JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_L8KGVdx.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|||||||||||E|E|E|||||E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|||||||||||||||E|E||||||||||||||||||||E|E|E|E|||||||||||E|E|E||||||||||E|E|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|||||||||E|||||||E|E|E|E|E||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 8|2|8|9|9|9|6|4|8|8|8|4|5|8|7|6|6|4|3|6|7|7|7|7|7|7|6|2|5|6|4|3|6|7|5|2|2|2|3|1|1|7|7|7|6|5|4|0|2|2|1|1|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|1|0|0|1|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|1|1|3|2|1|1|7|7|7|7|7|7|7|7|1|0|1|0|1|7|7|7|7|7|7|7|1|0|0|0|4|5|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|3|2|3|3|4|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|6|5|6|7|7|7|0|1|2|4|4|3|1|1|7|7|7|6|3|4|7|6|1|5|6|7|7|6|3|1|0|4|6|7|7|7|3|5|8|8|6|1|6|9|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|B|B|B|B|-|B|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|-|-|B|-|B|-|B|B|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|B|B|-|B|-|B|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|B|B|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|||||||||||E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|||||||||||||E|E|E|E||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E||||||||||||||||E|E|E|E|E||| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles |E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|||||||||||E|E|E||||||E|E|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|||||||E|E|||||||E|E|E|E|E||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | |*|*|*| | | | | | |*|*|*|*|*| | | | | | | | | | | | |*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*|*|*| | | | | | | | |*|*|*|*|*| | | | | | | |*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*|*|*|*|*| | | | | | | | |*| | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | |