Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 R -3 4 -2 -2 -5 2 2 -4 -2 -5 -4 5 -3 -5 -3 -2 -3 -5 -4 -4 0 29 0 0 0 9 14 0 0 0 0 48 0 0 0 0 0 0 0 0 1.05 0.78 2 R -3 1 -1 -2 -4 1 4 -5 -3 -1 -3 2 0 -4 -4 -2 -1 -5 -4 4 0 8 2 0 0 4 34 0 0 1 0 13 2 0 0 2 2 0 0 33 0.65 0.99 3 K -3 2 1 -3 -6 -1 -2 -4 -3 -5 -5 7 -4 -6 -4 -3 -2 -6 -4 -5 0 6 5 0 0 0 0 0 0 0 0 87 0 0 0 0 2 0 0 0 1.67 1.26 4 P -1 0 -4 -3 -5 -1 -3 -5 -1 -5 -3 -2 -4 -6 8 0 -1 -1 -5 -2 4 5 0 1 0 3 0 0 1 0 3 2 0 0 68 6 3 1 0 2 1.66 1.30 5 G -2 -2 -3 -4 -5 -4 -5 7 -5 -7 -6 -2 -5 -6 -5 -3 -4 -5 -6 -6 0 3 0 0 0 0 0 95 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 2.08 1.31 6 K -1 2 -1 -4 -4 -2 -1 -2 1 0 -3 3 -2 0 -4 2 3 -5 -3 0 4 11 2 0 0 1 4 3 4 5 2 17 1 4 0 19 18 0 1 5 0.38 1.37 7 C -3 -6 -6 -6 11 -6 -7 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -6 -4 -4 -5 -5 -4 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.43 1.37 8 P -4 -5 -5 -4 -6 -4 -4 -5 -5 -5 -3 -4 -5 -6 9 -4 -4 -6 -6 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 95 0 0 0 0 2 2.80 1.37 9 V 0 2 -2 -1 -5 -2 1 -5 -2 -1 -1 2 1 -1 0 -2 0 2 -4 3 7 12 2 3 0 1 10 0 1 2 4 14 3 2 5 2 7 2 0 22 0.29 1.37 10 T -1 -5 -5 1 -4 -4 -1 -5 -5 4 -1 -2 0 2 -2 -1 -1 -5 -4 4 5 0 0 8 0 0 5 0 0 26 2 2 1 8 2 4 4 0 0 33 0.62 1.37 11 Y -1 2 1 -2 -3 2 1 -2 0 -1 1 0 -1 -1 1 -1 1 -1 0 -2 4 9 7 2 0 11 10 2 2 3 12 4 1 2 7 4 11 1 4 2 0.16 1.37 12 G 1 -1 -1 -2 -5 -4 -1 4 -4 2 -1 -3 2 0 -1 -2 0 -5 -1 0 10 4 3 2 0 0 4 31 0 13 5 1 5 4 3 1 6 0 3 5 0.36 1.37 13 Q -3 4 -2 -3 -5 5 1 -1 3 -4 -3 1 -1 -3 0 -2 -1 0 -1 -5 1 23 1 0 0 24 10 5 7 1 2 8 1 1 5 2 4 1 3 0 0.61 1.35 14 C -2 -5 -5 -6 11 -3 -5 -3 -5 -2 -3 -5 -4 -5 -5 -2 -2 -5 -2 -3 2 0 0 0 83 1 0 2 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 2 0 2.59 1.33 15 L 1 1 -2 -3 -4 0 0 -3 -2 -1 2 0 3 0 1 0 0 -4 -3 -2 12 7 2 1 0 3 7 2 1 2 22 5 8 4 6 8 7 0 1 1 0.20 1.27 16 M -1 -1 -3 -1 -3 -1 -1 -2 -3 0 1 -1 7 -1 -2 0 0 -3 0 0 5 4 1 4 0 3 4 3 0 5 11 4 28 2 2 7 5 0 3 7 0.40 1.10 17 L -1 -2 -4 -4 -3 -3 -3 -4 0 1 4 -1 1 2 1 -1 0 1 -1 -1 5 2 1 1 0 1 1 1 3 7 39 4 4 9 7 4 5 2 2 3 0.41 1.21 18 N -2 0 6 1 1 -1 -1 -1 1 -4 -4 0 -3 -4 -1 2 -1 -4 -3 -4 3 4 39 7 3 2 4 4 4 1 1 5 0 1 3 15 4 0 0 1 0.66 1.17 19 P -3 -3 -1 -2 2 -1 1 -1 -1 -2 -4 -3 -3 -2 7 -1 -1 -4 0 -2 1 1 2 2 5 3 8 5 1 2 1 1 0 2 51 4 4 0 3 3 1.07 1.15 20 P -2 2 -3 -3 -4 -1 -2 -1 -1 -1 0 0 -2 -4 6 -1 0 -4 -3 0 3 10 1 1 0 3 2 5 2 4 8 6 1 1 37 4 6 0 1 6 0.65 1.15 21 N -3 -3 6 4 -4 1 0 -2 -1 -3 -4 -1 -4 -4 -3 0 -2 -5 -4 -2 2 1 41 25 0 5 5 2 1 1 1 4 0 0 1 7 2 0 0 3 0.90 1.23 22 F -1 2 1 -1 -4 3 -1 -4 5 -2 -2 2 -1 -1 0 -1 -1 -4 1 -2 4 12 8 4 0 13 3 1 14 3 4 12 2 2 4 3 3 0 4 4 0.36 1.27 23 C -3 -6 -6 -6 11 -6 -7 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -6 -4 -4 -5 -5 -4 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.43 1.38 24 E -3 -1 -1 -2 -3 3 2 -1 2 -2 1 -1 0 0 -5 -1 2 3 -2 -1 1 4 2 2 1 14 14 5 6 2 15 3 3 4 0 4 13 4 1 4 0.27 1.38 25 M -2 2 3 0 -1 -1 -1 -1 1 -4 -3 1 -1 -2 -4 3 2 -5 -2 -3 2 13 12 5 2 2 2 4 4 1 2 9 2 2 0 23 14 0 1 1 0.39 1.38 26 D -5 -4 1 8 -6 -3 -1 -4 1 -6 -7 -3 -6 -6 -4 -3 -4 -7 -5 -6 0 0 4 92 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.18 1.38 27 G 1 1 -1 -2 -4 -2 1 2 0 -4 -3 -2 -2 -1 -4 3 1 -1 1 -1 10 8 3 2 0 1 8 16 2 0 1 2 1 3 0 25 7 1 4 5 0.32 1.38 28 Q -4 -2 -1 5 -6 5 4 -3 5 -6 -6 -2 -4 -6 -4 -2 -4 -6 -4 -6 0 1 2 29 0 24 24 1 15 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 1.14 1.38 29 C -3 -6 -5 -6 11 -6 -6 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -5 -3 -3 -5 -5 -3 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.30 1.23 30 K -2 0 -4 0 -5 0 0 -5 -4 -3 -1 -1 -1 -5 7 0 -1 -1 -2 -1 1 4 0 5 0 4 6 0 0 1 8 4 1 0 50 6 3 1 1 4 1.03 1.23 31 R -1 0 0 0 -5 -3 0 6 -1 -6 -4 -1 -5 -2 -4 0 -3 -5 -5 -5 2 5 5 6 0 1 5 63 1 0 1 3 0 2 0 5 1 0 0 0 1.06 1.23 32 D 0 0 4 1 -4 -1 0 0 -2 -1 -1 1 -2 -2 0 0 1 -5 -2 -1 9 5 19 7 0 2 5 7 1 3 5 8 1 1 4 8 11 0 2 4 0.21 1.23 33 L -2 0 -3 -1 -5 3 0 -4 -3 -3 1 5 3 2 -4 -2 -3 0 0 -4 3 3 0 3 0 12 5 1 0 0 16 35 10 8 0 2 0 1 3 0 0.58 1.23 34 K -3 2 -2 -3 -6 -1 -2 -4 -3 -3 -5 7 -1 -6 -4 -3 -3 -6 -4 -2 0 6 1 0 0 0 0 0 0 1 0 87 1 0 0 0 0 0 0 3 1.60 1.23 35 C -3 -6 -5 -6 11 -6 -6 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -5 -3 -3 -5 -5 -3 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.30 1.23 36 C -3 -6 -5 -6 11 -6 -6 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -5 -3 -3 -5 -5 -3 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.25 1.17 37 M -3 1 0 -2 -5 0 2 -4 1 -2 0 2 2 0 2 0 -1 -4 1 0 1 6 4 1 0 3 13 0 3 1 8 14 5 4 9 8 4 0 6 8 0.21 1.17 38 G -2 0 1 -3 -4 -3 -3 5 -1 -3 -3 -3 -2 0 -4 2 1 -5 -1 -4 2 5 6 1 0 0 1 45 1 1 2 0 1 5 0 18 9 0 2 0 0.72 1.16 39 M 1 -3 -2 -2 -4 -3 -2 2 2 0 -2 -4 4 2 1 2 -2 -4 0 -1 11 1 2 1 0 0 2 14 4 5 2 0 15 9 6 20 1 0 3 4 0.33 1.17 40 C -3 -3 -3 -6 11 -5 -6 -4 -5 -3 -4 -3 -4 -5 -5 -3 -2 -5 -5 -3 0 1 1 0 92 0 0 1 0 1 0 2 0 0 0 0 1 0 0 0 2.87 1.17 41 G -1 -5 -2 -4 -5 -4 -3 7 -4 -6 -6 -4 -5 -3 -5 -1 -4 0 -5 -3 4 0 1 0 0 0 1 85 0 0 0 0 0 1 0 4 0 2 0 2 1.68 1.17 42 K -2 4 1 -4 -5 -2 -2 -4 1 -4 -2 5 3 -1 -2 -2 0 -5 -1 -2 3 21 6 0 0 0 0 0 3 0 3 41 9 3 1 1 5 0 3 3 0.73 1.17 43 S 2 0 -3 1 -4 1 0 -2 1 0 -2 1 -1 -2 -4 1 1 -5 -4 2 16 5 0 8 0 7 5 3 3 4 2 8 1 1 0 11 8 0 0 16 0.21 1.17 44 C -3 -6 -5 -6 11 -5 -6 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -5 -2 -3 -5 -5 -3 0 0 0 0 98 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 3.14 1.17 45 V -2 0 -5 -5 -4 -4 -5 -5 -5 1 3 -4 5 0 -5 -1 -2 -4 -2 4 2 6 0 0 0 0 0 0 0 5 30 0 16 3 0 4 1 0 1 32 0.74 1.16 46 S -1 -1 2 3 -5 -1 1 -4 0 -1 -1 1 0 -4 0 1 1 -5 -2 -3 4 3 11 20 0 2 10 0 2 4 6 8 2 0 4 12 7 0 2 1 0.31 1.17 47 P -3 -3 -4 -4 -5 -4 -4 -5 -5 -5 -4 -3 -5 -6 8 -3 -3 -6 -5 -5 1 2 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 96 0 1 0 0 0 2.73 1.14 48 V -2 -4 -1 -4 -1 0 2 -4 -4 1 1 -2 2 -3 -4 -3 -2 -5 -2 5 1 0 3 0 1 4 14 1 0 6 12 2 6 0 0 0 1 0 1 49 0.64 1.03 49 K -3 3 -1 -2 -5 1 2 -4 -2 -5 -3 5 -3 -5 0 -1 -3 -5 -4 -4 0 19 2 0 0 5 16 0 0 0 2 48 0 0 5 3 0 0 0 0 0.88 0.84 50 A 4 -4 -2 -3 -3 -3 -3 6 -4 -4 -4 -3 -4 -5 -3 -1 -3 -4 -4 -3 39 0 0 0 0 0 0 61 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.18 0.67 K Lambda Standard Ungapped 0.1420 0.3270 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1755 0.3192 PSI Gapped 0.0537 0.2670