Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 G 1 -5 -3 -4 -5 -4 -5 7 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -5 -3 -4 -5 -6 -5 13 0 0 0 0 0 0 87 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.91 1.36 2 S 3 -2 2 -2 -4 0 -3 -1 -3 -4 -3 -2 -3 -6 0 4 1 -6 -5 -4 25 2 8 2 0 4 1 4 0 0 2 1 0 0 5 35 10 0 0 1 0.64 1.61 3 R -3 6 -2 2 -6 1 1 -5 -1 -4 -3 4 -3 -5 -3 -1 -2 -6 -5 -5 1 39 1 11 0 5 7 0 1 1 2 22 1 0 1 5 3 0 0 0 0.93 1.70 4 R -3 4 -3 -1 -4 1 1 -4 -2 1 -3 3 -2 -3 0 -1 -1 -6 -5 1 2 24 1 4 0 6 7 1 1 7 2 20 1 1 4 5 4 0 0 10 0.47 1.74 5 A 2 -1 -3 -3 -4 0 -1 0 6 -2 -2 -1 0 -1 1 1 -2 2 2 -2 16 3 1 1 0 4 4 8 18 3 4 3 3 2 7 10 2 3 7 2 0.37 1.76 6 S 1 1 0 -1 -1 3 2 -3 -1 -3 -4 2 -2 -4 -2 2 1 -6 -2 -2 10 6 5 2 1 11 14 2 1 2 1 11 1 1 2 17 8 0 1 2 0.33 1.77 7 V 1 -3 -1 -3 -5 0 -3 -3 -2 2 -2 -2 2 -2 2 -1 1 -1 -3 4 10 1 2 1 0 5 1 2 1 12 3 2 5 2 10 5 8 1 1 28 0.39 1.77 8 G -2 3 5 -3 -2 0 -2 2 2 -3 -3 3 -3 -4 -3 -1 -1 -6 -4 -4 2 14 24 0 1 3 2 15 5 1 2 19 1 1 1 4 3 0 0 1 0.61 1.79 9 S 0 -2 1 -1 -4 0 -2 4 0 -5 -5 -2 -1 -2 4 0 0 -6 -4 -5 7 2 5 4 0 5 2 32 2 0 1 2 2 2 19 8 6 0 0 0 0.61 1.80 10 H -5 -3 -3 -4 -6 -2 -3 -5 11 -7 -6 -4 -2 -5 -6 -3 -5 -6 -1 -5 0 1 0 0 0 1 1 0 95 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 1 3.11 1.82 11 R -1 3 2 1 -1 1 -1 -4 3 -1 -2 1 -1 -3 -4 1 2 -6 -2 -2 4 18 9 7 2 7 4 1 7 3 4 7 2 1 0 9 12 0 1 3 0.32 1.87 12 F -5 -6 -7 -7 -3 -6 -5 -6 -3 -3 1 -5 -1 8 -7 -5 -5 5 1 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 10 0 1 75 0 0 0 8 2 1 2.10 1.87 13 K -2 2 -1 -3 -2 4 1 -4 1 0 -2 2 0 -3 -5 0 0 -5 0 2 3 12 2 1 1 16 8 1 4 5 3 12 2 1 0 6 6 0 3 14 0.36 1.87 14 V 1 -1 -1 -2 -3 -1 2 -3 -2 -2 0 0 2 -4 3 1 0 -3 -3 1 12 3 3 2 1 3 12 2 1 2 8 6 4 1 15 9 5 0 1 9 0.23 1.89 15 Y -2 0 -2 -3 0 0 -3 -2 5 -1 -3 4 -1 0 -4 -1 1 0 2 -1 3 5 2 1 2 4 1 4 12 4 3 26 1 4 1 5 9 1 7 6 0.42 1.84 16 N -1 1 2 -3 -2 0 -3 -3 2 -2 -3 -2 -2 -2 -1 3 4 -3 -2 -2 3 7 8 1 1 4 1 2 6 3 2 2 1 2 3 20 31 0 2 3 0.52 1.81 17 Y -3 -3 -1 -6 -2 -4 -5 -4 0 -1 0 -3 -2 7 -4 -2 -3 0 5 1 2 2 4 0 1 1 0 1 2 3 10 1 1 41 1 4 1 1 18 8 1.00 1.81 18 M -1 1 1 -2 -5 -1 -2 -1 3 0 -1 3 1 0 0 2 0 -3 -1 -2 4 6 6 2 0 3 3 4 6 7 6 18 3 5 4 14 6 0 2 2 0.20 1.81 19 S -2 3 0 -3 -3 0 -2 1 -1 0 -3 4 0 -3 -3 1 0 -2 -4 -2 3 18 4 1 1 3 2 11 1 6 2 23 2 1 1 12 6 1 0 2 0.40 1.78 20 P -1 -1 -2 -4 -2 0 -3 -2 -2 0 -1 -1 1 -3 7 -2 -1 -6 -4 -1 5 4 2 1 1 4 1 4 1 5 7 3 4 1 46 3 4 0 1 5 0.90 1.74 21 T 1 -2 -1 -2 -2 0 0 -3 1 -2 -3 -2 -1 -5 1 -1 5 -6 -3 1 11 2 3 1 1 3 6 2 4 2 2 2 2 0 6 4 39 0 1 8 0.53 1.71 22 F -1 -1 -1 -3 -3 -1 -3 -4 3 -2 -2 1 -1 4 -1 0 0 6 4 -1 5 4 3 1 1 3 1 1 6 3 4 9 1 17 3 6 6 9 14 4 0.44 1.64 23 C -3 -6 -5 -6 11 -6 -6 -5 -5 -4 -4 -6 -4 -5 -6 -4 -4 -5 -1 -1 0 0 0 0 91 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 3 3.17 1.59 24 D 1 0 2 4 1 -1 1 -1 3 -3 -2 -2 -2 -3 -2 0 -1 -2 -1 -1 10 4 10 25 3 3 7 4 7 1 3 2 1 1 2 6 3 1 2 5 0.34 1.64 25 H -1 -2 -3 -3 -2 -1 -2 -4 5 0 0 -2 -1 1 1 -1 -3 -1 3 3 6 2 1 1 1 3 3 1 14 5 8 2 1 6 6 6 1 1 10 22 0.39 1.59 26 C -3 -6 -5 -6 11 -5 -6 -5 -5 -4 -4 -6 -4 -5 -5 -1 -4 3 0 -4 0 0 0 0 86 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 0 3 4 0 2.99 1.63 27 G -2 1 2 0 -1 1 0 2 3 -3 -2 2 -1 -3 -3 0 1 -1 -2 -3 3 6 8 5 1 6 5 18 7 1 4 11 2 1 1 8 8 1 1 1 0.25 1.82 28 S -2 1 0 2 -6 1 2 0 1 -3 -3 3 0 -3 -5 2 -1 -6 -1 -2 2 7 4 12 0 5 13 6 3 1 3 17 2 1 0 14 3 0 3 3 0.33 1.89 29 L -1 0 -1 -5 0 -1 -2 -2 0 0 2 -1 2 2 0 -1 1 1 0 0 4 6 4 0 2 3 2 3 2 4 23 4 6 9 5 4 8 2 3 5 0.20 1.78 30 L -1 -5 0 -5 2 -4 -5 -5 -5 3 3 -5 4 1 0 -1 0 -5 -4 1 5 0 5 0 4 0 0 0 0 18 28 0 9 6 4 5 5 0 0 9 0.53 1.63 31 W -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.09 2.12 32 G -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.09 2.12 33 L -2 -2 -1 -2 0 -1 -2 0 0 0 2 -2 4 1 0 -2 -1 -5 0 2 3 2 4 2 2 3 2 8 3 6 22 2 9 6 4 3 4 0 3 12 0.22 2.02 34 V -1 0 0 -1 0 -1 -1 1 -1 1 -1 0 1 2 -2 0 0 1 0 0 6 6 5 4 2 2 4 9 2 9 7 6 4 7 2 8 6 2 3 8 0.05 2.08 35 K -1 3 -1 -2 -2 2 -1 -2 1 -3 -3 5 -1 -1 -2 -1 -2 1 -1 -2 4 14 2 2 1 9 4 2 4 1 2 35 1 2 2 4 2 2 2 3 0.58 1.97 36 Q -1 -1 1 1 1 3 0 -2 1 -1 -1 1 1 -1 -1 0 0 2 0 -2 5 4 7 7 3 12 6 4 3 3 7 9 4 3 4 8 5 3 3 3 0.12 1.97 37 G 2 -1 -1 -5 2 -1 -1 3 1 -1 -2 -4 -4 0 -1 0 -1 4 0 0 17 3 3 0 5 3 3 21 3 4 4 0 0 3 3 7 3 5 3 8 0.30 1.97 38 L -1 0 0 -4 3 1 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 0 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.13 2.01 39 K -2 2 -1 -1 1 1 0 -2 1 0 -2 3 1 0 -5 -1 0 2 0 0 3 11 3 3 3 7 5 3 3 5 4 19 4 3 0 5 6 2 3 6 0.20 2.10 40 C -3 -5 -5 -5 10 -5 -5 0 -5 0 -4 -5 -4 -5 -5 -3 0 -5 -5 0 0 0 0 0 70 0 0 8 0 6 1 0 0 0 0 0 6 0 0 6 2.20 1.53 41 E 0 1 2 2 -1 1 3 -2 -1 -2 -3 1 -1 -3 -2 1 0 0 -2 -2 9 8 8 9 1 6 16 2 2 3 2 9 2 1 2 9 6 1 1 2 0.22 1.70 42 D 0 -1 1 2 0 -1 1 -1 0 1 -1 -1 -1 -1 -3 1 -1 -1 -2 1 7 3 7 12 2 3 8 4 2 8 7 3 1 2 1 11 4 1 2 11 0.12 1.78 43 C -3 -3 -5 -6 11 -3 -6 -3 -5 -4 -3 -3 -1 -5 -3 -2 -2 -5 -5 -2 0 2 0 0 81 2 0 2 0 0 2 2 2 0 2 2 3 0 0 2 2.65 1.68 44 G -2 0 2 0 0 0 -1 4 0 -4 -4 4 -2 -3 -3 0 -2 -2 -3 -4 2 5 10 4 2 3 3 29 3 1 2 23 1 1 1 6 1 1 1 1 0.54 1.78 45 M -1 -2 -3 -4 0 -2 -4 -4 -1 1 2 -2 4 3 -4 -3 -1 -4 4 2 5 2 2 1 2 1 1 1 1 7 17 2 10 10 1 2 4 0 16 15 0.49 1.83 46 N 0 -1 4 -3 -1 -2 -3 -3 -2 0 -2 1 0 0 -2 0 3 -2 -2 1 8 4 18 1 2 1 1 2 1 5 4 10 2 4 2 8 17 1 1 9 0.30 1.85 47 V 0 -4 -4 -6 9 -5 -6 -6 -6 1 -2 -5 -2 0 -6 -1 -2 -5 -1 4 9 1 1 0 37 0 0 0 0 7 2 0 1 5 0 4 3 0 3 28 1.26 1.83 48 H -3 -3 -3 -3 -2 -2 -3 -5 11 -6 -6 -4 -5 -2 -1 -3 -5 -5 -1 -6 1 0 0 1 1 1 0 0 87 0 0 0 0 2 4 1 0 0 0 0 2.71 1.71 49 H -2 3 -2 -2 -3 1 1 -3 2 -1 -3 5 -2 -2 -1 -1 -1 -2 -2 -2 4 14 2 2 0 4 8 1 6 4 2 35 1 2 2 4 4 1 1 3 0.55 1.73 50 K -2 4 -2 0 -3 1 1 -2 2 -4 -3 4 -1 -4 -3 0 -2 -1 -3 -2 3 21 2 6 1 6 9 3 5 1 2 24 2 1 1 8 3 1 1 2 0.51 1.76 51 C -2 -6 -6 -5 11 -6 -6 -4 -2 -3 -2 -4 -4 -5 -6 -4 -4 -5 -2 -3 2 0 0 1 87 0 0 1 1 1 4 1 0 0 0 0 0 0 2 1 2.96 1.71 52 R 2 2 -3 -4 0 2 0 -4 2 0 0 1 -1 -3 -5 0 -2 -2 -2 1 16 9 1 0 2 8 6 1 6 6 11 10 2 1 0 7 2 1 1 11 0.24 1.71 53 E -1 0 1 2 -1 0 1 -1 2 -3 -2 2 0 -2 0 1 -1 -5 -1 -2 5 4 7 12 1 3 10 5 5 2 4 14 2 2 6 9 3 0 2 3 0.19 1.74 54 K -2 2 1 -2 -2 2 -2 -2 1 -3 1 4 0 -2 -5 0 -1 -5 -1 -2 2 10 8 2 1 10 2 2 3 1 15 24 2 2 0 7 3 0 2 2 0.36 1.77 55 V 2 -4 -4 -5 1 -4 -5 -4 -4 3 1 -3 1 -3 -4 -3 -2 -6 -3 5 15 0 1 1 2 1 0 1 0 16 13 1 3 1 0 1 2 0 1 41 0.77 1.75 56 A 0 -2 -2 -2 -2 -1 -2 -4 -2 -1 -2 -1 -3 -3 6 0 1 -6 -2 0 9 2 2 3 1 3 2 1 1 4 3 4 1 1 38 8 8 0 2 7 0.70 1.75 57 N 0 -1 3 0 -1 0 0 -4 0 -1 -1 -1 0 -3 2 1 2 -1 -3 -1 9 3 14 5 1 4 7 1 2 4 6 4 3 1 9 8 11 1 1 5 0.18 1.76 58 L -2 -2 3 2 1 0 1 -3 1 -2 0 -1 1 0 2 0 0 -3 -1 -1 3 2 14 10 3 3 9 1 3 2 9 4 3 4 11 7 5 0 2 4 0.22 1.73 59 C -3 -6 -6 -7 11 -6 -7 -5 1 -5 -5 -6 -5 -6 -6 -3 -3 -6 -5 -3 1 0 0 0 91 0 0 1 4 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 3.23 1.74 60 E -1 -2 -2 -3 -4 2 -1 2 -4 -3 -5 3 -3 -5 4 1 1 -6 -5 -3 4 2 1 1 0 10 4 13 0 1 1 21 0 0 19 11 9 0 0 1 0.58 1.71 61 F -2 0 -3 -3 3 -2 -3 3 5 -3 -3 -2 4 -1 -3 1 -1 5 -1 -3 2 5 0 1 6 2 1 25 15 1 1 2 10 3 1 11 3 7 2 2 0.61 1.71 62 I -1 -4 -2 1 -1 -2 -1 -3 -5 3 -1 -1 1 -4 -5 0 4 -6 -5 2 4 0 1 9 1 1 4 2 0 17 5 4 4 0 0 5 26 0 0 17 0.48 1.65 63 V 3 -3 -3 -2 -3 -1 -1 -4 4 1 -1 -1 2 -2 -1 -1 -2 -5 -1 3 24 1 1 2 0 2 4 1 11 7 7 5 5 1 3 3 2 0 2 19 0.37 1.59 64 T 2 -1 -2 -2 -4 -2 -1 -3 -2 -2 -4 -2 -2 -4 0 2 5 -6 -5 -2 19 3 1 2 0 2 4 1 1 2 1 1 1 0 4 14 42 0 0 2 0.70 1.53 65 D -4 -3 5 5 -6 -2 5 -4 -3 -6 -6 -3 -5 -6 -4 -3 -3 -7 -5 -6 0 0 31 32 0 0 37 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.42 1.38 K Lambda Standard Ungapped 0.1392 0.3265 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1419 0.3184 PSI Gapped 0.0434 0.2670