JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_SflCI7j.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet ||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 8|9|8|8|7|7|7|7|7|3|1|8|8|8|9|9|9|9|8|6|5|8|1|5|8|9|9|9|8|6|2|3|1|6|8|7|3|2|6|8|8|8|9|9|8|8|5|3|7|7|8|8|7|6|3|3|4|5|4|5|4|2|1|1|1|2|1|1|4|7|8|8|7|7|7|6|4|1|5|4|4|0|2|7|8|8|4|5|8|8|9|9|9|7|1|6|8|7|1|6|8|9|8|9|9|9|9|8|6|1|8|6|5|8|9|9|8|8|8|9|9|8|5|3|6|7|7|7|7|7|7|7|6|4|0|1|2|0|5|7|7|6|1|7|8|7|4|3|6|7|7|7|7|7|6|1|4|3|3|3|4|4|4|3|4|7|8|8|7|4|5|8|8|7|4|3|1|1|0|2|5|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|5|1|7|8|8|8|8|8|9|9|8|6|3|7|8|8|8|7|3|5|8|8|8|8|8|9|9|9|7|1|1|8|9|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|-|B|B|-|-|-|B|-|B|-|B|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|B|-|B|-|-|B|-|B|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|-|B|-|-|-|B|B|B|-|B|-|B|-|B|-|B|-|-|-|B|B|-|B|-|B|-|B|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|B|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|B|B|B|B|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|-|B|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|B|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|E|E|E|E|E|E||||||||||H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||E|E||||||E|E|E|E|E||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E||||E|||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | |*|*| | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*|*|*|*|*|*| | | | | | | | | | | |*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | |