Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 D -4 -4 1 6 -7 -2 6 -5 -3 -6 -6 -3 -5 -6 -4 -3 -4 -7 -5 -6 0 0 6 37 0 0 56 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.61 1.48 2 R -3 4 -2 -4 -6 3 -1 2 2 -2 -2 2 2 -2 -1 -2 -3 -3 -3 -1 1 21 1 1 0 11 3 18 5 3 3 14 6 2 3 2 1 0 1 5 0.47 1.72 3 K -4 2 -1 -2 -6 2 1 -5 -4 -5 -4 7 -5 -6 -3 -2 -2 -6 -5 -5 0 9 3 1 0 7 9 0 0 0 1 65 0 0 1 1 2 0 0 1 1.35 1.80 4 A 4 -5 -4 -6 -1 -5 -4 -3 -4 3 -2 -4 -2 -2 4 -3 -1 -6 -4 2 40 0 1 0 1 0 0 1 0 16 2 0 0 1 17 1 3 0 0 15 0.83 1.86 5 V -3 -2 -2 -2 -3 1 -1 -5 0 2 1 0 1 -3 -4 -1 1 -6 -4 5 1 2 2 2 0 6 4 0 2 12 11 6 3 1 1 4 8 0 0 35 0.49 1.90 6 I -4 -6 -7 -7 -2 -6 -6 -7 -7 6 1 -6 0 0 -6 -4 -3 -6 -4 5 1 0 0 0 1 0 0 0 0 44 11 0 2 3 0 1 1 0 0 36 1.34 1.93 7 K -4 3 -2 -4 -4 0 -1 -3 1 0 -2 6 -2 -3 -4 -3 -2 1 -4 -1 0 14 2 0 0 3 3 2 3 6 3 50 1 1 0 1 2 2 0 5 0.90 1.98 8 N 1 -1 4 1 0 0 1 -3 3 -3 -3 -1 1 0 -2 2 -1 -6 0 -3 10 3 17 7 2 4 10 2 6 2 3 3 3 4 2 17 3 0 3 1 0.33 1.97 9 A 3 -4 -1 -5 4 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -2 -4 -3 -3 3 3 -6 -4 1 24 1 2 0 8 1 1 1 2 2 2 2 0 1 1 21 18 0 0 11 0.59 1.96 10 D -3 -3 0 8 -2 -3 1 -3 -2 -6 -6 -3 -4 -6 -5 -3 -2 -7 -2 -4 2 1 3 74 1 0 8 1 1 0 1 1 0 0 0 1 2 0 2 1 1.71 1.99 11 M -4 -5 -6 -7 0 -4 -4 -6 -5 0 0 -5 10 -2 -4 -4 -3 -5 -4 -1 1 0 0 0 2 0 1 0 0 4 5 0 80 1 1 1 1 0 0 2 2.32 2.01 12 P -1 -3 2 1 -2 -1 0 -3 -1 -5 -2 0 -5 -5 5 3 1 -6 -4 -4 4 1 8 7 1 2 5 2 1 0 4 5 0 1 28 22 8 0 0 1 0.67 2.01 13 E -2 -1 -2 3 -4 1 5 -2 -2 -4 -2 -1 -3 -3 0 -1 0 -1 -3 -1 3 3 2 14 0 6 37 3 1 1 4 4 1 1 6 4 5 1 1 4 0.57 2.02 14 D 0 -2 -1 4 -4 -1 5 -3 0 -4 -4 1 -3 -1 -1 -1 -2 -3 -1 -3 7 1 2 18 0 2 39 1 2 1 2 7 0 3 3 4 3 0 2 2 0.69 1.98 15 L -4 -2 -3 -4 -5 -1 -3 -6 -3 1 2 -2 9 -2 -4 -4 -2 -5 -4 0 1 2 1 1 0 2 1 0 1 5 14 3 58 1 1 1 2 0 0 5 1.52 1.99 16 Q -2 2 -3 -4 0 7 0 -4 -1 -1 0 2 -1 -4 -4 -3 -2 -3 -3 -2 3 8 1 0 2 49 6 1 1 3 8 9 1 0 0 1 2 0 1 2 1.00 1.98 17 Q -1 0 2 1 -4 5 3 -4 -1 -1 -3 1 0 -4 -5 -1 0 -3 -3 -2 5 5 9 7 0 24 16 1 1 4 2 7 2 1 0 4 6 0 1 3 0.46 2.00 18 D -2 1 -1 4 -4 1 4 -3 3 -3 -3 0 -2 1 -5 -2 -3 -1 1 -3 4 6 2 24 0 5 23 2 7 2 2 6 1 6 0 2 2 1 4 2 0.55 2.00 19 A 5 -5 -5 -5 4 -3 -5 -4 -5 1 -2 -5 -1 -2 -4 0 -1 -2 -5 2 54 0 0 0 7 1 0 0 0 9 3 0 1 1 1 6 3 1 0 13 0.95 2.00 20 I -2 -2 -6 -6 -1 -1 -3 -6 -3 4 1 0 3 2 -6 -3 -1 -5 -2 4 4 2 0 0 1 3 2 0 1 21 13 6 8 9 0 1 3 0 1 24 0.61 2.04 21 D 0 2 1 4 -4 1 4 -4 0 -5 -4 1 -3 -4 -5 -1 -2 -2 -3 -4 7 12 6 19 0 5 26 1 2 1 2 6 1 1 0 5 3 1 1 1 0.59 2.08 22 C -1 -3 -4 -6 7 0 -3 -5 1 4 1 -3 1 -1 -6 -1 0 -1 -1 2 4 2 1 0 19 5 1 1 3 19 14 1 3 3 0 4 6 1 2 12 0.62 2.08 23 A 5 -5 -3 -4 4 -3 -5 -3 -5 0 -3 -5 -3 -2 -5 1 1 -6 -3 2 51 0 1 1 8 1 0 2 0 5 2 0 1 2 0 8 7 0 1 12 0.87 2.08 24 N 1 3 0 -3 -1 1 -2 -3 0 0 -2 1 -1 -2 -3 1 2 -5 -1 1 11 14 4 1 1 6 3 2 2 6 5 9 1 2 1 9 11 0 2 11 0.20 2.06 25 Q -1 0 1 2 -3 4 3 -3 1 -2 -3 1 0 -4 -3 0 0 -6 -1 -3 4 4 6 11 1 15 18 2 4 3 2 10 2 1 1 8 6 0 2 2 0.38 2.15 26 A 6 -3 -2 -5 -1 -2 -3 -2 -2 -2 -1 -4 -1 -2 -3 -1 -2 -6 -1 -1 62 1 2 0 1 2 2 3 1 2 6 0 2 2 1 4 2 0 2 5 0.92 2.16 27 L -3 -3 -6 -4 3 -2 -3 -4 -6 2 4 -3 4 1 -3 -3 -2 -5 -1 0 1 1 0 1 6 2 1 1 0 10 40 1 10 6 1 2 2 0 2 6 0.63 2.21 28 E -1 0 0 4 -2 1 4 -3 0 -4 -3 1 -2 -3 -3 -1 -2 -6 -3 -4 5 4 4 23 1 6 24 2 2 1 3 9 1 1 1 4 2 0 1 1 0.49 2.23 29 K -1 1 1 -2 -1 1 0 -4 0 -2 -1 4 0 -2 -3 0 -1 -6 -2 -3 5 6 7 2 2 5 7 1 2 3 8 28 2 2 1 7 4 0 1 2 0.30 2.25 30 Y -2 -2 0 -3 2 -2 -1 -3 4 -3 -1 -1 1 5 -3 -1 -2 0 5 -3 3 3 4 1 4 1 3 2 10 1 5 3 4 20 1 5 2 1 18 1 0.56 2.26 31 N -2 -1 3 2 -1 1 -1 -1 1 -3 -4 1 -1 -6 1 1 0 0 -2 -2 4 3 12 12 1 6 4 5 4 2 2 8 2 0 8 10 7 1 2 3 0.20 2.25 32 I -2 -2 1 2 0 -1 0 -3 0 0 -1 -1 0 -1 0 0 1 1 -1 2 4 2 6 13 2 3 5 2 2 6 6 4 2 2 4 8 8 2 2 12 0.07 2.25 33 E -2 -2 2 1 0 -1 3 -2 0 -2 -2 -1 0 0 0 0 -1 1 1 -1 3 2 10 8 2 2 20 4 2 2 5 4 2 4 5 8 3 2 4 4 0.17 2.24 34 K -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 0 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 35 D -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 -5 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 0.02 2.12 36 I -1 0 1 0 3 