Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 G 0 -4 -2 -3 -4 -3 -3 6 -3 -5 -5 -3 -4 -5 -3 3 -2 -4 -4 -4 7 0 0 0 0 0 0 69 0 0 0 0 0 0 0 24 0 0 0 0 1.25 0.72 2 S 1 3 1 -3 -4 -2 -2 -1 -3 -2 -4 4 0 -5 -3 2 0 -5 -2 -4 13 14 6 0 0 0 1 3 0 2 0 32 3 0 0 19 6 0 1 0 0.53 0.96 3 Q -2 1 -3 -1 -5 4 3 2 -1 -4 -1 3 -2 -1 -2 -1 -2 -5 -4 -4 1 8 0 3 0 19 21 14 1 1 6 18 1 3 1 2 1 0 0 0 0.49 1.04 4 V -2 -1 -1 -2 -4 -1 0 -4 -2 2 -2 3 -3 -1 -4 1 3 -4 2 1 1 2 2 2 0 2 5 0 1 13 2 22 0 2 0 10 17 0 8 11 0.35 1.13 5 D -2 -3 4 6 -2 -1 0 -2 -3 -5 -6 -1 -5 -6 -3 0 -1 -6 -5 -5 2 0 24 50 1 1 5 2 0 0 0 2 0 0 1 7 3 0 0 0 1.13 1.15 6 A 2 -3 0 4 -2 -1 3 -2 -3 -3 -5 -1 -4 -5 -1 3 -1 -5 -3 -3 20 0 3 22 1 2 17 2 0 1 0 3 0 0 3 22 3 0 1 1 0.58 1.23 7 E -2 -1 3 5 -6 -1 4 -1 -1 -6 -6 -1 -5 -6 -2 0 -3 -6 -5 -4 3 2 16 31 0 2 31 4 1 0 0 2 0 0 2 5 0 0 0 1 0.90 1.28 8 G -2 -3 0 3 -5 -3 2 5 -1 -6 -5 -2 -5 -6 -3 -1 -3 -5 -3 -4 1 1 3 15 0 0 14 55 1 0 0 2 0 0 1 4 1 0 1 1 1.03 1.28 9 N -2 0 3 5 -5 -1 3 -2 -2 0 -5 -1 -3 -5 -4 -1 0 -6 -4 -2 2 4 16 36 0 2 19 2 1 6 0 2 0 0 0 3 4 0 0 2 0.75 1.29 10 P -1 -2 1 -2 -4 -1 1 -2 -2 1 -1 1 -3 1 1 -1 2 1 -1 2 3 1 7 2 0 2 8 2 1 9 6 9 0 5 8 4 16 2 2 13 0.18 1.29 11 F -2 -4 -4 -5 -2 -3 -4 -5 -1 4 0 -3 4 2 -3 -1 -1 -1 5 2 2 0 0 0 1 1 1 0 1 24 4 1 14 7 1 6 2 1 19 14 0.66 1.27 12 W -2 -5 -6 -6 6 -5 -6 -5 -5 2 -1 -5 -1 6 -6 -4 -4 7 0 0 3 0 0 0 21 0 0 0 0 11 5 0 1 34 0 0 0 18 2 5 1.37 1.26 13 E -2 0 0 3 -6 3 5 -4 1 -5 -4 1 -2 -4 -1 -1 -2 -3 -4 -3 3 5 4 14 0 12 36 0 4 0 1 9 1 1 3 3 2 0 0 2 0.68 1.30 14 I -3 -5 -6 -4 -4 -5 -5 -6 -5 4 5 -5 3 -1 -5 -5 -3 -4 -4 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 29 57 0 7 1 0 0 1 0 0 2 1.15 1.28 15 S -1 -3 -1 0 -4 -2 -1 4 -3 -5 -5 -2 -4 -5 -2 5 -1 -5 -4 -4 2 1 2 6 0 1 3 32 0 0 1 1 0 0 1 46 2 0 0 0 0.88 1.23 16 D -1 1 4 0 -5 -1 2 0 -2 -5 -5 4 -4 -5 -2 0 -2 -1 -4 -4 5 6 18 5 0 2 13 7 1 0 1 30 0 0 1 7 2 1 0 1 0.56 1.24 17 K -2 1 4 -2 -4 -1 -1 -2 -2 -2 -1 4 4 -3 -2 -2 -1 -5 -2 -2 2 7 22 1 0 2 3 2 1 1 5 30 12 1 1 2 3 0 2 2 0.59 1.25 18 R -3 7 -2 -4 -5 -1 -2 -4 -3 -4 -2 3 0 -4 -4 -2 -2 -4 -1 -2 0 59 1 0 0 2 1 0 0 0 4 21 2 0 0 2 2 0 2 3 1.21 1.22 19 R -3 6 0 -4 -5 1 -3 -4 0 -4 -3 2 -1 1 -4 -1 -2 -3 4 -2 1 41 5 0 0 5 0 0 1 0 1 11 2 7 0 4 1 0 15 3 0.82 1.24 20 V 1 -4 -5 -5 0 -4 -4 -5 -5 3 0 -4 0 -2 -4 -3 -2 -5 -3 6 11 0 0 0 2 0 0 0 0 16 8 0 2 1 0 0 1 0 0 56 0.95 1.24 21 G -1 -1 -1 -2 -2 0 -1 0 -2 -4 -3 0 -1 -1 -4 3 5 -5 -4 -1 2 2 2 1 1 5 3 7 1 0 2 5 2 3 0 26 34 0 0 4 0.55 1.27 22 I -2 -2 -5 -5 -3 -4 -4 -5 -5 3 0 -2 0 -2 -3 -3 -3 -5 -2 6 3 3 0 0 0 0 0 0 0 17 7 2 2 1 1 1 0 0 1 59 0.97 1.25 23 S -2 5 0 -1 -1 2 -1 0 0 -5 -3 0 -4 -4 -3 3 -1 -2 -1 -4 2 33 4 3 2 10 3 6 2 0 3 3 0 0 1 23 4 1 2 0 0.60 1.25 24 Q -2 0 2 3 -3 0 3 -2 -1 -2 -3 2 -3 -5 -2 0 1 -5 -3 -2 2 5 9 16 1 4 19 3 1 3 2 15 1 0 2 7 8 0 1 3 0.39 1.23 25 F -4 -4 -4 -5 0 -4 -4 -4 0 -2 -2 -4 -2 7 -5 -4 -4 7 5 -2 1 0 0 0 2 0 1 1 2 2 2 1 0 52 0 1 1 13 19 3 1.49 1.13 26 K -2 4 2 -2 -5 1 -1 -2 1 -5 -4 5 -3 -4 -3 -2 -2 -4 -2 -4 2 22 9 2 0 6 2 3 3 0 1 45 0 0 0 2 2 0 2 0 0.88 1.17 27 K -1 -2 1 -1 -4 -3 -2 6 -4 -5 -5 -1 -4 -5 -4 -1 -2 -4 -5 -5 3 2 6 3 0 0 2 71 0 0 1 5 0 0 0 4 1 0 0 0 1.29 1.18 28 M -2 2 0 -1 -4 2 1 -3 1 -1 -3 4 1 -4 -3 -2 0 -4 -2 0 3 10 5 3 0 10 9 1 3 3 1 31 5 0 0 2 5 0 1 6 0.45 1.18 29 D 0 -1 0 -3 -1 -2 -2 -4 -4 1 -1 0 0 -2 2 -1 2 -1 -2 3 7 4 6 1 1 2 1 0 0 9 3 7 2 2 11 4 15 1 1 23 0.29 1.19 30 F -4 1 -3 -5 0 -2 -4 -5 -3 -1 4 -2 3 3 -3 -3 -3 1 4 0 0 9 1 0 2 1 0 0 0 1 37 3 8 13 1 2 0 2 13 6 0.61 1.19 31 I -2 -4 -5 -5 -1 -4 -5 -5 -5 4 2 -4 1 -1 -4 -4 -1 -4 -2 5 2 0 0 0 1 0 0 0 0 23 15 0 2 2 0 0 3 0 1 45 0.87 1.19 32 N -2 -3 3 6 -5 -2 -1 -2 2 -5 -5 -3 -4 -5 -4 2 -3 -5 -2 -5 3 0 17 52 0 0 2 2 6 0 1 0 0 0 0 13 0 0 2 0 1.10 1.19 33 I -3 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -5 -5 6 2 -4 3 1 -4 -4 -1 -4 -3 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55 15 0 7 7 0 0 3 0 0 9 1.00 1.07 34 R -3 7 -2 -3 -4 -1 -2 0 1 -4 -2 1 -3 -1 -1 -3 -3 -4 -3 -4 1 69 0 1 0 0 1 7 3 1 4 5 0 3 3 1 1 0 0 1 1.19 1.01 35 E -2 -2 -2 2 -4 0 5 -1 -2 0 -2 0 -3 -4 -3 -1 -1 -4 0 -1 3 1 0 8 0 3 51 4 0 6 3 5 0 0 1 2 4 0 3 5 0.69 1.01 36 Y -3 -4 -4 -5 0 -4 -4 -4 2 -2 -2 -4 0 5 -5 -1 -2 6 7 -2 0 0 0 0 2 0 0 0 5 2 3 0 2 22 0 7 2 12 39 3 1.17 1.07 37 Y -3 -2 -2 -4 1 -1 -2 -4 1 -2 -3 -2 -1 2 -4 -1 0 6 7 -2 0 2 2 0 3 3 3 0 3 2 1 2 1 7 0 4 6 13 46 2 1.12 1.07 38 E -2 -1 1 4 -2 1 2 -2 -2 -1 -2 2 -1 -2 -3 -1 0 -5 -3 0 2 2 7 23 1 7 15 3 1 3 4 11 1 2 1 3 6 0 1 7 0.35 1.25 39 A 0 -1 0 1 -1 1 1 -2 -3 -2 -4 5 -2 -5 2 -1 0 -5 -4 -4 7 2 4 9 2 4 8 3 0 3 1 39 1 0 9 4 4 0 0 0 0.55 1.25 40 G -1 -3 2 5 1 0 3 -1 -3 -5 -5 -1 -4 -5 -2 1 -1 -5 -4 -4 3 0 9 36 3 3 19 5 0 0 1 3 0 0 2 12 4 0 0 0 0.74 1.24 41 G -1 -2 -1 0 -5 -3 -3 6 -2 -6 -6 -1 -5 -6 -4 -1 -4 -5 -5 -5 2 2 2 6 0 1 1 74 1 0 0 4 0 0 0 4 0 0 0 0 1.43 1.33 42 E -2 0 0 0 -2 1 4 -3 -2 -4 -4 4 -4 -3 -4 0 0 -5 -2 -3 3 5 5 4 1 6 31 1 0 1 1 28 0 1 0 5 5 0 1 1 0.66 1.31 43 M -3 -2 -3 -2 -3 2 1 -5 1 -1 2 -1 5 -1 0 -2 0 5 0 -1 1 1 1 2 1 10 10 0 4 3 16 3 19 2 5 2 5 8 4 3 0.46 1.31 44 K -2 2 -1 -4 -5 0 -1 -4 1 -2 2 4 1 2 -4 -2 -3 -4 -1 -2 4 9 3 0 0 3 4 1 3 2 23 30 4 8 0 2 1 0 2 2 0.47 1.34 45 P -2 -1 -2 -4 -5 -3 -3 -4 0 -5 -4 -3 -4 -3 8 -3 -3 -5 -5 -4 3 4 2 0 0 0 0 0 3 0 2 0 0 1 81 1 0 0 0 0 2.17 1.29 46 G -2 -2 -3 -3 -2 -3 -2 5 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -4 2 4 -1 -5 -4 1 2 0 0 1 0 2 53 0 0 0 0 0 0 0 13 25 1 0 0 1.10 1.31 47 K -1 4 -2 -2 -5 1 -2 -2 -3 -4 -3 6 -2 -4 -3 -1 -1 -5 -4 -4 4 20 1 2 0 5 0 2 0 1 2 53 1 1 1 4 4 0 0 0 0.98 1.31 48 K -2 2 -1 -3 -6 0 0 -4 -3 -4 -5 7 -4 -6 -4 -2 -2 -6 -4 -5 2 10 3 0 0 2 3 0 0 1 0 75 0 0 0 1 2 0 0 0 1.43 1.35 49 G -2 -5 -1 -1 -5 -4 -5 7 -5 -7 -6 -4 -5 -6 -5 -3 -4 -5 -6 -6 0 0 3 3 0 0 0 95 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.07 1.29 50 I -2 -5 -5 -4 -2 -5 -5 -6 -6 7 0 -5 0 -2 -5 -2 -2 -5 -4 3 3 0 0 1 1 0 0 0 0 67 4 0 1 1 0 3 1 0 0 19 1.29 1.27 51 G 1 -4 0 -3 2 -2 -3 -3 3 -3 -3 -3 -1 -3 -4 6 1 -5 -3 -4 12 0 3 0 4 0 0 1 7 1 2 0 2 1 0 61 6 0 0 0 0.94 1.27 52 L -4 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -5 0 6 -5 3 1 -6 -4 -4 -4 -3 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 81 0 7 6 0 1 0 0 0 2 1.34 1.23 53 T -2 -1 4 -1 -4 -1 -2 -1 -2 -5 -4 0 -4 -3 1 3 4 -6 -4 -4 2 3 20 2 0 2 1 3 0 0 1 7 0 1 7 24 28 0 0 0 0.67 1.28 54 V 0 -2 -4 -3 -3 -1 0 -2 -3 0 2 -1 4 -3 4 -2 1 -5 -3 0 7 2 0 1 0 2 7 3 0 5 18 4 10 1 22 2 8 0 1 7 0.40 1.28 55 D -1 -2 1 4 -6 0 5 -3 -2 -4 -5 0 -5 -6 -1 -1 -2 -6 -3 -5 4 0 6 26 0 2 45 1 1 1 1 6 0 0 3 2 2 0 1 0 0.95 1.29 56 Q -3 0 -1 -2 -5 7 1 -4 -1 -3 -1 -1 -1 -5 -4 -2 -2 -1 -4 -3 1 3 3 1 0 70 7 0 1 1 7 1 1 0 0 1 1 1 0 2 1.36 1.29 57 Y -3 -5 -6 -6 -5 -3 -5 -5 -4 -3 -1 -5 -2 3 -6 -5 -4 11 4 -3 2 0 0 0 0 1 0 0 0 1 5 0 1 13 0 0 0 64 11 1 2.55 1.26 58 T -1 1 3 0 -5 0 2 -3 -1 -4 -4 2 -1 -3 -2 3 0 0 -2 -4 4 6 15 5 0 4 13 1 1 1 1 15 2 1 1 24 4 1 1 0 0.45 1.31 59 A 1 -1 0 -1 -4 3 0 -3 -3 0 -1 3 0 -4 -3 -2 1 -2 -3 1 14 2 5 3 0 14 5 2 0 6 6 19 2 0 1 2 8 0 1 10 0.28 1.31 60 F -3 -5 -6 -6 -2 -5 -5 -6 -5 3 5 -5 0 4 -5 -5 -3 -4 -3 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 13 63 0 1 15 0 0 1 0 0 4 1.12 1.31 61 L -3 2 -3 -4 0 0 -1 -5 -3 0 1 5 2 -4 -3 -1 -1 -5 -3 1 1 11 0 0 2 3 3 0 0 5 11 38 6 0 1 4 3 0 0 11 0.56 1.32 62 K 0 -1 1 2 -5 1 4 -2 -1 -5 -4 3 -2 -5 -4 1 -2 -2 -1 -5 9 3 7 11 0 6 26 3 1 0 1 19 1 0 0 9 2 1 2 0 0.52 1.32 63 A 1 -1 3 -3 -2 3 -2 -2 3 0 1 -3 -1 -1 -4 1 -2 -5 -1 0 12 2 16 0 1 14 1 3 7 6 13 1 2 3 0 11 1 0 2 6 0.29 1.34 64 I 0 -2 -5 -5 -4 -1 -3 -4 0 5 1 -2 3 1 -5 -2 -2 -2 -1 2 9 2 0 0 0 3 1 1 3 31 11 2 9 6 0 3 2 1 2 16 0.55 1.37 65 P -1 -3 0 3 -5 -1 2 -1 -3 -3 -3 -1 -2 -3 5 2 -2 -6 -5 -5 5 1 4 16 0 2 12 4 1 1 2 2 