Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 M -3 -4 -5 -6 -4 -3 -4 -5 -4 0 1 -4 10 -2 -5 -4 -3 -4 -3 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 4 0 94 0 0 0 0 0 0 0 2.13 1.03 2 L -3 2 -2 -4 -5 -1 -3 -5 -3 -1 -1 3 8 -4 -4 -3 0 -5 -4 -2 1 10 2 0 0 2 1 0 0 3 4 19 51 0 0 1 7 0 0 0 1.15 1.30 3 Y 0 -3 -5 -5 -3 -4 -5 -3 -2 -1 -2 -1 -2 5 -2 -3 -2 2 7 -2 8 1 0 0 0 0 0 2 0 4 2 4 1 24 3 1 3 3 42 3 1.09 1.31 4 R -3 3 -1 -1 -2 1 -1 -4 0 0 -1 5 -2 -3 -4 -2 1 -5 -2 -2 1 15 3 4 1 7 3 0 2 5 7 38 1 1 0 1 8 0 1 3 0.58 1.34 5 V 4 -5 -5 -5 -2 -4 -5 -3 -5 2 -2 -4 -2 -1 -4 -3 -2 -5 -4 5 41 0 0 0 1 0 0 1 0 11 2 0 0 3 0 0 1 0 0 41 0.96 1.34 6 E -2 3 -1 -1 -4 0 3 -5 1 -1 -3 3 -3 -5 -4 -2 2 -5 -1 1 2 15 2 3 0 3 21 0 3 4 1 19 0 0 0 1 12 0 2 10 0.47 1.35 7 L -2 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -6 4 0 -5 -1 -2 -5 -5 -3 -5 -4 6 1 0 0 0 0 0 0 0 0 26 6 0 1 1 0 0 0 0 0 64 1.34 1.34 8 I -3 0 1 1 -5 -2 0 -5 2 1 -1 -1 -1 2 -5 -1 2 -2 4 -2 1 5 8 9 0 2 6 0 6 9 7 5 1 9 0 3 13 0 16 2 0.33 1.36 9 I -3 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -6 5 -1 -5 -2 -3 -5 -5 -2 -6 -4 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33 1 0 0 0 0 0 1 0 0 64 1.48 1.36 10 T -2 1 -2 -4 -4 -1 0 -2 -2 -3 -2 0 5 -1 -4 1 4 -2 -1 -2 2 9 1 0 0 3 5 3 1 1 2 6 16 3 0 11 32 0 2 2 0.55 1.38 11 N -4 -4 0 -5 -5 -4 -5 -6 -4 -1 5 -3 -1 1 3 -4 -3 -2 3 -2 0 0 5 0 0 0 0 0 0 1 56 1 0 5 15 0 1 0 12 0 0.92 1.36 12 K -4 3 -1 -4 -6 0 -2 -5 -2 -5 -3 7 -4 -6 -4 -3 -4 -6 -5 -5 0 15 2 0 0 2 0 0 1 0 3 77 0 0 0 0 0 0 0 0 1.55 1.37 13 E 0 0 0 0 -5 1 3 -3 -1 -5 -5 2 -5 -6 5 0 -2 -6 -5 -4 7 4 5 5 0 5 18 1 1 0 0 14 0 0 32 5 2 0 0 0 0.79 1.36 14 G -2 -4 0 -2 -4 -1 2 5 -1 -6 -5 -2 -5 -6 -4 3 -2 -6 -4 -4 2 0 3 2 0 2 14 47 1 0 1 1 0 0 0 24 2 0 0 1 0.93 1.37 15 V -2 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -6 4 0 -5 3 -2 -5 -3 -3 -5 -4 