JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_TvzYb9X.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|||H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||H|H|H|H|H|H|H||||||||||E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 8|9|8|8|7|7|7|7|8|7|7|7|6|4|0|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|4|3|8|8|8|5|6|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|1|4|7|8|8|7|7|3|2|4|4|3|3|1|5|7|5|6|8|9|9|9|9|8|6|1|3|1|8|8|8|8|8|7|4|2|6|8|8|8|8|7|4|0|8|9|9|8|5|4|8|8|6|1|8|9|8|7|4|1|6|7|7|7|7|6|6|6|6|6|6|6|7|7|7|7|7|6|5|2|7|8|9|9|9|9|9|7|5|0|2|7|8|8|8|8|6|0|3|6|8|8|8|8|7|4|4|8|8|9|8|5|4|7|4|3|2|7|8|8|7|5|1|3|5|7|7|7|8|7|7|5|2|7|8|8|9|8|8|6|2|3|7|7|7|5|1|1|0|5|7|7|8|9|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|B|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|B|-|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|B|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|B|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|||H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|||||| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|E||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E||||||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | |*| | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*| | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*| | | | | |