JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_sFJJTpN.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E||E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||||||E|E|E|E|E|E||||||||||||E|E|E|E|E|E||||||||||||||||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 8|9|8|8|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|4|1|3|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|1|6|7|8|7|7|7|6|2|1|2|2|1|0|5|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|2|7|8|9|9|9|9|8|6|2|3|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|6|6|7|7|7|7|7|3|5|8|8|8|2|0|5|7|5|1|0|6|7|4|6|8|9|9|9|8|8|7|5|3|8|8|6|5|8|8|8|6|2|5|7|8|8|8|6|1|0|1|2|8|7|4|1|6|7|7|7|7|7|7|7|7|5|1|6|8|8|9|8|8|8|1|3|6|7|7|7|7|7|7|4|1|8|8|8|8|6|1|5|6|7|7|7|7|7|7|7|4|4|8|8|8|8|4|4|7|7|7|4|1|3|6|6|7|6|7|6|1|0|2|7 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|B|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|B|B|B|B|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||H|H|H|H|H|H|||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|||E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|||||||||||E|E|E|E|||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E||||||||||||E|E|E|E|E||||||||||||E|E|E|E|E|E||||||||||||||E|E|E| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||E|E|E|||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||E|E|E|E|E|E||||||||||||||||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*| | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*| | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | |*| | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|