Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 E -3 -1 -2 1 -5 6 5 -4 -2 -5 -4 0 -3 -5 -3 -2 -3 -4 -4 -4 0 0 0 6 0 44 48 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1.23 0.74 2 K -1 4 1 0 -5 -1 2 -4 -3 -4 -3 5 -3 -5 -3 -1 -3 -1 -4 -3 4 22 5 3 0 1 12 0 0 0 2 47 0 0 0 2 0 1 0 2 0.82 0.92 3 P 1 -4 -4 -3 -5 -2 0 -4 -4 -5 -3 -1 -4 -6 7 -2 0 -6 -5 -4 10 0 0 0 0 1 7 0 0 0 2 3 0 0 68 2 7 0 0 0 1.68 1.06 4 A 3 -2 -1 1 -4 -2 -3 1 -4 -4 -4 -3 -4 -1 -1 4 2 -5 -2 -3 27 2 3 9 0 1 0 9 0 1 1 0 0 3 2 30 11 0 1 0 0.53 1.16 5 A 2 -1 -4 -1 -4 -2 0 -2 -4 -5 -4 1 -4 -5 6 1 -3 -6 -5 -2 21 4 0 3 0 1 5 1 0 0 1 8 0 0 42 11 0 0 0 2 0.99 1.20 6 C 1 -2 1 -2 7 -1 1 0 -2 -4 -3 -1 -3 -5 0 1 0 -1 -4 -3 12 2 6 2 27 2 10 9 1 0 2 3 0 0 5 10 7 1 0 2 0.60 1.19 7 R -2 1 -2 -1 -5 6 3 -4 -1 -5 -3 1 -3 -5 -1 -1 -2 -5 -2 -2 3 5 1 2 0 48 16 0 1 0 3 8 0 0 3 4 2 0 1 2 0.91 1.24 8 C -2 -5 -5 -5 11 -5 -4 -5 -3 -3 -3 -5 -4 -5 -5 -2 0 -5 -5 -3 1 0 0 0 85 0 1 0 1 1 1 0 0 0 0 2 7 0 0 0 2.67 1.28 9 S 1 -2 0 1 5 0 -1 -1 0 -4 -3 -2 -3 -4 2 4 -1 -4 -1 -3 12 1 3 9 11 4 3 3 3 0 3 2 0 0 9 31 3 0 2 1 0.48 1.21 10 R 1 2 1 -1 -1 2 0 -2 -2 -1 -1 0 -1 -3 -1 1 0 -3 -3 1 14 10 8 3 1 8 4 3 0 3 7 6 2 1 2 11 5 0 1 10 0.14 1.04 11 Q -2 -3 -2 -5 -4 -2 -5 -2 -3 4 0 -3 4 -2 -2 -3 -2 -5 -1 5 1 1 2 0 0 1 0 3 1 20 6 1 11 1 2 2 1 0 2 44 0.77 1.29 12 D 1 -2 1 3 -5 0 1 -2 -3 -3 -4 -1 -4 -3 5 1 0 -6 -5 -2 11 2 7 16 0 4 9 3 0 1 1 2 0 1 25 9 6 0 0 3 0.54 1.28 13 P 0 -3 -2 0 -5 -2 1 -3 -3 -2 -2 -1 -2 -5 6 -3 -2 -6 -4 0 9 1 1 4 0 1 11 2 0 3 4 4 1 0 49 1 1 0 1 8 1.03 1.25 14 K 0 1 3 0 -5 2 0 -2 3 -4 -3 2 -2 -2 -3 2 -1 -1 -2 -2 9 8 15 6 0 8 6 3 7 1 1 11 1 1 1 16 2 1 1 3 0.33 1.24 15 N 0 0 2 2 -5 1 4 -3 2 -3 -4 1 -1 -4 -4 1 -1 0 -2 -3 7 3 10 9 0 7 25 2 4 1 1 10 1 0 0 11 3 1 1 2 0.41 1.22 16 R -3 8 -3 -4 -6 -1 -3 -5 -3 -5 -5 1 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -2 -3 1 92 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0 0 1 1 1.97 1.22 17 V -3 0 -3 -4 -4 1 -1 -5 -3 3 -1 2 0 4 -4 -1 -1 -4 -1 3 1 6 1 0 0 6 4 0 1 16 3 12 2 18 0 5 4 0 1 19 0.40 1.23 18 N -1 -4 5 6 -5 -2 0 -4 -3 -4 -6 -2 -5 -6 -2 -1 -2 -6 -5 -4 4 0 30 52 0 1 5 0 0 1 0 1 0 0 2 3 1 0 0 1 1.29 1.23 19 C -3 -6 -5 -6 11 -6 -6 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -5 -3 -3 -5 -5 -3 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.30 1.23 20 G 1 -2 -2 -2 -3 -1 -3 6 2 -2 -4 -3 -3 -2 -3 -1 -3 -3 -1 -3 11 2 1 2 0 3 1 60 5 3 1 1 0 2 1 2 1 0 2 2 0.95 1.04 21 F -3 -3 -2 -2 -5 -3 -2 -4 2 -3 -4 -3 -2 5 4 -2 -4 3 6 -4 1 1 2 2 0 1 3 1 4 1 0 1 0 21 20 2 0 4 35 0 1.09 1.21 22 P -2 -3 -1 0 -5 -2 0 -2 -2 -4 -1 -1 -3 -3 7 -1 -3 -1 -3 -3 2 1 3 5 0 1 5 2 1 1 7 4 1 1 59 5 0 1 1 2 1.30 1.27 23 G -1 -2 -1 0 -5 0 1 6 -2 -4 -5 0 -4 -5 -3 -1 -2 -5 -2 -4 5 2 2 4 0 3 9 59 1 1 0 4 0 0 1 3 1 0 2 1 0.96 1.23 24 I 1 -5 -5 -3 -3 -3 -5 -5 -5 6 0 -4 -1 -3 -5 -3 -1 -5 -2 3 12 0 0 1 0 1 0 0 0 52 4 0 1 0 0 1 3 0 1 23 0.98 1.24 25 T -2 -4 0 -2 -4 -2 -2 -2 -4 -3 -4 -2 -4 -5 -3 4 6 -5 -3 -3 1 0 3 1 0 1 1 2 0 1 0 1 0 0 1 31 55 0 1 1 1.09 1.28 26 S 2 2 -2 -2 -5 4 2 -4 -3 -5 -4 2 -4 -5 3 1 -2 -5 -3 -3 17 11 1 1 0 20 13 0 0 0 1 11 0 0 14 10 1 0 1 1 0.59 1.28 27 D 1 -1 -1 3 -5 2 4 -2 -1 -3 -4 1 -4 -2 -4 1 -1 0 -3 -4 11 2 2 16 0 8 32 3 1 2 1 7 0 2 0 9 3 1 1 0 0.54 1.28 28 Q -1 -2 -1 2 -5 5 4 -2 0 -3 -1 0 -2 -5 -4 -1 1 -5 -4 -3 4 1 2 10 0 27 28 3 2 1 5 4 1 0 0 3 8 0 0 1 0.64 1.28 29 C -3 -6 -5 -6 11 -6 -6 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -6 -3 -3 -5 -5 -3 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.35 1.28 30 F -1 0 1 -1 -5 2 4 -4 -1 -1 -2 1 -3 1 -4 -2 0 -1 1 -1 5 4 6 3 0 7 30 1 1 4 4 7 0 8 0 2 6 1 5 5 0.37 1.28 31 T 3 1 2 1 -4 2 0 -2 -1 -4 -2 0 -4 -5 -4 1 -1 -5 -3 -4 29 8 10 7 0 11 5 2 2 0 4 6 0 0 0 12 3 0 1 0 0.42 1.28 32 S -2 7 -1 -4 -6 0 -3 -5 -1 -3 -3 3 0 -5 -5 -2 -3 -5 -3 -3 2 66 3 0 0 3 0 0 1 2 3 15 2 0 0 2 1 0 1 1 1.31 1.28 33 G -2 -2 0 -2 -5 -1 -3 7 -2 -5 -5 -2 -5 -5 -4 -2 -4 -5 -5 -5 0 2 3 2 0 3 1 81 1 0 0 2 0 0 0 2 0 0 0 0 1.58 1.21 34 C -3 -5 -5 -5 11 -5 -5 -5 -5 -4 -4 -5 -4 -5 -5 -3 -3 -4 -5 -3 0 0 0 0 95 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.08 1.21 35 C -3 -4 -5 -5 11 -5 -5 -5 -5 -2 -3 -5 -2 -2 -5 -3 -1 -4 -4 -2 0 1 0 0 86 0 0 0 0 2 1 0 1 2 0 0 3 0 0 2 2.67 1.21 36 F -4 -4 -5 -5 -4 -4 -5 -5 -3 -3 -3 -5 -3 6 -5 -4 -4 9 5 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 43 0 0 0 34 18 0 2.03 1.20 37 D -1 -1 3 6 1 -1 0 -2 -2 -3 -4 -1 -3 -4 -1 1 -2 -5 -4 -3 4 3 13 42 3 3 5 2 1 2 1 3 1 0 3 10 2 0 0 2 0.72 1.14 38 S 1 -2 2 1 -4 -1 0 0 -1 -3 -4 -2 -4 -4 2 4 1 -2 -4 -4 11 1 10 8 0 2 4 6 2 1 1 1 0 0 12 32 7 1 0 1 0.48 1.16 39 Q 0 0 1 0 -4 0 -1 -2 -2 -4 -3 0 -4 -5 1 4 3 -5 -3 -3 6 4 5 5 0 4 3 3 1 1 2 6 0 0 6 36 17 0 1 1 0.50 1.23 40 V -1 -3 -2 -1 -4 -2 -3 -3 -2 3 -1 -2 0 -2 2 -1 0 -5 0 4 4 1 2 4 0 1 2 2 1 18 4 2 2 2 12 5 5 0 3 32 0.45 1.32 41 P 0 1 -1 -1 -4 0 -1 -2 -2 -1 -3 -1 -2 -2 5 0 1 1 -1 -2 7 8 3 4 0 3 3 3 1 4 2 4 1 2 33 6 8 2 2 3 0.52 1.30 42 G -2 -1 5 0 -5 -1 -1 5 -3 -5 -5 -2 -5 -5 -3 -1 -1 -5 -5 -5 1 2 28 5 0 3 3 48 0 0 0 1 0 0 1 4 3 0 0 0 1.04 1.30 43 V 1 -3 -3 -5 -4 0 -2 -3 -1 1 -2 -3 -1 -1 -1 -2 0 -5 -1 5 14 1 1 0 0 5 2 2 1 7 2 1 1 3 3 2 6 0 2 47 0.61 1.31 44 P -3 -3 -3 -3 -5 -4 -4 -5 -5 -2 -5 -2 -5 -3 8 -3 -4 -6 -5 -3 1 1 1 1 0 0 0 0 0 3 0 2 0 2 85 1 0 0 0 2 2.32 1.33 45 W -3 -4 -5 -5 -4 -2 -3 -3 -2 -4 -3 -4 -1 -1 -5 -2 -4 12 2 -3 1 0 0 0 0 2 1 2 1 0 2 1 1 1 0 3 0 77 4 2 2.89 1.21 46 C -3 -6 -5 -6 11 -5 -6 -5 -5 -4 -4 -5 -4 -5 -5 -2 -3 -5 -5 -3 0 0 0 0 95 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 3.12 1.25 47 F -4 -5 -5 -6 -5 -5 -5 -5 -3 -3 -2 -5 -3 8 -6 -2 -4 -1 5 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 74 0 3 0 0 20 1 1.94 1.25 48 K -3 -2 0 -3 -5 0 -1 -5 5 -3 -3 1 -3 5 -5 -3 -2 -2 6 -4 1 2 6 1 0 5 3 0 13 1 1 9 0 25 0 1 2 0 32 0 1.02 1.28 49 P -2 -4 -4 -4 -5 -3 -3 -2 2 -5 -5 -1 -5 -6 8 -2 -2 -6 -5 -5 1 0 0 0 0 0 0 4 5 0 0 4 0 0 84 2 1 0 0 0 2.28 1.18 50 L -1 1 -2 -3 -4 0 -1 -4 -3 0 4 1 2 -2 -3 -3 -2 -1 -2 0 4 7 2 1 0 4 4 1 0 3 47 8 4 1 1 1 2 1 1 7 0.42 0.95 51 P 1 -1 0 -3 -4 3 -2 -3 -3 -4 -3 -2 -3 -5 6 1 1 -5 -4 -2 13 2 4 0 0 17 0 0 0 0 1 0 0 0 39 12 10 0 0 2 0.89 0.87 52 A 0 -1 1 -2 -4 -2 3 -4 -3 1 -3 3 1 -4 -1 -2 -2 -5 -4 3 8 2 7 1 0 0 20 0 0 7 0 21 4 0 2 1 1 0 0 26 0.40 0.84 53 Q -3 1 2 -1 -5 5 5 -4 -2 -5 -4 1 -3 -5 -3 -2 -2 -4 -4 -4 0 5 9 0 0 36 41 0 0 0 0 8 0 0 0 0 0 0 0 0 0.99 0.70 K Lambda Standard Ungapped 0.1402 0.3245 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1815 0.3184 PSI Gapped 0.0556 0.2670