JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_hRMpIf2.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet ||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|||||E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E|E|||||||||||H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E||||||||||||H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|8|3|2|1|1|1|2|5|4|4|2|7|8|9|9|9|8|7|5|1|5|6|5|5|5|6|7|7|6|3|4|7|7|4|1|2|7|0|2|7|8|9|9|9|8|7|1|1|3|4|6|7|6|4|3|0|1|5|3|3|3|3|3|1|0|2|9|9|9|9|8|2|2|4|7|7|7|7|7|6|6|6|2|2|5|6|7|7|5|2|2|5|4|2|5|8|8|8|4|2|8|8|7|7|5|4|4|2|4|7|8|8|1|2|5|8|7|4|4|7|7|2|4|3|4|7|5|6|8|9|9|9|9|9|8|7|2|4|7|8|8|8|5|1|6|8|8|8|4|3|7|7|8|7|7|7|7|5|2|7|8|8|8|8|7|2|2|7|8|8|5|0|7|7|1|1|6|7|1|7|8|9|9|9|8|9|8|7|3|4|7|4|1|6|7|5|3|7|7|7|6|5|3|0|2|3|4|0|1|0|0|1|7|7|7|7|6|5|3|3|1|3|8|8|8|7|3|7|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|-|-|-|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|B|B|-|B|-|B|-|B|-|-|B|-|-|-|-|B|B|B|B|-|B|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|B|B|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |||H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||E|E|E|E|E|E||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||E|E||||||||||H|H|H|H|H|||||||||||||||||||E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|||||E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E|E|||||||||||H|H|H|H|H|H||||||||E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E||||||||||||H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E||||E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|E|||||||||||H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | |*|*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*| |*| | | | | | | | |*|*|*| | | | | | |*|*| | | | | | |*|*|*| | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | |*| | | | | |*| | | | | | | | | | | | |*|*| | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | |*| | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*|*| | | | | | |*|*|*|*| | | | | | |