Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 P -3 -4 -4 -3 -5 -3 -3 -4 -4 -5 -5 -3 -5 -6 9 -3 -3 -6 -5 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 2.77 0.82 2 Q 1 -1 -2 2 -5 2 3 4 -1 -5 -5 0 -4 -5 -4 -2 0 -5 -4 -3 11 3 0 10 0 10 25 29 1 0 0 4 0 0 0 0 6 0 0 1 0.60 0.96 3 L -3 -4 -5 -6 -4 -1 -5 -6 -5 2 4 -4 6 -2 -5 -4 -3 -4 -3 2 0 0 0 0 0 3 0 0 0 12 43 0 29 0 0 0 0 0 0 13 1.02 1.00 4 K -1 -3 -5 -5 -3 -2 -4 -5 -2 2 5 -1 0 -2 -5 -4 -2 -4 -3 3 6 1 0 0 0 2 0 0 1 8 56 4 1 1 0 0 2 0 0 18 0.75 1.01 5 F 3 0 -1 2 -4 1 2 -3 -1 -4 -3 -1 -3 -2 -1 1 2 -5 -4 -3 28 5 2 10 0 6 13 1 1 0 2 3 0 2 2 11 12 0 0 1 0.37 1.02 6 A 6 -4 -4 -4 -3 -2 -3 -1 -4 -4 -4 -3 -3 -5 -3 0 -2 -5 -4 -2 94 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 2 1 0 0 1 1.43 1.03 7 M -2 -4 -5 -6 -4 -3 -5 -5 -4 1 3 -4 9 -2 -5 -4 -3 -4 -3 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 5 21 0 67 0 0 0 0 0 0 4 1.54 1.04 8 Q -1 3 -2 -3 -5 6 2 -2 -2 -5 -3 2 -3 -5 -4 -1 -1 -5 -4 -3 6 15 0 0 0 48 10 2 0 0 2 9 0 0 0 2 4 0 0 1 0.93 1.04 9 R -3 8 -3 -4 -6 -1 -1 -5 1 -5 -5 0 -4 -5 -4 -2 -3 -5 -4 -5 1 89 0 0 0 1 2 0 4 0 0 2 0 0 0 1 1 0 0 0 1.77 1.04 10 D -2 -4 0 8 -6 -2 0 -4 -3 -5 -6 -3 -5 -6 -4 -2 -3 -7 -5 -5 2 0 1 95 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.02 1.04 11 L -4 -4 -6 -6 -4 -2 -5 -3 -5 -1 6 -5 0 2 -5 -5 -4 -4 -3 -2 0 0 0 0 0 2 0 2 0 0 86 0 1 10 0 0 0 0 0 0 1.28 1.04 12 G -1 -2 -2 -2 -5 -3 -2 6 0 -6 -6 2 -5 -5 -3 -2 -4 -5 -5 -5 2 2 1 1 0 0 2 75 2 0 0 13 0 0 1 1 0 0 0 0 1.38 1.04 13 I -4 -2 -6 -6 -4 -4 -5 -4 -5 3 5 -5 2 -2 -5 -5 -3 -4 -3 0 0 2 0 0 0 0 0 1 0 14 74 0 4 0 0 0 0 0 0 5 1.15 1.04 14 F -2 -3 0 2 -3 -3 -2 -3 -4 -4 -4 -2 -3 -2 -2 4 5 -5 -4 -3 1 0 3 12 0 0 0 0 0 0 0 1 0 2 2 32 48 0 0 0 0.95 1.04 15 P 3 2 -3 -1 -4 -1 2 -1 1 -4 -4 0 -4 -5 4 -1 -1 -5 -4 -3 28 11 0 2 0 1 13 3 3 0 1 5 0 0 25 4 4 0 0 1 0.62 1.04 16 T 3 -1 -1 3 -4 1 2 0 -3 -4 -5 -1 -4 -5 -2 0 0 -5 -4 -3 30 3 1 20 0 7 16 6 0 0 0 2 0 0 1 6 7 0 0 1 0.53 1.04 17 Q -1 0 -2 -1 -5 7 4 -2 -2 -5 -4 -1 -3 -5 -3 -2 -3 -4 -4 -4 6 4 0 2 0 61 24 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.27 1.01 18 L 5 -4 -4 -4 -3 -3 -3 -3 -4 -1 -1 -3 -2 -3 -3 -1 -1 -4 0 2 68 0 0 0 0 0 0 0 0 3 7 0 0 0 0 1 1 0 4 15 0.90 1.01 19 P 0 3 -2 -2 -4 2 2 -2 0 -3 0 1 -1 -4 -2 0 1 -4 -1 0 10 19 1 2 0 8 13 3 2 0 12 7 1 0 2 6 8 0 2 6 0.24 1.01 20 Q 3 1 -2 1 -4 4 1 -2 0 -4 -3 -1 -3 -5 -4 -1 2 -5 -4 -1 25 8 1 8 0 18 10 2 3 0 2 2 0 0 0 2 14 0 0 4 0.43 1.04 21 Y -4 7 -3 -4 -5 1 -2 -5 -2 -4 -1 0 -2 -4 -4 -2 -2 -4 1 -4 0 79 0 0 0 4 0 0 0 0 7 1 1 0 0 1 2 0 6 0 1.46 1.04 22 L -1 -5 -6 -6 -4 -4 -3 -6 -5 2 5 -5 0 1 -5 -4 -3 2 -3 1 4 0 0 0 0 0 1 0 0 9 70 0 1 4 0 0 0 3 0 7 1.01 1.04 23 Q 4 1 -3 0 -3 0 -1 -2 -2 -3 -2 1 -3 -4 -3 0 1 -5 -4 1 45 9 0 7 0 5 2 1 1 1 3 7 0 0 0 4 7 0 0 9 0.48 1.01 24 T 3 1 3 -1 -4 2 -2 -2 -1 -3 -2 -2 -3 2 -4 1 0 -4 -3 0 23 8 16 3 0 10 1 1 1 0 2 1 0 10 0 9 7 0 0 8 0.33 1.01 25 E -1 -2 -2 2 -6 3 6 -4 -2 -5 -5 -1 -4 -6 -3 -1 -3 -5 -4 -5 5 0 0 8 0 13 71 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 1.34 1.04 26 K 3 2 -2 0 -4 2 0 -3 1 -2 -3 1 -2 -4 -4 0 0 -5 -1 -3 33 13 1 6 0 8 6 1 4 2 1 9 1 0 0 7 5 0 2 0 0.42 1.04 27 L 2 2 -3 1 -4 2 2 -3 0 -2 -1 2 -2 -4 -4 -2 0 3 -4 -2 20 14 0 9 0 8 15 1 2 2 6 11 0 0 0 1 6 4 0 3 0.35 1.04 28 A 6 -4 -4 -4 -3 -3 -3 -2 -4 -3 -2 -3 -2 -4 -3 0 -2 -5 -4 -1 90 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 1 0 0 4 0 0 0 4 1.32 1.04 29 R 3 2 -1 -2 -4 -1 -2 2 -1 -2 -3 -2 -1 -3 0 0 2 -5 -4 -1 24 14 2 2 0 2 1 16 1 2 1 0 2 1 5 7 16 0 0 4 0.35 1.02 30 T 3 2 -2 1 -4 0 1 0 -2 -4 -3 1 -3 -5 -1 -1 1 -5 -3 0 29 12 1 8 0 4 10 6 1 0 1 8 0 0 2 3 10 0 0 6 0.34 1.04 31 Q 0 0 -3 -4 -4 2 -3 -3 -4 1 2 -3 -2 1 -4 -2 2 -4 -3 3 8 5 1 0 0 9 0 2 0 7 20 1 0 5 0 1 15 0 0 25 0.38 1.04 32 A 3 -3 -3 1 -4 1 4 -1 0 -1 -3 -2 -2 -5 -4 0 -2 -5 -4 -1 28 0 0 8 0 6 36 4 2 4 1 0 0 0 0 4 2 0 0 5 0.59 1.04 33 A 2 1 -2 0 -4 1 1 1 0 -4 -2 0 -4 -5 2 0 0 -5 -4 -4 22 10 1 6 0 7 9 11 2 0 4 6 0 0 12 5 7 0 0 0 0.33 1.04 34 A 2 4 -2 -2 -4 2 0 0 -2 -1 -3 0 -2 -3 -3 1 3 -5 -4 -2 15 21 0 2 0 9 4 6 0 4 1 6 1 1 0 9 19 0 0 2 0.38 1.04 35 I 3 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -4 -5 0 5 -4 1 0 -4 -3 -3 -1 -3 2 25 0 0 0 0 0 0 0 0 3 55 0 2 3 0 0 0 1 0 11 0.81 1.04 36 E -1 6 -2 -2 -5 3 1 -3 -2 -5 -4 1 -3 -5 -4 0 -1 -5 -4 -4 4 58 0 1 0 14 8 1 0 0 0 5 0 0 0 6 2 0 0 0 1.10 1.03 37 R 1 4 1 -3 -4 1 0 0 -2 -4 -4 2 -4 -5 -2 0 1 -5 -3 -2 15 25 6 0 0 4 6 7 1 0 0 15 0 0 1 8 7 0 0 3 0.43 1.04 38 E 3 1 -2 0 -4 3 1 -3 -3 -4 -4 0 -3 -5 -3 2 1 -5 -4 -2 31 9 1 4 0 14 10 1 0 0 0 6 0 0 0 14 8 0 0 2 0.49 1.04 39 F 2 -2 -5 -5 -3 -4 -5 -5 -5 -1 5 -4 -1 2 -5 -3 -1 -4 -1 -1 16 2 0 0 0 0 0 0 0 1 66 0 0 8 0 1 3 0 1 2 0.87 1.04 40 G -1 -3 -3 -2 -5 -3 -4 7 -4 -5 -5 -3 -5 -3 1 -1 -3 -5 -5 -5 3 1 0 2 0 1 0 79 0 0 0 1 0 1 8 3 0 0 0 0 1.48 1.02 41 A 2 -2 -1 4 -4 0 2 0 -3 -5 -5 0 -3 -5 0 1 0 -5 -5 -4 22 2 2 25 0 3 12 8 0 0 0 4 1 0 3 12 5 0 0 0 0.51 1.04 42 Q 3 3 -1 2 -4 -1 -1 -1 -1 -3 -4 -1 -4 -5 -1 2 0 -5 -2 -2 28 16 3 13 0 2 3 4 2 1 0 2 0 0 2 17 4 0 1 3 0.41 1.04 43 F -4 -5 -5 -6 -5 -3 -5 -4 -2 -2 -2 -5 -2 8 -2 -4 -4 1 6 -3 0 0 0 0 0 1 0 1 0 1 1 0 0 65 2 0 0 1 28 0 1.72 1.04 44 A 5 -4 -3 -4 -3 -3 -4 5 -4 -4 -5 -3 -4 -5 -4 -1 -3 -5 -5 -3 57 0 0 0 0 0 0 42 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 1.23 1.04 45 G -2 -5 -3 -2 -5 -4 -4 7 -4 -6 -6 -4 -5 -6 -4 -3 -4 -5 -5 -6 0 0 0 2 0 0 0 98 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.05 1.04 46 S 5 -3 -3 -3 -3 -3 -3 -2 -4 -4 -3 -3 0 -4 -3 4 1 -5 -2 -2 50 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 2 0 0 33 9 0 1 2 0.87 1.03 47 W -4 -3 -5 -5 -4 -4 -4 -3 0 -4 -3 -4 -3 -1 -5 -3 -4 12 2 -4 0 2 0 0 0 0 0 2 3 0 1 0 0 1 0 2 0 84 4 1 3.12 0.99 48 I -3 -4 -5 -5 -4 -4 -5 -5 -4 2 3 -4 1 5 -5 -4 -3 -3 2 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13 28 0 3 25 0 0 0 0 8 20 0.81 1.00 49 E -1 0 0 5 -3 -1 2 -1 0 -3 -3 -1 -2 -3 -1 1 0 -3 -2 -2 5 4 3 39 1 2 11 3 3 2 3 2 1 1 3 9 4 0 1 3 0.51 0.71 50 R 1 2 -1 -1 -2 0 -1 2 -2 -1 -2 0 -2 -1 1 0 0 -2 -1 -1 14 13 2 3 1 4 3 14 1 4 4 7 1 3 8 7 5 1 3 4 0.15 0.62 51 N 3 -1 2 0 -2 -1 0 0 -2 -2 -2 1 -2 -3 -1 1 1 -3 -3 0 25 3 11 5 0 2 5 7 1 2 3 8 1 1 2 10 8 0 1 6 0.23 0.80 52 E 3 -2 -2 2 -3 -1 2 -1 -3 -3 -2 -1 -3 -4 1 1 1 -4 -3 -2 32 2 1 13 0 1 14 3 0 1 3 2 0 1 7 9 10 0 0 1 0.41 0.92 53 D -1 -2 0 5 -3 -2 1 3 -2 -4 -4 -2 -3 -4 -2 0 0 -4 -3 -3 5 1 4 38 0 1 9 20 0 1 2 2 0 1 2 7 5 0 1 1 0.63 0.87 54 G 1 -1 -2 -1 -3 -1 -1 5 -2 -2 -2 -1 -2 -3 -2 0 0 -3 -3 -3 10 3 1 4 0 2 3 45 1 2 4 3 1 1 2 7 7 0 1 2 0.55 0.80 55 S 1 1 -1 -1 -3 -2 -1 2 0 -3 -2 1 -3 -4 -2 2 3 -4 -3 -3 9 9 1 3 0 1 2 18 2 1 3 7 0 1 1 19 20 0 0 1 0.36 0.92 56 F 1 0 -1 -1 -3 1 1 -2 0 -2 0 1 -2 0 -1 -1 2 -3 0 -1 13 5 2 3 0 7 9 2 2 1 11 9 0 4 3 4 17 0 4 5 0.15 0.93 57 K -1 3 -3 -2 -4 -2 -1 -1 0 0 3 1 -2 -3 -4 -2 2 -4 -3 0 4 15 1 3 0 1 4 5 2 3 33 9 0 1 0 1 14 0 1 4 0.33 1.06 58 L -1 -3 0 -5 -3 -3 -4 -5 -2 1 3 -2 1 0 -5 -3 1 -4 -2 4 6 1 5 0 0 1 0 0 1 6 30 2 2 5 0 0 10 0 1 31 0.53 1.08 59 V 1 -4 -4 -5 -3 -3 -4 -5 -5 1 -2 -4 -1 -3 -4 -2 2 -5 -4 6 11 0 0 0 0 1 0 0 0 3 0 0 0 0 0 1 14 0 0 69 1.08 1.09 60 A 3 -2 -4 -4 -3 -4 -4 3 -5 -1 -2 -4 -3 -4 -4 -1 0 -5 -4 4 29 2 0 0 0 0 0 20 0 1 2 0 0 0 0 2 4 0 0 41 0.73 1.09 61 A 3 -4 -4 -1 -3 -4 -3 1 -5 0 -1 -4 -3 -4 -4 -1 2 -5 -4 4 29 0 0 4 0 0 1 11 0 4 3 0 0 0 0 2 16 0 0 30 0.56 1.09 62 T 0 -3 -3 0 -3 -2 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -3 -3 -4 1 6 -5 -4 1 6 1 0 7 0 1 0 0 0 0 3 0 0 1 0 10 59 0 0 13 0.89 1.08 63 S 1 -3 -1 5 -4 -2 -1 -2 -4 -4 -5 -2 -4 -5 0 0 4 -6 -5 -4 11 1 1 40 0 1 1 2 0 0 0 1 0 0 5 6 32 0 0 0 0.89 1.08 64 G 2 -1 -1 4 -4 1 2 1 -1 -5 -5 -1 -4 -5 0 2 -2 -5 -4 -4 15 4 1 25 0 5 14 11 1 0 0 3 0 0 5 14 1 0 0 1 0.50 1.07 65 A 6 -2 -4 -3 -3 -2 -2 -2 -4 -2 -3 -2 -3 -5 1 0 1 -5 -4 -3 73 2 0 1 0 1 1 0 0 1 