Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 T -3 -5 -4 -5 -1 -4 -4 -5 -5 -2 -3 -4 -3 -5 -5 4 4 -6 -5 5 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31 24 0 0 44 1.08 1.53 2 V -4 -6 -6 -7 -4 -3 -6 -7 -7 5 -1 -6 0 -3 -6 -5 -2 -6 -4 6 0 0 0 0 0 1 0 0 0 32 2 0 2 1 0 0 2 0 0 59 1.53 1.90 3 R -5 8 -4 -5 -7 -2 -4 -6 -2 -7 -5 -1 -5 -6 -6 -3 -5 -6 -3 -6 0 97 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 2.47 1.92 4 K -4 5 -3 -5 -5 2 -3 -5 -1 -4 -2 6 -2 -4 -1 -3 -4 -6 -4 -2 0 33 0 0 0 7 1 0 1 1 4 41 1 1 3 1 1 0 1 3 1.15 1.98 5 N -1 -3 5 2 -6 -3 5 -4 -3 -7 -6 -3 -6 -7 1 0 -4 -7 -5 -6 6 1 25 10 0 0 44 0 0 0 0 0 0 0 6 7 0 0 0 0 1.13 1.99 6 Q 0 -5 -7 -7 -1 -2 -6 -6 -3 5 0 -6 -1 1 -6 -5 -4 9 1 1 7 0 0 0 2 2 0 0 1 32 7 0 1 4 0 0 0 30 4 10 1.42 2.01 7 A -2 6 1 0 -6 -2 -2 -2 4 -4 -2 -1 0 1 -5 0 -1 -2 -1 -4 4 37 7 6 0 1 2 4 10 1 5 2 2 6 0 6 3 1 2 1 0.66 2.04 8 T 1 0 1 3 -3 1 1 -4 -1 -4 -2 0 2 -4 -4 2 3 -4 -4 -3 10 5 6 16 1 6 7 1 2 1 3 5 5 0 0 15 15 0 1 1 0.38 2.02 9 L -4 -5 -5 -7 -3 -4 -6 -7 -3 0 6 -6 5 2 -5 -5 -4 -1 -1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 2 65 0 14 7 0 1 1 1 2 4 1.27 2.01 10 T -1 -3 1 0 -3 -1 -2 -3 -3 -4 -4 -2 -2 -4 0 4 4 -4 -3 -2 3 1 6 6 0 3 2 2 1 0 1 2 1 1 5 35 29 0 1 2 0.74 2.03 11 A 2 1 -1 3 -4 1 0 -2 -2 -3 -3 1 -3 -5 3 0 1 -2 -3 -2 15 7 3 14 0 5 5 2 1 2 3 10 0 0 13 7 8 1 1 3 0.30 2.01 12 D 2 -1 -1 4 -4 1 3 -1 -1 -4 -4 -1 -5 -5 0 0 0 -4 -4 -3 20 3 3 20 0 6 17 4 1 1 1 3 0 0 4 7 6 0 1 1 0.46 2.00 13 E -2 -3 -2 3 -7 3 6 -4 -1 -5 -5 -2 -3 -5 -4 -3 -3 -6 0 -4 3 1 1 13 0 10 58 1 1 0 1 2 0 0 1 1 1 0 4 1 1.22 1.99 14 K -4 5 -3 -4 -6 1 -3 -6 -2 0 -1 4 0 -1 -1 -4 -3 6 -2 -2 1 31 1 1 0 5 1 0 1 6 7 26 2 2 3 0 1 9 1 3 0.85 1.98 15 R 1 2 2 3 -3 2 1 -3 -1 -3 -2 1 -3 -3 -3 0 0 -6 -4 -3 13 10 11 15 0 8 10 1 1 2 4 9 1 1 1 7 5 0 1 1 0.33 1.99 16 R 2 2 0 1 -3 0 0 -4 -2 -3 1 2 -1 -3 -4 1 -1 -2 -4 -3 14 12 4 7 0 4 7 1 1 1 16 14 1 1 1 9 4 1 0 1 0.27 1.99 17 F -5 -6 -6 -7 -6 -6 -6 -7 -1 -2 1 -6 -1 6 -7 -6 -4 4 7 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 1 2 12 0 1 34 0 0 1 5 41 2 1.70 1.98 18 V -2 1 -2 -4 -3 -1 -2 -4 1 5 2 -1 0 1 -6 -4 -1 -2 -3 2 3 7 2 1 0 3 3 1 3 28 19 4 2 6 0 1 5 0 0 12 0.49 2.06 19 A 2 2 2 3 -3 2 0 -2 -1 -4 -1 1 -2 -4 -5 0 -1 -6 -3 -4 15 10 9 17 1 8 6 3 2 1 7 7 1 1 0 6 3 0 1 1 0.33 2.04 20 A 6 -3 -3 -4 1 -3 -4 -1 -3 -4 -4 -3 -3 -3 -5 -1 -2 -6 1 -3 73 1 1 1 2 1 0 5 1 1 1 1 1 1 0 3 2 0 6 1 1.27 2.05 21 V -2 -6 -3 -4 -2 -4 -3 -7 -6 3 4 -6 4 2 -6 -4 -3 0 -1 4 3 0 1 1 1 1 2 0 0 12 33 0 9 7 0 1 1 1 2 24 0.77 2.06 22 L -1 1 3 1 -6 3 0 -2 2 -3 0 2 -2 -3 -3 0 -1 0 -1 -1 6 8 12 6 0 11 5 3 5 2 10 13 1 1 1 6 4 1 2 4 0.24 2.04 23 E 0 1 -2 -1 7 1 0 -2 -1 -1 1 0 1 -4 -3 -2 -1 -1 -3 -1 8 9 2 3 21 6 5 3 1 4 14 6 3 1 1 2 5 1 1 4 0.45 2.08 24 L 2 -3 -4 -4 -5 -3 -4 -4 -6 0 4 -5 5 0 -6 -2 -3 -1 -2 0 16 1 1 1 0 1 1 1 0 5 42 0 16 4 0 2 2 1 1 4 0.79 2.07 25 K -2 0 -1 -2 -6 4 -2 -3 0 -2 -3 5 5 -2 -3 -2 -1 0 2 -3 4 4 2 2 0 17 1 2 2 2 2 30 13 1 1 3 3 1 7 1 0.65 2.11 26 R 1 2 2 1 0 2 1 -2 0 -5 -4 1 -1 -6 -3 1 1 -1 -1 -3 10 12 9 8 2 7 8 3 3 0 2 9 1 0 1 10 8 1 2 2 0.28 2.09 27 S -1 1 0 2 -1 -1 -2 -2 -1 -3 0 2 -1 -2 0 1 2 0 -2 -2 5 7 4 10 1 3 2 2 2 2 11 12 2 1 5 8 15 1 1 2 0.17 2.10 28 G -2 -1 2 0 -5 -2 -2 2 0 -2 -3 -1 -1 -2 3 2 1 -6 -1 -3 3 3 10 6 0 2 2 17 2 2 3 3 2 2 14 14 9 0 2 2 0.33 2.06 29 R -1 3 0 0 -5 1 0 -2 1 -1 -2 -1 1 0 0 0 -1 2 1 -1 6 14 5 5 0 7 6 3 4 4 5 4 3 4 6 8 4 3 5 4 0.13 2.09 30 Y -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.09 2.12 31 D -2 -3 1 7 -6 1 0 -2 -1 -2 -4 -2 -1 -2 -1 -1 -2 -2 -2 -3 3 1 5 51 0 5 6 3 2 2 2 2 2 2 3 4 2 1 2 2 0.93 2.15 32 E -1 1 -2 4 -6 2 1 -1 -2 -4 -1 0 -2 -2 2 -1 -2 -1 0 -3 5 8 1 26 0 9 8 5 1 1 6 6 1 2 9 4 2 1 4 2 0.39 2.16 33 F -3 -2 -1 -2 -2 -1 -3 -3 -1 1 1 -3 1 7 -3 -3 -3 0 1 -2 2 3 3 3 1 3 2 3 1 9 15 1 3 39 1 2 2 1 4 3 0.76 2.10 34 V 2 -2 -2 -3 -1 0 -2 -1 -1 1 -2 -3 -1 -2 0 1 0 -1 -2 4 17 2 2 1 1 5 2 4 2 6 2 1 1 1 5 9 6 1 2 29 0.37 2.11 35 R 2 1 0 -2 -1 0 -1 0 0 -2 -2 -2 -1 -1 -2 0 0 7 2 -2 15 8 5 2 1 4 4 7 2 2 3 3 1 2 2 8 5 13 7 3 0.33 2.12 36 T -1 -2 -2 -3 -1 -1 -2 -3 -1 3 1 -2 2 1 -2 -1 1 4 1 2 5 2 2 2 2 3 3 3 1 15 13 2 5 5 2 5 10 5 4 12 0.24 2.14 37 H -2 -2 -1 -2 -6 -1 -2 -3 9 -2 -3 -2 0 -1 -2 -2 -2 2 1 -2 3 2 3 2 0 2 3 2 53 2 2 2 2 2 3 3 2 3 5 3 1.40 2.16 38 N -1 0 1 1 2 1 -1 1 1 1 -2 -1 2 0 -1 0 -1 2 1 -1 5 4 6 7 4 6 3 12 3 8 4 3 5 3 3 6 5 3 6 5 0.09 2.12 39 E -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.09 2.12 40 F 0 -2 -1 -2 -2 2 -2 -2 2 -2 -1 -2 0 2 3 0 -1 2 4 -1 8 2 2 3 1 8 2 3 5 2 5 2 3 7 15 6 3 3 14 5 0.33 2.08 41 I 1 -1 -2 -3 3 -2 -3 -2 0 0 -1 -2 2 1 -1 1 1 0 3 1 11 3 2 2 5 2 1 4 2 4 5 2 