1 -4 -5 2 0 -1 0 2 1 0 -4 0 -4 2 0 6 6 6 6 6 6 0 0 6 6 6 6 6 6 6 0 6 0 6 6 0.13 1.78 37 A 5 -4 -1 -5 2 -4 -2 -2 -5 -1 -2 -1 -4 -5 -1 0 -1 -5 -5 0 53 0 3 0 5 0 3 3 0 3 5 3 0 0 3 5 3 0 0 6 0.71 1.94 38 A 2 0 0 -1 0 0 1 -2 0 -2 -2 2 0 -1 -1 0 0 1 -1 -2 15 6 5 3 2 5 9 3 2 2 3 13 3 3 3 6 6 2 3 2 0.09 1.94 39 F 0 -1 -1 -2 0 0 -1 -3 5 -2 -2 -1 1 2 -2 -1 -1 1 4 -2 8 3 3 3 2 5 3 2 14 2 4 3 4 9 2 4 4 2 14 2 0.30 1.90 40 I -1 -1 -4 -5 4 -4 -4 -5 -4 4 1 -4 2 1 -4 0 1 -4 -3 1 5 5 0 0 9 0 0 0 0 27 12 0 6 5 0 7 8 0 0 7 0.43 1.40 41 K 0 1 1 -4 -5 1 0 -4 -4 0 -1 0 2 1 1 0 0 -4 2 0 6 6 6 0 0 6 6 0 0 6 6 6 6 6 6 6 6 0 6 6 0.09 1.67 42 K -1 1 0 0 0 1 2 -2 1 -2 -2 4 0 -5 -4 -1 0 -5 -1 -2 4 6 3 5 2 6 11 3 3 2 4 27 2 0 0 4 6 0 2 3 0.30 1.81 43 E -1 0 0 0 0 1 3 -2 2 -1 -3 0 2 -1 -4 -1 0 2 0 -2 5 4 4 5 2 7 21 3 4 3 2 6 4 2 0 4 7 3 3 3 0.18 1.76 44 F 0 -4 1 -4 4 -3 0 -4 -3 1 0 -4 3 2 1 0 -3 -4 2 0 8 0 7 0 7 0 8 1 0 8 8 0 7 7 8 8 0 0 7 8 0.20 1.34 45 D -3 0 0 4 -5 0 2 -1 1 -4 -1 0 1 -4 -4 -1 0 -5 -4 -1 0 5 4 26 0 4 14 4 4 0 7 4 4 0 0 5 5 0 0 4 0.34 1.41 46 R 0 2 0 -1 -1 1 1 -2 0 0 -3 4 -1 -1 -4 0 0 -5 -2 -2 7 10 4 3 2 5 8 3 3 6 2 24 2 3 0 5 5 0 2 2 0.24 1.71 47 K -1 2 0 -2 -1 0 -1 -3 0 -1 -1 5 -1 -2 -2 -1 1 -5 -1 -1 4 12 4 2 2 4 4 2 2 4 5 33 2 2 2 4 7 0 2 4 0.42 1.73 48 H -3 -3 -2 -1 -1 -1 -2 -2 3 -1 -2 -1 -2 4 -2 -3 -3 2 7 -3 1 1 2 3 1 3 3 4 6 3 4 4 1 15 3 2 1 2 40 1 0.94 1.83 49 N -2 -2 1 -1 -2 -2 -1 6 0 -3 -4 0 -3 -3 -2 -1 -3 -5 -1 -4 2 2 6 4 1 2 4 53 2 2 2 7 1 1 3 5 1 0 3 1 0.83 1.90 50 P -1 -2 -2 -3 -2 -2 -3 3 -1 -4 -4 -1 -2 -2 6 -1 -2 0 -3 -3 6 3 2 1 1 1 1 21 1 1 1 3 1 2 42 5 3 1 1 2 0.94 1.92 51 T -1 -1 -1 -2 1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 0 -1 1 0 5 2 0 0 4 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 8 6 32 2 3 8 0.35 1.67 52 W -3 1 -4 -4 4 -3 -4 0 3 1 0 -3 -3 2 1 0 -3 5 2 0 1 8 0 0 8 0 0 8 8 8 8 0 0 8 8 8 0 8 8 8 0.38 1.23 53 H -1 -1 0 -1 1 0 -1 0 8 -1 -2 -4 0 -1 -1 -2 -2 -5 1 -2 4 3 4 3 3 4 3 7 40 3 4 0 3 3 3 3 3 0 4 3 0.83 1.60 54 C 0 -2 -4 -5 9 -4 -4 -4 1 -1 -3 -4 -3 -4 -4 -1 0 -4 0 2 7 3 0 0 47 0 1 1 4 3 1 0 0 0 0 4 5 0 4 18 1.29 1.30 55 V -2 -4 -4 -2 2 -4 -4 -5 -1 5 0 -2 2 0 -5 -2 0 -4 -1 4 3 0 0 2 4 0 0 0 2 34 8 3 5 3 0 3 5 0 2 25 0.65 1.34 56 V -2 -1 -1 -5 1 -4 -1 -5 -5 2 -1 -4 3 -1 -5 -2 -2 -5 -1 6 2 3 4 0 2 0 5 0 0 11 3 0 6 2 0 2 2 0 2 54 0.80 1.36 57 G -1 -2 0 -2 -5 -4 -2 7 -4 -5 -4 -4 -4 -5 -4 -1 -2 0 -5 -2 3 3 4 2 0 0 2 72 0 0 2 0 0 0 0 3 2 1 0 4 1.28 1.30 58 R -3 5 -1 -1 -2 1 1 -1 0 -4 -2 3 -2 -5 -2 -1 1 -1 -1 -3 2 32 2 4 1 4 9 5 2 0 4 14 1 0 2 4 9 1 2 2 0.52 1.41 59 N -2 -1 5 2 -1 -1 -1 1 2 -5 -5 0 -4 -3 0 2 -1 -1 -1 -5 3 2 30 9 2 2 4 9 5 0 1 5 0 1 4 17 3 1 2 0 0.54 1.40 60 F -4 -3 -1 -5 -5 -5 -4 -5 -1 -2 0 -5 -1 8 -6 -3 -4 0 3 -1 0 1 3 0 0 0 1 0 1 2 6 0 1 66 0 2 0 1 10 3 1.55 1.43 61 G 0 -2 -2 -2 0 -1 -2 6 -2 -4 -6 -3 -5 -5 -5 1 -2 -1 -3 -4 7 2 1 2 2 2 2 63 1 1 0 1 0 0 0 10 2 1 1 1 1.12 1.49 62 S 0 -3 -2 -4 5 -4 -4 -1 -2 -3 -3 -4 -2 2 -3 5 -1 -1 0 -3 6 1 1 0 12 0 0 4 1 1 1 0 1 9 1 52 2 1 3 2 0.86 1.49 63 Y -1 -3 -1 1 4 -2 0 -5 3 -3 -2 -3 -2 3 -5 0 -3 -3 6 -3 5 1 4 7 9 2 7 0 6 1 3 1 1 12 0 8 1 0 30 2 0.70 1.49 64 V -2 -5 -5 -3 0 -5 -4 -3 -2 3 0 -5 0 2 -3 -3 -3 -1 0 5 3 0 0 2 2 0 1 3 1 13 7 0 2 9 1 2 1 1 3 48 0.77 1.47 65 T 0 -2 -2 -2 -4 -2 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -2 -5 0 2 6 -6 -5 -1 6 2 1 2 0 1 2 2 1 3 2 2 1 0 5 13 55 0 0 3 0.88 1.52 66 H -2 -3 -2 -4 2 0 -2 -4 9 -4 -3 -4 -4 0 -4 -2 -3 -3 5 -4 3 1 1 0 4 4 2 1 50 1 2 0 0 4 1 3 2 0 21 1 1.51 1.53 67 E -3 -1 -2 3 -1 2 6 -4 -2 -2 -2 0 -2 -4 -3 -1 -2 -3 -3 -2 2 2 1 14 1 7 48 1 1 3 3 4 1 1 1 5 2 0 1 3 0.79 1.58 68 T 0 0 -2 -1 2 -1 0 -3 -1 -2 -2 2 0 -4 2 0 4 -6 -4 0 7 4 2 3 4 3 5 1 1 2 3 11 2 1 11 6 25 0 0 7 0.35 1.65 69 H -3 1 3 0 -2 0 1 3 -2 -4 -4 5 -3 -6 -4 -1 -3 -6 -3 -4 1 7 14 4 1 4 8 19 1 1 1 32 1 0 0 3 1 0 1 1 0.65 1.63 70 H -2 0 3 -3 4 0 -2 -1 7 -5 -4 -1 -3 -2 -4 1 2 -5 2 -4 2 5 12 1 8 4 1 4 25 0 1 3 1 2 1 10 12 0 8 1 0.70 1.64 71 F -3 -4 -3 -6 0 -5 -6 -4 1 -2 1 -4 2 7 -6 -1 -4 1 3 -2 1 1 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