JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_NJbbREb.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet ||E|E|E|E|E||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||E|E|E|E|E||||||||||||||E|E|E|E|E|||||||E|E|||||H|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||H||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|8|3|8|8|8|5|1|5|7|7|7|7|5|4|2|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|2|5|8|8|5|0|7|7|6|2|2|6|7|8|7|7|5|1|2|7|8|7|7|7|7|3|5|8|8|6|5|8|8|8|7|2|5|7|8|8|7|4|1|8|8|8|9|9|9|8|5|5|8|8|5|4|3|2|0|2|4|8|8|6|1|3|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|2|2|4|5|0|3|6|8|9|9|9|9|9|8|8|6|1|2|4|3|5|7|8|8|6|1|5|7|8|8|7|7|0|1|3|4|4|6|6|6|5|3|1|2|3|2|0|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|2|1|2|2|3|3|1|7|7|7|7|6|5|3|3|3|3|3|2|5|8|8|6|2|1|8|7|7|3|1|1|0|5|6|7|4|0|1|2|2|1|1|5|7|8|8|6|3|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|1|5|7|7|7|6|6|7|7|7|7|6|4|4|6|6|9|9|9|9|9|9|8|6|3|6|8|0|0|0|6|8|9|9|9|9|8|6|2|3|1|7|7|8|8|7|3|5|8|6|3|8|8|8|5|3|7|7|8|8|7|7|3|1|2|7|8|9|9|9|9|8|7|5|3|8|9|6|4|8|8|8|7|6|0|4|6|7|4|2|7|3|3|7|5|1|1|5|7|7|7|5|2|7|8|7|7|5|0|1|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|0|8|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|B|-|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|B|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|B|-|B|-|B|-|B|B|B|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|B|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|B|-|B|B|B|B|B|-|B|-|B|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|B|-|B|B|B|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|-|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles ||E|E|E|E|E||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|H|H|H|||||||||||||||E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||H|H|H|H|H|H|E|||||||||||||E|E|E|E|E|E|||||||E|||||E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E||||||||E|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E||||||H|||H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||E|E|E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E||||||||||||H|H|H|H|H||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|||||||||||||E|E|E|E|E|||||||E|E|E|||||H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | |*| | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | |*|*|*|*|*|*| | | |*| | | | | | | | | | | | | |*|*| | |*|*| | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*|*| | | | | |*|*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*|*|*|*| | | | | | 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