JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_Ztw6may.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet ||||||E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||E|E|E|E|E|E||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E||||||||||||||||E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E|E|E|||||||||||||E|E|E|E|E||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|9|9|8|7|5|1|5|5|3|2|1|6|7|7|7|7|7|5|1|6|8|8|5|4|8|8|0|5|8|9|8|8|4|0|7|8|8|7|1|3|5|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|8|5|1|5|7|7|7|6|4|3|3|5|6|7|7|7|4|5|8|8|8|8|6|1|4|7|7|7|7|7|7|5|1|6|8|8|8|7|4|1|6|7|7|7|7|6|6|6|6|7|7|7|7|7|3|5|8|9|8|5|0|8|8|0|5|8|9|8|8|4|0|7|8|8|6|3|6|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|2|4|7|8|8|8|8|7|4|4|8|8|8|8|6|1|5|7|7|7|7|7|7|7|7|7|4|1|4|6|6|5|0|8|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|-|B|-|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|B|-|B|-|-|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles ||||||E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||E|E|E|E|E|E||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|||E|E|E|E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E|E|E|||||||||||||E|E|E|E|E|E|| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||||||E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||||E|E|E|E|E||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | |*| | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | |*| | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | |*| |