Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 H -3 1 -1 -3 -5 -1 -2 -4 10 -5 -4 -2 -3 -2 -4 -2 -3 -3 3 -5 0 9 0 0 0 0 0 0 83 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8 0 1.64 0.50 2 Y -1 -3 -2 1 5 -3 -3 -2 2 -3 -3 -3 -3 0 -4 -2 -3 3 7 -1 4 0 1 12 14 0 0 3 3 0 0 0 0 0 0 2 0 4 53 4 0.90 0.53 3 E -1 -2 -2 1 -5 0 6 -3 -2 -4 -4 1 -3 -4 -1 -1 0 -4 0 -4 5 0 0 4 0 0 68 0 0 0 0 7 0 0 3 2 7 0 4 0 0.85 0.53 4 E -2 -2 -2 2 -5 0 7 -4 -2 -5 -3 0 -3 -5 -3 0 -2 -5 -4 -4 0 0 0 7 0 0 80 0 0 0 3 3 0 0 0 7 0 0 0 0 1.10 0.53 5 G -1 -4 -2 -1 1 -3 -3 7 -4 -4 -5 -3 -4 -5 -4 -1 0 -4 -4 -2 0 0 0 4 4 0 0 82 0 0 0 0 0 0 0 2 5 0 0 4 1.21 0.49 6 P -2 -3 -3 -3 -4 -3 -3 -3 -4 -4 -1 -2 -3 -4 8 1 -2 2 -4 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0 0 0 74 14 0 3 0 0 1.66 0.50 7 G -1 1 -2 -3 -4 -3 0 7 -3 -6 -5 -2 -4 -5 -4 -2 -3 -4 -5 -5 0 8 0 0 0 0 6 86 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.35 0.53 8 K 0 2 0 -2 -4 1 1 -3 1 -4 -4 6 -3 -5 -3 0 -1 -5 -3 -4 6 5 4 0 0 2 6 0 3 0 0 66 0 0 0 5 3 0 0 0 0.78 0.53 9 N -3 -2 8 0 -4 -1 -2 -2 -1 -5 -5 -2 -4 -4 -4 0 1 -5 0 -4 0 0 88 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 6 0 3 0 1.33 0.53 10 I -3 -4 -4 -5 -3 -4 -4 -5 -4 1 5 -4 1 -1 -4 0 -2 -3 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 83 0 0 0 0 9 0 0 0 3 0.86 0.53 11 P -1 -4 -3 -3 -4 -3 -3 -4 -4 -4 -1 -3 -3 -5 8 0 -2 -5 -4 -3 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10 0 0 0 82 6 0 0 0 0 1.90 0.53 12 F -4 -5 -5 -5 -4 -5 -5 -5 -3 0 0 -5 -1 8 -5 -4 -4 -1 2 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 6 0 0 91 0 0 0 0 0 0 1.53 0.53 13 S -1 -2 1 1 -3 -1 -1 -2 -2 -4 -2 1 -3 -4 -1 5 1 -5 -3 -3 0 0 3 8 0 0 0 0 0 0 4 8 0 0 2 69 5 0 0 0 0.69 0.53 14 V -1 -4 -4 -5 -2 -4 -4 -2 -5 3 0 -4 3 -2 -4 -3 -1 -4 -3 6 2 0 0 0 0 0 0 3 0 15 2 0 8 0 0 0 2 0 0 68 0.78 0.53 15 E -2 -2 1 1 -5 1 6 -3 0 -5 -4 0 -3 -1 -3 -1 -1 -4 -3 -4 2 0 7 4 0 2 72 0 2 0 0 3 0 3 0 2 3 0 0 0 0.93 0.53 16 N -3 -2 8 0 -4 -1 -2 -2 1 -5 -5 0 -4 -5 -3 1 -1 -5 -3 -4 0 0 81 0 0 0 0 0 3 0 0 5 0 0 0 11 0 0 0 0 1.25 0.53 17 K -2 2 0 -2 -5 1 0 -3 -2 -4 -4 6 0 -5 0 -2 -1 -5 -3 -4 0 7 3 0 0 5 2 0 0 0 0 74 3 0 3 0 4 0 0 0 0.91 0.53 18 W -3 0 -4 -5 1 0 -4 -1 -3 -4 -3 -3 -3 1 -5 -4 -4 11 4 -4 2 7 0 0 4 5 0 4 0 0 0 0 0 4 0 0 0 61 12 0 1.89 0.57 19 R 0 6 -2 -3 -5 2 -1 0 -2 -5 -4 2 -3 -4 -4 -1 -1 4 -3 -4 7 54 0 0 0 11 0 8 0 0 0 11 0 0 0 1 3 6 0 0 0.81 0.57 20 L -3 -4 -5 -5 -3 -4 -4 -5 -4 0 5 -4 2 1 -4 -4 -3 -3 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 72 0 5 4 0 0 0 0 0 4 0.67 0.56 21 L 0 -2 -4 -4 0 -3 -4 -4 -4 -1 4 -3 1 -2 0 -2 2 -4 -3 -1 7 2 0 0 2 0 0 0 0 0 51 0 3 0 5 0 16 0 0 0 0.39 0.65 22 A 2 -4 -2 -1 -3 -3 -3 -1 -4 3 -1 -3 -2 1 -1 -2 0 -4 -3 2 21 0 1 3 0 0 0 4 0 19 2 0 0 8 3 1 7 0 0 18 0.17 0.65 23 M -2 -2 -3 -3 -3 -2 -3 0 2 0 0 3 5 -2 -3 -2 2 -3 2 -2 1 1 1 1 0 0 1 9 5 6 7 18 16 0 1 1 12 0 8 1 0.23 0.79 24 M -2 -3 -3 -4 -3 -3 -3 -4 -3 1 -1 0 7 4 -3 1 2 -3 -2 -2 1 0 0 0 0 0 1 1 0 7 1 7 29 16 0 9 14 0 0 1 0.47 0.81 25 T 1 -3 -3 -4 5 -3 -3 -3 -4 1 -1 -3 0 2 -3 -1 4 -3 -2 -1 15 0 0 0 11 0 0 0 0 10 3 0 2 12 0 2 26 0 0 3 0.31 0.73 26 L -1 -4 -4 -4 -3 -4 -4 -3 -4 2 4 -4 -1 -2 -4 -2 -2 1 -3 3 4 0 0 0 0 0 0 2 0 10 42 0 0 0 0 3 0 2 0 22 0.43 0.73 27 F -4 -4 -2 -3 -4 -4 -4 -4 0 -3 -2 -4 -2 6 -4 -3 -3 -1 7 -3 0 0 1 2 0 0 0 0 2 0 0 0 0 41 0 2 0 0 36 0 1.04 0.73 28 F -1 -4 -4 -4 -3 -4 -4 -4 -3 0 0 -4 -2 7 -4 -3 1 -2 0 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 4 6 0 0 55 0 0 10 0 0 5 0.77 0.73 29 G -1 -1 -3 -1 -4 -3 -2 6 -4 -1 -2 -3 -4 -4 -4 -1 -3 -4 -4 -4 3 3 0 3 0 0 2 63 0 5 5 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0.82 0.77 30 S -1 -3 -2 -3 -3 -2 -2 -3 -3 -1 -4 -2 -3 1 -1 6 2 -4 -3 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 6 2 62 12 0 0 0 0.64 0.77 31 G 1 -1 -3 -3 -4 -3 -1 6 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -4 -1 -2 -4 -5 -3 13 3 0 0 0 0 4 63 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 0.89 0.77 32 F -4 -5 -5 -5 1 -5 -5 -5 -4 1 0 -5 -2 8 -5 -2 -4 -2 0 -2 0 0 0 0 3 0 0 0 0 9 8 0 0 64 0 2 0 0 0 0 1.04 0.77 33 A 5 -3 0 -3 -3 -3 -3 2 -3 -3 -4 -3 -3 -4 -3 1 1 -4 -4 -1 47 0 4 0 0 0 0 13 0 0 0 0 0 0 0 12 7 0 0 4 0.47 0.77 34 A 4 -4 -3 -4 -3 -3 -3 1 -4 1 -1 -3 -2 -1 -3 -1 0 -4 -3 1 47 0 0 0 0 0 1 9 0 8 4 0 0 3 0 3 4 0 0 8 0.36 0.77 35 P -3 -4 -4 -3 -4 -3 -3 -4 -1 -4 -2 -3 -4 -5 8 -1 0 -5 -4 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 4 0 0 0 71 4 6 0 0 0 1.59 0.77 36 F -4 -5 -5 -5 4 -5 -5 -5 -3 -2 -1 -5 -2 8 -5 -4 -4 -1 2 -3 0 0 0 0 9 0 0 0 0 0 2 0 0 72 0 0 0 0 4 0 1.30 0.77 37 F -3 -4 -5 -5 -4 -4 -5 -5 -3 0 3 -4 -1 7 -5 -1 -3 -2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 24 0 0 47 0 5 0 0 3 6 0.76 0.74 38 I -1 -1 -4 -5 -3 -4 -4 -5 -4 6 0 -4 1 -2 -4 -1 -1 -4 -3 2 4 3 0 0 0 0 0 0 0 56 4 0 2 0 0 6 2 0 0 11 0.61 0.74 39 V -2 -3 -4 -4 3 -4 -4 -4 -4 1 -1 -4 -1 -3 -4 -3 1 -4 -3 6 1 1 0 0 6 0 0 0 0 2 3 0 0 0 0 0 9 0 0 65 0.69 0.73 40 R -3 7 -3 -4 -5 1 -2 -4 -2 -5 -4 1 -3 -3 -2 -3 -3 2 2 -4 0 79 0 0 0 3 0 0 0 0 0 3 0 0 2 0 0 3 10 0 1.36 0.74 41 H -4 -2 -2 -3 -5 -2 -2 -4 10 -5 -5 -3 -4 -2 -2 -3 -4 4 4 -5 0 0 0 0 0 0 0 0 80 0 0 0 0 0 2 0 0 6 13 0 1.93 0.74 42 Q -3 1 -2 -2 -5 8 0 -4 3 -5 -4 0 -2 -5 -1 -2 -3 -4 -3 -4 0 4 0 0 0 89 0 0 6 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 1.50 0.70 43 L -3 -4 -5 -6 -3 -4 -5 -6 -5 1 6 -4 3 -1 -2 -4 -3 -4 -3 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 86 0 8 0 2 0 0 0 0 0 1.12 0.70 44 L -3 -1 -5 -5 -3 -4 -4 -5 -5 0 6 -4 0 -1 -2 -4 -1 -4 -3 -1 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 89 0 0 0 2 0 5 0 0 0 0.99 0.63 45 K -2 1 -2 -2 -5 0 1 -3 -2 -5 -4 7 -3 -5 -3 -2 -2 -5 -4 -4 0 3 0 0 0 0 5 0 0 0 0 93 0 0 0 0 0 0 0 0 1.30 0.61 46 K -2 1 1 -2 -5 3 0 -3 -2 -4 -4 6 -3 -5 -3 -2 -2 -5 -3 -4 0 0 6 0 0 17 0 0 0 0 0 77 0 0 0 0 0 0 0 0 1.03 0.52 K Lambda Standard Ungapped 0.1441 0.3285 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1954 0.3177 PSI Gapped 0.0598 0.2670