Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 T 4 -5 2 -4 -4 -4 -4 -4 -5 -5 -5 -4 -4 -6 -4 3 5 -6 -5 -4 35 0 9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22 35 0 0 0 1.11 1.85 2 F -5 -6 -7 -6 -3 -6 -7 -7 -4 -1 -3 -7 -4 8 -7 -5 -6 0 6 -4 1 0 0 0 0 0 0 0 0 4 1 0 0 71 0 0 0 1 21 1 2.23 2.06 3 T -3 -3 0 -3 -3 -3 -4 -4 -3 -5 -4 -2 -3 -5 -4 4 6 -4 -4 -4 1 1 4 1 0 0 0 0 1 0 1 3 0 0 0 34 52 0 0 0 1.32 2.14 4 S 0 2 0 0 -3 2 0 -2 2 -5 -4 2 -3 -5 3 1 0 -3 -3 -3 8 9 5 5 0 8 7 3 5 0 2 11 1 1 16 11 5 0 1 2 0.33 2.15 5 F 0 -1 -1 1 -4 2 4 -3 2 -4 -2 0 -2 0 -3 1 -1 1 1 -3 8 3 3 8 0 8 25 2 5 1 5 5 1 4 1 9 4 2 4 2 0.33 2.14 6 Q -3 -2 -3 -3 -4 9 0 -5 -2 -4 -5 -2 -3 -5 -4 -3 -4 -6 -3 -5 1 1 0 1 0 86 3 0 1 1 0 1 0 1 0 1 0 0 1 0 2.17 2.13 7 L -2 0 -4 -6 -3 -1 -5 -7 -2 2 5 -2 -1 -3 -5 -2 0 -3 -3 2 2 6 1 0 0 3 0 0 1 10 48 2 1 1 1 3 6 0 1 13 0.72 2.13 8 E 0 1 1 0 0 3 2 -4 1 -3 0 0 0 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -2 9 8 6 5 2 12 14 1 3 2 11 6 2 2 2 5 3 1 2 3 0.19 2.12 9 E 1 1 -3 -2 -3 1 4 -3 -1 2 -1 -1 0 -1 -4 -2 0 -3 -2 1 12 8 1 1 1 5 25 2 1 10 6 3 2 3 0 3 5 0 1 11 0.32 2.11 10 L -5 -6 -7 -4 -2 -4 -6 -7 -4 -1 7 -5 2 -2 -5 -5 -5 -5 -5 -2 0 0 0 1 1 1 0 0 1 1 88 1 3 1 1 1 0 0 0 1 1.67 2.09 11 E -4 -1 0 -2 -4 1 7 -4 -2 -3 -3 1 -1 -5 -4 -3 -2 -2 -3 -3 1 3 4 1 0 4 67 1 1 1 2 6 2 0 0 1 2 1 1 2 1.30 2.15 12 K 1 4 0 0 -2 1 1 -3 0 -4 -3 4 -1 -4 -5 1 -1 -3 -3 -3 10 18 5 4 1 6 8 2 2 1 2 22 2 1 0 9 4 0 1 1 0.46 2.14 13 A 1 0 -1 -3 0 -1 3 -2 1 -1 -1 -1 0 1 -5 0 0 0 0 0 13 6 3 1 2 2 21 3 3 4 6 3 2 6 0 7 5 1 4 8 0.20 2.14 14 F -4 -5 -6 -7 -3 -6 -5 -5 -4 -3 -2 -5 -2 9 -5 -5 -5 -1 4 -4 1 1 0 0 1 0 1 1 0 1 2 1 1 78 1 1 0 1 10 1 2.20 2.12 15 S 1 1 1 0 -2 3 3 -1 3 -3 -2 1 -1 -3 -5 0 -2 -2 -2 -3 10 7 6 5 1 13 16 4 7 1 4 10 2 1 0 6 3 1 1 2 0.32 2.19 16 R -1 3 -1 -2 -1 2 2 -3 1 -1 -2 3 0 1 -5 -1 0 -2 -1 -1 6 13 2 2 1 9 12 2 3 3 4 15 2 5 0 4 5 1 2 6 0.23 2.18 17 T -2 -3 5 1 3 1 0 -3 2 -4 -4 0 -3 -4 -4 1 2 -1 -3 -4 2 1 27 6 5 7 6 2 5 1 1 6 1 1 1 8 13 1 1 1 0.55 2.17 18 H -2 2 0 -3 -1 3 -2 -4 5 -3 -4 2 1 -3 4 -1 -2 -2 -3 -3 3 12 5 1 1 11 2 1 13 1 1 10 3 1 20 4 3 1 1 2 0.55 2.15 19 Y -4 -2 -2 -3 -1 -3 -4 -4 2 -3 -3 0 -2 2 -6 -3 -1 0 8 -3 1 2 2 1 1 1 1 1 5 1 2 7 1 6 0 2 5 1 54 1 1.30 2.13 20 P -3 -3 -3 -5 -1 -5 -5 -4 -2 0 3 -5 0 -2 6 -3 -3 -6 -2 -1 2 1 2 0 1 0 0 2 1 5 27 0 2 1 44 2 1 0 1 4 1.09 2.13 21 D -2 -2 1 5 1 -2 -1 -1 -1 -3 -4 -2 -2 -3 -2 2 2 -6 -2 -2 3 3 7 27 3 1 3 5 2 2 2 2 1 1 2 17 13 0 1 3 0.47 2.24 22 V 0 2 -2 -2 0 -1 -1 -1 0 2 -2 0 0 -1 1 -1 -1 1 -1 2 8 12 2 2 2 2 5 4 2 11 4 5 2 2 7 6 4 2 2 12 0.09 2.25 23 F 0 -1 0 0 1 0 0 -2 3 -1 -2 0 0 2 0 0 -1 2 2 -1 7 4 4 5 2 5 7 4 6 3 4 6 3 8 5 6 5 3 7 4 0.07 2.24 24 T -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 25 R -1 0 0 -5 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 0 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.07 2.12 26 E -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 27 E -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 28 L -1 0 -4 -5 3 1 -4 -1 2 0 -1 0 2 1 0 0 0 4 2 0 6 6 0 0 6 6 0 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 0.20 1.78 29 A -1 0 0 0 3 1 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 -5 -4 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 0 5 0.03 2.01 30 M -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 31 K -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 32 I -1 0 0 -4 3 1 0 -1 2 0 -1 -4 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 0 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 5 5 5 5 5 5 0.10 2.01 33 G -2 0 4 1 1 0 -2 3 2 -3 -3 0 0 -2 -5 0 -2 -5 -1 -3 3 5 16 8 3 4 3 22 5 2 3 6 2 2 0 7 3 0 2 2 0.36 2.02 34 L -1 0 0 -4 3 1 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 0 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.13 2.01 35 T -1 -1 -1 0 1 0 0 -1 1 -2 -2 -1 0 -1 2 1 3 -5 0 -2 4 4 3 5 3 4 7 5 3 3 4 3 3 3 11 10 18 0 3 3 0.17 2.07 36 E -2 1 -2 -1 -1 1 5 -3 0 -2 -1 -1 0 -2 3 -2 -1 -5 -1 -2 3 7 2 3 2 5 32 2 2 3 5 3 2 2 15 2 3 0 2 4 0.46 2.08 37 A 0 4 0 -1 -1 0 0 -2 0 -3 -2 2 -1 -2 -2 1 0 1 0 -2 9 20 4 3 1 4 5 3 2 2 3 10 1 1 2 11 7 2 3 3 0.23 2.14 38 R -2 4 -1 -3 -2 6 -1 -3 -1 -3 -4 1 -2 -3 -3 -2 -1 -1 -5 1 2 20 2 1 1 34 4 2 1 2 1 7 1 1 1 3 4 1 0 10 0.74 2.14 39 I -3 -3 -4 -6 -1 -3 -4 -5 -2 5 -1 -4 -1 -3 -3 -4 -2 -6 -2 6 1 2 1 0 1 1 1 1 1 31 5 1 1 1 1 1 2 0 1 46 1.09 2.13 40 Q -2 1 -1 -2 -2 6 0 -3 1 -3 -4 4 -1 -6 -3 -2 -1 -2 -3 -4 4 7 3 2 1 33 4 2 3 2 2 26 1 0 1 2 3 1 1 1 0.79 2.13 41 V -3 -3 1 -3 -2 -3 -4 -4 -3 4 -2 -3 0 -1 -4 -3 1 -2 -2 5 2 2 8 1 1 1 1 1 1 23 1 1 2 3 1 1 10 1 1 39 0.80 2.15 42 W -6 -3 -4 -7 -2 -5 -6 -4 -3 -6 -4 -4 -3 -2 -4 -4 -4 13 0 -6 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 85 1 0 3.65 2.06 43 F -4 -4 -4 -4 -3 -4 -4 -4 -1 -2 -1 -6 -3 9 -4 -4 -5 -3 1 -3 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 4 0 0 80 1 1 0 0 2 1 2.06 2.03 44 Q -3 0 -2 -4 2 7 -2 -4 0 -5 -4 3 -3 -5 -3 -1 -3 -3 -3 -5 1 5 1 0 4 58 1 1 2 1 2 16 1 1 1 4 1 0 1 1 1.34 2.09 45 N -4 -2 8 -2 -2 -2 -2 -2 2 -5 -5 -2 -3 -6 -6 -1 -2 -7 -4 -6 1 1 74 1 1 1 2 3 5 1 1 2 1 0 0 3 2 0 1 0 1.74 2.05 46 R -3 7 -1 -4 -2 1 -2 -5 1 -5 -5 2 -3 -4 -3 -3 -3 0 -3 -5 1 65 2 0 1 5 2 1 3 0 0 10 0 1 1 2 1 1 1 1 1.46 2.06 47 R -3 8 -3 -2 -4 -1 -4 -5 -3 -5 -4 -1 -3 -6 -4 -2 -4 -1 -4 -6 1 84 1 2 0 1 0 0 0 1 1 1 0 0 1 2 0 1 0 0 2.00 2.03 48 A 5 -1 -2 -4 -1 1 -2 -4 -3 -2 -2 -2 3 -3 -4 1 0 -3 -1 -1 47 4 2 0 1 6 2 1 1 3 3 2 8 1 0 8 6 0 2 4 0.65 2.05 49 K -3 5 -3 -4 -4 1 -2 -5 -1 -4 -5 7 -4 -6 -4 -2 -4 -3 -4 -5 1 24 1 0 0 5 1 0 2 1 1 56 0 0 0 3 1 0 0 1 1.36 2.04 50 W -2 -2 -3 0 2 1 1 -3 3 -2 -1 -1 1 2 -6 -2 -2 9 2 -3 3 2 1 6 4 5 10 2 6 3 6 4 4 8 0 3 2 24 5 1 0.78 2.01 51 R -5 7 -4 -5 -7 0 -3 -5 -4 -6 -6 6 -5 -7 -5 -4 -4 -6 -5 -6 0 52 0 0 0 3 0 0 0 0 0 45 0 0 0 0 0 0 0 0 1.82 1.85 K Lambda Standard Ungapped 0.1330 0.3249 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1548 0.3141 PSI Gapped 0.0474 0.2670