6 2 0 0 0 0 0 0 0 0 26 7 0 6 1 0 1 0 0 0 58 1.23 1.37 16 R -3 1 -2 -4 -4 -4 -3 -6 -4 -1 6 -4 1 0 -3 -3 -2 -5 -4 -2 1 9 2 1 0 0 2 0 0 1 71 0 2 3 1 2 2 0 0 1 0.99 1.37 17 D -5 -4 1 8 -6 -3 -1 -4 -4 -6 -7 -3 -6 -6 -4 -2 -4 -7 -6 -6 0 0 5 93 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 2.19 1.37 18 P -2 -5 -2 -3 -6 -4 -4 -5 -5 -5 -6 -4 -5 -7 9 -2 -2 -7 -6 -3 2 0 2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 90 2 2 0 0 2 2.58 1.45 19 E 1 -1 -3 -3 -6 7 4 -5 -3 -5 -5 -1 -4 -6 -3 -3 -2 -5 -5 -3 10 2 0 0 0 54 28 0 0 0 0 2 0 0 1 0 1 0 0 2 1.34 1.45 20 G 2 -5 -3 -4 -5 -4 -3 7 -5 -6 -4 -4 -5 -6 -5 -2 -4 -6 -6 -5 16 0 0 0 0 0 1 80 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1.73 1.45 21 E -1 2 -1 -1 -6 3 4 -4 -2 -4 -3 4 -3 -5 -4 -1 0 -6 -5 -2 4 8 2 2 0 12 27 1 0 1 2 28 0 0 0 5 5 0 0 3 0.68 1.45 22 T 5 -4 -3 -4 -4 -3 -3 -2 -5 -3 -4 -4 -4 -5 -2 -1 4 -6 -5 0 60 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 2 27 0 0 5 1.09 1.45 23 I -2 -5 -3 -6 -4 -5 -5 -6 -6 6 0 -5 -2 -3 -5 -4 1 -6 -4 5 3 0 1 0 0 0 0 0 0 44 5 0 0 0 0 0 8 0 0 38 1.18 1.45 24 Q 1 1 -2 -3 -2 3 2 -2 2 -4 -1 4 -1 -3 -4 -2 -1 -5 -3 -2 10 7 1 1 1 15 13 3 5 1 7 23 1 1 0 2 4 0 1 3 0.43 1.59 25 R -1 4 2 -1 -4 1 -1 2 4 -6 -4 2 -5 -6 -5 1 -1 -6 -4 -5 4 23 9 4 0 5 4 15 11 0 2 11 0 0 0 9 3 0 0 0 0.58 1.60 26 Y 5 -4 -1 -1 -4 -3 -2 0 -3 -4 -5 -3 -3 -4 -4 2 -1 -6 -2 0 57 1 3 4 0 1 3 7 0 0 0 1 0 1 0 12 4 0 2 5 0.83 1.60 27 V -1 -5 -6 -7 -1 -5 -6 -5 -6 1 6 -5 1 -1 -6 -4 -3 -5 -4 1 6 0 0 0 1 0 0 1 0 5 77 0 2 1 0 1 1 0 0 7 1.29 1.61 28 V 0 0 1 -1 -3 0 1 0 5 -2 -2 1 -3 -2 0 0 -1 -2 -3 -1 7 5 7 3 1 5 11 9 15 3 5 10 0 2 5 6 3 1 1 4 0.25 1.54 29 S 0 4 2 0 -5 1 0 -1 2 -3 -1 0 -3 -3 -5 2 0 -6 -4 -3 7 22 8 4 0 7 6 5 4 1 7 6 0 1 0 14 5 0 0 1 0.35 1.61 30 R -3 1 -3 -6 -5 -2 -2 -6 -1 0 5 -1 4 -2 -6 -3 -3 -5 -2 -2 2 7 2 0 0 1 2 0 2 5 61 4 10 1 0 1 1 0 1 1 0.92 1.61 31 F -2 -4 -1 0 -4 -2 -3 6 -2 -5 -1 -3 -3 -2 -5 -2 -3 -6 -3 -4 2 1 3 5 0 2 1 68 1 0 8 1 1 1 0 2 1 0 1 1 1.23 1.61 32 S -3 -4 -2 -3 -5 -3 -4 0 2 -1 -2 -4 -2 6 -3 -3 -1 1 6 -1 2 1 2 2 0 1 1 7 5 4 3 1 1 30 2 2 3 1 29 5 0.92 1.60 33 D -1 -2 1 4 -5 1 3 -1 2 -3 -4 0 -4 -1 -1 0 0 -5 1 -3 6 2 7 19 0 5 16 5 5 1 2 6 0 3 2 8 7 0 5 2 0.34 1.57 34 K -1 -3 3 0 -4 -1 2 4 -1 -4 -5 0 -3 -4 0 1 -1 -3 -4 -4 4 1 14 5 0 3 16 27 1 1 1 6 1 1 5 8 3 0 1 1 0.49 1.52 35 I -2 -6 -6 -5 -3 -5 -6 -3 -6 4 0 -5 -1 1 -6 -4 -1 -5 -2 6 2 0 0 1 0 0 0 2 0 19 7 0 0 6 0 1 3 0 1 58 1.12 1.60 36 I 0 -1 1 1 -5 1 3 -1 -1 -3 -4 2 -3 -4 -1 2 1 -6 -4 -3 6 2 6 8 0 6 19 5 2 1 1 15 0 0 3 16 8 0 0 1 0.38 1.59 37 E -1 -1 3 5 -5 1 2 1 -1 -6 -5 0 -5 -6 -3 2 -2 -6 -4 -5 5 3 12 29 0 5 11 9 1 0 1 5 0 0 1 16 1 0 0 1 0.64 1.60 38 T -1 -6 -6 -6 -2 -5 -6 -6 -6 2 1 -5 -1 -2 -6 -5 0 -6 -4 6 3 0 0 0 1 0 0 0 0 11 12 0 1 1 0 0 5 0 0 65 1.25 1.61 39 R -3 8 -2 -3 -6 0 -2 -4 -1 -4 -4 2 -3 -6 -5 -2 -2 -6 -4 -4 1 74 1 1 0 4 1 1 1 1 1 8 0 0 0 3 2 0 0 1 1.60 1.61 40 A 0 -4 -4 -5 -2 4 -4 -5 -5 4 -1 -4 1 -2 -5 0 2 -5 -2 3 6 0 0 0 1 20 0 0 0 23 3 0 4 1 0 7 12 0 1 22 0.67 1.61 41 G 0 -4 -3 -5 -5 -4 -5 7 -5 -4 -5 -2 -4 -4 -3 -1 -3 -5 -1 -4 7 0 1 0 0 1 0 76 0 1 1 3 0 1 1 3 1 0 3 1 1.51 1.61 42 K -4 2 -2 0 -6 -1 -1 -5 -4 -6 -6 7 -5 -6 -4 -3 -2 -6 -5 -5 0 7 1 5 0 1 1 0 0 0 0 83 0 0 0 1 2 0 0 0 1.72 1.61 43 Y -3 3 -4 -5 1 0 -3 -5 1 1 -1 -2 0 1 -5 -1 -2 -2 6 2 2 15 0 0 3 4 1 1 4 8 6 1 2 5 0 5 2 0 25 14 0.57 1.59 44 L -4 -3 -6 -6 -5 -5 -6 -6 -5 5 1 -5 2 6 -6 -5 -4 -3 2 1 1 2 0 0 0 0 0 0 0 34 11 0 4 33 0 0 0 0 6 8 1.14 1.58 45 V -3 1 -3 2 -6 1 6 -4 0 -2 -3 -1 -3 -4 -4 -2 0 -6 -2 0 1 7 0 9 0 4 49 1 2 3 3 3 0 1 0 1 7 0 2 7 0.80 1.61 46 F -4 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -5 -5 3 4 -5 2 4 -6 -5 -3 -4 -1 2 0 0 0 0 0 0 0 1 0 16 43 0 4 18 0 0 1 0 2 14 0.99 1.59 47 R -3 -2 0 3 -3 1 4 -5 -1 -2 -2 0 -2 -3 -4 -1 3 1 -1 -2 1 1 3 15 1 5 29 0 1 3 4 6 1 1 0 3 18 2 2 3 0.51 1.60 48 V -4 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -5 -4 4 4 -5 2 1 -6 -5 -3 -5 -3 4 0 0 0 0 0 0 1 1 0 23 36 0 4 5 0 0 1 0 0 27 0.95 1.59 49 N 0 -2 2 5 -5 0 4 -3 -2 -4 -3 -1 -4 -5 -2 -1 0 -6 -5 -4 8 2 8 27 0 3 30 1 1 1 2 3 0 0 2 3 5 0 0 1 0.70 1.55 50 S 4 -3 -2 1 -2 -2 2 3 -3 -4 -4 -2 -3 -4 -2 1 0 -5 -5 -3 34 1 1 9 1 1 12 18 0 1 1 1 1 1 2 8 5 0 0 2 0.51 1.58 51 S 0 -1 0 3 -3 0 3 -1 -3 -3 -4 0 -2 -5 2 1 1 -6 -4 -2 9 3 4 14 0 3 20 6 1 2 1 6 1 0 8 9 7 0 0 3 0.31 1.62 52 S -2 -4 2 5 -4 -3 -1 -2 -2 -3 -4 -3 -5 -5 -1 3 1 -6 -5 -1 3 0 11 34 0 0 2 3 1 2 1 1 0 0 3 23 7 0 0 6 0.70 1.64 53 Q 0 2 -2 1 -3 0 3 -2 -1 -2 -3 2 -4 -4 1 -1 1 -6 -2 -1 9 11 1 8 0 3 21 2 1 2 2 12 0 1 7 4 9 0 1 4 0.30 1.65 54 Q 2 0 -1 3 -5 0 5 -2 -2 -4 -3 0 -3 -5 -1 -1 -2 -6 -5 -3 16 4 2 15 0 3 34 2 1 1 3 5 1 0 3 4 2 0 0 2 0.56 1.66 55 E 2 -2 0 2 -2 0 4 -4 -1 -3 -4 2 -3 -4 -2 0 0 -6 -4 -2 15 2 3 12 1 4 28 1 1 1 1 11 1 1 2 5 5 0 1 3 0.46 1.66 56 A 5 -3 -4 -3 -3 -3 -2 -3 -2 0 -1 -3 -2 -4 -3 -2 -2 -5 -3 2 59 1 0 2 0 1 2 1 1 5 5 1 1 1 1 2 2 0 1 13 0.83 1.64 57 T -1 3 -2 0 -4 0 3 -3 0 -1 1 2 -2 -3 -4 -2 -1 -5 -2 -1 5 15 1 4 0 3 23 1 2 3 13 12 1 1 0 2 4 0 1 4 0.32 1.62 58 E 2 0 0 1 -5 2 4 -3 -2 -4 -4 2 -3 -4 -4 0 -1 -5 -3 -3 19 6 4 7 0 9 24 1 1 1 1 12 0 0 0 5 4 0 1 1 0.44 1.62 59 L -1 2 -2 1 -5 3 2 -5 -3 1 -1 2 -1 -3 -4 -2 0 -5 -3 -1 5 12 1 6 0 15 14 0 0 8 7 11 1 1 0 2 6 0 1 5 0.30 1.66 60 V 3 -5 -5 -6 -1 -5 -4 -3 -5 3 1 -5 -1 -3 -5 -4 -2 -5 -4 5 22 0 0 0 1 0 1 2 0 14 14 0 1 0 0 0 1 0 0 39 0.78 1.68 61 K -2 3 0 2 -4 0 4 -3 0 -3 -3 3 -4 -6 -4 -2 0 -6 -5 -3 4 14 4 13 0 3 24 2 2 1 3 17 0 0 0 2 5 0 0 1 0.52 1.68 62 K 0 1 -1 2 -6 2 4 -4 -2 -4 -3 2 -4 -6 -4 -1 -1 -6 -4 -3 8 7 2 9 0 9 32 1 1 1 3 14 0 0 0 4 4 0 0 2 0.56 1.69 63 L 1 -5 -5 -5 -4 -4 -5 -5 -5 4 2 -5 8 -1 -5 -4 -3 -3 -3 0 11 0 0 0 0 0 0 0 0 22 13 0 42 2 0 0 0 0 1 4 1.21 1.70 64 A 4 -5 -5 -5 10 -4 -5 -3 -5 -3 -3 -4 -4 -5 -4 0 -2 -5 -3 -2 31 0 0 0 51 0 0 1 0 1 2 0 0 0 0 5 2 0 1 2 1.71 1.63 65 D -1 1 -1 4 -5 1 5 -3 -1 -5 -5 1 -3 -5 -4 -1 -2 -2 -3 -4 4 9 3 19 0 6 36 2 1 0 1 7 1 0 0 3 2 1 1 1 0.72 1.64 66 E -2 3 -1 1 -5 2 2 -3 -3 -5 -5 5 -4 -6 -4 -1 0 -5 -5 -4 3 14 3 8 0 7 15 2 0 0 0 34 0 0 0 4 6 0 0 1 0.71 1.65 67 M -3 -4 -5 -6 -4 -4 -5 -5 -5 0 6 -3 2 -1 -5 -4 -2 -4 -4 0 2 1 0 0 0 0 0 1 0 3 73 2 4 2 0 1 2 0 0 5 1.17 1.65 68 R 0 2 0 0 -1 0 0 -1 -1 -1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 6 11 4 4 2 3 5 6 2 4 12 5 2 5 4 7 5 1 3 6 0.00 0.31 69 L -5 -5 -6 -7 -4 -5 -6 -7 -6 1 6 -6 -1 -1 -6 -6 -4 -5 -4 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 89 0 0 2 0 0 0 0 0 1 1.60 1.64 70 Y 5 -5 -4 -5 1 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79 I -3 -6 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -4 5 0 -6 -1 3 -6 -5 -3 0 4 4 1 0 0 0 0 0 0 0 0 35 5 0 1 13 0 0 0 1 12 31 1.11 1.56 80 R -3 3 -2 2 -6 1 5 -5 -1 -5 -5 1 -5 -4 -4 -1 0 -6 -4 -3 1 16 1 9 0 4 46 0 1 0 0 9 0 1 0 4 5 0 0 2 0.90 1.50 81 A -1 -3 -6 -6 -2 -4 -5 -5 -6 4 3 -5 -1 -2 -5 -3 -3 -2 -4 5 5 1 0 0 1 0 0 0 0 20 30 0 1 1 0 2 1 0 0 37 0.89 1.47 82 N 1 1 -2 -1 -4 0 5 -4 -2 -2 -3 1 -2 -5 -4 1 0 -6 -5 -1 12 6 1 2 0 2 41 0 0 3 2 9 1 0 0 8 6 0 0 5 0.60 1.44 83 R -1 0 -3 -1 -6 1 6 -4 -3 -6 -5 1 -5 -6 2 -2 -2 -6 -5 -4 4 5 0 2 0 5 61 0 0 0 1 9 0 0 9 1 1 0 0 1 1.14 1.40 84 I -1 -2 -4 0 -4 -2 -4 -5 -5 4 -1 -3 1 -3 -4 -2 1 -5 -3 5 4 2 0 7 0 2 0 0 0 22 3 1 3 1 0 3 9 0 0 41 0.68 1.27 85 E -3 -2 -2 1 -6 3 7 -4 -2 -6 -5 1 -4 -6 -3 -2 -3 -5 -4 -5 0 0 0 4 0 10 78 0 0 0 0 9 0 0 0 0 0 0 0 0 1.46 1.01 K Lambda Standard Ungapped 0.1351 0.3184 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.2038 0.3172 PSI Gapped 0.0624 0.2670