JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_ow1si13.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet ||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E||||||||E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 8|9|8|8|8|8|7|7|7|6|4|0|0|3|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|1|5|8|8|5|4|7|2|2|4|7|8|8|7|1|6|8|8|2|0|3|7|8|8|6|3|7|8|8|8|7|4|3|4|7|6|5|2|1|4|5|6|7|8|8|3|0|4|7|8|8|6|1|4|4|3|5|6|5|1|4|7|7|8|7|7|7|6|1|3|3|4|3|3|3|0|6|8|8|5|5|8|9|9|8|8|4|3|6|7|7|7|7|7|7|6|4|1|4|5|8|9|9|8|8|6|2|1|4|5|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|6|7|7|7|7|7|5|2|6|8|8|7|3|5|8|6|1|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|1|3|7|8|8|6|1|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|3|1|6|7|7|3|7|8|4|4|1|1|2|7|6|6|8|9|9|9|9|9|8|8|6|3|3|7|8|9|9|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|B|-|-|B|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|B|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|||||||||E|E|E||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles |||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|E|E||||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | |*|*| | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | |*|*| | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | |*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | |