JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_CenZ86q.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet ||||||H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E||||||||||E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|E|E|E||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H||||||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|9|9|8|6|1|7|8|8|7|7|4|1|5|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|6|6|7|7|7|7|7|1|3|5|3|0|7|7|4|6|8|8|8|8|8|6|1|2|2|1|2|7|8|8|7|5|1|2|6|7|8|8|7|7|7|6|3|3|1|1|1|1|1|4|1|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|8|7|5|2|8|7|3|8|9|9|9|8|8|9|8|6|3|1|0|2|8|7|7|1|4|7|7|6|1|5|7|7|7|7|7|7|7|5|2|7|8|8|8|6|1|3|4|4|5|6|6|7|7|7|7|6|5|1|2|5|6|6|7|7|7|7|7|7|6|6|6|6|5|0|1|1|2|3|7|6|5|1|5|1|7|8|9|9|9|9|9|8|7|4|4|7|2|1|7|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|1|5|7|8|8|8|7|7|6|5|2|7|8|8|8|8|7|5|1|5|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|4|3|1|3|7|8|8|7|6|3|0|4|7|8|8|7|4|1|1|2|7|4|3|6|7|7|3|1|3|1|7|8|8|9|3|2|0|0|1|1|4|7|8|7|5|2|5|7|7|7|7|6|2|7|8|9|9|9|9|9|8|7|4|4|7|8|5|5|8|8|8|8|8|7|4|2|6|8|8|9|9|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|-|B|-|B|-|-|B|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|B|-|-|B|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|B|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|B|-|-|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|B|B|-|B|-|-|B|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|B|-|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|B|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles ||||||H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|E||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E||||||||||E|E|E|E|E|E||||||||||||||E||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|||||||||||E|E||||||||H|H|H|H|H||E|E|E|E|E||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H||||||| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||||||H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E||||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H||||||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | |*| | | | | | | | | | | | |*|*| | | | | | |*| | | | | | | | | | |*|*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*| | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*| | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*| | | | | | | |*| | | | | | |*|*|*| | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |