JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_EAvlOYr.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E|E|E|E| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|9|8|6|7|6|2|7|8|9|9|9|9|8|7|2|1|5|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|2|3|3|3|3|1|4|6|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|4|5|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|6|6|7|7|7|7|7|4|5|8|8|8|8|8|7|4|3|6|7|8|8|7|1|5|8|8|7|4|1|6|7|7|7|6|6|6|5|4|4|5|5|6|6|6|5|4|5|5|4|6|6|7|7|7|7|7|7|7|4|0|8|8|9|8|8|8|2|3|7|8|8|8|4|1|8|8|8|8|8|8|8|6|1|7|8|8|8|7|5|1|7|8|9|9|8|8|8|4|2 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off B|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|B|B|B|B|-|B|B|B|B|-|B|-|-|B|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|B|B|B|-|B|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|B|-|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|B|B|-|-|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|B|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |||||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E|E|E|E| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles |||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||H|H|H|H|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E||||||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | |*| | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | |*| | | | | | |*| | | | | | | | |*| | | | | | |*| | | | | | | | |