 0 3 3 0.54 1.25 23 R -2 4 4 -3 -5 -1 -3 -2 2 -1 -3 0 -2 -5 -4 3 1 -2 -1 -2 1 26 18 0 0 2 0 3 5 4 2 3 1 0 0 21 8 1 2 3 0.55 1.19 24 Q 0 1 0 1 -3 6 1 -4 2 -3 -2 2 -2 -4 -4 -2 -1 -5 -1 -1 7 5 5 6 1 35 9 1 5 1 4 10 1 1 0 2 3 0 2 4 0.54 1.17 25 Q -3 2 1 -3 -5 7 0 -4 -2 -5 -3 1 -3 -6 -4 -1 -1 -5 -4 -3 0 9 7 0 0 64 3 0 0 0 2 8 0 0 0 2 3 0 0 2 1.26 1.18 26 Q -1 3 -1 -2 -5 6 -1 -4 -3 -2 -2 0 -1 -5 -4 -1 0 -5 -4 2 3 17 3 1 0 39 2 1 0 2 4 4 1 0 0 5 4 0 0 14 0.69 1.18 27 S 3 -1 0 3 -4 1 2 -1 -2 -3 -4 -2 0 -5 -4 3 0 -5 -4 -1 22 4 3 14 0 7 11 4 1 1 1 1 2 0 0 20 4 0 0 5 0.38 1.13 28 E 3 -1 -1 -3 -4 1 2 -3 -2 -2 2 -1 -1 -3 -1 0 0 1 -4 0 29 2 3 0 0 6 14 0 1 0 19 3 1 1 2 6 4 2 0 6 0.30 1.10 29 L -2 -4 -5 -6 -4 -1 -5 -4 -5 1 5 -4 4 0 -5 -4 -2 -1 -3 1 4 0 0 0 0 3 0 1 0 5 61 0 13 4 0 0 1 1 0 7 0.89 1.02 30 T -1 -2 4 4 -4 -3 -1 1 -3 -5 -5 -3 0 -5 -4 1 2 -5 0 -3 5 2 23 22 0 0 3 10 0 0 0 0 4 0 0 12 15 0 3 1 0.57 1.03 31 S 0 1 1 4 -5 4 1 0 0 -3 -3 0 -2 -5 -4 0 -1 -5 -4 -3 6 8 7 21 0 18 9 7 2 2 3 4 1 0 0 8 3 0 0 1 0.42 1.02 32 T 4 -4 -3 -4 -3 -3 -3 -2 -4 -1 -2 -3 -1 -4 -3 3 4 -5 -4 1 32 0 0 0 0 0 0 2 0 3 2 0 1 0 0 26 24 0 0 9 0.65 1.02 33 W -2 4 -2 -5 -5 -3 -4 -5 -3 -3 -3 -3 -3 0 -5 -2 0 11 3 -1 3 22 2 0 0 0 0 0 0 1 2 0 0 2 0 2 6 47 8 5 1.65 1.02 34 D 1 -4 0 0 -4 1 0 -3 -2 3 -1 -2 4 -1 -4 -1 0 -5 -2 2 13 0 4 6 0 8 5 1 1 20 2 2 11 3 0 4 5 0 1 16 0.29 0.97 35 L 3 -1 1 0 -4 -1 2 -1 2 -4 -1 -3 -1 -4 -4 2 1 -5 -1 -2 25 2 8 6 0 2 13 5 4 0 7 0 2 0 0 13 8 0 2 3 0.28 0.97 36 M -2 -4 -5 -6 -3 -4 -5 -5 -5 1 5 -4 4 2 -5 -4 -3 -3 -2 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 70 0 11 7 0 0 0 0 0 4 0.97 0.78 37 L -3 -4 2 -2 -3 -1 -4 -5 -4 1 5 -4 4 -2 -5 -1 -3 -4 -3 0 0 0 11 2 0 2 0 0 0 8 55 0 12 0 0 4 0 0 0 6 0.67 0.78 38 Q -1 0 2 0 -5 6 2 -2 0 -2 -4 1 0 -5 -3 0 -1 -5 -4 -4 3 4 9 4 0 44 12 3 1 2 0 8 2 0 0 5 3 0 0 0 0.69 0.78 39 T 5 -3 0 -3 -3 -3 -3 -2 -3 -3 -3 -3 -3 -4 -3 1 4 -5 -4 0 57 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 25 0 0 5 0.79 0.78 40 R -2 7 -2 -3 1 0 -2 -2 1 -5 -4 0 -3 -5 -4 3 -2 -5 -4 -4 0 66 0 0 3 3 0 3 3 0 0 0 0 0 0 23 0 0 0 0 1.11 0.78 41 I -1 -3 3 3 -4 -1 -2 -4 -3 2 0 -3 0 -4 -4 1 1 -5 -4 2 4 0 17 21 0 2 0 0 0 11 7 0 2 0 0 10 10 0 0 16 0.39 0.78 42 N 1 -4 4 0 -4 -2 0 -3 -4 -3 0 0 -4 -5 -4 1 5 -6 -5 -1 10 0 18 5 0 1 5 2 0 1 9 5 0 0 0 9 32 0 0 4 0.54 1.37 43 L -3 -5 -6 -6 -4 -3 -5 -6 -5 2 6 -5 3 -1 -5 -2 -3 -5 -4 0 2 0 0 0 0 1 0 0 0 10 70 0 7 2 0 3 1 0 0 3 1.14 1.35 44 S -3 -2 7 0 -5 -3 -3 -2 1 -5 -4 -3 -4 -5 -4 3 1 -6 -4 -5 0 2 61 3 0 0 0 2 3 0 2 0 0 0 0 20 7 0 0 0 1.31 1.33 45 R -3 8 -3 -4 -5 1 -1 -3 -3 -5 -4 1 -4 -5 -4 -2 -3 -5 -4 -5 2 76 0 0 0 6 2 1 0 0 2 6 0 0 0 2 0 0 0 0 1.58 1.29 46 S 5 -5 -5 -5 -4 -4 -4 0 -5 2 -2 -4 -3 -3 -4 0 -2 -5 -2 1 57 0 0 0 0 0 0 5 0 13 2 0 0 1 0 8 2 0 1 11 0.91 1.62 47 A 3 -3 -2 -5 -5 0 -4 5 -5 -1 -2 -4 3 -5 -5 1 -2 -5 -1 -1 27 1 2 0 0 4 0 36 0 4 3 0 7 0 0 8 2 0 2 3 0.71 1.62 48 A 0 -5 -1 -5 -4 -3 -3 -5 -2 5 1 -3 -1 -4 -5 -1 4 -6 -5 1 9 0 4 0 0 1 2 0 1 30 14 2 1 0 0 5 23 0 0 9 0.64 1.62 49 R -1 7 -2 -3 -5 -2 -4 -2 -1 -4 0 -1 -4 -2 -5 -1 -3 2 2 -3 4 56 2 1 0 1 0 4 1 1 9 2 0 1 0 4 1 3 8 2 1.02 1.59 50 M -2 -5 -5 -5 -5 -1 -4 -4 1 2 1 -3 6 3 -5 -2 1 0 4 0 4 0 0 0 0 3 1 2 3 10 12 1 18 12 0 3 9 1 15 6 0.60 1.61 51 M 3 -2 -5 -5 -4 2 -4 -5 -5 0 2 0 6 -2 -5 -4 -2 -5 -4 1 22 2 0 0 0 9 0 0 0 4 21 6 20 2 0 0 1 0 0 11 0.65 1.66 52 M -3 -1 -2 -3 -4 1 -2 -2 -4 -1 3 1 5 -2 -5 -1 -1 -4 0 0 2 4 1 1 0 8 3 3 0 2 30 9 16 1 0 5 5 0 3 8 0.44 1.60 53 D -2 0 3 5 -4 0 1 1 0 -5 -4 1 -4 -5 -2 2 -1 -5 -4 -4 3 6 11 27 0 3 7 10 2 1 2 8 0 0 2 14 3 0 0 1 0.52 1.53 54 A 1 -1 -2 -4 -4 4 0 1 -2 -1 -1 1 2 -4 -2 0 -1 -4 1 -1 11 3 1 1 0 18 5 11 1 3 8 10 5 0 2 8 4 0 6 4 0.24 1.55 55 S 1 1 3 0 -5 0 0 -3 0 -2 -2 -1 -4 -2 4 1 0 -5 -2 -3 11 8 12 6 0 5 6 1 2 3 4 3 0 2 20 8 6 0 1 2 0.36 1.59 56 N -2 0 4 2 -4 2 0 0 1 -3 -3 0 -2 -4 -1 0 2 -5 -2 -3 3 4 19 9 0 7 7 7 3 2 2 7 1 0 4 8 11 0 2 2 0.28 1.55 57 Q -1 0 -1 2 -5 3 1 2 -3 0 -3 1 -1 -1 1 -2 -1 -5 -1 -2 4 4 2 11 0 13 9 16 0 6 2 7 1 3 6 3 5 0 2 2 0.21 1.57 58 Q 0 -2 -2 1 -5 3 -1 2 0 0 -2 -1 1 -2 0 1 -2 -5 -3 -1 6 2 2 9 0 13 3 18 2 5 4 4 3 2 5 11 2 0 1 4 0.18 1.61 59 S 1 -1 2 1 -4 -1 0 -1 -4 1 -3 -2 -1 -2 -4 3 0 -5 -4 1 10 3 9 7 0 3 6 4 0 7 2 2 1 2 0 23 6 0 0 10 0.21 1.56 60 S 0 -3 1 3 -4 0 1 3 -4 -5 -2 0 -4 -5 0 0 0 -5 -4 -4 9 0 7 13 0 4 7 23 0 0 4 6 0 0 4 7 7 0 0 1 0.31 1.52 61 A 4 -3 -1 0 -4 -1 0 0 -4 -3 -3 0 0 -4 -2 2 -2 -4 0 -2 31 0 2 5 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