JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_tOqqT3p.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet ||E|E|E|E|E|E||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|H|H||||E|E|||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E||||||E|E|H|H||H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E|||||E|E||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|8|3|8|9|9|8|4|4|6|7|7|7|7|7|7|7|6|5|2|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|1|7|8|1|7|8|7|5|1|7|6|5|8|9|9|9|9|9|9|9|8|6|0|3|6|7|7|7|7|7|7|7|7|6|4|2|6|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|1|3|7|8|7|6|1|0|0|0|1|0|1|3|1|1|2|4|7|7|6|4|3|2|4|4|2|2|3|5|7|7|7|6|3|7|8|9|9|9|9|8|7|1|3|8|8|0|5|8|8|6|3|7|8|1|2|6|8|8|7|1|5|6|3|1|1|0|0|1|1|1|1|2|3|3|2|1|0|2|7|7|3|4|7|7|5|2|6|8|8|8|0|2|7|8|8|1|4|7|8|6|0|7|7|5|0|6|0|6|8|9|9|9|9|9|9|9|7|5|0|4|3|1|2|4|4|4|2|5|7|8|5|0|2|1|5|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|3|5|6|6|8|8|8|7|5|2|6|7|8|8|8|7|6|6|2|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|2|6|9|7|3|7|7|6|3|5|6|5|8|8|9|8|8|8|6|1|5|8|8|5|5|8|8|7|1|7 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|-|B|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|B|-|-|-|B|B|B|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles ||E|E|E|E|E|E||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|||||E|E|||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E||||||E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E|||||E|E||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||E|E|E|E|E|E|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E||||||E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E||||||||||||||E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||H|H|H|H|H|H|H||||||E|E||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | |*|*|*|*|*|*|*|*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | |*| | | | | | | |*|*| | | | |*| | | |*|*|*|*|*|*|*|*|*|*|*|*|*|*|*| | | | | | | | | | | | |*| | | | |*| | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | 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