JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_P0zH2GT.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet ||||||||H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E||||||||||||H|H|H|H|H||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|||E|E|E||||||||E|E|E|E|||||||||||||||||||||E|E|E||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E|E|E|E||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|9|9|8|8|7|5|1|7|8|7|7|7|5|1|6|8|8|8|4|1|8|9|9|9|8|1|4|8|8|5|5|8|9|9|8|6|1|1|7|8|8|7|7|5|0|6|7|7|3|2|1|6|5|1|3|3|3|1|3|3|1|1|3|3|2|2|1|6|7|7|7|7|7|7|7|3|2|3|6|2|2|3|3|3|2|0|2|7|7|7|6|2|2|3|2|1|2|1|1|0|1|4|4|3|1|1|1|1|2|2|0|1|3|4|3|3|6|7|7|7|7|0|2|2|3|2|0|6|7|7|7|7|7|6|6|6|4|4|3|5|6|6|7|7|7|5|2|3|3|0|6|7|7|7|7|7|7|7|7|6|6|5|4|6|7|6|3|1|0|1|3|4|6|6|4|5|6|7|7|6|4|1|4|6|6|7|7|7|7|7|7|3|1|8|8|8|2|3|5|8|8|8|6|3|0|3|8|9|9|9|9|7|1|6|7|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|B|-|-|B|-|-|-|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|B|-|B|B|-|-|-|-|B|B|B|-|B|-|-|B|-|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|B|-|-|B|B|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|B|B|B|B|B|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|B|B|B|-|-|B|-|B|B|B|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|B|-|B|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles ||||||||H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|H||H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E||||||||||||||||||||E|E|E|E||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|||||||||||E|E|E|E|E|E|E||| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||||||||H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E||||||E|E|H||H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | |*| | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | |*|*| | | |*|*|*| |*|*|*| | | | |*|*| | | | | | | | |*|*|*| |*|*|*|*|*|*|*|*| | | | | | | | | |*|*|*|*| |*|*|*|*|*|*|*|*|*|*|*|*| | | | | | | | |*|*|*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | |*|*| | | | | |*|*|*| | | | | | | | | |