JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_5v93Exw.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |||||E|E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|9|9|8|5|4|7|8|8|7|5|0|5|8|8|0|2|2|7|7|7|7|5|2|3|7|8|8|8|7|4|5|8|8|8|8|8|8|8|5|4|7|7|5|4|5|5|5|4|2|6|6|3|8|9|9|6|0|8|8|5|5|8|9|8|6|1|5|7|7|7|7|6|6|7|1|0|1|7|7|7|7|7|7|7|6|4|3|3|3|0|0|1|4|6|7|8|7|7|0|2|3|8|8|7|7|7|4|4|8|8|6|5|8|9|9|9|8|8|8|8|8|8|9|9|9|8|5|3|6|7|7|7|7|7|7|7|1|5|8|8|9|9|9|8|6|4|8|8|7|1|7|8|8|9|8|8|8|5|4|7|8|7|4|6|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|1|6|7|8|8|8|7|7|6|4|2|8|9|9|9|9|9|9|8|6|1|6|9|9|9|9|9|9|8|6|2|9|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|B|-|B|B|B|-|B|B|B|-|B|-|B|B|-|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |||||E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|||||||||E|E|E||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles |||||E|E|E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||H|H|H||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||H|H|H|H|H|H|H|H|H||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | |*| | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*| | | | | | | | | |*|*|*| | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| |