Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 G -1 -4 -2 -3 -4 -3 -4 7 -4 -6 -5 -3 -4 -5 -4 -2 -3 -4 -5 -5 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.81 0.63 2 A 4 -3 -2 -3 -3 -2 1 -3 -4 -4 -2 -3 -3 -5 4 2 -2 -5 -4 -1 39 0 2 0 0 0 12 0 0 0 4 0 0 0 24 16 0 0 0 3 0.76 0.93 3 M 3 -2 -3 -1 -4 1 -1 -1 -3 -4 -3 4 -1 -5 0 0 1 -5 -4 -1 29 0 0 3 0 6 2 5 0 0 2 29 2 0 4 4 11 0 0 5 0.48 1.00 4 G 0 3 -2 0 -1 0 -1 4 -3 -5 -3 -1 -4 -1 0 2 0 -5 -2 -4 6 15 1 5 1 4 4 29 0 0 3 3 0 2 4 14 6 0 1 0 0.40 1.07 5 S -1 1 1 3 -5 1 2 1 -3 -5 -5 3 -4 -5 -4 2 -1 0 -4 -5 4 8 8 16 0 4 13 10 0 0 0 20 0 0 0 16 2 1 0 0 0.51 1.11 6 H -1 -2 0 -1 -5 5 2 0 4 -3 -4 -2 -1 0 0 -2 -3 1 2 -3 5 1 3 2 0 31 15 6 10 1 1 1 2 4 5 2 1 2 6 1 0.55 1.16 7 P -1 -3 -4 -2 -5 -1 -1 -3 -2 -2 -1 -2 -4 -2 7 0 -1 0 -3 -3 4 1 0 2 0 2 4 1 1 2 7 1 0 2 60 7 3 1 1 1 1.29 1.17 8 M -2 1 -4 -5 -2 -2 -4 -4 -4 0 1 -1 6 -2 -4 0 4 -5 -2 1 2 8 0 0 1 1 0 1 0 5 10 4 24 1 1 6 25 0 1 11 0.59 1.24 9 C -3 -6 -5 -6 11 -1 -6 -5 -5 -4 -4 -5 -4 -5 -5 -2 -2 2 -5 -4 0 0 0 0 89 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 2 3 0 0 2.88 1.30 10 K -1 0 0 2 -5 1 2 -3 -2 -3 -2 2 -4 -4 4 0 0 -2 -5 -2 4 4 4 9 0 6 14 2 1 1 5 14 0 1 20 7 5 1 0 3 0.41 1.39 11 E -3 -2 0 2 -3 0 5 -5 1 -2 -2 2 -3 -1 -4 -2 -2 -5 -2 -1 1 1 4 13 1 2 46 0 3 3 4 11 0 3 0 2 2 0 1 4 0.73 1.35 12 H -3 -3 -2 -4 -6 -2 -2 -5 10 -6 -4 -3 -4 -4 -2 -2 -4 -5 0 -6 2 0 0 0 0 0 1 0 90 0 2 0 0 0 2 2 0 0 1 0 2.58 1.35 13 E -2 -1 -1 1 -3 2 5 -2 0 -4 -3 1 -4 -4 3 0 -2 -5 -3 -3 2 3 2 6 1 8 34 4 2 1 2 8 0 1 14 7 2 0 1 1 0.56 1.30 14 D -1 0 1 4 -5 0 2 1 -1 -4 -2 0 0 -3 -2 0 0 -5 -2 -3 4 4 5 27 0 4 13 12 1 0 4 5 3 1 1 8 5 0 1 1 0.39 1.25 15 E -3 0 -2 -1 -6 3 6 -5 0 -4 -4 2 -4 -5 -3 -1 -2 -5 -2 -4 0 4 1 1 0 10 60 0 2 1 1 12 0 0 1 4 2 0 1 1 1.09 1.28 16 K -2 2 2 -2 -3 1 -1 -3 0 -1 -3 4 -1 -3 1 0 0 -5 -4 -1 3 9 9 2 1 6 4 1 2 5 3 32 2 1 7 5 6 0 0 4 0.41 1.24 17 I -1 -5 -4 -6 4 -4 -5 -5 -1 4 3 -3 1 -1 -3 -4 -1 -4 1 3 6 0 1 0 8 0 0 0 2 24 24 1 4 1 1 0 4 0 5 19 0.61 1.19 18 N -2 -1 5 2 -5 0 2 -3 0 -5 -4 1 -4 -5 -4 2 -1 -6 -4 -2 3 3 32 10 0 4 13 1 2 0 1 10 0 0 0 13 4 0 0 4 0.63 1.16 19 I -3 -4 -5 -6 -4 -2 -5 -6 -1 4 3 -3 6 2 -5 -3 -1 0 2 1 1 0 0 0 0 2 0 0 2 22 27 1 21 7 0 1 3 1 6 6 0.74 1.14 20 Y -4 -2 -5 -6 -5 -4 -5 -6 1 -3 -3 -4 0 4 -6 -4 -4 2 9 -2 0 2 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 3 16 0 0 0 2 72 3 1.87 1.14 21 C -3 -6 -5 -6 11 -5 -6 -1 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -5 -3 -3 -5 -5 -3 0 0 0 0 94 0 0 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.94 1.14 22 L -1 0 -3 -2 -1 0 2 -4 -2 0 2 0 0 -1 -2 -1 -1 -1 1 2 4 4 1 2 1 4 17 1 1 4 25 5 2 2 2 4 3 1 4 14 0.22 1.14 23 T -1 0 0 1 -4 2 -1 -3 -1 -2 -3 0 -1 -5 -2 1 5 -5 -2 -1 4 4 3 7 0 11 3 1 1 1 2 4 1 0 1 11 39 0 1 5 0.51 1.14 24 C -3 -5 -3 3 10 -4 -1 -5 2 -4 -4 -5 -4 -5 -5 -3 -3 -5 -5 -4 0 0 0 21 70 0 3 0 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.16 1.14 25 E -2 2 -1 0 1 4 3 -1 3 -5 -4 3 -4 -5 -4 -1 -3 -5 -4 -5 3 11 2 6 3 19 21 6 7 0 2 17 0 0 0 4 0 0 0 0 0.60 1.14 26 V -1 1 -4 -4 0 1 -1 -3 -1 2 0 0 1 -2 -4 -1 1 -5 -4 3 3 9 0 0 2 7 4 1 1 13 9 7 4 1 0 5 11 0 0 23 0.30 1.14 27 P 0 -3 -3 -4 2 -4 -4 -3 -5 -3 0 -3 -4 -5 7 -2 -2 -6 -5 -3 7 1 1 0 5 0 0 1 0 1 11 1 0 0 68 1 1 0 0 1 1.64 1.11 28 T -2 -5 -5 -5 -3 -4 -5 -5 -5 5 0 -4 2 -2 -5 -2 3 -5 -4 4 2 0 0 0 0 0 0 0 0 34 4 0 4 1 0 1 17 0 0 36 0.90 1.12 29 C -3 -2 -5 -6 11 -5 -6 -5 -5 -4 -4 -5 -4 -5 -1 -1 -3 -5 -5 -4 0 3 0 0 88 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 5 0 0 0 0 2.78 1.27 30 S 2 -1 -2 -4 -2 -2 -3 -1 2 -1 -2 -2 -2 -3 0 3 0 -5 2 2 20 3 2 0 1 2 0 5 4 3 4 1 1 0 4 23 5 0 7 15 0.32 1.27 31 M -3 0 -3 -1 -4 1 0 -4 0 1 3 -2 4 2 -4 -2 -2 -4 0 1 1 4 1 4 0 6 6 1 3 8 28 2 10 8 1 3 2 0 3 11 0.34 1.27 32 C -3 -6 -5 1 11 -5 -2 -5 -5 -4 -4 -5 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -5 -4 0 0 0 9 88 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.80 1.27 33 K -1 1 -3 -3 -3 0 -2 -3 -3 -1 1 5 -1 -2 -2 -2 -1 -5 -2 0 6 7 1 1 1 4 2 1 0 3 13 45 1 1 2 2 2 0 1 6 0.56 1.22 34 V -2 -3 -2 0 -2 -1 1 -4 -2 1 3 -3 3 -1 -5 -1 0 -5 -4 3 2 1 2 5 1 3 9 1 1 7 26 1 7 3 0 3 6 0 0 22 0.36 1.25 35 F -2 -1 -2 0 -4 -3 1 -2 -1 0 -1 -2 -1 6 -4 1 -1 -1 1 1 2 3 1 7 0 0 10 4 1 4 5 2 1 33 0 10 3 1 3 9 0.47 1.22 36 G -2 0 -1 -1 -5 -2 -3 6 -4 -4 -4 -1 -5 -5 -2 -1 -2 -2 -5 -5 2 6 2 4 0 2 1 70 0 1 1 3 0 0 1 4 2 1 0 0 1.22 1.23 37 I 2 3 0 1 -3 2 1 -2 -2 -3 -3 1 -4 -3 -2 1 1 -5 -4 -2 20 14 3 8 1 8 10 2 1 1 2 9 0 1 1 8 10 0 0 3 0.32 1.27 38 H -4 -3 -2 -3 -5 -2 -2 -4 11 -5 -5 -3 -4 -4 -4 -3 -4 -5 -1 -5 0 0 0 0 0 0 0 0 95 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.74 1.22 39 K 0 3 -1 -2 -3 1 -1 -2 0 -4 -4 5 -2 -5 -2 1 -1 -5 -3 -3 7 12 2 2 1 6 2 3 2 1 1 45 1 0 1 10 2 0 1 1 0.69 1.22 40 A -1 -3 3 4 -3 0 0 3 0 -4 -5 0 -5 -2 0 0 -1 -6 -5 -4 4 1 16 24 1 3 4 20 2 1 1 6 0 2 5 6 2 0 0 1 0.53 1.30 41 C -4 -2 -2 -4 5 -2 -3 -1 10 -6 -5 -4 -4 -4 -5 -3 -4 -5 -1 -5 0 1 0 0 14 0 0 4 79 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 2.34 1.27 42 E -3 0 1 3 -6 3 5 -4 -1 -5 -4 1 -3 -6 -1 -1 -2 -6 -3 -3 1 5 7 16 0 12 37 0 1 0 2 7 1 0 3 5 2 0 1 2 0.71 1.28 43 V -2 -5 -5 -6 0 -3 -5 -6 -5 3 0 -5 0 2 -5 -3 -1 -4 0 6 2 0 0 0 2 1 0 0 0 12 4 0 2 9 0 1 2 0 3 61 1.01 1.24 44 A 3 -1 -3 -2 -2 2 -2 -4 -4 1 -2 1 -1 -4 -3 1 2 -5 -3 1 27 2 1 2 1 9 2 0 0 8 3 11 1 0 0 10 13 0 1 9 0.35 1.24 45 P 1 -2 -1 1 -5 0 0 -3 -4 -4 -3 -1 -4 -5 6 1 1 -5 -1 -4 13 1 2 10 0 3 5 1 0 1 3 3 0 0 38 8 11 0 2 0 0.79 1.23 46 L -4 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 4 5 -5 3 -2 -5 -5 -4 -4 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25 66 0 5 0 0 0 0 0 0 4 1.24 1.19 47 Q -1 -2 1 2 -5 3 2 -1 -2 -5 -4 3 -3 -5 -2 2 1 -5 -4 -4 4 0 8 10 0 13 14 3 1 0 1 17 0 0 2 18 7 0 0 1 0.47 1.13 48 S 1 -3 4 -2 -3 -2 -2 -3 -3 -4 -4 -2 -3 -5 -3 4 4 -5 -4 -3 12 0 27 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32 29 0 0 0 0.83 0.83 K Lambda Standard Ungapped 0.1352 0.3232 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1727 0.3192 PSI Gapped 0.0529 0.2670