5 7 4 12 10 1 9 8 0.18 2.07 42 M -1 2 1 -1 -2 1 -2 -1 0 0 -1 0 3 -1 -1 0 0 1 0 1 4 10 6 4 1 7 2 6 2 6 7 7 6 3 3 6 5 2 4 9 0.08 2.04 43 S 0 0 0 1 2 0 -1 1 1 -2 -2 -1 -1 -1 1 1 0 1 1 -1 8 5 4 8 5 5 3 9 3 3 5 3 2 3 7 10 7 2 4 5 0.08 2.05 44 D 1 -1 0 2 -1 0 -1 1 4 -1 -3 -2 -1 -2 0 -1 0 4 -1 -2 13 3 5 13 1 4 4 10 8 3 3 2 2 2 5 5 7 5 2 3 0.21 2.03 45 T -1 -2 1 0 0 -1 -1 1 3 -2 -1 -1 0 2 -1 0 1 1 2 -1 5 3 7 5 2 3 4 10 6 3 6 3 3 9 3 6 10 2 7 5 0.12 2.03 46 D -1 -1 0 2 1 0 0 0 1 -1 0 -1 0 0 1 -1 0 2 0 -1 4 3 5 10 3 4 6 7 3 4 9 4 3 4 8 5 5 3 4 4 0.04 2.09 47 S -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.09 2.12 48 G 0 -2 -1 -1 -1 0 -1 3 -1 -1 -1 -1 0 -1 -1 1 -1 0 1 0 7 3 3 3 1 5 4 24 1 4 7 3 2 3 3 10 4 1 4 6 0.16 1.89 49 E 0 0 1 0 2 1 1 1 2 -2 -2 -2 -1 -1 1 1 0 2 -1 -2 6 4 7 4 4 6 9 11 4 3 5 3 2 3 7 9 5 3 2 3 0.09 1.96 50 R -1 1 1 2 0 1 -1 -3 1 -1 -1 0 1 0 1 -1 -1 0 3 -1 4 7 7 13 2 7 4 2 3 3 5 5 3 5 7 4 3 2 9 4 0.14 2.03 51 T -1 -2 -1 -2 6 1 0 -1 2 -2 -1 -2 0 1 -1 -1 1 4 0 0 5 2 4 3 16 7 6 4 4 2 5 2 2 6 3 5 8 6 3 5 0.34 2.05 52 G 2 1 0 -1 1 -1 -1 1 1 -1 -1 -2 0 1 -1 -1 -1 3 0 0 15 7 4 4 2 3 5 9 4 4 6 3 3 6 4 5 4 4 4 6 0.09 2.07 53 H -1 0 0 0 -5 1 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 0 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.10 2.01 54 R -2 0 1 1 0 0 0 2 1 -2 -2 -1 1 0 -1 0 -1 3 1 -2 4 6 8 7 2 4 5 17 3 3 3 4 3 5 3 6 3 4 5 3 0.14 2.18 55 S -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.09 2.12 56 P 1 -2 -1 -2 4 -2 -1 1 -1 -2 -2 -2 -1 -2 3 0 -1 5 0 -1 11 2 3 2 9 2 5 10 2 2 4 2 2 2 16 7 4 8 3 5 0.33 1.91 57 S 0 -1 1 -1 1 -1 -1 2 1 -1 0 -1 0 -1 1 -1 0 4 0 -2 8 3 8 3 3 3 3 18 3 3 10 3 3 3 7 5 5 5 3 3 0.14 1.79 58 F 0 -4 1 1 -4 -3 -4 -4 -4 1 0 0 3 2 -4 0 0 5 2 0 7 0 7 7 0 0 0 0 0 7 7 7 7 7 0 7 7 7 7 7 0.20 1.45 59 L -2 -4 -2 -4 0 -2 -2 -1 -1 -1 3 -2 1 3 2 -2 -1 0 0 -1 4 1 2 1 2 2 3 6 2 3 33 2 3 10 10 3 3 1 2 4 0.31 1.66 60 P 0 -1 -1 -4 -4 -1 -1 -1 1 0 -2 -3 0 -1 4 0 2 1 0 -1 7 3 3 1 0 2 5 5 3 6 4 1 2 3 22 5 14 2 4 4 0.30 1.63 61 W -1 0 -1 -5 3 -1 -4 -2 1 -4 -1 -4 1 3 -1 -1 -1 8 0 0 5 5 3 0 6 3 0 4 3 0 5 0 3 12 4 6 3 23 3 7 0.65 1.62 62 H -4 1 1 1 -4 1 -3 -4 3 1 -1 1 -3 1 1 0 -3 -4 2 0 1 7 7 7 0 7 0 0 7 7 7 7 0 7 7 7 0 0 7 7 0.15 1.45 63 R -1 5 -3 0 1 0 -3 -1 1 -1 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