1 2 0 0 6 3 7 0 0 0 0.99 1.08 66 R 1 3 -3 1 -4 1 -1 0 1 -3 0 0 -3 -4 -4 0 0 -5 -4 0 14 20 0 10 0 6 4 8 3 0 10 6 0 0 0 6 5 0 0 9 0.26 1.05 67 K 2 2 0 3 -4 1 1 -1 -3 -4 -3 2 -4 -5 -3 -1 0 -5 -4 -2 23 14 3 17 0 5 9 5 0 0 2 12 0 0 1 2 5 0 0 3 0.41 1.04 68 S 5 -1 -3 -2 -3 -1 0 1 -3 -2 -4 -1 -3 -4 1 0 0 -5 -4 -1 52 3 0 2 0 3 5 8 0 2 0 2 0 1 7 6 4 0 0 5 0.59 1.04 69 S 4 0 -4 -1 -3 -1 -2 -2 -4 0 -1 -1 -2 -4 -1 -1 -2 -5 -4 4 37 5 0 4 0 2 1 2 0 4 4 4 0 0 4 2 1 0 0 30 0.50 1.04 70 T 3 4 -3 -2 -4 0 1 -3 -3 -2 -4 0 -1 -5 -4 0 2 -5 -4 -1 23 27 0 1 0 3 10 1 0 2 0 5 1 0 0 6 16 0 0 4 0.52 1.03 71 L 4 0 -4 -2 -3 -3 -2 -3 -4 2 1 -2 -2 -3 -4 0 -2 -5 -4 3 35 5 0 2 0 0 2 1 0 11 11 2 0 0 0 7 1 0 0 23 0.48 1.03 72 G 5 0 -3 -1 -3 -3 -1 1 -4 -4 -3 -3 -1 -5 -3 -1 2 -5 -4 -3 61 5 0 4 0 0 4 10 0 0 1 0 1 0 1 2 12 0 0 0 0.78 1.02 73 G 1 -2 -2 -2 -4 -4 -3 7 -4 -6 -5 -3 -5 -5 -4 -2 -2 -5 -5 -5 9 2 1 1 0 0 1 83 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 1.57 1.00 74 V 5 -4 -4 -4 -3 -3 -2 -3 -4 -1 -1 -3 0 1 -4 -2 -1 -4 0 3 54 0 0 0 0 0 2 0 0 2 3 0 2 7 0 0 2 0 3 24 0.73 0.96 75 E -2 1 -2 1 -5 2 5 0 -1 -5 -5 0 -4 -5 0 -1 -1 -5 -4 -3 3 6 0 6 0 10 51 7 1 0 0 4 0 0 4 2 4 0 0 2 0.76 0.94 76 V 3 -4 -4 -4 -3 -3 -4 -4 -4 0 -1 -2 -2 -4 3 -2 2 -5 -4 4 28 0 0 0 0 0 0 0 0 2 6 1 0 0 17 0 14 0 0 31 0.65 0.92 77 R -3 7 -2 -2 -5 1 -1 -4 -1 -5 -4 2 -3 -5 -4 -3 -1 -5 -4 -3 0 75 0 1 0 4 2 0 1 0 0 12 0 0 0 0 3 0 0 2 1.41 0.92 78 N -1 0 1 -1 -3 0 -3 -4 -1 1 2 -2 -2 -3 1 -1 2 -5 -3 3 4 6 7 4 0 4 0 0 2 6 19 1 0 0 7 5 12 0 0 24 0.27 0.89 79 V 1 -4 -5 -5 -3 -4 -4 -5 -5 1 -1 -4 -1 -3 -4 -3 -2 -5 -3 7 11 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 89 1.28 0.87 80 R -3 7 -2 -3 -5 0 -2 -4 -2 -5 -4 2 -3 -5 -4 -2 -3 -4 -3 -4 0 89 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 0 0 0 0 0 1.54 0.64 K Lambda Standard Ungapped 0.1310 0.3173 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1786 0.3166 PSI Gapped 0.0547 0.2670