Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 L -4 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -5 -1 5 -5 4 1 -6 -5 -3 -4 -3 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55 0 12 5 0 0 0 0 0 28 1.11 1.22 2 A 4 -5 -5 -5 -1 -3 -5 -3 -5 -2 3 -4 6 -4 -5 -1 0 -5 -4 0 32 0 0 0 1 1 0 1 0 0 26 0 25 0 0 3 5 0 0 6 0.85 1.42 3 E -2 1 0 4 -6 0 4 -1 -4 -6 -3 1 -3 -6 -1 1 -2 -6 -5 -4 3 8 3 19 0 4 31 4 0 0 3 10 1 0 4 10 1 0 0 1 0.62 1.49 4 H -2 1 1 -4 3 0 1 -4 8 -4 -2 -1 -4 -4 -1 0 -1 -1 0 -1 3 7 6 0 7 3 8 1 33 1 4 4 0 0 3 8 5 1 3 4 0.72 1.51 5 L -3 -2 -5 -6 -2 2 -3 -6 -3 0 3 -5 0 6 -4 -1 -4 -4 -2 1 1 2 0 0 1 10 1 0 1 5 30 0 2 31 1 5 0 0 0 8 0.78 1.54 6 L -2 1 1 -2 -5 -2 1 -5 -2 0 1 1 -1 6 -4 0 -2 -4 -2 -3 3 7 7 2 0 1 8 0 1 4 12 8 1 33 0 9 2 0 0 1 0.53 1.56 7 K 1 3 -1 -1 -5 2 0 -3 -4 -4 -3 4 -3 -2 1 1 0 -6 -4 -3 12 14 3 4 0 7 6 2 0 0 2 22 0 2 6 11 5 0 0 2 0.38 1.55 8 P 1 -2 -3 2 5 -1 -1 -3 -1 -5 -5 -1 -5 -5 5 3 -3 -6 -5 -4 13 2 0 11 13 2 3 1 2 0 0 4 0 0 26 19 1 0 0 1 0.79 1.58 9 L -1 -2 -2 -5 2 -3 -2 -5 -3 2 4 -2 2 0 -2 -3 -2 -5 -4 3 4 3 2 0 4 1 4 1 1 12 35 2 4 3 2 2 2 0 0 17 0.50 1.62 10 P -2 -2 1 1 -2 -2 -2 -1 -2 -1 -2 -1 -2 -4 5 1 1 -6 -5 -1 2 2 7 8 1 1 2 4 1 4 5 4 1 1 32 12 9 0 0 5 0.56 1.66 11 A 2 -3 -1 1 -2 -2 4 1 -2 -2 -4 -2 -4 -4 2 0 0 -5 -2 -1 16 1 3 7 1 1 24 11 1 3 1 2 0 1 10 6 7 0 1 4 0.37 1.59 12 D -1 -2 2 6 -5 0 2 -2 -2 -4 -5 -1 -5 -2 -3 0 -2 -6 -4 -4 4 1 10 42 0 4 15 3 0 1 1 4 0 2 1 8 2 0 1 1 0.83 1.58 13 K -2 0 2 2 -4 0 1 4 2 -5 -3 2 -3 -4 -2 0 -3 -5 -4 -4 3 4 8 13 0 3 8 27 6 1 3 13 0 1 2 6 1 0 1 1 0.47 1.60 14 Q -1 -1 0 3 -4 2 3 2 1 -3 -4 1 -3 -4 -3 1 -2 -6 -3 -3 6 3 4 18 0 7 18 13 4 2 1 9 0 1 1 8 2 0 1 2 0.41 1.62 15 I -2 -5 -5 -6 -4 -5 -5 -4 -6 6 2 -5 3 -3 -3 -3 -2 -5 -4 4 3 0 0 0 0 0 0 2 0 40 14 0 6 0 1 2 1 0 0 29 1.02 1.61 16 E -2 1 0 3 -5 -1 2 -4 0 -3 0 0 -3 -4 3 2 -2 -6 -3 -2 3 6 4 16 0 2 12 1 2 1 12 5 1 1 15 14 2 0 1 3 0.36 1.72 17 T -1 -5 -3 -2 1 -4 -5 -4 -5 0 2 -5 1 -2 -2 -1 5 -5 -5 2 5 0 1 2 3 0 0 1 0 5 20 0 3 2 2 5 36 0 0 14 0.62 1.72 18 G 1 0 -2 1 -1 1 3 0 -1 -2 -1 1 0 -4 0 0 -1 -6 -5 -1 11 5 1 8 2 7 16 8 2 2 6 10 2 0 5 6 4 0 0 5 0.19 1.74 19 P 0 0 -2 1 -1 2 1 -3 2 -4 -2 -1 -3 -4 5 1 -1 -6 -1 -4 7 5 2 9 1 8 9 1 4 1 4 4 0 1 27 10 3 0 2 1 0.51 1.74 20 F -5 -6 -6 -3 -6 -6 -4 -5 0 -2 2 -6 -3 7 -3 -3 -5 2 5 -4 0 0 0 1 0 0 1 1 2 1 18 0 0 49 1 2 0 3 20 0 1.44 1.72 21 L -2 -6 -4 -7 3 -5 -6 -4 -3 2 5 -6 1 -3 -6 -2 -3 0 -4 2 3 0 1 0 5 0 0 1 1 8 59 0 3 0 0 4 1 1 0 12 0.98 1.77 22 E 1 1 -1 3 -2 0 3 -2 1 -3 -3 0 -3 -6 -1 1 -2 -3 -3 -3 11 8 2 18 1 5 19 3 3 2 2 6 1 0 3 12 2 0 1 1 0.36 1.74 23 A 5 -2 -3 -2 1 -4 -4 1 -2 -2 -1 -4 -1 0 -5 1 -2 -5 -2 0 49 2 1 3 3 0 0 9 1 1 6 0 2 4 0 9 2 0 1 7 0.65 1.76 24 V 1 -5 -3 -5 8 -5 -5 -4 -2 -1 -3 -3 0 1 -1 1 -1 6 3 0 13 0 1 0 27 0 0 1 1 4 2 1 3 5 3 12 3 9 9 5 0.88 1.75 25 S -1 4 1 -1 -3 0 2 -3 0 -3 -4 1 -2 -3 -2 2 0 -1 0 -2 4 19 5 4 1 4 15 1 2 2 2 9 1 1 2 15 5 1 3 4 0.35 1.76 26 H 0 -2 -1 0 0 1 3 0 4 -3 -1 -2 -2 -1 -2 1 -1 -5 -2 -1 8 2 3 4 2 7 19 9 11 1 6 2 1 2 2 12 3 0 1 4 0.27 1.71 27 L -2 -5 -2 -5 -4 -2 -5 -3 -1 3 4 -5 1 0 -1 -4 -2 -4 0 2 3 0 2 0 0 2 0 2 2 18 42 0 3 4 3 0 3 0 3 13 0.67 1.63 28 P -1 -3 -1 -5 4 -2 -2 -3 -1 2 1 -3 0 -2 1 1 0 -5 0 3 4 1 3 0 7 2 2 2 1 9 14 2 2 2 6 10 5 0 3 23 0.30 1.69 29 P -1 2 1 -1 -1 -1 -1 -2 0 -2 -1 2 0 -2 4 -1 0 -5 -1 0 5 10 6 4 1 3 4 3 2 2 6 13 2 2 17 4 6 0 2 7 0.23 1.62 30 F -1 -5 -5 -5 1 -4 -2 -5 -4 0 2 -4 1 6 -1 0 -1 2 1 2 4 0 0 0 3 0 4 0 0 5 16 0 4 30 3 8 3 3 3 12 0.57 1.46 31 F -1 0 -5 -5 2 -4 -5 -5 -4 1 2 -4 3 5 0 -1 -1 -3 1 0 4 5 0 0 5 0 0 0 0 9 19 0 6 25 5 5 4 0 5 6 0.54 1.51 32 D -1 0 1 0 -5 1 0 -1 3 0 -1 0 2 -4 1 0 0 -5 1 0 6 6 6 6 0 6 6 6 6 6 6 6 6 0 6 6 6 0 6 6 0.10 1.78 33 C -1 -1 -1 -4 4 -1 -2 -3 -1 -1 3 2 0 -1 -1 1 -1 -5 0 0 5 3 3 1 8 2 2 2 2 3 24 13 2 2 3 11 3 0 3 8 0.25 1.65 34 L -3 -5 -6 -6 -2 -3 -5 -6 -5 2 5 -5 3 4 -6 -2 -2 0 -3 -1 1 0 0 0 1 1 0 0 0 11 50 0 7 17 0 3 2 1 0 3 0.92 1.62 35 G -1 -2 -2 -2 -5 -3 -3 7 -4 -6 -5 -3 -5 0 -5 -2 -3 -1 -3 -5 3 2 2 2 0 1 1 75 0 0 1 2 0 4 0 2 1 1 1 0 1.46 1.60 36 S -1 0 0 -1 -1 0 -1 0 -3 -2 -2 1 -1 -1 0 4 0 -3 -3 -1 5 5 4 3 2 3 4 7 0 2 5 9 1 3 5 32 5 0 1 4 0.29 1.35 37 P 1 -1 -1 -2 -4 -3 -2 1 -1 0 -2 0 2 1 3 -1 2 -4 -1 0 11 4 3 2 0 1 3 9 1 5 3 5 5 6 16 4 12 0 2 6 0.22 1.50 38 V 3 -4 -4 -5 -1 -1 -4 -2 -4 2 0 -4 2 0 -3 0 2 1 0 3 21 0 0 0 1 3 0 4 0 12 7 0 4 4 1 5 11 2 3 19 0.37 1.56 39 F -3 -2 -5 -5 0 -4 -5 -3 -4 -1 0 -4 4 7 -5 -2 -1 1 2 -2 2 2 0 0 2 0 1 2 0 2 8 1 12 50 0 4 4 2 4 2 1.10 1.54 40 T 3 -1 1 -2 -4 -2 -2 1 0 -1 -2 0 -1 -3 -2 2 1 -5 -1 -2 23 4 7 2 0 1 1 12 2 3 4 7 2 1 2 16 8 0 2 2 0.28 1.63 41 P -2 -1 -5 -5 -5 -4 -2 -2 -4 0 -1 -2 1 6 4 -2 -1 2 0 1 3 3 0 0 0 0 3 3 0 5 5 3 3 30 19 3 5 2 2 10 0.64 1.57 42 I 2 -5 -5 -5 2 -4 -4 -5 1 3 1 -4 2 0 0 -1 -1 3 -3 3 16 0 0 0 4 0 0 0 4 13 11 0 4 4 4 4 4 4 0 24 0.46 1.56 43 K -1 2 -1 -4 1 2 0 -2 1 -1 -2 3 -4 -1 -1 1 0 -5 0 0 4 11 3 0 3 8 5 3 3 3 3 19 0 3 3 10 7 0 3 7 0.20 1.56 44 A 1 0 1 -2 2 2 -3 -1 0 -1 -2 2 2 -3 -2 3 -2 3 -2 -3 9 4 7 2 3 8 1 4 2 3 3 11 5 1 2 19 2 4 1 2 0.19 1.72 45 D -4 -1 0 7 -6 -3 2 -2 -4 -5 -4 -2 -5 0 -4 -2 0 -6 -5 -5 0 3 3 54 0 0 13 2 0 0 2 2 0 4 0 3 6 0 0 0 1.08 1.76 46 I 0 -5 -2 -5 -4 -5 -5 -5 -5 3 2 -5 4 1 -1 -4 -1 -4 3 2 9 0 2 0 0 0 0 0 0 19 16 0 9 5 4 0 4 0 9 15 0.48 1.78 47 S 0 1 1 -2 1 0 0 -2 0 -1 -1 -1 0 0 -1 1 -1 1 -2 1 8 8 6 2 2 4 6 4 2 4 5 4 2 4 3 10 4 2 2 12 0.01 1.76 48 G 1 0 0 -2 -1 1 -1 4 -1 -3 -4 -2 -1 -2 0 1 0 -5 -1 -2 10 5 5 2 1 6 3 28 1 2 2 2 1 2 5 9 5 0 2 2 0.25 1.77 49 N 0 1 1 1 -5 1 0 -4 3 -4 -4 0 2 1 1 0 0 -4 2 -4 7 7 7 7 0 7 7 0 6 0 1 7 6 6 7 7 7 0 6 0 0.19 1.56 50 I -2 -1 -1 -5 1 -1 -2 -5 -5 4 0 -4 2 0 -1 -1 0 -5 -4 3 4 4 3 0 3 3 3 0 0 26 8 0 4 3 3 5 5 0 0 18 0.37 1.75 51 T -1 0 1 0 3 1 0 -1 2 0 -1 0 2 -5 0 0 0 -5 -4 0 6 6 5 6 5 5 6 6 5 6 6 6 5 0 6 6 6 0 0 6 0.06 1.89 52 K -1 2 -1 1 -5 -1 -1 -2 1 2 -2 4 2 -2 -4 -2 -1 -5 -1 -1 5 9 3 7 0 3 4 3 3 11 3 24 5 2 0 3 3 0 2 3 0.24 1.64 53 I -1 0 -5 -5 -4 -4 -1 -5 -5 3 3 -4 3 1 -5 -1 -3 -4 -4 2 6 5 0 0 0 0 5 0 0 14 32 0 8 5 0 5 0 0 0 11 0.44 1.53 54 K 0 2 0 -1 -4 1 2 -2 1 -1 -1 1 2 -4 -1 -1 -1 2 0 -2 7 11 4 3 0 6 13 3 3 3 6 9 6 0 3 3 3 3 3 3 0.09 1.47 55 A 1 1 1 1 -3 2 2 -2 1 -4 -4 2 -2 -4 -5 0 1 -6 -3 -3 13 6 6 9 1 7 12 3 3 1 2 14 1 1 0 7 9 0 1 2 0.26 2.11 56 V 0 3 -1 -5 0 -3 -3 -3 3 -2 2 2 1 1 -5 -2 -3 0 0 0 8 16 3 0 2 1 1 2 6 2 20 12 3 5 0 2 1 1 3 6 0.28 2.05 57 Y -1 2 -3 -4 1 1 -3 -4 4 -3 0 -3 0 1 -5 -1 -3 2 6 -2 5 11 1 1 2 6 2 1 10 2 10 1 2 6 0 5 1 2 23 2 0.50 2.07 58 D -1 0 2 1 -2 1 3 0 0 -2 0 2 -1 -2 -3 0 -3 -6 -3 -3 5 4 8 7 1 6 16 7 2 3 9 10 2 2 1 8 1 0 1 2 0.15 2.09 59 T 2 -1 -2 -2 -2 0 1 -2 -3 -4 -2 2 -1 -3 0 3 2 -6 -3 -3 15 2 2 1 1 4 9 3 1 1 4 10 2 1 6 20 12 0 1 1 0.26 2.09 60 N 0 -1 4 4 -3 0 -1 -2 2 -4 -3 -1 -3 -1 -3 0 -2 0 -1 -4 9 3 18 26 1 4 4 2 5 1 2 3 1 3 1 7 2 1 2 1 0.46 2.02 61 P -1 -1 -2 -2 0 0 -1 0 -1 -3 -4 1 -2 -5 6 0 -1 -5 -3 -3 5 4 2 2 2 5 4 6 2 1 2 9 1 0 39 6 4 0 1 2 0.72 2.00 62 A 2 -2 -1 1 -1 -1 3 -1 0 -2 -3 -1 -3 -3 -2 2 1 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