Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 M -3 -4 -4 -5 -4 -3 -4 -5 -4 0 1 -4 10 -2 -5 -4 -3 -4 -3 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 3 0 95 0 0 0 0 0 0 0 1.97 0.88 2 I -3 -4 -1 -1 -4 -3 0 -5 -4 2 3 -1 7 -1 -5 -3 -1 -4 -3 0 0 0 4 3 0 0 8 0 0 14 26 4 33 1 0 2 2 0 0 3 0.71 1.01 3 S -2 -3 0 3 -4 -2 3 -4 0 1 -3 -1 3 -4 0 2 2 -5 -4 -2 1 0 3 17 0 0 17 0 2 9 1 3 7 0 4 20 13 0 0 1 0.42 1.01 4 N -2 -1 1 2 -5 4 2 -4 -2 -5 -5 5 -4 -6 1 -1 -2 -5 -4 -4 1 1 7 13 0 18 13 0 0 0 0 35 0 0 6 4 1 0 0 0 0.76 1.04 5 A -1 -1 0 3 -5 0 5 -3 0 -4 -4 3 -4 -5 -4 0 -1 -5 -4 -4 5 1 4 13 0 3 43 1 2 1 1 18 0 0 0 6 2 0 0 0 0.75 1.05 6 K -3 0 -3 -2 -5 0 -1 -4 -4 1 2 5 1 -4 -4 -3 -1 -5 -3 0 0 3 0 2 0 4 2 1 0 8 22 46 3 0 0 0 2 0 0 5 0.65 1.03 7 I -4 -4 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -5 6 4 -5 1 -2 -5 -5 -2 -5 -4 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 53 35 0 3 1 0 0 2 0 0 6 1.13 1.05 8 A 2 -2 2 4 -5 1 2 -3 -1 -4 -5 2 -4 -2 -2 -1 -1 -5 -4 -4 19 1 8 25 0 5 15 1 1 1 0 14 0 3 2 2 3 0 0 0 0.53 1.07 9 R -4 8 -2 -4 -6 -1 -1 -5 -1 -6 -5 2 -4 -5 -4 -3 -3 -5 -4 -5 0 87 1 0 0 1 2 0 1 0 0 8 0 0 0 0 0 0 0 0 1.77 1.05 10 I -4 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 8 0 -5 -1 -2 -5 -5 -3 -5 -4 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 93 5 0 0 0 0 0 0 0 0 2 1.69 1.05 11 N -4 -3 8 -1 -5 -2 -3 -2 -2 -6 -6 -2 -5 -6 -4 -1 -2 -6 -5 -5 0 0 95 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 3 0 0 0 0 2.05 1.09 12 E -1 -2 -3 -1 -5 1 6 -5 0 -3 -4 -1 -2 0 -4 -2 -1 -4 1 -2 6 1 0 1 0 4 68 0 1 1 1 1 1 4 0 1 3 0 6 3 1.07 1.09 13 L -4 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -5 -1 6 -5 0 0 -5 -5 -4 -4 0 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 94 0 0 3 0 0 0 0 4 0 1.47 1.09 14 A 5 -4 -3 -4 -3 -3 -3 -2 -2 -4 -4 -3 -3 -2 -4 2 -1 -4 4 -3 63 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 17 2 0 15 1 1.01 1.09 15 A 0 5 1 -3 -5 0 -2 -4 5 -5 -3 5 -4 -5 -4 -2 -3 -3 -3 -5 8 28 8 0 0 3 0 1 17 0 2 33 0 0 0 0 0 0 0 0 0.94 1.15 16 K -3 1 -3 -3 -5 -1 -1 -4 -3 -1 -1 7 -2 -5 -4 -3 -3 -6 -4 -3 0 3 0 0 0 1 1 0 0 5 6 83 1 0 0 0 1 0 0 1 1.41 1.15 17 A 3 -1 -1 -2 -4 3 1 -3 0 -5 -5 4 -4 -5 -3 3 -2 -5 -3 -4 24 1 2 1 0 12 7 0 2 0 0 23 0 0 0 26 0 0 0 1 0.64 1.14 18 K -3 4 -2 -3 -6 1 -1 -4 -2 -5 -5 7 -4 -6 -4 -3 -3 -5 -4 -4 1 17 1 0 0 6 1 0 1 0 0 73 0 0 0 0 0 0 0 1 1.41 1.14 19 A 2 -2 1 -1 -4 0 3 -3 -3 -2 -4 -1 -3 -5 -4 2 3 -5 -4 -2 15 1 7 2 0 4 23 1 0 3 1 3 0 0 0 16 22 0 0 3 0.49 1.14 20 G -2 2 -1 0 -3 1 4 1 -2 -2 -4 -1 -3 -4 -4 0 0 -5 -2 1 3 10 2 3 0 4 35 12 1 2 1 1 0 1 0 6 6 0 1 12 0.46 1.15 21 V -2 -4 -1 -2 -5 -2 0 6 -4 -5 -6 -2 -5 -6 -2 -1 1 -5 -5 -4 2 0 2 2 0 1 7 70 0 1 0 3 0 0 2 2 8 0 0 1 1.24 1.15 22 I -4 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -5 1 6 -5 1 -2 -5 -5 -4 -4 -4 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 93 0 2 0 0 0 0 0 0 0 1.50 1.10 23 T -2 -3 0 -2 -3 -2 -2 -3 -4 -4 -4 -2 -3 -5 -4 2 7 -5 -4 -3 0 0 4 1 0 1 2 1 0 0 0 1 0 0 0 12 78 0 0 0 1.33 1.10 24 E 0 -3 -2 3 -5 0 5 -3 -2 -3 -4 1 -2 -5 3 -1 -2 -6 -3 -2 8 0 1 14 0 4 37 2 1 2 1 8 1 0 13 4 2 0 1 3 0.62 1.10 25 E 2 -2 -1 1 -5 0 5 -2 -2 -3 -4 0 -3 -4 -3 0 -1 1 -4 -2 19 1 2 7 0 3 44 2 0 2 1 5 0 0 1 5 4 2 0 2 0.64 1.10 26 E -3 -2 -3 -1 -6 1 7 -5 -2 -6 -5 -1 -4 -6 -4 -3 -3 -5 -5 -5 0 0 0 0 0 3 97 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.88 1.10 27 K 1 0 -2 -3 -5 2 0 -4 -1 -2 0 5 0 -4 -4 -2 -1 -2 -3 -2 12 3 1 0 0 8 5 0 1 2 12 45 2 0 0 1 3 0 0 2 0.59 1.10 28 A 2 -1 -2 -1 -3 2 3 -4 -1 0 -2 3 -1 -4 -4 -1 -1 -5 -4 0 22 2 1 3 0 10 18 0 1 5 3 19 2 0 0 3 3 0 0 7 0.38 1.10 29 E -3 -1 -3 0 -6 0 7 -5 0 -4 -4 -1 -4 -6 -4 -3 -3 -5 -4 -5 0 1 0 1 0 1 92 0 2 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1.72 1.10 30 Q -3 4 -3 -3 -6 8 -1 -4 -1 -4 -3 0 -3 -5 -4 -3 -3 -5 -4 -5 0 23 0 0 0 71 0 0 1 1 2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1.55 1.10 31 Q 3 -1 -2 0 -4 4 1 -2 1 -2 -3 3 -2 -4 -4 -1 0 -5 -4 -3 25 2 1 5 0 18 8 2 3 2 1 21 1 0 0 3 6 0 0 1 0.47 1.10 32 K 2 0 -1 -1 -4 1 2 -2 -1 -1 -2 3 2 -4 -4 -1 -1 -5 -3 -1 17 5 3 3 0 6 15 3 1 4 3 21 6 0 0 2 4 0 1 5 0.30 1.10 33 L -4 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -5 0 6 -5 0 -2 -5 -5 -4 -4 -1 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 96 0 0 0 0 0 0 0 2 1 1.52 1.10 34 R -4 8 -3 -4 -6 -1 -3 -5 1 -6 -5 0 -4 -5 -5 -3 -4 -5 0 -5 0 92 0 0 0 0 0 0 3 0 0 1 0 0 0 0 0 0 4 0 1.92 1.10 35 Q -2 3 -1 0 -5 5 3 -3 -1 -5 -4 4 -2 -5 -4 -2 -1 -2 -4 -4 3 14 2 3 0 28 18 1 1 0 1 23 1 0 0 2 3 0 0 1 0.76 1.10 36 E -1 -1 -1 0 -5 2 6 -4 -1 -1 -3 1 -1 -5 -4 -1 -2 -5 -4 -3 6 2 1 3 0 6 58 0 1 4 1 9 2 0 0 2 2 0 0 1 0.90 1.10 37 Y -4 -4 -5 -6 -5 -4 -5 -6 -1 -4 -3 -4 -3 3 -6 -4 -4 0 9 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 0 94 0 2.40 1.10 38 L -3 -2 -6 -6 0 -5 -5 -6 -5 4 5 -5 1 -2 -5 -5 -2 -5 -4 1 1 3 0 0 2 0 0 0 0 29 55 0 3 0 0 0 1 0 0 7 1.01 1.10 39 K 2 0 -1 3 -5 3 2 -1 -2 -4 -4 3 -2 -4 -4 0 -1 -3 -4 -4 19 4 2 17 0 12 15 3 0 0 0 17 1 0 0 6 3 0 0 0 0.48 1.10 40 G 2 -2 3 -1 -3 -1 1 0 -2 -2 -2 -1 1 -1 -4 2 1 -5 -2 -2 18 2 18 2 0 2 9 6 1 2 3 3 4 3 0 16 7 0 1 2 0.29 1.10 41 F -3 -5 -6 -6 -2 -5 -6 -6 -4 4 -1 -5 0 7 -6 -5 -4 0 1 2 1 0 0 0 1 0 0 0 0 28 1 0 2 48 0 0 0 1 3 16 1.22 1.10 42 R -4 7 -3 -4 -1 -1 -2 -5 -1 -3 -4 3 -2 -5 -4 -3 -2 -5 -4 -3 0 74 0 0 1 0 0 0 1 2 1 18 1 0 0 0 1 0 0 1 1.53 1.10 43 S 2 1 1 -2 -4 0 1 4 -2 -4 -4 1 -2 -4 -4 1 -1 -5 -4 -3 16 9 7 1 0 4 9 27 1 0 1 9 1 1 0 12 2 0 0 1 0.43 1.10 44 S -1 -1 5 -1 -4 3 -2 1 0 -5 -5 -2 -3 -5 -4 3 0 -5 -4 -5 4 2 29 1 0 17 0 12 2 0 0 1 0 0 0 28 4 0 0 0 0.75 1.10 45 M -3 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -5 0 3 -5 4 6 -5 -4 -3 -3 -1 3 2 0 0 0 0 0 0 0 0 3 31 0 13 31 0 0 1 0 0 19 0.96 1.10 46 K -2 6 -1 -1 -4 0 0 -4 -1 -1 -2 4 -3 -5 -4 -2 0 -5 -4 -3 2 40 2 3 0 3 4 1 1 4 5 27 0 0 0 1 5 0 0 2 0.78 1.13 47 N 1 -2 3 2 -4 2 -1 0 2 -4 -5 0 -3 -4 -4 3 0 -5 -4 -3 10 1 17 10 0 12 3 8 6 0 0 4 1 0 0 23 5 0 0 1 0.47 1.13 48 T -3 -2 0 -2 -5 6 -1 -4 4 0 -3 -1 0 -5 -4 -1 3 -5 -3 -2 1 1 4 1 0 41 2 1 12 5 1 1 3 0 0 4 20 0 0 3 0.80 1.13 49 L -4 -5 -6 -6 -2 -5 -6 -6 -5 3 5 -5 1 0 -5 -5 -4 -4 -3 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 18 68 0 3 4 0 0 0 0 0 7 1.15 1.13 50 K -2 -3 2 4 -5 -1 4 -4 2 -5 -1 0 -1 -5 -4 0 -2 -6 -4 -5 2 0 9 25 0 1 34 0 6 0 6 4 2 0 0 8 2 0 0 0 0.75 1.13 51 S -2 0 6 -2 -2 -1 -3 2 3 -5 -5 -1 1 -5 -4 2 1 -6 -4 -5 2 4 37 1 1 2 0 16 8 0 0 2 4 0 0 14 9 0 0 0 0.76 1.13 52 V -3 -5 -5 -5 -4 -4 -5 -5 -5 5 1 -4 4 -3 -5 -3 3 -5 -4 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33 8 0 12 0 0 0 22 0 0 25 0.91 1.11 K Lambda Standard Ungapped 0.1208 0.3078 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.2045 0.3178 PSI Gapped 0.0626 0.2670