JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_wKOsRvg.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet ||||||||||||||||||E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|||||E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|9|8|8|7|7|7|6|5|3|3|5|6|7|7|7|7|3|1|7|8|7|4|4|7|7|8|8|7|6|2|6|8|9|9|9|9|9|8|7|4|4|8|8|1|6|8|8|6|0|5|7|8|8|8|7|6|3|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|3|0|6|8|8|5|3|6|4|1|6|6|2|7|8|7|7|7|6|3|4|7|6|1|4|3|1|7|8|8|7|5|2|6|8|9|9|9|8|7|0|1|6|7|1|3|3|1|0|2|3|0|8|9|9|9|9|9|9|8|6|1|4|7|7|0|3|0|1|6|7|7|7|6|6|5|6|6|7|7|7|7|7|6|5|2|5|7|6|9|9|9|9|8|8|5|2|7|8|8|5|4|7|7|5|1|6|7|4|6|8|9|9|9|8|8|7|5|4|8|9|7|0|7|6|4|1|1|2|1|0|5|7|7|5|6|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|4|5|9|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off B|-|B|-|B|-|-|B|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|-|B|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|B|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|B|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|B|-|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |||||||||||||||||||E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||||||||||||||||||E|E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | |*| | |*| | | | | | | | | | |*| |*|*| | | | | | | | | | | | | |*| | | |*|*|*|*|*|*| |*| | | | | | | | | |*| | | |*|*| |*| | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | |*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |