JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_hiUZhEb.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet ||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|||E|E|E|E|E||||||||||||||E|E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||E|E|E|E||||||||||||||E|E|E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E||||||E|E|E|E||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|9|9|8|8|7|6|2|7|8|9|9|9|9|9|8|6|2|3|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|5|1|1|2|2|3|1|1|3|5|8|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|2|6|8|8|8|7|5|1|5|6|5|1|4|6|7|7|7|6|6|7|7|7|7|7|6|5|4|5|6|7|7|7|6|2|5|7|6|1|4|4|4|7|6|2|0|6|7|5|1|1|2|1|4|6|7|8|7|4|1|8|8|8|7|4|4|7|8|7|6|2|6|7|7|7|7|4|1|5|7|7|7|2|2|7|7|7|7|7|7|6|3|3|4|1|0|5|4|4|5|6|6|7|7|7|7|7|7|4|4|8|8|8|8|1|0|6|7|4|4|2|7|8|7|7|7|5|2|6|7|8|8|7|5|0|5|7|4|3|6|7|5|3|2|1|4|6|7|7|7|7|7|7|7|7|6|6|3|3|0|5|7|7|5|1|6|7|6|0|6|7|7|4|1|7|8|7|8|8|6|1|5|8|8|5|0|6|6|4|1|6|7|7|3|6|8|7|1|6|8|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|B|-|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|B|-|B|-|B|-|-|B|B|-|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|-|-|B|-|-|B|-|B|-|-|B|B|-|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|B|-|-|-|B|-|B|-|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|B|B|B|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles ||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|||E|E|E|E|E|||||||||||||||E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|||||||||E|E|E|E||||||||||||||E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E||||||E|E|E|E||| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||E|E|E|E|E|H||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||E|E|E|E|||E|E|E|E||||||H|H||||||||E|E|E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H||||||||||||||||E|E|E|||||||||||||||E|E|E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|||||||||||||||||||||E||||||E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E||||||E|E|E|E||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | |*| | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | |*| | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | |*|*| | | | | | | |*| | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | |