Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 M -3 -3 -4 -5 -4 -2 -4 -5 -4 -1 1 -3 10 -2 -5 -4 -3 -4 -3 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 97 0 0 0 0 0 0 0 2.08 0.92 2 H 0 3 2 0 -2 3 -1 -3 5 -5 -4 4 -2 -5 -4 -1 -1 -5 -3 -3 8 14 10 4 1 13 1 0 14 0 0 26 1 0 0 3 3 0 0 1 0.61 1.01 3 V 0 -1 -1 -3 -4 0 1 -3 1 1 -3 -1 0 -4 -3 2 5 -5 -3 -1 7 3 2 0 0 3 11 0 3 9 1 3 3 0 0 14 38 0 1 2 0.51 1.02 4 W -3 -3 -6 -6 -4 -4 -5 -5 -4 2 0 -5 2 -1 -6 -3 -3 11 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 12 8 0 6 1 0 1 1 60 4 6 2.12 1.06 5 P -1 0 0 -2 -4 5 -1 -2 -1 -4 -4 0 -3 -5 3 2 3 -5 -4 -3 5 4 4 1 0 29 1 2 1 0 1 5 0 0 14 16 17 0 0 1 0.63 1.07 6 V 1 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -5 -5 1 4 -4 2 -1 -5 -2 -2 -4 -1 3 12 0 0 0 0 0 0 0 0 7 46 0 6 1 0 2 1 0 2 23 0.74 1.07 7 Q 2 1 0 -2 -4 6 0 -3 1 -5 -4 1 -3 -5 -4 0 0 -5 -1 -3 15 8 4 0 0 44 3 1 3 0 0 7 0 0 0 7 6 0 2 1 0.76 1.10 8 D -3 -2 0 6 -6 0 4 -3 -2 -5 -5 -1 -5 -6 -4 -2 -2 -6 -5 -5 0 1 3 51 0 3 33 2 1 0 1 2 0 0 0 1 2 0 0 0 1.25 1.10 9 A 6 -4 -4 -4 -3 -3 -3 -2 -4 -3 -3 -3 -3 -4 -3 -1 -2 -5 -4 -1 94 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 4 1.46 1.10 10 K -3 2 -2 -3 -5 0 -1 -4 -3 -5 -5 7 -4 -5 -3 -2 -3 -5 -4 -4 0 8 0 0 0 3 2 0 0 0 0 85 0 0 0 0 0 0 0 0 1.57 1.09 11 A 5 -2 4 -1 -4 2 -3 -2 -3 -4 -4 -2 -4 -5 -4 0 -1 -5 -2 -2 52 1 24 2 0 9 0 1 0 0 0 1 0 0 0 5 2 0 1 2 0.84 1.12 12 R -3 6 2 -3 -5 1 -2 -1 3 -5 -5 3 -4 -5 -4 -2 -1 -5 -4 -4 1 48 9 0 0 7 0 5 8 0 0 15 0 0 0 1 4 0 0 1 0.98 1.12 13 F -4 -5 -5 -5 -4 -5 -5 -5 -4 -1 3 -5 -1 7 -3 -4 -3 -2 0 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 34 0 1 60 1 0 1 0 0 0 1.43 1.09 14 S 0 -2 -1 -3 -3 -3 -3 1 -2 -3 -5 -3 -4 -5 -2 6 0 -1 -4 -4 5 2 2 0 0 0 0 12 1 1 0 0 0 0 1 73 2 1 0 0 1.08 1.09 15 E 1 0 -1 1 -5 2 5 -4 -2 -5 -3 1 -2 -4 -3 -1 -2 -5 -3 -4 15 3 2 7 0 7 50 0 1 0 2 6 1 1 0 4 1 0 0 0 0.80 1.09 16 F -3 -5 -5 -6 -3 -4 -5 -5 -5 1 4 -5 1 0 -4 -3 -3 -4 -1 5 1 0 0 0 0 0 0 1 0 6 39 0 3 4 1 1 0 0 2 42 0.90 1.13 17 L -2 -5 -6 -6 -3 -5 -5 -6 -5 4 3 -5 0 -1 -5 -4 -3 -5 -3 5 2 0 0 0 0 0 0 0 0 24 25 0 2 1 0 0 0 0 0 46 1.04 1.15 18 D -2 3 0 5 -6 1 3 -3 0 -5 -3 1 -1 -5 -4 -1 -2 -6 -3 -5 2 15 3 34 0 4 22 1 2 0 2 8 1 0 0 3 2 0 1 0 0.77 1.18 19 A 2 3 -1 0 0 2 -1 -4 -1 -2 -1 2 -1 -4 -4 1 1 -5 -3 -3 15 20 2 4 2 9 3 0 1 2 7 10 1 0 0 10 10 0 0 0 0.33 1.17 20 C 6 -4 -4 -4 4 -3 -4 -3 -4 -3 -3 -3 -3 -5 -4 -1 -1 -5 -4 1 75 0 0 0 9 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 2 3 0 0 10 1.19 1.17 21 I 0 3 -4 -2 -4 3 2 -3 -1 0 2 -1 1 -3 -4 -2 -2 -5 -2 1 9 14 0 1 0 13 15 2 1 6 20 2 4 1 0 1 2 0 1 9 0.33 1.16 22 T 2 3 1 0 -3 2 0 -2 2 -3 -3 0 -3 -2 -4 1 1 -5 -4 -3 17 16 8 4 0 10 4 2 5 1 2 5 0 2 0 12 10 0 0 1 0.34 1.14 23 E -2 -2 -2 2 -3 0 5 3 0 -4 -5 0 -3 -5 -4 -1 -1 -5 -4 -3 2 1 1 9 1 3 37 28 2 1 0 4 1 0 0 4 4 0 0 2 0.71 1.09 24 G -1 -1 -1 -1 -3 -1 2 5 0 -3 -3 0 -2 -3 -3 -2 -1 -3 -3 -2 4 3 2 3 0 2 17 46 2 1 2 4 1 1 1 2 3 0 1 3 0.65 0.93 25 P -2 -3 -4 -1 -5 -3 -1 -4 -4 -5 -5 -3 -3 -4 8 -3 -3 -6 -3 -4 3 1 0 3 0 0 4 0 0 0 0 0 1 1 85 1 1 0 1 1 2.30 1.14 26 Q -1 -2 -3 -3 -4 7 -1 -4 -3 -1 -3 -2 -2 -2 -4 -2 0 -5 -4 3 3 1 0 0 0 60 1 0 0 3 1 0 0 2 0 2 5 0 0 22 1.11 1.14 27 I -2 -1 -4 -1 -2 -2 0 -4 1 3 0 -1 1 0 -5 -3 2 -1 -2 3 3 4 0 3 1 2 7 0 4 17 9 3 4 5 0 1 13 1 1 23 0.33 1.14 28 V -3 -5 -6 -6 -3 -5 -5 -6 -6 6 0 -5 -1 -3 -5 -4 -2 -5 -4 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60 4 0 0 0 0 0 1 0 0 34 1.37 1.14 29 S -1 -2 -2 -3 -3 -1 -1 -4 -4 -3 -3 -3 -2 -4 -4 1 7 -5 -1 -2 2 1 1 0 0 2 4 0 0 0 1 0 1 0 0 10 75 0 2 1 1.24 1.14 30 R -4 6 -1 -2 -5 -1 -2 -5 -1 -3 -2 3 -3 -5 -4 -3 -3 -1 -4 1 0 57 2 2 0 1 0 0 1 1 4 20 0 0 0 0 0 1 0 12 1.11 1.14 31 R -4 6 2 -3 -6 0 -2 -4 8 -5 -5 -1 -1 -4 -5 -2 -4 -5 -1 -5 0 43 10 1 0 2 0 1 39 0 0 1 1 0 0 1 0 0 1 0 1.45 1.14 32 G -2 -4 -3 -2 -5 -4 -2 7 -4 -6 -6 -2 -5 -5 -4 -2 -4 -5 -5 -5 0 0 0 2 0 0 2 91 0 0 0 3 0 0 0 1 0 0 0 0 1.85 1.12 33 A -2 4 -1 -1 -5 1 1 -3 0 -4 -4 5 -4 -5 -4 -2 -1 -5 -4 -1 2 27 2 2 0 4 8 1 3 1 0 41 0 0 0 1 2 0 0 5 0.83 1.14 34 E -2 0 -1 2 -3 -1 2 -4 -4 -5 -4 1 -4 -6 6 -1 -1 -1 -5 -3 2 5 2 12 1 2 16 1 0 0 1 9 0 0 41 3 3 1 0 1 0.95 1.14 35 E 3 -1 -3 -3 -2 -1 0 -4 -4 0 -3 -3 -1 -4 -3 0 1 -5 -3 4 32 3 1 0 1 3 7 0 0 3 1 1 1 0 1 7 10 0 1 29 0.51 1.14 36 A 5 -4 -4 -5 -3 -4 -4 -2 -2 -2 -2 -4 -1 -2 -4 -1 -2 -5 -4 4 62 0 0 0 0 0 0 2 1 0 1 0 1 1 0 2 0 0 0 31 1.03 1.14 37 V 0 -3 -5 -5 -3 -4 -5 -4 -5 1 -2 -4 0 -3 -5 -4 -1 -5 -2 7 7 1 0 0 0 0 0 1 0 4 0 1 2 0 0 0 2 0 1 83 1.31 1.14 38 L -2 -5 -6 -6 -3 -5 -5 -4 -5 3 3 -5 1 -3 -5 -4 -3 -5 -4 5 1 0 0 0 0 0 0 1 0 16 27 0 2 0 0 0 0 0 0 53 1.06 1.14 39 V -3 -5 -5 -6 -4 -4 -5 -6 -5 3 4 -5 3 -3 -5 -2 -2 -5 -4 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19 37 0 7 0 0 2 1 0 0 33 0.95 1.14 40 P 0 -2 -1 1 -4 -3 -2 -2 -3 -5 -5 -3 -4 -5 3 6 -1 -5 -4 -4 7 2 1 8 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 13 66 0 0 0 0 1.07 1.14 41 I 2 -1 -4 -5 -2 -2 -2 -4 -2 3 -1 -1 2 1 -2 -3 -2 1 2 3 22 3 0 0 1 2 2 1 1 19 2 4 5 6 2 0 2 2 9 19 0.41 1.14 42 G 1 -1 -2 2 -5 2 5 -3 1 -3 -5 0 -4 -5 -2 0 -1 -5 -4 -3 14 2 1 13 0 7 43 1 3 2 0 3 0 0 1 4 4 0 0 1 0.71 1.16 43 E -1 -2 -1 4 -6 0 6 -4 -3 -5 -4 -1 -2 -5 -4 -2 -2 -5 -3 -4 4 1 2 23 0 2 60 0 0 0 2 2 1 0 0 1 2 0 1 1 1.17 1.16 44 W -3 -4 -2 -6 -3 -4 -5 -3 1 -2 -2 -5 -3 3 -6 -4 -4 8 8 -4 1 0 2 0 1 0 0 2 2 2 2 0 0 11 0 0 0 22 55 0 1.78 1.14 45 R -1 4 0 2 -5 2 4 -4 1 -5 -3 1 -4 -4 -4 -2 -2 -5 -4 -4 6 25 3 12 0 9 28 0 3 0 2 8 0 1 0 1 1 0 0 1 0.69 1.15 46 R 0 6 -2 -3 -5 2 0 -3 1 -5 -4 3 -2 -5 -4 -1 -3 -5 -4 -5 10 53 1 1 0 8 5 1 3 0 1 14 1 0 0 3 0 0 0 0 1.03 1.16 47 L -4 -3 -5 -6 -4 -4 -5 -6 -5 0 6 -1 2 0 -5 -4 -2 -4 -1 -1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 4 79 4 4 3 0 1 1 0 2 1 1.16 1.13 48 Q -1 2 0 -1 -4 3 -1 -4 0 -2 -2 1 -1 -5 -4 2 4 -5 -3 -1 4 11 5 2 0 15 3 0 2 2 3 8 1 0 0 13 26 0 1 3 0.44 1.10 49 A 3 -2 -2 -1 -4 3 -2 4 -2 -5 -5 -1 -4 -4 0 1 -2 -5 -4 -3 27 2 1 3 0 15 1 29 1 0 0 3 0 1 5 10 1 0 0 1 0.58 1.03 50 A 4 -2 -1 -1 -3 -1 2 2 1 -4 -4 -2 -3 -5 -2 2 -1 -5 -4 -3 41 2 1 2 0 2 16 13 3 0 0 0 0 0 1 16 2 0 0 1 0.56 0.87 51 A 6 -3 -3 -3 -2 -2 -2 -2 -3 -3 -3 -2 -3 -4 -2 3 -1 -4 -3 -2 80 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20 0 0 0 0 1.04 0.68 K Lambda Standard Ungapped 0.1341 0.3227 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1998 0.3177 PSI Gapped 0.0612 0.2670