1 1 28 19 1 0 0 0 0.67 1.38 66 A 2 -3 0 3 -5 1 3 -2 -1 -4 -3 0 -1 -5 -4 0 -1 -6 -5 -3 21 1 5 20 0 7 22 3 2 1 3 5 2 0 0 5 4 0 0 1 0.52 1.39 67 I -2 -3 -3 -6 -4 -5 -6 -6 -6 7 1 -5 -2 -1 -5 -4 -1 -5 -4 3 3 1 1 0 0 0 0 0 0 65 9 0 0 2 0 1 3 0 0 15 1.26 1.37 68 N -3 -3 3 5 -6 1 3 -3 -3 -4 -6 -1 -5 -6 -4 0 -1 -6 -2 -4 2 0 13 40 0 5 22 1 0 1 0 4 0 0 0 5 4 0 2 1 0.95 1.36 69 A 2 0 0 4 -5 1 4 -2 -2 -5 -5 2 -4 -6 -3 0 -1 -6 -5 -3 17 4 4 21 0 5 24 2 1 0 0 11 0 0 0 6 3 0 0 1 0.58 1.37 70 E 5 -2 -3 -1 0 -2 0 -2 -3 -2 -2 0 0 -4 -4 0 -1 0 -4 0 59 1 1 3 2 1 5 2 0 1 3 5 2 0 0 4 3 1 0 6 0.72 1.38 71 L -3 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 5 4 -4 2 -1 -5 -4 -3 -5 -3 3 2 0 0 0 0 0 0 0 0 32 36 1 4 2 0 0 0 0 0 24 1.02 1.35 72 R -1 4 0 -1 -5 2 1 -2 -1 -4 -4 5 -4 -6 -4 -1 -2 -6 -4 -3 6 23 3 2 0 8 8 3 1 0 1 35 0 0 0 5 2 0 0 2 0.72 1.31 73 S 0 0 0 1 -5 2 3 -3 -1 -5 -4 4 -4 -6 -2 1 -1 -6 -4 -5 7 4 4 6 0 8 21 1 1 0 1 33 0 0 1 10 2 0 0 0 0.63 1.25 74 R -2 -1 -2 -3 -4 2 -2 -3 -4 -1 3 3 5 -1 -5 -2 -3 -4 -4 -1 2 2 2 1 0 10 1 2 0 2 36 18 18 2 0 2 0 0 0 3 0.61 1.16 75 G -2 -3 0 0 -5 1 1 6 -3 -5 -3 -1 -4 -5 -4 1 -3 -5 -5 -5 0 0 3 6 0 7 9 58 0 0 3 2 0 0 0 12 0 0 0 0 0.96 0.95 76 H -2 -3 -1 -1 -4 1 4 -1 3 1 -2 0 -3 -1 -4 2 -2 -5 -3 0 0 0 2 1 0 6 34 5 8 10 3 5 0 2 0 17 0 0 0 7 0.45 0.92 77 D 0 0 1 4 -4 0 1 -3 -1 -4 -3 2 -3 -3 -3 1 1 -5 -4 -3 8 4 6 28 0 4 8 0 1 0 2 17 0 1 0 12 8 0 0 2 0.47 0.85 78 I -2 -4 -4 -5 -3 -4 -4 -5 -4 4 2 -4 0 2 -4 0 -1 -4 -2 4 1 0 0 0 0 0 0 0 0 25 17 0 1 9 0 8 1 0 0 37 0.66 0.75 79 T 0 -3 -2 3 2 -1 3 -2 -3 -3 -2 -2 -3 -4 -3 2 2 -5 -4 1 9 0 0 16 6 1 19 1 0 0 3 1 0 0 0 20 12 0 0 11 0.38 0.68 80 D -3 -3 2 7 -5 -1 3 -3 -2 -5 -5 -2 -4 -5 -3 -1 -2 -5 -4 -4 0 0 6 79 0 0 15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.34 0.48 K Lambda Standard Ungapped 0.1378 0.3168 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1896 0.3186 PSI Gapped 0.0580 0.2670