JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_jMM8QN6.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H||E|E|||||E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E||||||||E|E|E|E||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|E|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|||||||||||E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|9|9|8|8|7|6|3|3|2|1|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|2|2|4|7|8|8|8|7|4|4|8|8|8|7|4|4|7|8|8|6|0|3|8|9|9|9|9|9|9|8|7|4|1|4|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|7|7|7|7|7|6|6|2|2|4|6|7|7|6|7|6|5|5|4|6|7|7|7|0|1|2|2|4|4|4|4|2|0|0|0|2|5|5|6|0|1|2|2|2|4|3|3|4|4|1|3|4|8|9|8|8|8|8|5|1|7|8|2|6|8|9|9|8|7|5|3|3|7|7|8|7|7|4|1|6|8|7|4|3|6|7|6|5|6|6|6|6|5|6|7|7|7|7|7|7|6|6|5|3|3|4|4|2|1|2|8|8|8|7|1|2|3|2|6|7|6|4|0|0|1|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|2|0|3|9|9|9|9|9|8|7|1|2|7|8|8|4|3|2|7|8|8|8|7|6|2|3|6|7|7|7|7|6|0|2|3|2|0|1|7|7|7|5|3|2|0|1|1|1|1|5|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|2|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|1|6|8|8|8|7|1|4|7|7|6|2|1|5|6|7|6|5|6|6|7|7|6|3|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|2|5|8|8|6|2|7|8|8|8|5|1|7|7|7|7|7|1|3|2|2|5|6|6|7|7|6|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|7|6|5|4|6|6|6|6|5|3|2|3|0|1|3|4|6|7|7|7|7|6|1|1|6|7|6|1|4|6|7|7|7|7|7|7|1|1|1|7|6|3|7|8|9|9|9|9|9|8|7|2|8|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|B|-|-|-|B|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|B|-|B|B|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|-|-|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||E|E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||E||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||E|E|E||||E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|||||||||E|E|E|||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H||||||E|E||H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|E|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E||||||||||E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles |||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E|E|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||H||||||||||||E|E|E|E|E|||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*| | | | | | | |*|*|*| | | |*| | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | 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