JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_GrVegvU.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet ||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|||||||||||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|9|8|7|6|6|7|7|7|7|7|6|7|7|7|7|7|4|4|8|8|8|8|6|1|5|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|1|2|8|9|9|9|9|9|8|7|3|4|7|8|8|7|1|5|8|8|8|5|1|3|2|0|4|6|6|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|0|2|4|4|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|2|4|8|8|8|4|5|7|8|7|4|2|2|7|7|0|1|3|3|3|2|2|1|2|5|6|7|7|7|7|7|5|5|4|1|6|8|8|8|8|4|3|6|7|7|7|7|6|6|7|7|6|6|7|7|7|7|7|5|1|6|8|8|6|1|5|6|7|7|7|6|6|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|4|2|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|5|2|8|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|-|-|B|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|-|B|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|B|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles ||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|||E||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | |*| |*| | | | | | | | | | | | | | |*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*| | |*| | | | | |*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |